MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_021014	ATGA	2	8	752112	752119	50 %	25 %	25 %	0 %	479153015
15502	NC_021014	GCA	2	6	752125	752130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153015
15503	NC_021014	ACC	2	6	752243	752248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479153015
15504	NC_021014	T	6	6	752254	752259	0 %	100 %	0 %	0 %	479153015
15505	NC_021014	GAAAG	2	10	752292	752301	60 %	0 %	40 %	0 %	479153015
15506	NC_021014	ATATGA	2	12	752319	752330	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479153015
15507	NC_021014	G	6	6	752362	752367	0 %	0 %	100 %	0 %	479153016
15508	NC_021014	ATG	2	6	752378	752383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153016
15509	NC_021014	GGA	2	6	752404	752409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153016
15510	NC_021014	GGT	2	6	752425	752430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479153016
15511	NC_021014	CGG	2	6	752456	752461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479153016
15512	NC_021014	TTA	2	6	752517	752522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153016
15513	NC_021014	AT	3	6	752535	752540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15514	NC_021014	TA	3	6	752546	752551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15515	NC_021014	GTTT	2	8	752555	752562	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15516	NC_021014	TCT	2	6	752586	752591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15517	NC_021014	T	6	6	752593	752598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15518	NC_021014	GAA	2	6	752623	752628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153017
15519	NC_021014	GT	3	6	752631	752636	0 %	50 %	50 %	0 %	479153017
15520	NC_021014	TCCA	2	8	752641	752648	25 %	25 %	0 %	50 %	479153017
15521	NC_021014	AAG	2	6	752657	752662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153017
15522	NC_021014	A	7	7	752689	752695	100 %	0 %	0 %	0 %	479153017
15523	NC_021014	TGA	3	9	752721	752729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153017
15524	NC_021014	AAGC	2	8	752777	752784	50 %	0 %	25 %	25 %	479153017
15525	NC_021014	AAT	2	6	752920	752925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15526	NC_021014	GCA	2	6	752944	752949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153018
15527	NC_021014	TGC	2	6	752954	752959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153018
15528	NC_021014	AG	3	6	753032	753037	50 %	0 %	50 %	0 %	479153018
15529	NC_021014	AT	3	6	753045	753050	50 %	50 %	0 %	0 %	479153018
15530	NC_021014	TAT	2	6	753087	753092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153018
15531	NC_021014	ATA	2	6	753145	753150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153018
15532	NC_021014	GAT	2	6	753157	753162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153018
15533	NC_021014	A	6	6	753190	753195	100 %	0 %	0 %	0 %	479153018
15534	NC_021014	AGA	2	6	753243	753248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153018
15535	NC_021014	A	6	6	753305	753310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15536	NC_021014	AAC	2	6	753401	753406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479153019
15537	NC_021014	GAAA	2	8	753469	753476	75 %	0 %	25 %	0 %	479153019
15538	NC_021014	AGC	2	6	753496	753501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153019
15539	NC_021014	AC	3	6	753583	753588	50 %	0 %	0 %	50 %	479153019
15540	NC_021014	ATG	2	6	753637	753642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153019
15541	NC_021014	AAG	2	6	753650	753655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153019
15542	NC_021014	GAA	2	6	753666	753671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153019
15543	NC_021014	AGC	2	6	753680	753685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153019
15544	NC_021014	TAT	2	6	753726	753731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153019
15545	NC_021014	TTATG	2	10	753827	753836	20 %	60 %	20 %	0 %	479153019
15546	NC_021014	AC	3	6	753859	753864	50 %	0 %	0 %	50 %	479153019
15547	NC_021014	ATTG	2	8	753893	753900	25 %	50 %	25 %	0 %	479153019
15548	NC_021014	ATC	2	6	753901	753906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153019
15549	NC_021014	TGGA	2	8	753973	753980	25 %	25 %	50 %	0 %	479153019
15550	NC_021014	T	6	6	753987	753992	0 %	100 %	0 %	0 %	479153019
15551	NC_021014	ATGT	2	8	754089	754096	25 %	50 %	25 %	0 %	479153019
15552	NC_021014	ATG	2	6	754116	754121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153019
15553	NC_021014	GAA	2	6	754254	754259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153019
15554	NC_021014	A	6	6	754293	754298	100 %	0 %	0 %	0 %	479153019
15555	NC_021014	CTT	2	6	754384	754389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153020
15556	NC_021014	GAT	2	6	754398	754403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153020
15557	NC_021014	AAAT	2	8	754442	754449	75 %	25 %	0 %	0 %	479153020
15558	NC_021014	GAA	2	6	754482	754487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153020
15559	NC_021014	A	6	6	754593	754598	100 %	0 %	0 %	0 %	479153020
15560	NC_021014	ATT	2	6	754627	754632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153020
15561	NC_021014	A	6	6	754689	754694	100 %	0 %	0 %	0 %	479153020
15562	NC_021014	AAG	2	6	754808	754813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153021
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15564	NC_021014	T	6	6	754848	754853	0 %	100 %	0 %	0 %	479153021
15565	NC_021014	CTG	2	6	754889	754894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153021
15566	NC_021014	GTG	2	6	754896	754901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479153021
15567	NC_021014	GA	3	6	754945	754950	50 %	0 %	50 %	0 %	479153021
15568	NC_021014	TTG	3	9	754951	754959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479153021
15569	NC_021014	TTA	2	6	755030	755035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15570	NC_021014	AGAA	2	8	755174	755181	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15571	NC_021014	TTA	2	6	755218	755223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15572	NC_021014	GAG	2	6	755282	755287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15573	NC_021014	ATT	2	6	755355	755360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153022
15574	NC_021014	AT	3	6	755368	755373	50 %	50 %	0 %	0 %	479153022
15575	NC_021014	TGAT	2	8	755456	755463	25 %	50 %	25 %	0 %	479153022
15576	NC_021014	ATG	2	6	755522	755527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153022
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15581	NC_021014	TA	3	6	755666	755671	50 %	50 %	0 %	0 %	479153022
15582	NC_021014	GAT	2	6	755680	755685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153022
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15584	NC_021014	T	8	8	755773	755780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15585	NC_021014	TCTT	2	8	755782	755789	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15586	NC_021014	N	291	291	755794	756084	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15587	NC_021014	GAA	2	6	756088	756093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15588	NC_021014	TTG	2	6	756235	756240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15589	NC_021014	AT	3	6	756247	756252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15590	NC_021014	TAT	2	6	756279	756284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15591	NC_021014	TGA	2	6	756339	756344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15592	NC_021014	GAA	2	6	756370	756375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15593	NC_021014	AG	3	6	756378	756383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15594	NC_021014	ATAA	2	8	756406	756413	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15595	NC_021014	GAA	2	6	756522	756527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15596	NC_021014	CAATT	2	10	756555	756564	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15597	NC_021014	AAT	2	6	756606	756611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15598	NC_021014	ATA	2	6	756615	756620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15599	NC_021014	TAA	2	6	756621	756626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15600	NC_021014	AATC	2	8	756660	756667	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15601	NC_021014	T	6	6	756682	756687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15602	NC_021014	TCA	2	6	756703	756708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15603	NC_021014	TATG	2	8	756719	756726	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15604	NC_021014	TGTA	2	8	756756	756763	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15605	NC_021014	CGG	2	6	756799	756804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15606	NC_021014	GCA	2	6	756849	756854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15607	NC_021014	TAT	2	6	757057	757062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15608	NC_021014	CCG	2	6	757098	757103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15609	NC_021014	TGC	2	6	757190	757195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479153023
15610	NC_021014	CA	3	6	757199	757204	50 %	0 %	0 %	50 %	479153023
15611	NC_021014	CCGG	2	8	757221	757228	0 %	0 %	50 %	50 %	479153023
15612	NC_021014	GCA	2	6	757261	757266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153023
15613	NC_021014	A	6	6	757351	757356	100 %	0 %	0 %	0 %	479153023
15614	NC_021014	AGC	2	6	757418	757423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153023
15615	NC_021014	GAA	2	6	757603	757608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153023
15616	NC_021014	GAA	2	6	757738	757743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479153023
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15619	NC_021014	ATT	2	6	757769	757774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479153023
15620	NC_021014	TGA	2	6	757802	757807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153023
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15622	NC_021014	TAA	2	6	757878	757883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479153023
15623	NC_021014	CAGT	2	8	757900	757907	25 %	25 %	25 %	25 %	479153023
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15625	NC_021014	ATC	2	6	757950	757955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153023
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15646	NC_021014	ACA	2	6	758952	758957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15996	NC_021014	CAG	2	6	773720	773725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153039
15997	NC_021014	ACG	2	6	773726	773731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153039
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16000	NC_021014	ATC	2	6	773878	773883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479153039

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