MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_021014	ATTT	2	8	703962	703969	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14502	NC_021014	GGA	2	6	704019	704024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14503	NC_021014	TCT	2	6	704049	704054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14504	NC_021014	TCC	2	6	704086	704091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14505	NC_021014	AGA	2	6	704124	704129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14506	NC_021014	TCT	2	6	704175	704180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14507	NC_021014	TAT	2	6	704254	704259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14508	NC_021014	CCCA	2	8	704299	704306	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14509	NC_021014	T	6	6	704404	704409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14510	NC_021014	TA	3	6	704452	704457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14511	NC_021014	GA	3	6	704504	704509	50 %	0 %	50 %	0 %	479152954
14512	NC_021014	AAAG	2	8	704524	704531	75 %	0 %	25 %	0 %	479152954
14513	NC_021014	AC	3	6	704554	704559	50 %	0 %	0 %	50 %	479152954
14514	NC_021014	AGA	2	6	704569	704574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152954
14515	NC_021014	A	7	7	704579	704585	100 %	0 %	0 %	0 %	479152954
14516	NC_021014	ATG	2	6	704638	704643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152955
14517	NC_021014	ATG	2	6	704648	704653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152955
14518	NC_021014	TGC	2	6	704694	704699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152955
14519	NC_021014	TAA	2	6	704712	704717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152955
14520	NC_021014	GCT	2	6	704721	704726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152955
14521	NC_021014	GCCA	2	8	704728	704735	25 %	0 %	25 %	50 %	479152955
14522	NC_021014	TGA	2	6	704787	704792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152955
14523	NC_021014	TGA	2	6	704816	704821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152955
14524	NC_021014	AGG	2	6	704845	704850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14525	NC_021014	GAAA	2	8	704855	704862	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14526	NC_021014	GCC	2	6	704896	704901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479152956
14527	NC_021014	GCC	2	6	705031	705036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479152956
14528	NC_021014	AGA	2	6	705096	705101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152956
14529	NC_021014	ATG	2	6	705196	705201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152956
14530	NC_021014	GCT	2	6	705261	705266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152956
14531	NC_021014	ATC	2	6	705277	705282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152956
14532	NC_021014	TCA	2	6	705305	705310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152956
14533	NC_021014	TCCT	2	8	705379	705386	0 %	50 %	0 %	50 %	479152956
14534	NC_021014	CTG	2	6	705440	705445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152956
14535	NC_021014	ATG	2	6	705460	705465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152956
14536	NC_021014	GTC	2	6	705661	705666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152956
14537	NC_021014	GA	3	6	705674	705679	50 %	0 %	50 %	0 %	479152956
14538	NC_021014	GGAA	2	8	705705	705712	50 %	0 %	50 %	0 %	479152956
14539	NC_021014	ACC	2	6	705847	705852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479152956
14540	NC_021014	ATC	2	6	705862	705867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152956
14541	NC_021014	CCA	2	6	705890	705895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479152956
14542	NC_021014	GT	3	6	705932	705937	0 %	50 %	50 %	0 %	479152956
14543	NC_021014	ATC	2	6	705976	705981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152956
14544	NC_021014	CTT	2	6	705985	705990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152956
14545	NC_021014	TCA	2	6	706040	706045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152956
14546	NC_021014	GGA	2	6	706146	706151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152956
14547	NC_021014	TTC	2	6	706226	706231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152956
14548	NC_021014	A	7	7	706285	706291	100 %	0 %	0 %	0 %	479152956
14549	NC_021014	A	6	6	706321	706326	100 %	0 %	0 %	0 %	479152956
14550	NC_021014	CAG	2	6	706443	706448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152956
14551	NC_021014	AGC	2	6	706487	706492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152956
14552	NC_021014	CTT	2	6	706516	706521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152956
14553	NC_021014	ATC	2	6	706549	706554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152956
14554	NC_021014	CAGG	2	8	706675	706682	25 %	0 %	50 %	25 %	479152956
14555	NC_021014	TTC	2	6	706706	706711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152956
14556	NC_021014	AAAG	2	8	706720	706727	75 %	0 %	25 %	0 %	479152956
14557	NC_021014	ACG	2	6	706784	706789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152956
14558	NC_021014	TGA	2	6	706871	706876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152956
14559	NC_021014	GCA	2	6	706990	706995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152956
14560	NC_021014	TGT	2	6	707073	707078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152956
14561	NC_021014	GCA	2	6	707119	707124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152956
14562	NC_021014	ATG	2	6	707168	707173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152956
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14565	NC_021014	ATG	2	6	707236	707241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152956
14566	NC_021014	AGA	2	6	707295	707300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152956
14567	NC_021014	TTC	2	6	707307	707312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152956
14568	NC_021014	AAC	2	6	707325	707330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152956
14569	NC_021014	GAA	2	6	707371	707376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152956
14570	NC_021014	A	6	6	707509	707514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14571	NC_021014	CAT	2	6	707660	707665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14572	NC_021014	AGT	2	6	707666	707671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14573	NC_021014	AG	3	6	707672	707677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14574	NC_021014	T	6	6	707696	707701	0 %	100 %	0 %	0 %	479152957
14575	NC_021014	T	6	6	707736	707741	0 %	100 %	0 %	0 %	479152957
14576	NC_021014	CGC	2	6	707774	707779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479152957
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14578	NC_021014	GCA	2	6	708004	708009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152957
14579	NC_021014	GTAC	2	8	708124	708131	25 %	25 %	25 %	25 %	479152957
14580	NC_021014	CTT	2	6	708161	708166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152957
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14582	NC_021014	GA	3	6	708315	708320	50 %	0 %	50 %	0 %	479152957
14583	NC_021014	CAG	2	6	708333	708338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152957
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14585	NC_021014	TAC	2	6	708401	708406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152957
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14587	NC_021014	CATT	2	8	708588	708595	25 %	50 %	0 %	25 %	479152957
14588	NC_021014	A	6	6	708701	708706	100 %	0 %	0 %	0 %	479152957
14589	NC_021014	CTT	2	6	708707	708712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152957
14590	NC_021014	GTCC	2	8	708797	708804	0 %	25 %	25 %	50 %	479152957
14591	NC_021014	TGCC	2	8	708805	708812	0 %	25 %	25 %	50 %	479152957
14592	NC_021014	AG	3	6	708897	708902	50 %	0 %	50 %	0 %	479152957
14593	NC_021014	GAT	2	6	709028	709033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152957
14594	NC_021014	GATC	2	8	709051	709058	25 %	25 %	25 %	25 %	479152957
14595	NC_021014	AT	3	6	709065	709070	50 %	50 %	0 %	0 %	479152957
14596	NC_021014	A	6	6	709098	709103	100 %	0 %	0 %	0 %	479152957
14597	NC_021014	GCT	2	6	709119	709124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14599	NC_021014	TAA	2	6	709178	709183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14600	NC_021014	AT	3	6	709190	709195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14601	NC_021014	ATT	2	6	709232	709237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14602	NC_021014	A	7	7	709266	709272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14603	NC_021014	CT	3	6	709347	709352	0 %	50 %	0 %	50 %	479152958
14604	NC_021014	AT	3	6	709376	709381	50 %	50 %	0 %	0 %	479152958
14605	NC_021014	GAA	2	6	709491	709496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152958
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14607	NC_021014	CAGAA	2	10	709591	709600	60 %	0 %	20 %	20 %	479152958
14608	NC_021014	GAAA	2	8	709656	709663	75 %	0 %	25 %	0 %	479152958
14609	NC_021014	CTT	2	6	709668	709673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152958
14610	NC_021014	T	6	6	709677	709682	0 %	100 %	0 %	0 %	479152958
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14613	NC_021014	TA	3	6	709935	709940	50 %	50 %	0 %	0 %	479152958
14614	NC_021014	GGA	2	6	709953	709958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152958
14615	NC_021014	GCAG	2	8	709988	709995	25 %	0 %	50 %	25 %	479152959
14616	NC_021014	GGA	2	6	710006	710011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152959
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14618	NC_021014	ACC	2	6	710096	710101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479152959
14619	NC_021014	TGATC	2	10	710212	710221	20 %	40 %	20 %	20 %	479152959
14620	NC_021014	A	6	6	710257	710262	100 %	0 %	0 %	0 %	479152959
14621	NC_021014	GTG	2	6	710267	710272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152959
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14996	NC_021014	ATA	3	9	729503	729511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14997	NC_021014	TAT	2	6	729517	729522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14998	NC_021014	AAT	2	6	729532	729537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14999	NC_021014	AAAT	2	8	729604	729611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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