MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_021014	TA	3	6	943149	943154	50 %	50 %	0 %	0 %	479153196
19503	NC_021014	TCA	2	6	943195	943200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153196
19504	NC_021014	TGT	3	9	943228	943236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479153196
19505	NC_021014	CAG	2	6	943271	943276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153196
19506	NC_021014	CAAA	2	8	943296	943303	75 %	0 %	0 %	25 %	479153196
19507	NC_021014	CGG	2	6	943369	943374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153196
19508	NC_021014	TA	3	6	943398	943403	50 %	50 %	0 %	0 %	479153196
19509	NC_021014	ACA	2	6	943431	943436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479153196
19510	NC_021014	TCA	2	6	943458	943463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153196
19511	NC_021014	GAT	2	6	943478	943483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153196
19512	NC_021014	GCT	2	6	943487	943492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153196
19513	NC_021014	CT	3	6	943519	943524	0 %	50 %	0 %	50 %	479153196
19514	NC_021014	ACA	2	6	943550	943555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479153196
19515	NC_021014	TGCT	2	8	943629	943636	0 %	50 %	25 %	25 %	479153196
19516	NC_021014	CCTCT	2	10	943650	943659	0 %	40 %	0 %	60 %	479153196
19517	NC_021014	TGA	2	6	943669	943674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153196
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19519	NC_021014	CGG	2	6	943708	943713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153196
19520	NC_021014	GAG	2	6	943805	943810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153196
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19522	NC_021014	GA	3	6	943880	943885	50 %	0 %	50 %	0 %	479153196
19523	NC_021014	CAG	2	6	943958	943963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153196
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19535	NC_021014	GGAAA	2	10	944558	944567	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
19536	NC_021014	GCA	2	6	944578	944583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153197
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19538	NC_021014	CCGG	2	8	944706	944713	0 %	0 %	50 %	50 %	479153197
19539	NC_021014	ATA	2	6	944805	944810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153197
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19544	NC_021014	TAC	2	6	944986	944991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153197
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19548	NC_021014	GGAGCT	2	12	945118	945129	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479153197
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19555	NC_021014	T	6	6	945462	945467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19561	NC_021014	TTG	2	6	945885	945890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19566	NC_021014	GTA	2	6	946035	946040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19589	NC_021014	T	8	8	946928	946935	0 %	100 %	0 %	0 %	479153198
19590	NC_021014	AT	3	6	946984	946989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19591	NC_021014	TA	3	6	947185	947190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19592	NC_021014	A	6	6	947190	947195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19593	NC_021014	GCAG	2	8	947217	947224	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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19608	NC_021014	TTCTG	2	10	948548	948557	0 %	60 %	20 %	20 %	479153201
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19623	NC_021014	TTC	2	6	949441	949446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153202
19624	NC_021014	TCC	2	6	949454	949459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479153202
19625	NC_021014	CGG	2	6	949562	949567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153202
19626	NC_021014	TCT	3	9	949629	949637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153202
19627	NC_021014	TCC	2	6	949673	949678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479153202
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19636	NC_021014	CT	3	6	950218	950223	0 %	50 %	0 %	50 %	479153203
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19644	NC_021014	CCT	2	6	950463	950468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479153204
19645	NC_021014	CTCTTC	2	12	950491	950502	0 %	50 %	0 %	50 %	479153204
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19648	NC_021014	TTTC	2	8	950566	950573	0 %	75 %	0 %	25 %	479153204
19649	NC_021014	CTG	2	6	950574	950579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153204
19650	NC_021014	TGCT	2	8	950628	950635	0 %	50 %	25 %	25 %	479153204
19651	NC_021014	TCG	2	6	950678	950683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153204
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19655	NC_021014	A	6	6	950797	950802	100 %	0 %	0 %	0 %	479153205
19656	NC_021014	CTT	2	6	950810	950815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153205
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19677	NC_021014	TCT	2	6	951753	951758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153207
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19723	NC_021014	GATT	2	8	954373	954380	25 %	50 %	25 %	0 %	479153210
19724	NC_021014	A	6	6	954389	954394	100 %	0 %	0 %	0 %	479153210
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19727	NC_021014	CAA	2	6	954511	954516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19728	NC_021014	A	6	6	954515	954520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19729	NC_021014	TTC	2	6	954540	954545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19730	NC_021014	T	6	6	954610	954615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19731	NC_021014	T	6	6	954690	954695	0 %	100 %	0 %	0 %	479153211
19732	NC_021014	CAGAT	2	10	954765	954774	40 %	20 %	20 %	20 %	479153211
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19739	NC_021014	TCT	2	6	955108	955113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153211
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19867	NC_021014	GATCGG	2	12	961390	961401	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479153218
19868	NC_021014	TC	3	6	961436	961441	0 %	50 %	0 %	50 %	479153218
19869	NC_021014	GAT	2	6	961483	961488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153218
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19871	NC_021014	ATTCC	3	15	961518	961532	20 %	40 %	0 %	40 %	479153218
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19875	NC_021014	AC	3	6	961782	961787	50 %	0 %	0 %	50 %	479153218
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19878	NC_021014	CT	3	6	961861	961866	0 %	50 %	0 %	50 %	479153218
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19896	NC_021014	ACT	2	6	962758	962763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19899	NC_021014	CCTGG	2	10	962833	962842	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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19901	NC_021014	T	6	6	962858	962863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19902	NC_021014	TAT	2	6	962897	962902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19903	NC_021014	CATAC	2	10	962904	962913	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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19978	NC_021014	TCA	2	6	967317	967322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19980	NC_021014	GAA	2	6	967359	967364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19981	NC_021014	TCC	2	6	967417	967422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19982	NC_021014	TCA	2	6	967515	967520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19983	NC_021014	ATA	2	6	967594	967599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19984	NC_021014	TCTG	2	8	967604	967611	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19985	NC_021014	TCC	2	6	967633	967638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19986	NC_021014	CT	3	6	967681	967686	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19987	NC_021014	CTT	2	6	967809	967814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19988	NC_021014	AAG	2	6	967816	967821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19989	NC_021014	TCC	2	6	967832	967837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19990	NC_021014	CTTT	2	8	968045	968052	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19991	NC_021014	CCA	2	6	968053	968058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19992	NC_021014	T	7	7	968060	968066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19993	NC_021014	CCT	2	6	968079	968084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19994	NC_021014	T	7	7	968175	968181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19995	NC_021014	ACT	2	6	968203	968208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19996	NC_021014	TCA	2	6	968257	968262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19997	NC_021014	A	6	6	968269	968274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19998	NC_021014	TC	3	6	968300	968305	0 %	50 %	0 %	50 %	479153221
19999	NC_021014	T	7	7	968333	968339	0 %	100 %	0 %	0 %	479153221
20000	NC_021014	AAG	2	6	968365	968370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153221

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