MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus obeum A2-162 draft genome

Total Repeats: 79555

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
68001	NC_021022	TCC	2	6	3215666	3215671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68002	NC_021022	AGA	2	6	3215716	3215721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68003	NC_021022	AAAT	2	8	3215761	3215768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68004	NC_021022	CAAA	2	8	3215778	3215785	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
68005	NC_021022	A	6	6	3215783	3215788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68006	NC_021022	T	7	7	3215796	3215802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68007	NC_021022	A	6	6	3215806	3215811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68008	NC_021022	T	9	9	3215824	3215832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68009	NC_021022	TAC	2	6	3215838	3215843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68010	NC_021022	T	6	6	3215886	3215891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68011	NC_021022	GAA	2	6	3216041	3216046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479178755
68012	NC_021022	TTA	2	6	3216223	3216228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479178755
68013	NC_021022	CATT	2	8	3216349	3216356	25 %	50 %	0 %	25 %	479178755
68014	NC_021022	CTC	2	6	3216424	3216429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479178755
68015	NC_021022	TTC	2	6	3216430	3216435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479178755
68016	NC_021022	TAAA	2	8	3216451	3216458	75 %	25 %	0 %	0 %	479178755
68017	NC_021022	TTC	2	6	3216472	3216477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479178755
68018	NC_021022	TCT	2	6	3216479	3216484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479178755
68019	NC_021022	TAA	2	6	3216563	3216568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479178755
68020	NC_021022	TCT	2	6	3216583	3216588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479178755
68021	NC_021022	ATT	2	6	3216643	3216648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479178755
68022	NC_021022	CATG	2	8	3216680	3216687	25 %	25 %	25 %	25 %	479178755
68023	NC_021022	ACA	2	6	3216783	3216788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479178755
68024	NC_021022	A	6	6	3216831	3216836	100 %	0 %	0 %	0 %	479178755
68025	NC_021022	GCA	2	6	3216840	3216845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479178755
68026	NC_021022	ACA	2	6	3216850	3216855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479178755
68027	NC_021022	ACA	2	6	3216910	3216915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479178755
68028	NC_021022	TCT	2	6	3216947	3216952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479178755
68029	NC_021022	CTG	2	6	3216970	3216975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479178755
68030	NC_021022	TGA	2	6	3217022	3217027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479178755
68031	NC_021022	ACC	2	6	3217072	3217077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479178755
68032	NC_021022	CCG	2	6	3217098	3217103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479178755
68033	NC_021022	GTA	2	6	3217107	3217112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479178755
68034	NC_021022	TGA	2	6	3217127	3217132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479178755
68035	NC_021022	ACAG	2	8	3217242	3217249	50 %	0 %	25 %	25 %	479178755
68036	NC_021022	CTC	2	6	3217307	3217312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479178755
68037	NC_021022	TTC	2	6	3217313	3217318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479178755
68038	NC_021022	CAT	2	6	3217334	3217339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479178755
68039	NC_021022	CTG	2	6	3217348	3217353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479178755
68040	NC_021022	TCA	2	6	3217367	3217372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479178755
68041	NC_021022	CTG	2	6	3217431	3217436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479178755
68042	NC_021022	GAA	2	6	3217503	3217508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479178755
68043	NC_021022	A	7	7	3217573	3217579	100 %	0 %	0 %	0 %	479178755
68044	NC_021022	TCA	2	6	3217598	3217603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479178755
68045	NC_021022	TTCA	2	8	3217624	3217631	25 %	50 %	0 %	25 %	479178755
68046	NC_021022	TCT	2	6	3217712	3217717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479178755
68047	NC_021022	TAC	2	6	3217727	3217732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479178755
68048	NC_021022	A	6	6	3217741	3217746	100 %	0 %	0 %	0 %	479178755
68049	NC_021022	GCA	2	6	3217758	3217763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479178755
68050	NC_021022	GTT	2	6	3217776	3217781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479178755
68051	NC_021022	CTTCT	2	10	3217807	3217816	0 %	60 %	0 %	40 %	479178755
68052	NC_021022	A	6	6	3217869	3217874	100 %	0 %	0 %	0 %	479178755
68053	NC_021022	TCT	2	6	3217910	3217915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479178755
68054	NC_021022	CTGA	2	8	3218053	3218060	25 %	25 %	25 %	25 %	479178755
68055	NC_021022	ATGAAC	2	12	3218102	3218113	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68056	NC_021022	ACA	2	6	3218167	3218172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68057	NC_021022	AT	5	10	3218186	3218195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68058	NC_021022	CAT	2	6	3218227	3218232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68059	NC_021022	T	6	6	3218274	3218279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68060	NC_021022	AG	3	6	3218286	3218291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68061	NC_021022	ATT	2	6	3218304	3218309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479178756
68062	NC_021022	CAG	2	6	3218310	3218315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479178756
68063	NC_021022	TCT	2	6	3218352	3218357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479178756
68064	NC_021022	ATT	2	6	3218420	3218425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479178756
68065	NC_021022	TCG	2	6	3218472	3218477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479178756
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68073	NC_021022	TTG	2	6	3219126	3219131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479178756
68074	NC_021022	CTG	2	6	3219168	3219173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479178756
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68083	NC_021022	TGT	2	6	3219544	3219549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479178756
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68085	NC_021022	AAG	2	6	3219666	3219671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479178756
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68087	NC_021022	TAT	2	6	3219697	3219702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479178756
68088	NC_021022	GAA	2	6	3219722	3219727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479178756
68089	NC_021022	CATG	2	8	3219730	3219737	25 %	25 %	25 %	25 %	479178756
68090	NC_021022	AATG	2	8	3219739	3219746	50 %	25 %	25 %	0 %	479178756
68091	NC_021022	CTA	2	6	3219814	3219819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479178756
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68094	NC_021022	AG	3	6	3219915	3219920	50 %	0 %	50 %	0 %	479178756
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68099	NC_021022	TCT	2	6	3220150	3220155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479178757
68100	NC_021022	CA	3	6	3220272	3220277	50 %	0 %	0 %	50 %	479178757
68101	NC_021022	TGG	2	6	3220332	3220337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479178757
68102	NC_021022	ATA	2	6	3220348	3220353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479178757
68103	NC_021022	TC	3	6	3220354	3220359	0 %	50 %	0 %	50 %	479178757
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68107	NC_021022	CA	3	6	3220566	3220571	50 %	0 %	0 %	50 %	479178757
68108	NC_021022	CCA	2	6	3220586	3220591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479178757
68109	NC_021022	ATCAC	2	10	3220639	3220648	40 %	20 %	0 %	40 %	479178757
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68113	NC_021022	CAT	2	6	3220825	3220830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68114	NC_021022	TCT	2	6	3220833	3220838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68115	NC_021022	GA	3	6	3220872	3220877	50 %	0 %	50 %	0 %	479178758
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68117	NC_021022	CTG	2	6	3220922	3220927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479178758
68118	NC_021022	T	6	6	3220932	3220937	0 %	100 %	0 %	0 %	479178758
68119	NC_021022	TCC	2	6	3220940	3220945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479178758
68120	NC_021022	AGG	2	6	3220998	3221003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479178758
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68122	NC_021022	TGC	3	9	3221180	3221188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479178759
68123	NC_021022	CGG	2	6	3221213	3221218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479178759
68124	NC_021022	TGC	2	6	3221240	3221245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479178759
68125	NC_021022	CGG	2	6	3221246	3221251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479178759
68126	NC_021022	GTCA	2	8	3221320	3221327	25 %	25 %	25 %	25 %	479178759
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68129	NC_021022	TCG	2	6	3221545	3221550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479178759
68130	NC_021022	ATC	2	6	3221578	3221583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479178759
68131	NC_021022	ATC	2	6	3221595	3221600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479178759
68132	NC_021022	CT	3	6	3221610	3221615	0 %	50 %	0 %	50 %	479178759
68133	NC_021022	ATC	2	6	3221712	3221717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479178759
68134	NC_021022	TGC	2	6	3221723	3221728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479178759
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68136	NC_021022	CTG	2	6	3221854	3221859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479178759
68137	NC_021022	TGC	2	6	3221882	3221887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479178759
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68139	NC_021022	GT	3	6	3222003	3222008	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68140	NC_021022	AATTA	2	10	3222028	3222037	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68141	NC_021022	T	6	6	3222050	3222055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68142	NC_021022	TGTT	2	8	3222068	3222075	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68143	NC_021022	TCTT	2	8	3222083	3222090	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68144	NC_021022	T	7	7	3222123	3222129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68145	NC_021022	TCC	2	6	3222133	3222138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68146	NC_021022	GAA	2	6	3222151	3222156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68147	NC_021022	T	6	6	3222172	3222177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68148	NC_021022	ATA	2	6	3222182	3222187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68149	NC_021022	GGAG	2	8	3222207	3222214	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
68150	NC_021022	T	6	6	3222218	3222223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68151	NC_021022	AGA	2	6	3222234	3222239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68152	NC_021022	CTT	2	6	3222241	3222246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68153	NC_021022	T	7	7	3222325	3222331	0 %	100 %	0 %	0 %	479178760
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68159	NC_021022	ATGC	2	8	3222720	3222727	25 %	25 %	25 %	25 %	479178760
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68185	NC_021022	CAA	2	6	3223889	3223894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68186	NC_021022	CT	3	6	3223924	3223929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68187	NC_021022	GA	3	6	3224020	3224025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68188	NC_021022	CCA	2	6	3224035	3224040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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68190	NC_021022	GTTG	2	8	3224171	3224178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68191	NC_021022	AG	3	6	3224204	3224209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68192	NC_021022	GGC	2	6	3224236	3224241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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68198	NC_021022	GAAG	2	8	3224617	3224624	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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68202	NC_021022	AGG	2	6	3224895	3224900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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68208	NC_021022	TCGTG	2	10	3225256	3225265	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68209	NC_021022	N	1955	1955	3225320	3227274	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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68211	NC_021022	GAG	2	6	3227356	3227361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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68214	NC_021022	GCG	2	6	3227518	3227523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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68216	NC_021022	GCCG	2	8	3227619	3227626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68217	NC_021022	ACC	2	6	3227720	3227725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68218	NC_021022	GGGAG	2	10	3227795	3227804	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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68220	NC_021022	GAA	2	6	3228205	3228210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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68222	NC_021022	CATT	2	8	3228382	3228389	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68223	NC_021022	ACC	2	6	3228455	3228460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68224	NC_021022	GAA	2	6	3228509	3228514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68225	NC_021022	AG	3	6	3228547	3228552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68226	NC_021022	ACA	2	6	3228681	3228686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479178761
68227	NC_021022	TATGA	2	10	3228704	3228713	40 %	40 %	20 %	0 %	479178761
68228	NC_021022	AG	3	6	3228735	3228740	50 %	0 %	50 %	0 %	479178761
68229	NC_021022	CTT	2	6	3228859	3228864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479178761
68230	NC_021022	TTC	2	6	3228870	3228875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479178761
68231	NC_021022	CGC	2	6	3229020	3229025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479178762
68232	NC_021022	A	6	6	3229097	3229102	100 %	0 %	0 %	0 %	479178762
68233	NC_021022	AG	3	6	3229142	3229147	50 %	0 %	50 %	0 %	479178762
68234	NC_021022	GCC	2	6	3229150	3229155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479178762
68235	NC_021022	ATA	2	6	3229204	3229209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479178762
68236	NC_021022	T	6	6	3229288	3229293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68237	NC_021022	CG	3	6	3229371	3229376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68238	NC_021022	N	1938	1938	3229397	3231334	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68239	NC_021022	CCA	2	6	3231345	3231350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68240	NC_021022	ATC	2	6	3231369	3231374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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68242	NC_021022	CAA	2	6	3231428	3231433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68243	NC_021022	CCTC	2	8	3231458	3231465	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
68244	NC_021022	T	6	6	3231520	3231525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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68353	NC_021022	T	6	6	3237980	3237985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68354	NC_021022	GTCAG	2	10	3238015	3238024	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
68355	NC_021022	GCAGC	2	10	3238049	3238058	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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68360	NC_021022	TA	3	6	3238272	3238277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68361	NC_021022	CTT	2	6	3238286	3238291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68362	NC_021022	AAAG	2	8	3238300	3238307	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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68485	NC_021022	CAA	2	6	3244246	3244251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479178772
68486	NC_021022	CTT	2	6	3244276	3244281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479178772
68487	NC_021022	AGT	2	6	3244303	3244308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479178772
68488	NC_021022	TTC	2	6	3244328	3244333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479178772
68489	NC_021022	CTGCAC	2	12	3244381	3244392	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479178772
68490	NC_021022	CCG	2	6	3244416	3244421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479178772
68491	NC_021022	TTC	2	6	3244457	3244462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479178772
68492	NC_021022	TGT	2	6	3244474	3244479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479178772
68493	NC_021022	TTTC	2	8	3244507	3244514	0 %	75 %	0 %	25 %	479178772
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68499	NC_021022	TCA	2	6	3244758	3244763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479178772
68500	NC_021022	GTC	2	6	3244838	3244843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479178772

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