MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_021014	AT	3	6	729665	729670	50 %	50 %	0 %	0 %	479152983
15002	NC_021014	AGA	2	6	729791	729796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152983
15003	NC_021014	TGA	2	6	729903	729908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152984
15004	NC_021014	ATTG	2	8	729954	729961	25 %	50 %	25 %	0 %	479152984
15005	NC_021014	TTTCA	2	10	730054	730063	20 %	60 %	0 %	20 %	479152984
15006	NC_021014	AAG	2	6	730064	730069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152984
15007	NC_021014	TGA	2	6	730352	730357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15008	NC_021014	AT	3	6	730416	730421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15009	NC_021014	ATT	2	6	730438	730443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15010	NC_021014	TAC	3	9	730445	730453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15011	NC_021014	AGCA	2	8	730465	730472	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15012	NC_021014	CTT	2	6	730476	730481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15013	NC_021014	T	8	8	730480	730487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15014	NC_021014	CAGA	2	8	730545	730552	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15015	NC_021014	CGA	2	6	730560	730565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15016	NC_021014	ATG	2	6	730662	730667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152985
15017	NC_021014	AAT	2	6	730673	730678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152985
15018	NC_021014	TA	4	8	730695	730702	50 %	50 %	0 %	0 %	479152985
15019	NC_021014	T	6	6	730743	730748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15020	NC_021014	ATT	2	6	730753	730758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_021014	A	6	6	730810	730815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15022	NC_021014	TAT	2	6	730831	730836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_021014	A	6	6	730886	730891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_021014	GGA	2	6	730893	730898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_021014	TATGT	2	10	731014	731023	20 %	60 %	20 %	0 %	479152986
15026	NC_021014	AT	3	6	731036	731041	50 %	50 %	0 %	0 %	479152986
15027	NC_021014	GAA	2	6	731071	731076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152986
15028	NC_021014	AGGG	2	8	731105	731112	25 %	0 %	75 %	0 %	479152986
15029	NC_021014	ATAA	2	8	731113	731120	75 %	25 %	0 %	0 %	479152986
15030	NC_021014	ATA	2	6	731233	731238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152987
15031	NC_021014	ATG	2	6	731419	731424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152987
15032	NC_021014	GAAA	2	8	731429	731436	75 %	0 %	25 %	0 %	479152987
15033	NC_021014	AGT	2	6	731465	731470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152987
15034	NC_021014	TGA	2	6	731489	731494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152987
15035	NC_021014	ATT	2	6	731502	731507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152987
15036	NC_021014	GAT	2	6	731538	731543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152987
15037	NC_021014	ATA	2	6	731579	731584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152988
15038	NC_021014	GAT	2	6	731602	731607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152988
15039	NC_021014	GGAT	2	8	731632	731639	25 %	25 %	50 %	0 %	479152988
15040	NC_021014	GAC	2	6	731659	731664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152988
15041	NC_021014	GTTG	2	8	731676	731683	0 %	50 %	50 %	0 %	479152988
15042	NC_021014	AAGT	2	8	731686	731693	50 %	25 %	25 %	0 %	479152988
15043	NC_021014	AGA	2	6	731698	731703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152988
15044	NC_021014	ACAGA	2	10	731738	731747	60 %	0 %	20 %	20 %	479152988
15045	NC_021014	TTAC	2	8	731783	731790	25 %	50 %	0 %	25 %	479152988
15046	NC_021014	AT	3	6	731827	731832	50 %	50 %	0 %	0 %	479152988
15047	NC_021014	AAT	2	6	731887	731892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152988
15048	NC_021014	TAT	2	6	732008	732013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152988
15049	NC_021014	TGAT	2	8	732023	732030	25 %	50 %	25 %	0 %	479152988
15050	NC_021014	CAG	2	6	732033	732038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15051	NC_021014	AATC	2	8	732045	732052	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15052	NC_021014	GATA	2	8	732103	732110	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15053	NC_021014	GTG	2	6	732182	732187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15054	NC_021014	ATTC	2	8	732260	732267	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15055	NC_021014	ATC	2	6	732279	732284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15056	NC_021014	A	6	6	732310	732315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15057	NC_021014	TGA	2	6	732316	732321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15058	NC_021014	ATT	2	6	732329	732334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15059	NC_021014	TAAA	2	8	732336	732343	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15060	NC_021014	ATT	2	6	732362	732367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15061	NC_021014	ATA	3	9	732368	732376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15062	NC_021014	ATT	2	6	732380	732385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15063	NC_021014	TAT	2	6	732388	732393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_021014	CAC	2	6	732420	732425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479152989
15065	NC_021014	AG	3	6	732428	732433	50 %	0 %	50 %	0 %	479152989
15066	NC_021014	CTT	2	6	732444	732449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152989
15067	NC_021014	TGT	2	6	732521	732526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152989
15068	NC_021014	ATT	2	6	732619	732624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15069	NC_021014	AGA	2	6	732629	732634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15070	NC_021014	ATT	2	6	732640	732645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15071	NC_021014	A	7	7	732646	732652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15072	NC_021014	TTG	2	6	732675	732680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15073	NC_021014	AAG	2	6	732699	732704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15074	NC_021014	GAA	2	6	732735	732740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15075	NC_021014	A	6	6	732785	732790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15076	NC_021014	TATG	2	8	732807	732814	25 %	50 %	25 %	0 %	479152990
15077	NC_021014	ATT	2	6	732831	732836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152990
15078	NC_021014	TGC	2	6	732914	732919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152990
15079	NC_021014	TA	3	6	732940	732945	50 %	50 %	0 %	0 %	479152990
15080	NC_021014	TGT	2	6	732968	732973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152990
15081	NC_021014	TCATT	2	10	733007	733016	20 %	60 %	0 %	20 %	479152990
15082	NC_021014	CAGGA	2	10	733069	733078	40 %	0 %	40 %	20 %	479152990
15083	NC_021014	AGA	2	6	733118	733123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152990
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15085	NC_021014	ACA	2	6	733209	733214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15086	NC_021014	AT	3	6	733218	733223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15087	NC_021014	AT	3	6	733235	733240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15088	NC_021014	AGG	2	6	733246	733251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15089	NC_021014	ATGT	2	8	733268	733275	25 %	50 %	25 %	0 %	479152991
15090	NC_021014	ATG	2	6	733295	733300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152991
15091	NC_021014	GGT	2	6	733321	733326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152991
15092	NC_021014	GGA	2	6	733347	733352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152991
15093	NC_021014	AGA	2	6	733359	733364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152991
15094	NC_021014	T	6	6	733482	733487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15095	NC_021014	TGA	2	6	733502	733507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15096	NC_021014	AAT	2	6	733518	733523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15097	NC_021014	TAAG	2	8	733554	733561	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15098	NC_021014	GAAG	2	8	733651	733658	50 %	0 %	50 %	0 %	479152992
15099	NC_021014	GCA	2	6	733676	733681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152992
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15101	NC_021014	TAC	2	6	733936	733941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152992
15102	NC_021014	AGC	2	6	733948	733953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152992
15103	NC_021014	TGG	2	6	733962	733967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152992
15104	NC_021014	TC	3	6	733987	733992	0 %	50 %	0 %	50 %	479152992
15105	NC_021014	CTT	2	6	733995	734000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152992
15106	NC_021014	ATG	2	6	734150	734155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152992
15107	NC_021014	CGT	2	6	734207	734212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152992
15108	NC_021014	AGA	2	6	734224	734229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152992
15109	NC_021014	TTACA	2	10	734272	734281	40 %	40 %	0 %	20 %	479152992
15110	NC_021014	AAG	2	6	734311	734316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152992
15111	NC_021014	AAAT	2	8	734351	734358	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15112	NC_021014	TAA	2	6	734372	734377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15113	NC_021014	AGG	2	6	734399	734404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15114	NC_021014	AAT	2	6	734437	734442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152993
15115	NC_021014	GTA	2	6	734521	734526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152993
15116	NC_021014	TAT	2	6	734619	734624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152993
15117	NC_021014	GAA	2	6	734649	734654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152993
15118	NC_021014	CAG	2	6	734668	734673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152993
15119	NC_021014	G	8	8	734718	734725	0 %	0 %	100 %	0 %	479152993
15120	NC_021014	T	6	6	734739	734744	0 %	100 %	0 %	0 %	479152994
15121	NC_021014	AGA	2	6	734780	734785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152994
15122	NC_021014	TGA	2	6	734798	734803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152994
15123	NC_021014	CTG	2	6	734811	734816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152994
15124	NC_021014	GTAC	2	8	734820	734827	25 %	25 %	25 %	25 %	479152994
15125	NC_021014	AGGA	2	8	734842	734849	50 %	0 %	50 %	0 %	479152994
15126	NC_021014	GCA	2	6	734879	734884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152994
15127	NC_021014	GAA	2	6	734909	734914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152994
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15139	NC_021014	TCA	2	6	735282	735287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152995
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15183	NC_021014	AAT	2	6	737575	737580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15221	NC_021014	TAA	2	6	739032	739037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15222	NC_021014	A	7	7	739131	739137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15224	NC_021014	GT	4	8	739227	739234	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15225	NC_021014	TGAAA	2	10	739277	739286	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15226	NC_021014	GAA	2	6	739303	739308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15227	NC_021014	ATT	2	6	739326	739331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15228	NC_021014	T	7	7	739366	739372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15229	NC_021014	GAT	2	6	739396	739401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15230	NC_021014	AAAT	2	8	739441	739448	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15231	NC_021014	TG	3	6	739464	739469	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15232	NC_021014	TGG	2	6	739495	739500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15233	NC_021014	AACC	2	8	739524	739531	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15234	NC_021014	GATG	2	8	739536	739543	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15235	NC_021014	CAT	2	6	739635	739640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15236	NC_021014	ATT	2	6	739660	739665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15237	NC_021014	AGTTT	2	10	739731	739740	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15238	NC_021014	TGT	2	6	739770	739775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15239	NC_021014	TA	3	6	739797	739802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15240	NC_021014	A	6	6	739864	739869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15241	NC_021014	AAG	2	6	739877	739882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15242	NC_021014	TAT	2	6	739951	739956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15243	NC_021014	TTC	2	6	740039	740044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479153000
15244	NC_021014	GAT	2	6	740050	740055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479153000
15245	NC_021014	A	7	7	740062	740068	100 %	0 %	0 %	0 %	479153000
15246	NC_021014	ACG	2	6	740170	740175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479153000
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15248	NC_021014	GGA	2	6	740299	740304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479153000
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