MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_021014	GAA	2	6	895320	895325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153141
18502	NC_021014	T	6	6	895346	895351	0 %	100 %	0 %	0 %	479153141
18503	NC_021014	TA	3	6	895414	895419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18504	NC_021014	ATG	3	9	895454	895462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18505	NC_021014	TCT	2	6	895499	895504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18506	NC_021014	TA	3	6	895597	895602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18507	NC_021014	CAT	2	6	895616	895621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18508	NC_021014	GAAA	2	8	895673	895680	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18509	NC_021014	TAAAA	2	10	895699	895708	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18510	NC_021014	A	8	8	895705	895712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18511	NC_021014	A	7	7	895718	895724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18512	NC_021014	TAC	2	6	895738	895743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18513	NC_021014	TATT	2	8	895758	895765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18514	NC_021014	TAC	2	6	895849	895854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18515	NC_021014	TACA	2	8	895960	895967	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18516	NC_021014	TGA	2	6	896161	896166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18517	NC_021014	TGA	2	6	896173	896178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18518	NC_021014	ATC	2	6	896211	896216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18519	NC_021014	AGC	2	6	896225	896230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18520	NC_021014	GAA	2	6	896273	896278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18521	NC_021014	AT	3	6	896374	896379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18522	NC_021014	CAA	2	6	896394	896399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18523	NC_021014	AGA	2	6	896467	896472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18524	NC_021014	CCA	2	6	896475	896480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18525	NC_021014	CAGGC	2	10	896526	896535	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18526	NC_021014	GAA	2	6	896543	896548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18527	NC_021014	ATT	2	6	896577	896582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18528	NC_021014	ATG	2	6	896586	896591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18529	NC_021014	GTT	2	6	896594	896599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18530	NC_021014	GAA	2	6	896654	896659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18531	NC_021014	AGA	2	6	896766	896771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18532	NC_021014	CT	3	6	896813	896818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18533	NC_021014	ATG	2	6	896889	896894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18534	NC_021014	A	6	6	896967	896972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18535	NC_021014	TCC	2	6	897045	897050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18536	NC_021014	TGA	2	6	897102	897107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153142
18537	NC_021014	TCT	2	6	897108	897113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153142
18538	NC_021014	TGC	2	6	897222	897227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153142
18539	NC_021014	AT	3	6	897366	897371	50 %	50 %	0 %	0 %	479153142
18540	NC_021014	AGA	2	6	897441	897446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153142
18541	NC_021014	GGT	2	6	897472	897477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479153142
18542	NC_021014	TAC	2	6	897579	897584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153142
18543	NC_021014	ATA	2	6	897626	897631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153142
18544	NC_021014	CAA	2	6	897642	897647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479153142
18545	NC_021014	ATT	2	6	897659	897664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153142
18546	NC_021014	TTC	2	6	897697	897702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153142
18547	NC_021014	CAG	2	6	897715	897720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153142
18548	NC_021014	GAT	2	6	897787	897792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153142
18549	NC_021014	AT	3	6	897798	897803	50 %	50 %	0 %	0 %	479153142
18550	NC_021014	CTG	2	6	897846	897851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153142
18551	NC_021014	TC	3	6	897871	897876	0 %	50 %	0 %	50 %	479153142
18552	NC_021014	CCAG	2	8	898118	898125	25 %	0 %	25 %	50 %	479153142
18553	NC_021014	AAC	2	6	898236	898241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479153142
18554	NC_021014	GTAT	2	8	898289	898296	25 %	50 %	25 %	0 %	479153142
18555	NC_021014	GTG	2	6	898300	898305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479153142
18556	NC_021014	AGC	2	6	898341	898346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153142
18557	NC_021014	TAT	2	6	898375	898380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153142
18558	NC_021014	TGCC	2	8	898476	898483	0 %	25 %	25 %	50 %	479153142
18559	NC_021014	GCA	2	6	898552	898557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153142
18560	NC_021014	AAAC	2	8	898586	898593	75 %	0 %	0 %	25 %	479153142
18561	NC_021014	AGG	2	6	898628	898633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18562	NC_021014	GTCATT	2	12	898654	898665	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479153143
18563	NC_021014	ACC	3	9	898693	898701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479153143
18564	NC_021014	TGT	2	6	898785	898790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479153143
18565	NC_021014	GCC	2	6	898847	898852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479153143
18566	NC_021014	TCG	2	6	898875	898880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153143
18567	NC_021014	TCT	2	6	898896	898901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153143
18568	NC_021014	GAT	2	6	898947	898952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153143
18569	NC_021014	GAT	2	6	898963	898968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153143
18570	NC_021014	GAA	2	6	898975	898980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153143
18571	NC_021014	ATC	2	6	899107	899112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153143
18572	NC_021014	ATC	2	6	899152	899157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153143
18573	NC_021014	ATG	2	6	899194	899199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153143
18574	NC_021014	AGA	2	6	899205	899210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153143
18575	NC_021014	GAT	2	6	899254	899259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153143
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18577	NC_021014	AGA	3	9	899319	899327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153143
18578	NC_021014	GAA	2	6	899359	899364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153143
18579	NC_021014	GCA	2	6	899414	899419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153143
18580	NC_021014	TCA	2	6	899459	899464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18581	NC_021014	AGG	2	6	899466	899471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18582	NC_021014	A	6	6	899496	899501	100 %	0 %	0 %	0 %	479153144
18583	NC_021014	CTT	3	9	899536	899544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153144
18584	NC_021014	GAT	2	6	899574	899579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153144
18585	NC_021014	A	7	7	899613	899619	100 %	0 %	0 %	0 %	479153144
18586	NC_021014	TGA	2	6	899631	899636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153144
18587	NC_021014	CA	3	6	899658	899663	50 %	0 %	0 %	50 %	479153144
18588	NC_021014	ACC	2	6	899667	899672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479153144
18589	NC_021014	TGCA	2	8	899678	899685	25 %	25 %	25 %	25 %	479153144
18590	NC_021014	ATC	2	6	899854	899859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153145
18591	NC_021014	ATT	2	6	899894	899899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153145
18592	NC_021014	GCT	2	6	899904	899909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153145
18593	NC_021014	TTC	2	6	899965	899970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153145
18594	NC_021014	TGC	2	6	899988	899993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153145
18595	NC_021014	ATC	2	6	900046	900051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153145
18596	NC_021014	T	6	6	900061	900066	0 %	100 %	0 %	0 %	479153145
18597	NC_021014	T	6	6	900073	900078	0 %	100 %	0 %	0 %	479153145
18598	NC_021014	ATC	2	6	900244	900249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153145
18599	NC_021014	CAT	2	6	900282	900287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153145
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18601	NC_021014	GAT	2	6	900388	900393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153145
18602	NC_021014	CAG	2	6	900400	900405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153145
18603	NC_021014	AAC	2	6	900406	900411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479153145
18604	NC_021014	ATG	2	6	900485	900490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153145
18605	NC_021014	CTG	3	9	900577	900585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153145
18606	NC_021014	TGC	2	6	900652	900657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153145
18607	NC_021014	TCA	2	6	900689	900694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153145
18608	NC_021014	TATGGG	2	12	900783	900794	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	479153145
18609	NC_021014	ATA	2	6	900830	900835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153145
18610	NC_021014	A	6	6	900847	900852	100 %	0 %	0 %	0 %	479153145
18611	NC_021014	A	6	6	900914	900919	100 %	0 %	0 %	0 %	479153146
18612	NC_021014	AAC	2	6	900992	900997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479153146
18613	NC_021014	CGT	2	6	901065	901070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153146
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18617	NC_021014	AGA	2	6	901226	901231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153146
18618	NC_021014	GC	3	6	901235	901240	0 %	0 %	50 %	50 %	479153146
18619	NC_021014	TGT	2	6	901265	901270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479153146
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18621	NC_021014	CTT	2	6	901539	901544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153146
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18623	NC_021014	ATG	2	6	901570	901575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153146
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18995	NC_021014	CTCCGT	2	12	919058	919069	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18996	NC_021014	TA	3	6	919096	919101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18997	NC_021014	T	6	6	919175	919180	0 %	100 %	0 %	0 %	479153171
18998	NC_021014	T	6	6	919218	919223	0 %	100 %	0 %	0 %	479153171
18999	NC_021014	CAAT	2	8	919264	919271	50 %	25 %	0 %	25 %	479153171
19000	NC_021014	TCA	2	6	919309	919314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153171

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