MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021014	AGA	2	6	628843	628848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152879
13002	NC_021014	TGA	2	6	628856	628861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152879
13003	NC_021014	CA	3	6	628904	628909	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13004	NC_021014	A	6	6	628974	628979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_021014	A	6	6	628983	628988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_021014	GGC	2	6	629026	629031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152880
13007	NC_021014	GCC	2	6	629035	629040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479152880
13008	NC_021014	TGC	2	6	629061	629066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152880
13009	NC_021014	GC	3	6	629065	629070	0 %	0 %	50 %	50 %	479152880
13010	NC_021014	A	7	7	629096	629102	100 %	0 %	0 %	0 %	479152880
13011	NC_021014	A	6	6	629115	629120	100 %	0 %	0 %	0 %	479152880
13012	NC_021014	TCA	2	6	629126	629131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152880
13013	NC_021014	GAA	2	6	629173	629178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152880
13014	NC_021014	T	6	6	629257	629262	0 %	100 %	0 %	0 %	479152880
13015	NC_021014	GAG	2	6	629263	629268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152880
13016	NC_021014	TCAT	2	8	629322	629329	25 %	50 %	0 %	25 %	479152880
13017	NC_021014	A	6	6	629362	629367	100 %	0 %	0 %	0 %	479152880
13018	NC_021014	T	6	6	629458	629463	0 %	100 %	0 %	0 %	479152880
13019	NC_021014	AGG	2	6	629490	629495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152880
13020	NC_021014	TGC	2	6	629541	629546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152880
13021	NC_021014	GTT	2	6	629563	629568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152880
13022	NC_021014	TGG	2	6	629594	629599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152880
13023	NC_021014	AGA	2	6	629604	629609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152880
13024	NC_021014	A	6	6	629671	629676	100 %	0 %	0 %	0 %	479152880
13025	NC_021014	GAT	2	6	629700	629705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152880
13026	NC_021014	TCT	2	6	629908	629913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152880
13027	NC_021014	ATC	2	6	630058	630063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152880
13028	NC_021014	GT	3	6	630074	630079	0 %	50 %	50 %	0 %	479152880
13029	NC_021014	A	6	6	630115	630120	100 %	0 %	0 %	0 %	479152880
13030	NC_021014	A	6	6	630122	630127	100 %	0 %	0 %	0 %	479152880
13031	NC_021014	CTGGAT	2	12	630150	630161	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13032	NC_021014	AGGA	2	8	630242	630249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_021014	A	7	7	630315	630321	100 %	0 %	0 %	0 %	479152881
13034	NC_021014	TTTA	2	8	630340	630347	25 %	75 %	0 %	0 %	479152881
13035	NC_021014	TCT	2	6	630387	630392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152881
13036	NC_021014	A	6	6	630416	630421	100 %	0 %	0 %	0 %	479152881
13037	NC_021014	AGC	2	6	630473	630478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152881
13038	NC_021014	TCC	2	6	630512	630517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479152881
13039	NC_021014	GTGC	2	8	630568	630575	0 %	25 %	50 %	25 %	479152881
13040	NC_021014	TCT	2	6	630579	630584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152881
13041	NC_021014	AAT	2	6	630613	630618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152881
13042	NC_021014	ACC	2	6	630646	630651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479152881
13043	NC_021014	TTC	2	6	630653	630658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152881
13044	NC_021014	CAG	2	6	630708	630713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152881
13045	NC_021014	GA	4	8	630790	630797	50 %	0 %	50 %	0 %	479152881
13046	NC_021014	CG	3	6	630805	630810	0 %	0 %	50 %	50 %	479152881
13047	NC_021014	A	6	6	630823	630828	100 %	0 %	0 %	0 %	479152881
13048	NC_021014	TTG	2	6	630845	630850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152881
13049	NC_021014	GCA	2	6	631008	631013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152882
13050	NC_021014	ATC	2	6	631035	631040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152882
13051	NC_021014	GAG	2	6	631047	631052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152882
13052	NC_021014	A	6	6	631069	631074	100 %	0 %	0 %	0 %	479152882
13053	NC_021014	TGT	2	6	631125	631130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_021014	A	6	6	631174	631179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_021014	GA	4	8	631240	631247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_021014	ATC	2	6	631273	631278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13057	NC_021014	AAG	2	6	631388	631393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_021014	GAC	2	6	631410	631415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13059	NC_021014	ACA	2	6	631424	631429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13060	NC_021014	ATA	2	6	631472	631477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_021014	GAA	2	6	631525	631530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_021014	AGAA	2	8	631535	631542	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_021014	TACT	2	8	631647	631654	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13064	NC_021014	AGT	2	6	631699	631704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_021014	CAG	2	6	631718	631723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13066	NC_021014	ATT	2	6	631744	631749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_021014	GAG	2	6	631750	631755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13068	NC_021014	GA	3	6	631824	631829	50 %	0 %	50 %	0 %	479152883
13069	NC_021014	GAT	2	6	631859	631864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152883
13070	NC_021014	ATC	2	6	631868	631873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152883
13071	NC_021014	ATC	2	6	631901	631906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152883
13072	NC_021014	GTT	2	6	631952	631957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152883
13073	NC_021014	ACG	2	6	631998	632003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152883
13074	NC_021014	GCA	2	6	632039	632044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152883
13075	NC_021014	CAA	2	6	632053	632058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152883
13076	NC_021014	GAG	2	6	632066	632071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152883
13077	NC_021014	AGG	2	6	632085	632090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152883
13078	NC_021014	GGT	2	6	632123	632128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152883
13079	NC_021014	ATTC	2	8	632158	632165	25 %	50 %	0 %	25 %	479152883
13080	NC_021014	AAG	2	6	632254	632259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152883
13081	NC_021014	ATC	2	6	632267	632272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152883
13082	NC_021014	CTT	3	9	632288	632296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152883
13083	NC_021014	CTT	2	6	632324	632329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152883
13084	NC_021014	GTT	2	6	632363	632368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152883
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13086	NC_021014	CTT	2	6	632420	632425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152883
13087	NC_021014	GAA	2	6	632464	632469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152883
13088	NC_021014	GGA	2	6	632551	632556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152883
13089	NC_021014	GCT	2	6	632573	632578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152883
13090	NC_021014	GTA	2	6	632600	632605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152883
13091	NC_021014	TTG	2	6	632643	632648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152883
13092	NC_021014	CTT	2	6	632672	632677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152883
13093	NC_021014	AG	3	6	632696	632701	50 %	0 %	50 %	0 %	479152883
13094	NC_021014	GTT	2	6	632756	632761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152883
13095	NC_021014	GCAGA	2	10	632822	632831	40 %	0 %	40 %	20 %	479152883
13096	NC_021014	CAG	2	6	632859	632864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13097	NC_021014	T	7	7	632911	632917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_021014	ATT	2	6	632941	632946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152884
13099	NC_021014	ATA	2	6	632960	632965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152884
13100	NC_021014	GGCA	2	8	632967	632974	25 %	0 %	50 %	25 %	479152884
13101	NC_021014	GTAATC	2	12	633131	633142	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479152884
13102	NC_021014	AGT	2	6	633154	633159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152884
13103	NC_021014	AAG	2	6	633191	633196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152884
13104	NC_021014	TTC	2	6	633230	633235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152884
13105	NC_021014	AGA	2	6	633384	633389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152884
13106	NC_021014	TTTC	2	8	633431	633438	0 %	75 %	0 %	25 %	479152884
13107	NC_021014	TTGT	2	8	633449	633456	0 %	75 %	25 %	0 %	479152884
13108	NC_021014	AGT	2	6	633484	633489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152884
13109	NC_021014	TTC	2	6	633734	633739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152884
13110	NC_021014	ATC	2	6	633753	633758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152884
13111	NC_021014	GTT	2	6	633776	633781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152884
13112	NC_021014	T	6	6	633902	633907	0 %	100 %	0 %	0 %	479152884
13113	NC_021014	T	7	7	633946	633952	0 %	100 %	0 %	0 %	479152884
13114	NC_021014	A	7	7	634001	634007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_021014	AGTTAT	2	12	634041	634052	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_021014	TAG	2	6	634053	634058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_021014	TGA	2	6	634062	634067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_021014	A	6	6	634069	634074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13119	NC_021014	A	6	6	634113	634118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_021014	TAT	2	6	634123	634128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_021014	T	6	6	634159	634164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13122	NC_021014	TCT	2	6	634180	634185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13123	NC_021014	CATA	2	8	634226	634233	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13124	NC_021014	TTGT	2	8	634313	634320	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13125	NC_021014	A	6	6	634368	634373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13126	NC_021014	CATGTA	2	12	634399	634410	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13127	NC_021014	AGG	2	6	634424	634429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13128	NC_021014	ATCC	2	8	634468	634475	25 %	25 %	0 %	50 %	479152885
13129	NC_021014	A	6	6	634497	634502	100 %	0 %	0 %	0 %	479152885
13130	NC_021014	CTGTC	2	10	634503	634512	0 %	40 %	20 %	40 %	479152885
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13132	NC_021014	AGG	2	6	634631	634636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152885
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13155	NC_021014	TGC	2	6	635655	635660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152886
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13231	NC_021014	TC	3	6	640284	640289	0 %	50 %	0 %	50 %	479152893
13232	NC_021014	ATCT	2	8	640299	640306	25 %	50 %	0 %	25 %	479152893
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13245	NC_021014	ATG	2	6	640675	640680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152893
13246	NC_021014	TTC	2	6	640685	640690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152893
13247	NC_021014	ATT	2	6	640702	640707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152893
13248	NC_021014	GA	3	6	640748	640753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13249	NC_021014	TA	3	6	640767	640772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13250	NC_021014	T	8	8	640804	640811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13251	NC_021014	GATTT	2	10	640880	640889	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13252	NC_021014	GACAG	2	10	640972	640981	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13253	NC_021014	AGA	2	6	641013	641018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13254	NC_021014	GGA	2	6	641041	641046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13255	NC_021014	T	7	7	641065	641071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13256	NC_021014	GAT	2	6	641077	641082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13257	NC_021014	GAT	2	6	641191	641196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152894
13258	NC_021014	AAGCTG	2	12	641269	641280	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479152894
13259	NC_021014	CAG	2	6	641311	641316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152894
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13261	NC_021014	ATCTG	2	10	641337	641346	20 %	40 %	20 %	20 %	479152894
13262	NC_021014	GTC	2	6	641354	641359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152894
13263	NC_021014	GAT	2	6	641449	641454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152894
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13265	NC_021014	N	1488	1488	641556	643043	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13266	NC_021014	CCG	2	6	643045	643050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13267	NC_021014	TGAAA	2	10	643076	643085	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13268	NC_021014	ACA	2	6	643122	643127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152895
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13271	NC_021014	AGC	2	6	643243	643248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152895
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13274	NC_021014	AGA	2	6	643463	643468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152895
13275	NC_021014	CAA	2	6	643576	643581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152895
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13279	NC_021014	GAC	2	6	643664	643669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152895
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13281	NC_021014	TCT	2	6	643772	643777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152895
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13283	NC_021014	TCT	2	6	643853	643858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152895
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13287	NC_021014	TAA	2	6	644152	644157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13288	NC_021014	AGG	2	6	644231	644236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13289	NC_021014	GTT	2	6	644269	644274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152896
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13300	NC_021014	GATT	2	8	644699	644706	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13301	NC_021014	GAA	2	6	644947	644952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13302	NC_021014	GAT	2	6	644963	644968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13304	NC_021014	ACCGG	2	10	645104	645113	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13305	NC_021014	GGA	2	6	645130	645135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13307	NC_021014	TCT	2	6	645208	645213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13308	NC_021014	CT	3	6	645240	645245	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13309	NC_021014	TGA	2	6	645270	645275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13363	NC_021014	GA	3	6	648255	648260	50 %	0 %	50 %	0 %	479152899
13364	NC_021014	A	6	6	648285	648290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13365	NC_021014	CTT	2	6	648318	648323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13367	NC_021014	GTA	2	6	648436	648441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13369	NC_021014	GA	3	6	648511	648516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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13487	NC_021014	CCT	2	6	654248	654253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13492	NC_021014	TGAA	2	8	654517	654524	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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13498	NC_021014	GAA	2	6	654993	654998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13499	NC_021014	CAT	2	6	655068	655073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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