MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_021014	AGA	2	6	821495	821500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17002	NC_021014	AGA	2	6	821543	821548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17003	NC_021014	TGA	2	6	821630	821635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17004	NC_021014	GAA	2	6	821664	821669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17005	NC_021014	AGA	2	6	821687	821692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17006	NC_021014	CTTT	2	8	821703	821710	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17007	NC_021014	TATG	2	8	821711	821718	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17008	NC_021014	ATA	2	6	821773	821778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17009	NC_021014	TAA	2	6	821807	821812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17010	NC_021014	TAA	2	6	821828	821833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17011	NC_021014	TAA	2	6	821888	821893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17012	NC_021014	AGT	2	6	821927	821932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17013	NC_021014	ATT	2	6	822018	822023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17014	NC_021014	GCA	2	6	822030	822035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17015	NC_021014	A	7	7	822137	822143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17016	NC_021014	CAA	2	6	822239	822244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17017	NC_021014	CAT	2	6	822255	822260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17018	NC_021014	CAG	2	6	822396	822401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153081
17019	NC_021014	AAG	2	6	822441	822446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153081
17020	NC_021014	GCTG	2	8	822461	822468	0 %	25 %	50 %	25 %	479153081
17021	NC_021014	AAG	2	6	822471	822476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153081
17022	NC_021014	ATT	2	6	822504	822509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153081
17023	NC_021014	TGA	2	6	822520	822525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153081
17024	NC_021014	ACAT	2	8	822547	822554	50 %	25 %	0 %	25 %	479153081
17025	NC_021014	GTA	2	6	822569	822574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153081
17026	NC_021014	AGA	2	6	822640	822645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153081
17027	NC_021014	AAAG	2	8	822694	822701	75 %	0 %	25 %	0 %	479153081
17028	NC_021014	CAG	2	6	822711	822716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153081
17029	NC_021014	CTTA	2	8	822725	822732	25 %	50 %	0 %	25 %	479153081
17030	NC_021014	GCA	2	6	822738	822743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153081
17031	NC_021014	CAG	3	9	822810	822818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153081
17032	NC_021014	TCC	2	6	823013	823018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479153081
17033	NC_021014	GAA	2	6	823123	823128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153081
17034	NC_021014	CAG	3	9	823152	823160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153081
17035	NC_021014	GGAAA	2	10	823203	823212	60 %	0 %	40 %	0 %	479153081
17036	NC_021014	CAA	2	6	823279	823284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479153081
17037	NC_021014	TTC	2	6	823300	823305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153081
17038	NC_021014	GAAA	2	8	823323	823330	75 %	0 %	25 %	0 %	479153081
17039	NC_021014	AAT	2	6	823394	823399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17040	NC_021014	CTT	2	6	823416	823421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17041	NC_021014	T	7	7	823439	823445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17042	NC_021014	A	6	6	823463	823468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17043	NC_021014	GGCT	2	8	823492	823499	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17044	NC_021014	TCT	2	6	823509	823514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17045	NC_021014	ATA	2	6	823559	823564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17046	NC_021014	AGA	2	6	823611	823616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17047	NC_021014	TCA	2	6	823624	823629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17048	NC_021014	AGA	2	6	823647	823652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17049	NC_021014	AGA	2	6	823701	823706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17050	NC_021014	AG	3	6	823720	823725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17051	NC_021014	GAA	2	6	823756	823761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17052	NC_021014	AGATGA	2	12	823782	823793	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17053	NC_021014	AGA	2	6	823860	823865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17054	NC_021014	TCT	2	6	823963	823968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17055	NC_021014	AGC	2	6	823992	823997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17056	NC_021014	AT	3	6	824115	824120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17057	NC_021014	TCT	2	6	824125	824130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17058	NC_021014	GAA	2	6	824168	824173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17059	NC_021014	T	6	6	824199	824204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17060	NC_021014	T	6	6	824238	824243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17061	NC_021014	AGA	3	9	824246	824254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17062	NC_021014	ACAG	2	8	824255	824262	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17063	NC_021014	GAT	2	6	824304	824309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17064	NC_021014	TCTA	2	8	824343	824350	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17065	NC_021014	TA	3	6	824349	824354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17066	NC_021014	A	6	6	824360	824365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17067	NC_021014	CAG	2	6	824446	824451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17068	NC_021014	AAT	3	9	824463	824471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17069	NC_021014	AG	3	6	824477	824482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17070	NC_021014	CAG	2	6	824494	824499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17071	NC_021014	GTT	2	6	824517	824522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17072	NC_021014	CAG	2	6	824552	824557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17073	NC_021014	GAT	2	6	824742	824747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17076	NC_021014	TTCT	2	8	824827	824834	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17077	NC_021014	AAGA	2	8	824849	824856	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17078	NC_021014	CAGT	2	8	824920	824927	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17079	NC_021014	ATGG	2	8	825084	825091	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17080	NC_021014	A	6	6	825182	825187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17081	NC_021014	GAT	2	6	825188	825193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17083	NC_021014	TA	3	6	825219	825224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17084	NC_021014	ACA	2	6	825273	825278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17085	NC_021014	CAAAG	2	10	825319	825328	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
17086	NC_021014	A	6	6	825417	825422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17087	NC_021014	TAC	2	6	825473	825478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17094	NC_021014	TGT	2	6	825883	825888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479153082
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17097	NC_021014	ATAC	2	8	826023	826030	50 %	25 %	0 %	25 %	479153082
17098	NC_021014	TGGA	2	8	826063	826070	25 %	25 %	50 %	0 %	479153082
17099	NC_021014	GAA	2	6	826095	826100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153082
17100	NC_021014	GGGC	2	8	826180	826187	0 %	0 %	75 %	25 %	479153082
17101	NC_021014	CT	3	6	826191	826196	0 %	50 %	0 %	50 %	479153082
17102	NC_021014	CAA	2	6	826270	826275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479153082
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17105	NC_021014	TAT	2	6	826570	826575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153082
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17114	NC_021014	TTA	2	6	826945	826950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153082
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17119	NC_021014	AGG	2	6	827472	827477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153082
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17125	NC_021014	GT	3	6	827857	827862	0 %	50 %	50 %	0 %	479153082
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17127	NC_021014	GCT	2	6	827951	827956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153082
17128	NC_021014	TGA	2	6	827976	827981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153082
17129	NC_021014	TCCG	2	8	828084	828091	0 %	25 %	25 %	50 %	479153082
17130	NC_021014	AGGA	2	8	828099	828106	50 %	0 %	50 %	0 %	479153082
17131	NC_021014	A	6	6	828125	828130	100 %	0 %	0 %	0 %	479153082
17132	NC_021014	TCC	2	6	828182	828187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479153082
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17138	NC_021014	GAAAG	2	10	828451	828460	60 %	0 %	40 %	0 %	479153082
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17142	NC_021014	CTG	2	6	828842	828847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153083
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17146	NC_021014	A	7	7	829013	829019	100 %	0 %	0 %	0 %	479153083
17147	NC_021014	CT	3	6	829027	829032	0 %	50 %	0 %	50 %	479153083
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17152	NC_021014	CTGG	2	8	829112	829119	0 %	25 %	50 %	25 %	479153083
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17155	NC_021014	GCT	2	6	829415	829420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17167	NC_021014	A	6	6	830166	830171	100 %	0 %	0 %	0 %	479153084
17168	NC_021014	TA	3	6	830215	830220	50 %	50 %	0 %	0 %	479153084
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17172	NC_021014	CAT	2	6	830470	830475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17208	NC_021014	A	6	6	832740	832745	100 %	0 %	0 %	0 %	479153086
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17222	NC_021014	GAT	2	6	833284	833289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17225	NC_021014	TGCTCT	2	12	833338	833349	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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17228	NC_021014	ATG	2	6	833462	833467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17229	NC_021014	AGGG	2	8	833536	833543	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
17230	NC_021014	CTT	2	6	833548	833553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17231	NC_021014	GCT	2	6	833579	833584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17232	NC_021014	GT	3	6	833601	833606	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17233	NC_021014	GAGGC	2	10	833613	833622	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17234	NC_021014	TTG	2	6	833631	833636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17235	NC_021014	ATG	2	6	833648	833653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17236	NC_021014	CAT	2	6	833713	833718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17237	NC_021014	CGG	2	6	833815	833820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17238	NC_021014	TGCA	2	8	833916	833923	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17239	NC_021014	CTT	2	6	833963	833968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17240	NC_021014	A	6	6	833990	833995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17241	NC_021014	TGA	2	6	834057	834062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17242	NC_021014	GAAA	2	8	834069	834076	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17243	NC_021014	GAAA	2	8	834145	834152	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17244	NC_021014	A	6	6	834167	834172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17245	NC_021014	CAGG	2	8	834292	834299	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17246	NC_021014	A	6	6	834315	834320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17247	NC_021014	GAT	2	6	834339	834344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17248	NC_021014	ACAG	2	8	834378	834385	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17249	NC_021014	GGC	2	6	834461	834466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17250	NC_021014	CTT	2	6	834682	834687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17251	NC_021014	AGA	2	6	834732	834737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17252	NC_021014	A	6	6	834796	834801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17253	NC_021014	GTTA	2	8	834822	834829	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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17255	NC_021014	TGGG	2	8	834944	834951	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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