MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_021014	GCTT	2	8	680085	680092	0 %	50 %	25 %	25 %	479152931
14002	NC_021014	ACA	2	6	680098	680103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152931
14003	NC_021014	TTC	2	6	680281	680286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152931
14004	NC_021014	TGA	2	6	680294	680299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152931
14005	NC_021014	GAT	2	6	680311	680316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152931
14006	NC_021014	ATG	2	6	680348	680353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152931
14007	NC_021014	AAGG	2	8	680380	680387	50 %	0 %	50 %	0 %	479152931
14008	NC_021014	A	6	6	680434	680439	100 %	0 %	0 %	0 %	479152931
14009	NC_021014	GAA	2	6	680446	680451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152931
14010	NC_021014	AGA	2	6	680490	680495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152931
14011	NC_021014	ATG	2	6	680530	680535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152931
14012	NC_021014	TGG	2	6	680543	680548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152931
14013	NC_021014	GAA	2	6	680566	680571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152931
14014	NC_021014	TA	3	6	680601	680606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_021014	A	6	6	680616	680621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_021014	T	6	6	680661	680666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14017	NC_021014	A	6	6	680746	680751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_021014	AAC	2	6	680762	680767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14019	NC_021014	TGA	2	6	680781	680786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152932
14020	NC_021014	GA	3	6	680804	680809	50 %	0 %	50 %	0 %	479152932
14021	NC_021014	CGA	2	6	680888	680893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152932
14022	NC_021014	CAG	2	6	680903	680908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152932
14023	NC_021014	GGC	2	6	680940	680945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152932
14024	NC_021014	GAA	2	6	680974	680979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152932
14025	NC_021014	ATC	2	6	680995	681000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152932
14026	NC_021014	T	6	6	681143	681148	0 %	100 %	0 %	0 %	479152932
14027	NC_021014	ATT	2	6	681158	681163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152932
14028	NC_021014	TAT	2	6	681214	681219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152932
14029	NC_021014	CAG	2	6	681242	681247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152932
14030	NC_021014	CTT	2	6	681332	681337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152932
14031	NC_021014	GGA	2	6	681393	681398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152932
14032	NC_021014	CGTC	2	8	681420	681427	0 %	25 %	25 %	50 %	479152932
14033	NC_021014	GAAA	2	8	681449	681456	75 %	0 %	25 %	0 %	479152932
14034	NC_021014	CTT	2	6	681487	681492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152932
14035	NC_021014	AAG	2	6	681544	681549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152932
14036	NC_021014	T	6	6	681562	681567	0 %	100 %	0 %	0 %	479152932
14037	NC_021014	GAA	2	6	681574	681579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152932
14038	NC_021014	GA	3	6	681591	681596	50 %	0 %	50 %	0 %	479152932
14039	NC_021014	TTTAC	2	10	681609	681618	20 %	60 %	0 %	20 %	479152932
14040	NC_021014	ATT	2	6	681673	681678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152932
14041	NC_021014	AAC	2	6	681735	681740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14042	NC_021014	TCTG	2	8	681755	681762	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14043	NC_021014	CTATT	2	10	681805	681814	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14044	NC_021014	T	7	7	681842	681848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_021014	CAGAT	2	10	681851	681860	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14046	NC_021014	AT	3	6	681890	681895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14047	NC_021014	ATTT	2	8	682228	682235	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_021014	TG	3	6	682236	682241	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14049	NC_021014	T	6	6	682261	682266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14050	NC_021014	T	7	7	682320	682326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_021014	CTAA	2	8	682329	682336	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14052	NC_021014	ATC	2	6	682422	682427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14053	NC_021014	ACCT	2	8	682467	682474	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14054	NC_021014	AGACA	2	10	682546	682555	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
14055	NC_021014	GTT	2	6	682611	682616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_021014	TGA	2	6	682717	682722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_021014	ATT	2	6	682728	682733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14058	NC_021014	ATT	2	6	682783	682788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_021014	CTGG	2	8	682832	682839	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14060	NC_021014	AGG	2	6	682892	682897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_021014	TCC	2	6	682921	682926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14062	NC_021014	AAG	2	6	682976	682981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_021014	GGA	2	6	682991	682996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14064	NC_021014	TCCT	2	8	683068	683075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14065	NC_021014	TCT	2	6	683123	683128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14066	NC_021014	AGG	2	6	683311	683316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14067	NC_021014	TTC	2	6	683373	683378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14068	NC_021014	GTG	2	6	683391	683396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14069	NC_021014	TCT	2	6	683519	683524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14070	NC_021014	CT	3	6	683552	683557	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14071	NC_021014	CGG	2	6	683630	683635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14072	NC_021014	ATG	2	6	683670	683675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14073	NC_021014	GCCATT	2	12	683700	683711	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14074	NC_021014	AAG	2	6	683814	683819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14075	NC_021014	TTC	2	6	683869	683874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14076	NC_021014	TTC	2	6	683884	683889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14077	NC_021014	TGG	2	6	683908	683913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14078	NC_021014	GCA	2	6	683922	683927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14079	NC_021014	ATG	2	6	683940	683945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14080	NC_021014	TGAA	2	8	684016	684023	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14081	NC_021014	GAA	2	6	684025	684030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_021014	TGT	3	9	684089	684097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14083	NC_021014	AAC	2	6	684156	684161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14084	NC_021014	TAT	2	6	684193	684198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14085	NC_021014	AGG	2	6	684203	684208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14086	NC_021014	AAT	2	6	684220	684225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152933
14087	NC_021014	A	6	6	684232	684237	100 %	0 %	0 %	0 %	479152933
14088	NC_021014	GCTG	2	8	684240	684247	0 %	25 %	50 %	25 %	479152933
14089	NC_021014	ATG	2	6	684262	684267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152933
14090	NC_021014	ACA	2	6	684280	684285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152933
14091	NC_021014	A	7	7	684307	684313	100 %	0 %	0 %	0 %	479152933
14092	NC_021014	A	6	6	684587	684592	100 %	0 %	0 %	0 %	479152933
14093	NC_021014	GAT	2	6	684733	684738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152933
14094	NC_021014	GTA	2	6	684817	684822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152933
14095	NC_021014	A	6	6	684822	684827	100 %	0 %	0 %	0 %	479152933
14096	NC_021014	ACT	2	6	684833	684838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152933
14097	NC_021014	TG	3	6	684877	684882	0 %	50 %	50 %	0 %	479152933
14098	NC_021014	ACA	2	6	684892	684897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152933
14099	NC_021014	CTT	2	6	685081	685086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152933
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14101	NC_021014	GTG	2	6	685130	685135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152933
14102	NC_021014	TCC	2	6	685158	685163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479152933
14103	NC_021014	GAT	2	6	685183	685188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152933
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14105	NC_021014	TGA	2	6	685236	685241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152933
14106	NC_021014	TGACGG	2	12	685260	685271	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479152933
14107	NC_021014	GCA	2	6	685357	685362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152933
14108	NC_021014	CTT	2	6	685423	685428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152933
14109	NC_021014	GA	3	6	685434	685439	50 %	0 %	50 %	0 %	479152933
14110	NC_021014	ACT	2	6	685502	685507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152933
14111	NC_021014	AG	3	6	685510	685515	50 %	0 %	50 %	0 %	479152933
14112	NC_021014	CTC	2	6	685527	685532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479152933
14113	NC_021014	CTT	2	6	685576	685581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152933
14114	NC_021014	TCA	2	6	685625	685630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152933
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14116	NC_021014	GAT	2	6	685654	685659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152933
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14118	NC_021014	CAA	2	6	685704	685709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152933
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14120	NC_021014	TTAT	2	8	685791	685798	25 %	75 %	0 %	0 %	479152934
14121	NC_021014	GAA	2	6	685871	685876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152934
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14124	NC_021014	AAC	2	6	685919	685924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152934
14125	NC_021014	GCG	2	6	686074	686079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152934
14126	NC_021014	AT	3	6	686123	686128	50 %	50 %	0 %	0 %	479152934
14127	NC_021014	GAA	2	6	686165	686170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152934
14128	NC_021014	GGT	2	6	686247	686252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152934
14129	NC_021014	GCCATG	2	12	686274	686285	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479152934
14130	NC_021014	GCT	2	6	686300	686305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152934
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14132	NC_021014	GAT	2	6	686366	686371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152934
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14137	NC_021014	CTG	2	6	686538	686543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152934
14138	NC_021014	CGG	2	6	686637	686642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152935
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14140	NC_021014	A	6	6	686796	686801	100 %	0 %	0 %	0 %	479152935
14141	NC_021014	CT	3	6	686803	686808	0 %	50 %	0 %	50 %	479152935
14142	NC_021014	A	6	6	686818	686823	100 %	0 %	0 %	0 %	479152935
14143	NC_021014	AG	3	6	686971	686976	50 %	0 %	50 %	0 %	479152935
14144	NC_021014	CAGCGT	2	12	687043	687054	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479152935
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14148	NC_021014	CTG	3	9	687579	687587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14149	NC_021014	AT	3	6	687607	687612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14150	NC_021014	GTA	2	6	687623	687628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14152	NC_021014	ATT	2	6	687666	687671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152936
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14157	NC_021014	GCC	2	6	687871	687876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14158	NC_021014	TTC	2	6	687896	687901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14161	NC_021014	TAATA	2	10	687956	687965	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14162	NC_021014	GA	3	6	688067	688072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14244	NC_021014	ATA	2	6	691445	691450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152940
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14492	NC_021014	CTT	2	6	703558	703563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14493	NC_021014	AAG	2	6	703628	703633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14494	NC_021014	AG	3	6	703716	703721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14495	NC_021014	AGA	2	6	703724	703729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14496	NC_021014	AGC	2	6	703765	703770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14498	NC_021014	ACA	2	6	703864	703869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14499	NC_021014	AGA	3	9	703899	703907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14500	NC_021014	TGT	2	6	703926	703931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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