MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus obeum A2-162 draft genome

Total Repeats: 79555

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_021022	A	6	6	327594	327599	100 %	0 %	0 %	0 %	479176318
7003	NC_021022	GATCGA	2	12	327614	327625	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479176318
7004	NC_021022	GAT	2	6	327708	327713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176318
7005	NC_021022	AAAAC	2	10	327739	327748	80 %	0 %	0 %	20 %	479176318
7006	NC_021022	CAG	2	6	327864	327869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176318
7007	NC_021022	TCC	2	6	327919	327924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479176318
7008	NC_021022	CAG	2	6	327968	327973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176318
7009	NC_021022	CGAT	2	8	327991	327998	25 %	25 %	25 %	25 %	479176318
7010	NC_021022	TGCT	2	8	328027	328034	0 %	50 %	25 %	25 %	479176318
7011	NC_021022	GA	3	6	328047	328052	50 %	0 %	50 %	0 %	479176318
7012	NC_021022	AGA	2	6	328085	328090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176318
7013	NC_021022	TTC	2	6	328143	328148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176318
7014	NC_021022	ATA	2	6	328159	328164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176318
7015	NC_021022	GA	3	6	328167	328172	50 %	0 %	50 %	0 %	479176318
7016	NC_021022	GA	3	6	328220	328225	50 %	0 %	50 %	0 %	479176318
7017	NC_021022	TAA	2	6	328247	328252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176318
7018	NC_021022	ATGGCG	2	12	328260	328271	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479176318
7019	NC_021022	CAT	2	6	328293	328298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176318
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7021	NC_021022	ACC	2	6	328323	328328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7022	NC_021022	GGT	2	6	328400	328405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_021022	TA	3	6	328409	328414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_021022	AT	3	6	328472	328477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_021022	ATA	2	6	328490	328495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_021022	TAA	2	6	328524	328529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_021022	ATT	2	6	328537	328542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_021022	A	6	6	328549	328554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_021022	TAAA	2	8	328579	328586	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_021022	CG	3	6	328635	328640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7031	NC_021022	GT	3	6	328678	328683	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_021022	ATA	2	6	328702	328707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_021022	T	7	7	328734	328740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_021022	A	6	6	328742	328747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_021022	ATA	2	6	328799	328804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176319
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7040	NC_021022	ATC	2	6	329027	329032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176319
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7052	NC_021022	GAA	2	6	329633	329638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_021022	A	6	6	329637	329642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_021022	AGA	2	6	329738	329743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_021022	AACAA	2	10	329745	329754	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
7056	NC_021022	CAGA	2	8	329766	329773	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7057	NC_021022	GCTG	2	8	329879	329886	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7058	NC_021022	GCAGT	2	10	329914	329923	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7059	NC_021022	ATGG	2	8	329932	329939	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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7061	NC_021022	GGAA	2	8	330078	330085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_021022	AT	3	6	330203	330208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_021022	AGA	3	9	330248	330256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_021022	TGAT	2	8	330259	330266	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_021022	GAA	2	6	330330	330335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_021022	AGA	2	6	330353	330358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7101	NC_021022	T	6	6	332186	332191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7119	NC_021022	TA	3	6	333192	333197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7123	NC_021022	CATG	2	8	333308	333315	25 %	25 %	25 %	25 %	479176322
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7128	NC_021022	A	6	6	333496	333501	100 %	0 %	0 %	0 %	479176322
7129	NC_021022	AAT	2	6	333512	333517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176322
7130	NC_021022	GCA	2	6	333556	333561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176323
7131	NC_021022	TGCAA	2	10	333562	333571	40 %	20 %	20 %	20 %	479176323
7132	NC_021022	AT	3	6	333573	333578	50 %	50 %	0 %	0 %	479176323
7133	NC_021022	AGG	2	6	333632	333637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176323
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7136	NC_021022	TTC	2	6	333782	333787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176323
7137	NC_021022	ATG	2	6	333827	333832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176323
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7139	NC_021022	TCT	2	6	333906	333911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176323
7140	NC_021022	GGGAA	2	10	333928	333937	40 %	0 %	60 %	0 %	479176323
7141	NC_021022	GAA	2	6	333976	333981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176323
7142	NC_021022	ATGG	2	8	333992	333999	25 %	25 %	50 %	0 %	479176323
7143	NC_021022	TGA	2	6	334007	334012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176323
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7149	NC_021022	A	7	7	334164	334170	100 %	0 %	0 %	0 %	479176323
7150	NC_021022	T	6	6	334180	334185	0 %	100 %	0 %	0 %	479176323
7151	NC_021022	AT	3	6	334266	334271	50 %	50 %	0 %	0 %	479176323
7152	NC_021022	TCT	2	6	334323	334328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176323
7153	NC_021022	TGA	2	6	334332	334337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176323
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7156	NC_021022	CAGCTG	2	12	334588	334599	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479176323
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7158	NC_021022	TGG	2	6	334748	334753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479176323
7159	NC_021022	TAT	2	6	334759	334764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176323
7160	NC_021022	AAAG	2	8	334857	334864	75 %	0 %	25 %	0 %	479176323
7161	NC_021022	GAA	2	6	334927	334932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176323
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7164	NC_021022	A	6	6	334999	335004	100 %	0 %	0 %	0 %	479176323
7165	NC_021022	CGTC	2	8	335005	335012	0 %	25 %	25 %	50 %	479176323
7166	NC_021022	AAT	2	6	335155	335160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176323
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7173	NC_021022	CTG	2	6	335345	335350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176324
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7195	NC_021022	CATA	2	8	336490	336497	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7196	NC_021022	AAG	2	6	336503	336508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7197	NC_021022	AAAT	2	8	336551	336558	75 %	25 %	0 %	0 %	479176327
7198	NC_021022	TGA	2	6	336611	336616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176327
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7212	NC_021022	CGG	2	6	337351	337356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176327
7213	NC_021022	CTG	2	6	337385	337390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176327
7214	NC_021022	TGA	2	6	337403	337408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176327
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7232	NC_021022	GGCT	2	8	338249	338256	0 %	25 %	50 %	25 %	479176328
7233	NC_021022	ACG	2	6	338270	338275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176328
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7240	NC_021022	AT	3	6	338812	338817	50 %	50 %	0 %	0 %	479176329
7241	NC_021022	CAT	2	6	338819	338824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176329
7242	NC_021022	TCCGG	2	10	338928	338937	0 %	20 %	40 %	40 %	479176329
7243	NC_021022	TCA	2	6	338965	338970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176329
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7246	NC_021022	TTCT	2	8	339126	339133	0 %	75 %	0 %	25 %	479176329
7247	NC_021022	CTT	2	6	339138	339143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176329
7248	NC_021022	TCT	2	6	339164	339169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176329
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7250	NC_021022	GCGTTC	2	12	339204	339215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176329
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7376	NC_021022	GAT	2	6	344700	344705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176331
7377	NC_021022	AAT	2	6	344781	344786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176331
7378	NC_021022	AAG	2	6	344790	344795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176331
7379	NC_021022	GAA	2	6	344806	344811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176331
7380	NC_021022	TCT	2	6	344830	344835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176331
7381	NC_021022	GAA	2	6	344836	344841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176331
7382	NC_021022	AAT	2	6	344962	344967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176331
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7384	NC_021022	ATA	3	9	345011	345019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176331
7385	NC_021022	AGT	2	6	345037	345042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176331
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7387	NC_021022	ATC	2	6	345143	345148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176331
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7390	NC_021022	GAA	2	6	345256	345261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176331
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7395	NC_021022	AATCC	2	10	345556	345565	40 %	20 %	0 %	40 %	479176331
7396	NC_021022	GAT	2	6	345625	345630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176331
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7405	NC_021022	AAGT	2	8	345878	345885	50 %	25 %	25 %	0 %	479176331
7406	NC_021022	GAA	2	6	345886	345891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176331
7407	NC_021022	GAAGC	2	10	345961	345970	40 %	0 %	40 %	20 %	479176331
7408	NC_021022	AAAG	2	8	346026	346033	75 %	0 %	25 %	0 %	479176331
7409	NC_021022	TA	3	6	346039	346044	50 %	50 %	0 %	0 %	479176331
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7412	NC_021022	AGG	2	6	346082	346087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7443	NC_021022	GAGG	2	8	347847	347854	25 %	0 %	75 %	0 %	479176332
7444	NC_021022	GGACA	2	10	347878	347887	40 %	0 %	40 %	20 %	479176332
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7446	NC_021022	ATA	2	6	347967	347972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7447	NC_021022	AGAA	2	8	347978	347985	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7448	NC_021022	TCA	2	6	348124	348129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176333
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7457	NC_021022	GA	3	6	348631	348636	50 %	0 %	50 %	0 %	479176333
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7495	NC_021022	AGA	2	6	350482	350487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176333
7496	NC_021022	TTC	2	6	350493	350498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176333
7497	NC_021022	GCA	2	6	350501	350506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176333
7498	NC_021022	TGAAC	2	10	350551	350560	40 %	20 %	20 %	20 %	479176333
7499	NC_021022	GATG	2	8	350680	350687	25 %	25 %	50 %	0 %	479176333
7500	NC_021022	GAT	2	6	350741	350746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176333

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