MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus obeum A2-162 draft genome

Total Repeats: 79555

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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53002	NC_021022	ATT	2	6	2506048	2506053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479178154
53003	NC_021022	GCA	2	6	2506065	2506070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479178154
53004	NC_021022	A	6	6	2506175	2506180	100 %	0 %	0 %	0 %	479178154
53005	NC_021022	TAAGA	2	10	2506194	2506203	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53006	NC_021022	GCA	2	6	2506211	2506216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53007	NC_021022	AAG	2	6	2506240	2506245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479178155
53008	NC_021022	GA	4	8	2506279	2506286	50 %	0 %	50 %	0 %	479178155
53009	NC_021022	TCT	2	6	2506301	2506306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479178155
53010	NC_021022	GAA	2	6	2506349	2506354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479178155
53011	NC_021022	GTG	2	6	2506485	2506490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479178155
53012	NC_021022	A	6	6	2506535	2506540	100 %	0 %	0 %	0 %	479178155
53013	NC_021022	TAT	2	6	2506556	2506561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479178155
53014	NC_021022	TG	3	6	2506570	2506575	0 %	50 %	50 %	0 %	479178155
53015	NC_021022	ATG	2	6	2506635	2506640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479178155
53016	NC_021022	TGG	2	6	2506698	2506703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479178155
53017	NC_021022	ATG	2	6	2506715	2506720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479178155
53018	NC_021022	TGC	2	6	2506834	2506839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479178155
53019	NC_021022	AAG	2	6	2506911	2506916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479178155
53020	NC_021022	CAT	2	6	2506945	2506950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479178155
53021	NC_021022	CAA	2	6	2507004	2507009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479178155
53022	NC_021022	AGC	2	6	2507059	2507064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479178155
53023	NC_021022	GAA	2	6	2507084	2507089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479178155
53024	NC_021022	TGA	2	6	2507182	2507187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479178155
53025	NC_021022	AGA	2	6	2507214	2507219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479178156
53026	NC_021022	ATT	2	6	2507220	2507225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479178156
53027	NC_021022	GCG	2	6	2507252	2507257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479178156
53028	NC_021022	ATG	2	6	2507336	2507341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479178156
53029	NC_021022	GAT	2	6	2507385	2507390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479178156
53030	NC_021022	AGT	2	6	2507424	2507429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479178156
53031	NC_021022	ATC	2	6	2507605	2507610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479178156
53032	NC_021022	TGA	2	6	2507672	2507677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479178156
53033	NC_021022	GTG	2	6	2507681	2507686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479178156
53034	NC_021022	CA	3	6	2507718	2507723	50 %	0 %	0 %	50 %	479178156
53035	NC_021022	CAG	2	6	2507735	2507740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479178156
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53037	NC_021022	TGA	2	6	2507910	2507915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479178156
53038	NC_021022	TTA	2	6	2507918	2507923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479178156
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53042	NC_021022	GAA	2	6	2508178	2508183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479178156
53043	NC_021022	T	6	6	2508277	2508282	0 %	100 %	0 %	0 %	479178156
53044	NC_021022	AGT	2	6	2508294	2508299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479178156
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53046	NC_021022	TTTC	2	8	2508406	2508413	0 %	75 %	0 %	25 %	479178156
53047	NC_021022	ATT	2	6	2508464	2508469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479178156
53048	NC_021022	AGG	2	6	2508597	2508602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53049	NC_021022	ATG	2	6	2508680	2508685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479178157
53050	NC_021022	CGAG	2	8	2508711	2508718	25 %	0 %	50 %	25 %	479178157
53051	NC_021022	CA	4	8	2508743	2508750	50 %	0 %	0 %	50 %	479178157
53052	NC_021022	TGTA	2	8	2508908	2508915	25 %	50 %	25 %	0 %	479178157
53053	NC_021022	ATG	2	6	2508926	2508931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479178157
53054	NC_021022	TAT	2	6	2508978	2508983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479178157
53055	NC_021022	CGAC	2	8	2509054	2509061	25 %	0 %	25 %	50 %	479178157
53056	NC_021022	GA	4	8	2509173	2509180	50 %	0 %	50 %	0 %	479178157
53057	NC_021022	ATC	2	6	2509192	2509197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479178157
53058	NC_021022	TA	3	6	2509259	2509264	50 %	50 %	0 %	0 %	479178157
53059	NC_021022	GA	3	6	2509280	2509285	50 %	0 %	50 %	0 %	479178157
53060	NC_021022	TAAG	2	8	2509322	2509329	50 %	25 %	25 %	0 %	479178157
53061	NC_021022	CTGGCA	2	12	2509369	2509380	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479178157
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53065	NC_021022	ATTGCG	2	12	2509537	2509548	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479178157
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53069	NC_021022	TGA	2	6	2509698	2509703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479178157
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53074	NC_021022	CGACAA	2	12	2509877	2509888	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	479178158
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53082	NC_021022	GA	3	6	2510192	2510197	50 %	0 %	50 %	0 %	479178158
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53088	NC_021022	GGA	2	6	2510502	2510507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479178158
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53090	NC_021022	CTT	2	6	2510699	2510704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479178158
53091	NC_021022	ACG	2	6	2510739	2510744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479178158
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53094	NC_021022	TCC	2	6	2510893	2510898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53095	NC_021022	TTA	2	6	2510900	2510905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53100	NC_021022	GGTAC	2	10	2511333	2511342	20 %	20 %	40 %	20 %	479178159
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53107	NC_021022	TGA	2	6	2511831	2511836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479178159
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53109	NC_021022	TTG	2	6	2511984	2511989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479178159
53110	NC_021022	T	6	6	2512025	2512030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53111	NC_021022	AATA	2	8	2512035	2512042	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53112	NC_021022	AGGGGA	2	12	2512131	2512142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479178160
53113	NC_021022	CTG	2	6	2512191	2512196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479178160
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53115	NC_021022	TTC	2	6	2512249	2512254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479178160
53116	NC_021022	CCG	2	6	2512293	2512298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479178160
53117	NC_021022	TATTT	2	10	2512331	2512340	20 %	80 %	0 %	0 %	479178160
53118	NC_021022	TAT	2	6	2512344	2512349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479178160
53119	NC_021022	CGGT	2	8	2512351	2512358	0 %	25 %	50 %	25 %	479178160
53120	NC_021022	T	6	6	2512405	2512410	0 %	100 %	0 %	0 %	479178160
53121	NC_021022	TGTT	2	8	2512420	2512427	0 %	75 %	25 %	0 %	479178160
53122	NC_021022	GCA	2	6	2512434	2512439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479178160
53123	NC_021022	TTA	2	6	2512441	2512446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479178160
53124	NC_021022	GGT	2	6	2512461	2512466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479178160
53125	NC_021022	TGAT	2	8	2512474	2512481	25 %	50 %	25 %	0 %	479178160
53126	NC_021022	TTA	2	6	2512520	2512525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479178160
53127	NC_021022	TCTT	2	8	2512540	2512547	0 %	75 %	0 %	25 %	479178160
53128	NC_021022	ATGG	2	8	2512613	2512620	25 %	25 %	50 %	0 %	479178160
53129	NC_021022	GT	3	6	2512624	2512629	0 %	50 %	50 %	0 %	479178160
53130	NC_021022	ATT	2	6	2512638	2512643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479178160
53131	NC_021022	ACA	2	6	2512648	2512653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479178160
53132	NC_021022	TTC	2	6	2512731	2512736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479178160
53133	NC_021022	GAAG	2	8	2512766	2512773	50 %	0 %	50 %	0 %	479178160
53134	NC_021022	AAG	2	6	2512794	2512799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479178160
53135	NC_021022	AGG	2	6	2512832	2512837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479178160
53136	NC_021022	GAT	2	6	2512881	2512886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479178160
53137	NC_021022	ATC	2	6	2512945	2512950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479178160
53138	NC_021022	AAT	2	6	2512972	2512977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479178160
53139	NC_021022	GAG	2	6	2512985	2512990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53140	NC_021022	A	8	8	2513003	2513010	100 %	0 %	0 %	0 %	479178161
53141	NC_021022	GA	3	6	2513048	2513053	50 %	0 %	50 %	0 %	479178161
53142	NC_021022	AAG	2	6	2513115	2513120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479178161
53143	NC_021022	TTC	2	6	2513193	2513198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479178161
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53145	NC_021022	ACTGA	2	10	2513234	2513243	40 %	20 %	20 %	20 %	479178161
53146	NC_021022	A	6	6	2513267	2513272	100 %	0 %	0 %	0 %	479178161
53147	NC_021022	GAT	2	6	2513354	2513359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479178161
53148	NC_021022	ACA	2	6	2513495	2513500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479178161
53149	NC_021022	GAA	2	6	2513546	2513551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479178161
53150	NC_021022	AAT	2	6	2513617	2513622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479178161
53151	NC_021022	AGAA	2	8	2513646	2513653	75 %	0 %	25 %	0 %	479178161
53152	NC_021022	GGT	2	6	2513687	2513692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479178161
53153	NC_021022	CGTA	2	8	2513752	2513759	25 %	25 %	25 %	25 %	479178161
53154	NC_021022	GAA	2	6	2513768	2513773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479178161
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53159	NC_021022	CCG	2	6	2514153	2514158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479178161
53160	NC_021022	TTC	2	6	2514162	2514167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479178161
53161	NC_021022	GAT	2	6	2514190	2514195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479178161
53162	NC_021022	CGT	2	6	2514197	2514202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479178161
53163	NC_021022	ATT	2	6	2514219	2514224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479178161
53164	NC_021022	ATT	2	6	2514280	2514285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479178161
53165	NC_021022	AAT	2	6	2514288	2514293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479178161
53166	NC_021022	ATT	2	6	2514300	2514305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53167	NC_021022	AG	3	6	2514463	2514468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53168	NC_021022	T	6	6	2514472	2514477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53169	NC_021022	ATTT	2	8	2514481	2514488	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53170	NC_021022	AGAA	2	8	2514532	2514539	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53171	NC_021022	AT	3	6	2514546	2514551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53172	NC_021022	GGA	2	6	2514590	2514595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53173	NC_021022	AAAT	2	8	2514599	2514606	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53174	NC_021022	A	6	6	2514620	2514625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53175	NC_021022	ATGT	2	8	2514641	2514648	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53176	NC_021022	CAT	2	6	2514655	2514660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53177	NC_021022	TATCAT	2	12	2514667	2514678	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53178	NC_021022	TCT	2	6	2514679	2514684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53179	NC_021022	GA	3	6	2514713	2514718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53180	NC_021022	AGA	2	6	2514726	2514731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53181	NC_021022	ATT	2	6	2514735	2514740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53182	NC_021022	A	6	6	2514751	2514756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53183	NC_021022	TATT	2	8	2514802	2514809	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53184	NC_021022	ATGAA	2	10	2514810	2514819	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53185	NC_021022	N	307	307	2514856	2515162	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53186	NC_021022	GATG	2	8	2515165	2515172	25 %	25 %	50 %	0 %	479178162
53187	NC_021022	CTG	2	6	2515193	2515198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479178162
53188	NC_021022	CTT	2	6	2515256	2515261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479178162
53189	NC_021022	TGT	2	6	2515270	2515275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479178162
53190	NC_021022	TTATCT	2	12	2515284	2515295	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479178162
53191	NC_021022	GCTG	2	8	2515305	2515312	0 %	25 %	50 %	25 %	479178162
53192	NC_021022	AAG	2	6	2515316	2515321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479178162
53193	NC_021022	ATG	2	6	2515322	2515327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479178162
53194	NC_021022	TCT	2	6	2515328	2515333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479178162
53195	NC_021022	TGG	2	6	2515348	2515353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479178162
53196	NC_021022	TCC	2	6	2515397	2515402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479178162
53197	NC_021022	TCT	2	6	2515450	2515455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479178162
53198	NC_021022	GCC	2	6	2515540	2515545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479178162
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53200	NC_021022	TGC	2	6	2515651	2515656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479178162
53201	NC_021022	GTATT	2	10	2515701	2515710	20 %	60 %	20 %	0 %	479178162
53202	NC_021022	TGA	2	6	2515714	2515719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479178162
53203	NC_021022	GA	4	8	2515775	2515782	50 %	0 %	50 %	0 %	479178162
53204	NC_021022	ATGG	2	8	2515811	2515818	25 %	25 %	50 %	0 %	479178162
53205	NC_021022	GCA	2	6	2515850	2515855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479178162
53206	NC_021022	TCCG	2	8	2515890	2515897	0 %	25 %	25 %	50 %	479178162
53207	NC_021022	CCG	2	6	2515909	2515914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479178162
53208	NC_021022	AGA	2	6	2515948	2515953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479178162
53209	NC_021022	AAAATT	2	12	2515976	2515987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479178162
53210	NC_021022	TGA	2	6	2516005	2516010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479178162
53211	NC_021022	AGC	2	6	2516068	2516073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479178162
53212	NC_021022	GACG	2	8	2516090	2516097	25 %	0 %	50 %	25 %	479178162
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53214	NC_021022	GTT	2	6	2516138	2516143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479178162
53215	NC_021022	AGA	2	6	2516157	2516162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479178162
53216	NC_021022	TTG	2	6	2516226	2516231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479178162
53217	NC_021022	GAT	2	6	2516318	2516323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479178162
53218	NC_021022	GAA	2	6	2516348	2516353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479178162
53219	NC_021022	GGC	2	6	2516381	2516386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479178162
53220	NC_021022	TGC	2	6	2516389	2516394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479178162
53221	NC_021022	TGA	2	6	2516494	2516499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479178162
53222	NC_021022	AGT	2	6	2516599	2516604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479178162
53223	NC_021022	TTC	2	6	2516643	2516648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479178162
53224	NC_021022	ATA	2	6	2516652	2516657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479178162
53225	NC_021022	TGA	2	6	2516713	2516718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479178162
53226	NC_021022	GAA	2	6	2516744	2516749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479178162
53227	NC_021022	GCT	2	6	2516756	2516761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479178162
53228	NC_021022	AGA	2	6	2516767	2516772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479178162
53229	NC_021022	TA	3	6	2516785	2516790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53230	NC_021022	TAC	2	6	2516847	2516852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53231	NC_021022	AAG	2	6	2516854	2516859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53232	NC_021022	ACAGGA	2	12	2516865	2516876	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53233	NC_021022	GAA	2	6	2516878	2516883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53234	NC_021022	ATCA	2	8	2516935	2516942	50 %	25 %	0 %	25 %	479178163
53235	NC_021022	TGA	2	6	2516955	2516960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479178163
53236	NC_021022	GAA	2	6	2516965	2516970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479178163
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53355	NC_021022	GCA	2	6	2522528	2522533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479178167
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53479	NC_021022	GCATCG	2	12	2527459	2527470	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479178171
53480	NC_021022	TTTC	2	8	2527511	2527518	0 %	75 %	0 %	25 %	479178171
53481	NC_021022	GCT	2	6	2527527	2527532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479178171
53482	NC_021022	TG	3	6	2527666	2527671	0 %	50 %	50 %	0 %	479178171
53483	NC_021022	TAT	2	6	2527698	2527703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479178171
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53485	NC_021022	AGA	2	6	2527780	2527785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479178171
53486	NC_021022	CTT	2	6	2527796	2527801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479178171
53487	NC_021022	ATT	2	6	2527815	2527820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479178171
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53489	NC_021022	TG	3	6	2527891	2527896	0 %	50 %	50 %	0 %	479178171
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