MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_021014	TTC	2	6	655137	655142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13502	NC_021014	GCA	2	6	655339	655344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13503	NC_021014	AGC	2	6	655350	655355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13504	NC_021014	TGC	2	6	655368	655373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13505	NC_021014	AGA	2	6	655374	655379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_021014	T	6	6	655389	655394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13507	NC_021014	AAG	2	6	655460	655465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13508	NC_021014	GTG	2	6	655511	655516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13509	NC_021014	AAG	2	6	655538	655543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13510	NC_021014	ATT	2	6	655547	655552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13511	NC_021014	AGC	3	9	655563	655571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13512	NC_021014	AGGCAG	2	12	655598	655609	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13513	NC_021014	TAT	2	6	655638	655643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13514	NC_021014	CTT	2	6	655645	655650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13515	NC_021014	TGG	2	6	655724	655729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13516	NC_021014	TGA	3	9	655731	655739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13517	NC_021014	ATC	2	6	655766	655771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13518	NC_021014	GA	3	6	655836	655841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13519	NC_021014	ATTT	2	8	655926	655933	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13520	NC_021014	GGC	2	6	655999	656004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13521	NC_021014	CTGA	2	8	656125	656132	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13522	NC_021014	GTA	2	6	656149	656154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13523	NC_021014	CCAA	2	8	656155	656162	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13524	NC_021014	GCG	2	6	656213	656218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13525	NC_021014	TAC	2	6	656548	656553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13526	NC_021014	A	7	7	656580	656586	100 %	0 %	0 %	0 %	479152908
13527	NC_021014	AGA	2	6	656650	656655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152908
13528	NC_021014	TTA	2	6	656687	656692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152908
13529	NC_021014	AT	4	8	656707	656714	50 %	50 %	0 %	0 %	479152908
13530	NC_021014	GAG	2	6	656715	656720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152908
13531	NC_021014	CAG	2	6	656737	656742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152908
13532	NC_021014	AGG	2	6	656743	656748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152908
13533	NC_021014	ACA	2	6	656823	656828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152908
13534	NC_021014	GT	3	6	656908	656913	0 %	50 %	50 %	0 %	479152908
13535	NC_021014	ATC	2	6	656931	656936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152908
13536	NC_021014	A	7	7	656939	656945	100 %	0 %	0 %	0 %	479152908
13537	NC_021014	GAG	2	6	656994	656999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152908
13538	NC_021014	CAA	2	6	657047	657052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152908
13539	NC_021014	GAT	2	6	657053	657058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152908
13540	NC_021014	GGA	2	6	657116	657121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152908
13541	NC_021014	AGA	2	6	657278	657283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152908
13542	NC_021014	TGACC	2	10	657350	657359	20 %	20 %	20 %	40 %	479152908
13543	NC_021014	AGA	2	6	657367	657372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152908
13544	NC_021014	CAG	2	6	657487	657492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152908
13545	NC_021014	GAA	2	6	657573	657578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152908
13546	NC_021014	CAGA	2	8	657629	657636	50 %	0 %	25 %	25 %	479152908
13547	NC_021014	AGA	2	6	657652	657657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152908
13548	NC_021014	GTGAA	2	10	657667	657676	40 %	20 %	40 %	0 %	479152908
13549	NC_021014	ATC	2	6	657681	657686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152908
13550	NC_021014	AGC	2	6	657751	657756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152908
13551	NC_021014	GAC	2	6	657788	657793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152908
13552	NC_021014	GTA	2	6	657930	657935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152908
13553	NC_021014	AGGC	2	8	657993	658000	25 %	0 %	50 %	25 %	479152908
13554	NC_021014	TGG	2	6	658018	658023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152908
13555	NC_021014	AG	3	6	658025	658030	50 %	0 %	50 %	0 %	479152908
13556	NC_021014	ATG	2	6	658239	658244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152908
13557	NC_021014	TCA	2	6	658280	658285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152908
13558	NC_021014	GAA	2	6	658350	658355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152908
13559	NC_021014	ATG	2	6	658393	658398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152908
13560	NC_021014	TA	3	6	658404	658409	50 %	50 %	0 %	0 %	479152908
13561	NC_021014	ATG	2	6	658501	658506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152908
13562	NC_021014	GAA	2	6	658517	658522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152908
13563	NC_021014	AGC	2	6	658532	658537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152908
13564	NC_021014	GAA	2	6	658620	658625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152908
13565	NC_021014	TGGA	2	8	658648	658655	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13566	NC_021014	GAA	2	6	658663	658668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13567	NC_021014	AAAAAG	2	12	658689	658700	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13568	NC_021014	GAG	2	6	658715	658720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13569	NC_021014	A	6	6	658731	658736	100 %	0 %	0 %	0 %	479152909
13570	NC_021014	TG	3	6	658741	658746	0 %	50 %	50 %	0 %	479152909
13571	NC_021014	GAG	2	6	658836	658841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152909
13572	NC_021014	CAG	2	6	658897	658902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152909
13573	NC_021014	AGC	2	6	658910	658915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152909
13574	NC_021014	AGA	3	9	658946	658954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152909
13575	NC_021014	GAA	2	6	658959	658964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152909
13576	NC_021014	ATA	2	6	658969	658974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152909
13577	NC_021014	GGA	2	6	658985	658990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152909
13578	NC_021014	GAA	2	6	659007	659012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152909
13579	NC_021014	AGA	2	6	659021	659026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152909
13580	NC_021014	TGA	2	6	659039	659044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152909
13581	NC_021014	GAA	2	6	659058	659063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152909
13582	NC_021014	ATG	2	6	659088	659093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152909
13583	NC_021014	GGA	2	6	659097	659102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152909
13584	NC_021014	ATT	3	9	659182	659190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152909
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13587	NC_021014	GGA	2	6	659660	659665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152909
13588	NC_021014	TGT	2	6	659726	659731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152909
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13590	NC_021014	AGA	2	6	659807	659812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152909
13591	NC_021014	GTA	2	6	659961	659966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152909
13592	NC_021014	A	7	7	659994	660000	100 %	0 %	0 %	0 %	479152909
13593	NC_021014	GGAA	2	8	660050	660057	50 %	0 %	50 %	0 %	479152909
13594	NC_021014	GCT	2	6	660067	660072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152909
13595	NC_021014	AT	3	6	660131	660136	50 %	50 %	0 %	0 %	479152909
13596	NC_021014	AGC	2	6	660150	660155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152909
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13598	NC_021014	AT	3	6	660209	660214	50 %	50 %	0 %	0 %	479152909
13599	NC_021014	A	6	6	660309	660314	100 %	0 %	0 %	0 %	479152909
13600	NC_021014	AGT	2	6	660374	660379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152909
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13602	NC_021014	TAA	2	6	660515	660520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152909
13603	NC_021014	TAA	3	9	660767	660775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152909
13604	NC_021014	A	6	6	660830	660835	100 %	0 %	0 %	0 %	479152909
13605	NC_021014	AGCAA	2	10	660850	660859	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13606	NC_021014	A	6	6	660942	660947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13607	NC_021014	A	6	6	660998	661003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13608	NC_021014	GCG	2	6	661056	661061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13609	NC_021014	CTG	2	6	661129	661134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13610	NC_021014	ACTT	2	8	661211	661218	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13611	NC_021014	AAG	2	6	661284	661289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13612	NC_021014	TCT	2	6	661326	661331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13613	NC_021014	CAG	3	9	661401	661409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13614	NC_021014	ATG	2	6	661423	661428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13615	NC_021014	CAG	2	6	661481	661486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13616	NC_021014	AG	3	6	661558	661563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13617	NC_021014	TAC	2	6	661580	661585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13618	NC_021014	TTA	2	6	661639	661644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13619	NC_021014	GCA	2	6	661657	661662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13620	NC_021014	A	6	6	661677	661682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13621	NC_021014	TGT	2	6	661714	661719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13622	NC_021014	CAG	2	6	661753	661758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13624	NC_021014	AT	3	6	661958	661963	50 %	50 %	0 %	0 %	479152910
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13992	NC_021014	GAA	2	6	679654	679659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152931
13993	NC_021014	ATG	2	6	679687	679692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152931
13994	NC_021014	TCTGA	2	10	679702	679711	20 %	40 %	20 %	20 %	479152931
13995	NC_021014	GA	3	6	679710	679715	50 %	0 %	50 %	0 %	479152931
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