MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus obeum A2-162 draft genome

Total Repeats: 79555

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
50501	NC_021022	AAT	2	6	2384199	2384204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50502	NC_021022	A	7	7	2384216	2384222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50503	NC_021022	T	6	6	2384259	2384264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50504	NC_021022	TCA	2	6	2384279	2384284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50505	NC_021022	GCA	2	6	2384397	2384402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50506	NC_021022	AGC	2	6	2384528	2384533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50507	NC_021022	GCT	2	6	2384540	2384545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50508	NC_021022	A	6	6	2384680	2384685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50509	NC_021022	CTGA	2	8	2384724	2384731	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50510	NC_021022	TTA	2	6	2384735	2384740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50511	NC_021022	GTT	2	6	2384777	2384782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50512	NC_021022	A	6	6	2384807	2384812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50513	NC_021022	AGA	2	6	2384830	2384835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50514	NC_021022	AAAC	2	8	2384855	2384862	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50515	NC_021022	AAAC	2	8	2384895	2384902	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50516	NC_021022	AGG	2	6	2384913	2384918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50517	NC_021022	TAC	2	6	2384933	2384938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479178052
50518	NC_021022	AAG	2	6	2384939	2384944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479178052
50519	NC_021022	AT	3	6	2384947	2384952	50 %	50 %	0 %	0 %	479178052
50520	NC_021022	CAG	2	6	2384992	2384997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479178052
50521	NC_021022	AG	3	6	2385002	2385007	50 %	0 %	50 %	0 %	479178052
50522	NC_021022	ATT	2	6	2385091	2385096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479178052
50523	NC_021022	GAA	2	6	2385103	2385108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479178052
50524	NC_021022	GAA	2	6	2385144	2385149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479178052
50525	NC_021022	TCT	2	6	2385192	2385197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479178052
50526	NC_021022	GGA	2	6	2385198	2385203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479178052
50527	NC_021022	AAAAAG	2	12	2385216	2385227	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	479178052
50528	NC_021022	GCAG	2	8	2385249	2385256	25 %	0 %	50 %	25 %	479178052
50529	NC_021022	TGT	2	6	2385268	2385273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479178052
50530	NC_021022	ATT	2	6	2385328	2385333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479178052
50531	NC_021022	AAG	2	6	2385369	2385374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479178052
50532	NC_021022	AGTA	2	8	2385375	2385382	50 %	25 %	25 %	0 %	479178052
50533	NC_021022	A	6	6	2385422	2385427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50534	NC_021022	GAA	2	6	2385511	2385516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50535	NC_021022	A	6	6	2385562	2385567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50536	NC_021022	TAA	2	6	2385568	2385573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50537	NC_021022	AGG	2	6	2385579	2385584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50538	NC_021022	GCA	2	6	2385629	2385634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479178053
50539	NC_021022	TAT	2	6	2385639	2385644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479178053
50540	NC_021022	CAG	2	6	2385651	2385656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479178053
50541	NC_021022	CTT	2	6	2385665	2385670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479178053
50542	NC_021022	CAG	3	9	2385708	2385716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479178053
50543	NC_021022	TTC	2	6	2385717	2385722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479178053
50544	NC_021022	AGA	2	6	2385772	2385777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479178053
50545	NC_021022	CAG	2	6	2385794	2385799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479178053
50546	NC_021022	GCA	2	6	2385815	2385820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479178053
50547	NC_021022	CTG	2	6	2385843	2385848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479178053
50548	NC_021022	AAG	2	6	2385849	2385854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479178053
50549	NC_021022	AGA	2	6	2385871	2385876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479178053
50550	NC_021022	GCA	2	6	2385881	2385886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479178053
50551	NC_021022	TGC	2	6	2385920	2385925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50552	NC_021022	TGA	2	6	2385947	2385952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50553	NC_021022	AGAGA	2	10	2386134	2386143	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
50554	NC_021022	TGC	2	6	2386258	2386263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50555	NC_021022	GAAA	2	8	2386273	2386280	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50556	NC_021022	TTTC	2	8	2386283	2386290	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50557	NC_021022	GT	3	6	2386408	2386413	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50558	NC_021022	GAT	2	6	2386509	2386514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50559	NC_021022	GAC	2	6	2386563	2386568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50560	NC_021022	A	6	6	2386813	2386818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50561	NC_021022	GCA	2	6	2387022	2387027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50562	NC_021022	CAT	2	6	2387046	2387051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50563	NC_021022	GGC	2	6	2387064	2387069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50564	NC_021022	GTA	2	6	2387157	2387162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50565	NC_021022	AGA	2	6	2387183	2387188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50566	NC_021022	CTG	2	6	2387190	2387195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50567	NC_021022	GGC	2	6	2387201	2387206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50568	NC_021022	GAA	2	6	2387214	2387219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50569	NC_021022	TGC	2	6	2387255	2387260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50570	NC_021022	GAA	2	6	2387283	2387288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50571	NC_021022	ATC	2	6	2387355	2387360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50572	NC_021022	CAT	2	6	2387367	2387372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50573	NC_021022	AGA	2	6	2387414	2387419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50574	NC_021022	A	6	6	2387427	2387432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50575	NC_021022	GGA	2	6	2387438	2387443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50576	NC_021022	TCCGC	2	10	2387504	2387513	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
50577	NC_021022	ATG	2	6	2387571	2387576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50578	NC_021022	ATT	2	6	2387635	2387640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50579	NC_021022	TCCT	2	8	2387647	2387654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50580	NC_021022	AGA	2	6	2387675	2387680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50581	NC_021022	CAG	3	9	2387746	2387754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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50583	NC_021022	ATA	2	6	2387977	2387982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50584	NC_021022	ATA	2	6	2388034	2388039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50585	NC_021022	A	6	6	2388060	2388065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50586	NC_021022	A	6	6	2388081	2388086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50587	NC_021022	TATCA	2	10	2388095	2388104	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50588	NC_021022	A	7	7	2388123	2388129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50589	NC_021022	GC	3	6	2388232	2388237	0 %	0 %	50 %	50 %	479178054
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50591	NC_021022	A	6	6	2388327	2388332	100 %	0 %	0 %	0 %	479178054
50592	NC_021022	AGA	2	6	2388366	2388371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479178054
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50601	NC_021022	GACG	2	8	2388717	2388724	25 %	0 %	50 %	25 %	479178054
50602	NC_021022	GCA	2	6	2388747	2388752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479178054
50603	NC_021022	TAG	2	6	2388753	2388758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479178054
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50605	NC_021022	GCA	2	6	2388860	2388865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479178055
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50618	NC_021022	GATG	3	12	2389544	2389555	25 %	25 %	50 %	0 %	479178056
50619	NC_021022	AT	3	6	2389664	2389669	50 %	50 %	0 %	0 %	479178056
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50621	NC_021022	GAA	2	6	2389723	2389728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479178056
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50987	NC_021022	GAT	2	6	2406842	2406847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479178064
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50989	NC_021022	TGT	2	6	2407178	2407183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479178064
50990	NC_021022	TTC	2	6	2407219	2407224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479178064
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