MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus torques L2-14 draft genome

Total Repeats: 72617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_021015	TCA	2	6	1052445	1052450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479156651
23002	NC_021015	TC	3	6	1052472	1052477	0 %	50 %	0 %	50 %	479156651
23003	NC_021015	TTA	2	6	1052591	1052596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23004	NC_021015	CTTT	2	8	1052604	1052611	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23005	NC_021015	TCA	2	6	1052628	1052633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23006	NC_021015	AGA	2	6	1052658	1052663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23007	NC_021015	TTCT	2	8	1052672	1052679	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23008	NC_021015	CGA	2	6	1052709	1052714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23009	NC_021015	TTCC	2	8	1052772	1052779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23010	NC_021015	GAA	2	6	1052781	1052786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23011	NC_021015	GAT	2	6	1052791	1052796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23012	NC_021015	GATG	2	8	1052821	1052828	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23013	NC_021015	ACC	2	6	1052851	1052856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23014	NC_021015	GTT	2	6	1052881	1052886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23015	NC_021015	TGT	2	6	1052914	1052919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23016	NC_021015	AGA	2	6	1052934	1052939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23017	NC_021015	AATG	2	8	1052971	1052978	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23018	NC_021015	CTT	2	6	1053024	1053029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23019	NC_021015	TAC	2	6	1053033	1053038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23020	NC_021015	TCTTG	2	10	1053064	1053073	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
23021	NC_021015	AGA	2	6	1053107	1053112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23022	NC_021015	CTG	2	6	1053177	1053182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23023	NC_021015	CTGA	2	8	1053194	1053201	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23024	NC_021015	TGA	2	6	1053261	1053266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23025	NC_021015	TGT	2	6	1053370	1053375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23026	NC_021015	TCC	2	6	1053535	1053540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23027	NC_021015	AGA	2	6	1053552	1053557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23028	NC_021015	AGA	2	6	1053569	1053574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23029	NC_021015	T	6	6	1053611	1053616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23030	NC_021015	T	6	6	1053636	1053641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23031	NC_021015	TCC	2	6	1053652	1053657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23032	NC_021015	T	7	7	1053760	1053766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23033	NC_021015	GT	3	6	1053777	1053782	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23034	NC_021015	TGTT	2	8	1053885	1053892	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23035	NC_021015	T	7	7	1053900	1053906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23036	NC_021015	CAA	2	6	1053918	1053923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23037	NC_021015	CT	3	6	1053984	1053989	0 %	50 %	0 %	50 %	479156652
23038	NC_021015	GCA	2	6	1054118	1054123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479156652
23039	NC_021015	CCA	2	6	1054207	1054212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479156652
23040	NC_021015	CCTG	2	8	1054345	1054352	0 %	25 %	25 %	50 %	479156652
23041	NC_021015	AATT	2	8	1054443	1054450	50 %	50 %	0 %	0 %	479156652
23042	NC_021015	TTC	2	6	1054503	1054508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479156652
23043	NC_021015	AAC	2	6	1054533	1054538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479156652
23044	NC_021015	T	6	6	1054551	1054556	0 %	100 %	0 %	0 %	479156652
23045	NC_021015	GCA	2	6	1054558	1054563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479156652
23046	NC_021015	GAA	2	6	1054565	1054570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479156652
23047	NC_021015	AGA	2	6	1054624	1054629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479156652
23048	NC_021015	TTTC	2	8	1054640	1054647	0 %	75 %	0 %	25 %	479156652
23049	NC_021015	GCA	2	6	1054724	1054729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479156652
23050	NC_021015	CCT	2	6	1054844	1054849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479156652
23051	NC_021015	TAG	2	6	1054946	1054951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479156652
23052	NC_021015	TCT	2	6	1054961	1054966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23053	NC_021015	CAG	2	6	1055035	1055040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23054	NC_021015	GAA	2	6	1055061	1055066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23055	NC_021015	T	6	6	1055070	1055075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23056	NC_021015	GCCA	2	8	1055084	1055091	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23057	NC_021015	ATT	2	6	1055094	1055099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23058	NC_021015	TC	3	6	1055156	1055161	0 %	50 %	0 %	50 %	479156653
23059	NC_021015	CTT	2	6	1055179	1055184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479156653
23060	NC_021015	CTT	2	6	1055239	1055244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479156653
23061	NC_021015	AGA	2	6	1055361	1055366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479156653
23062	NC_021015	AAC	2	6	1055483	1055488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479156653
23063	NC_021015	CTGTC	2	10	1055513	1055522	0 %	40 %	20 %	40 %	479156653
23064	NC_021015	CTT	2	6	1055614	1055619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479156653
23065	NC_021015	GAC	2	6	1055674	1055679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479156653
23066	NC_021015	AAGG	2	8	1055717	1055724	50 %	0 %	50 %	0 %	479156653
23067	NC_021015	TCTT	2	8	1055728	1055735	0 %	75 %	0 %	25 %	479156653
23068	NC_021015	TGT	2	6	1055758	1055763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479156653
23069	NC_021015	ATA	2	6	1055784	1055789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479156653
23070	NC_021015	TCT	2	6	1055847	1055852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479156653
23071	NC_021015	AAG	2	6	1056059	1056064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479156653
23072	NC_021015	TGT	2	6	1056068	1056073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479156653
23073	NC_021015	T	6	6	1056095	1056100	0 %	100 %	0 %	0 %	479156653
23074	NC_021015	AGT	2	6	1056115	1056120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479156653
23075	NC_021015	ATC	2	6	1056141	1056146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479156653
23076	NC_021015	AAG	2	6	1056161	1056166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479156653
23077	NC_021015	TTC	2	6	1056275	1056280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479156653
23078	NC_021015	AAG	2	6	1056326	1056331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479156653
23079	NC_021015	CTTC	2	8	1056333	1056340	0 %	50 %	0 %	50 %	479156653
23080	NC_021015	TCG	2	6	1056342	1056347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479156653
23081	NC_021015	CGATAC	2	12	1056376	1056387	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479156653
23082	NC_021015	CTTTG	2	10	1056407	1056416	0 %	60 %	20 %	20 %	479156653
23083	NC_021015	A	6	6	1056437	1056442	100 %	0 %	0 %	0 %	479156653
23084	NC_021015	TTC	2	6	1056509	1056514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479156653
23085	NC_021015	T	6	6	1056590	1056595	0 %	100 %	0 %	0 %	479156653
23086	NC_021015	C	6	6	1056665	1056670	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23087	NC_021015	CTT	2	6	1056741	1056746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479156654
23088	NC_021015	CTT	2	6	1056792	1056797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479156654
23089	NC_021015	TGC	2	6	1056820	1056825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479156654
23090	NC_021015	GTT	2	6	1056949	1056954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479156654
23091	NC_021015	CAT	2	6	1056960	1056965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479156654
23092	NC_021015	CTT	2	6	1057062	1057067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479156654
23093	NC_021015	GAA	2	6	1057101	1057106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479156654
23094	NC_021015	CAC	2	6	1057220	1057225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479156654
23095	NC_021015	TCT	3	9	1057253	1057261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479156654
23096	NC_021015	CCA	2	6	1057270	1057275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479156654
23097	NC_021015	GCT	2	6	1057334	1057339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479156654
23098	NC_021015	AAG	2	6	1057471	1057476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479156654
23099	NC_021015	CAT	2	6	1057486	1057491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479156654
23100	NC_021015	CGT	2	6	1057509	1057514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479156654
23101	NC_021015	GTAT	2	8	1057527	1057534	25 %	50 %	25 %	0 %	479156654
23102	NC_021015	TGA	2	6	1057713	1057718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479156654
23103	NC_021015	AAC	2	6	1057732	1057737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479156654
23104	NC_021015	CTC	2	6	1057750	1057755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479156654
23105	NC_021015	CCAA	2	8	1057798	1057805	50 %	0 %	0 %	50 %	479156654
23106	NC_021015	ACG	2	6	1057876	1057881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479156654
23107	NC_021015	GAT	2	6	1057882	1057887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479156654
23108	NC_021015	GAT	2	6	1057948	1057953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479156654
23109	NC_021015	TGC	3	9	1058014	1058022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479156654
23110	NC_021015	TTG	2	6	1058073	1058078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479156654
23111	NC_021015	GTC	2	6	1058080	1058085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479156654
23112	NC_021015	TC	3	6	1058179	1058184	0 %	50 %	0 %	50 %	479156654
23113	NC_021015	ATCCAT	2	12	1058224	1058235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479156654
23114	NC_021015	GTAACT	2	12	1058264	1058275	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479156654
23115	NC_021015	CTTCT	2	10	1058289	1058298	0 %	60 %	0 %	40 %	479156654
23116	NC_021015	AGC	2	6	1058314	1058319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479156654
23117	NC_021015	TTG	2	6	1058340	1058345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479156654
23118	NC_021015	AAC	2	6	1058356	1058361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479156654
23119	NC_021015	TGC	2	6	1058410	1058415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479156654
23120	NC_021015	CTC	2	6	1058469	1058474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479156654
23121	NC_021015	CTA	2	6	1058520	1058525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479156654
23122	NC_021015	TCT	2	6	1058527	1058532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479156654
23123	NC_021015	TCC	2	6	1058550	1058555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23124	NC_021015	CTT	2	6	1058599	1058604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23125	NC_021015	CTTTC	2	10	1058622	1058631	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
23126	NC_021015	ACA	2	6	1058684	1058689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23127	NC_021015	AT	3	6	1058707	1058712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23128	NC_021015	TGTT	2	8	1058724	1058731	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23129	NC_021015	ATT	2	6	1058759	1058764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23133	NC_021015	CTT	2	6	1058986	1058991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479156655
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23139	NC_021015	ATC	2	6	1059277	1059282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479156655
23140	NC_021015	AAAG	2	8	1059315	1059322	75 %	0 %	25 %	0 %	479156655
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23143	NC_021015	A	6	6	1059571	1059576	100 %	0 %	0 %	0 %	479156655
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23147	NC_021015	T	6	6	1059654	1059659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23148	NC_021015	TTAT	2	8	1059726	1059733	25 %	75 %	0 %	0 %	479156656
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23150	NC_021015	TC	3	6	1059783	1059788	0 %	50 %	0 %	50 %	479156656
23151	NC_021015	CT	3	6	1059842	1059847	0 %	50 %	0 %	50 %	479156656
23152	NC_021015	CTT	2	6	1060020	1060025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479156656
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23155	NC_021015	TACGTA	2	12	1060143	1060154	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479156656
23156	NC_021015	TCTT	2	8	1060183	1060190	0 %	75 %	0 %	25 %	479156656
23157	NC_021015	CTG	2	6	1060208	1060213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479156656
23158	NC_021015	TAG	2	6	1060238	1060243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479156656
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23160	NC_021015	CCG	2	6	1060336	1060341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479156656
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23163	NC_021015	CT	4	8	1060427	1060434	0 %	50 %	0 %	50 %	479156656
23164	NC_021015	TCGCAA	2	12	1060435	1060446	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479156656
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23168	NC_021015	TCT	2	6	1060571	1060576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479156656
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23221	NC_021015	TA	3	6	1063004	1063009	50 %	50 %	0 %	0 %	479156656
23222	NC_021015	AAG	2	6	1063023	1063028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479156656
23223	NC_021015	TGT	3	9	1063050	1063058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479156656
23224	NC_021015	CTG	2	6	1063067	1063072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479156656
23225	NC_021015	CTG	2	6	1063094	1063099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479156656
23226	NC_021015	CTTC	2	8	1063156	1063163	0 %	50 %	0 %	50 %	479156656
23227	NC_021015	GCT	2	6	1063222	1063227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479156656
23228	NC_021015	GCT	2	6	1063255	1063260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479156656
23229	NC_021015	TCC	2	6	1063305	1063310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23230	NC_021015	TAAT	2	8	1063346	1063353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23231	NC_021015	ATT	2	6	1063476	1063481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23232	NC_021015	AGA	2	6	1063511	1063516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23233	NC_021015	T	6	6	1063564	1063569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23234	NC_021015	AAC	2	6	1063592	1063597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479156657
23235	NC_021015	GGT	2	6	1063613	1063618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479156657
23236	NC_021015	T	6	6	1063618	1063623	0 %	100 %	0 %	0 %	479156657
23237	NC_021015	TTG	2	6	1063635	1063640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479156657
23238	NC_021015	T	6	6	1063663	1063668	0 %	100 %	0 %	0 %	479156657
23239	NC_021015	GAA	2	6	1063776	1063781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479156657
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23242	NC_021015	CAG	2	6	1064172	1064177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479156657
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23246	NC_021015	TGC	2	6	1064419	1064424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479156657
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23266	NC_021015	CGC	2	6	1065293	1065298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479156658
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23270	NC_021015	TGC	2	6	1065566	1065571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479156658
23271	NC_021015	TCT	2	6	1065580	1065585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479156658
23272	NC_021015	TC	3	6	1065598	1065603	0 %	50 %	0 %	50 %	479156658
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23340	NC_021015	TTA	2	6	1068611	1068616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479156662
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23352	NC_021015	TGA	2	6	1068881	1068886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479156662
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23354	NC_021015	ACA	2	6	1069099	1069104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479156662
23355	NC_021015	CAA	2	6	1069109	1069114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479156662
23356	NC_021015	TCT	2	6	1069133	1069138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479156662
23357	NC_021015	TTC	2	6	1069159	1069164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479156662
23358	NC_021015	ATC	2	6	1069173	1069178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479156662
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23361	NC_021015	ATC	4	12	1069206	1069217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479156662
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