MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_021014	GCT	2	6	581621	581626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12002	NC_021014	AGG	2	6	581640	581645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12003	NC_021014	CAGA	2	8	581708	581715	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12004	NC_021014	GAA	2	6	581773	581778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12005	NC_021014	CCG	2	6	581792	581797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12006	NC_021014	GAT	2	6	582002	582007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12007	NC_021014	TCT	2	6	582121	582126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12008	NC_021014	TCAG	2	8	582127	582134	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12009	NC_021014	GCA	2	6	582170	582175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12010	NC_021014	TCT	2	6	582229	582234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12011	NC_021014	ATC	2	6	582284	582289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12012	NC_021014	GATC	2	8	582334	582341	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12013	NC_021014	GGT	2	6	582346	582351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12014	NC_021014	TA	3	6	582363	582368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12015	NC_021014	GGT	2	6	582394	582399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12016	NC_021014	GAA	2	6	582409	582414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12017	NC_021014	GGAG	2	8	582535	582542	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12018	NC_021014	ATC	2	6	582575	582580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12019	NC_021014	ATG	2	6	582602	582607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12020	NC_021014	GCA	2	6	582662	582667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12021	NC_021014	TCA	2	6	582711	582716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12022	NC_021014	CTT	2	6	582815	582820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12023	NC_021014	GAG	2	6	582896	582901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12024	NC_021014	GAG	2	6	582996	583001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12025	NC_021014	CGG	3	9	583003	583011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12026	NC_021014	GGA	2	6	583162	583167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12027	NC_021014	CCAAG	2	10	583173	583182	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12028	NC_021014	CAG	2	6	583197	583202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12029	NC_021014	GGA	2	6	583222	583227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12030	NC_021014	CGG	2	6	583231	583236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12031	NC_021014	CGA	2	6	583353	583358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152835
12032	NC_021014	A	6	6	583358	583363	100 %	0 %	0 %	0 %	479152835
12033	NC_021014	AGA	2	6	583389	583394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152835
12034	NC_021014	AAGG	2	8	583408	583415	50 %	0 %	50 %	0 %	479152835
12035	NC_021014	TCT	2	6	583422	583427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152835
12036	NC_021014	AT	3	6	583431	583436	50 %	50 %	0 %	0 %	479152835
12037	NC_021014	GGA	2	6	583440	583445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152835
12038	NC_021014	CGG	2	6	583557	583562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152835
12039	NC_021014	AAG	2	6	583580	583585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152835
12040	NC_021014	TCA	2	6	583635	583640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152835
12041	NC_021014	ATC	2	6	583687	583692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152835
12042	NC_021014	ATAA	2	8	583709	583716	75 %	25 %	0 %	0 %	479152835
12043	NC_021014	TAC	2	6	583722	583727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12044	NC_021014	GTA	2	6	583761	583766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12045	NC_021014	A	6	6	583771	583776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12046	NC_021014	TAA	2	6	583803	583808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12047	NC_021014	AGAA	2	8	583813	583820	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12048	NC_021014	CAGA	2	8	583850	583857	50 %	0 %	25 %	25 %	479152836
12049	NC_021014	AGA	2	6	583881	583886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152836
12050	NC_021014	CAG	2	6	583936	583941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152836
12051	NC_021014	AAG	2	6	583985	583990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152836
12052	NC_021014	TGA	2	6	584088	584093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152836
12053	NC_021014	TAT	2	6	584094	584099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152836
12054	NC_021014	TGA	2	6	584116	584121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152836
12055	NC_021014	TGC	2	6	584164	584169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152837
12056	NC_021014	ACA	2	6	584203	584208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152837
12057	NC_021014	ACC	2	6	584250	584255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479152837
12058	NC_021014	CAG	2	6	584280	584285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152837
12059	NC_021014	GAAA	2	8	584338	584345	75 %	0 %	25 %	0 %	479152837
12060	NC_021014	T	6	6	584394	584399	0 %	100 %	0 %	0 %	479152837
12061	NC_021014	GCT	2	6	584444	584449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152837
12062	NC_021014	ACA	2	6	584460	584465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152837
12063	NC_021014	ATC	2	6	584505	584510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152837
12064	NC_021014	TACT	2	8	584516	584523	25 %	50 %	0 %	25 %	479152837
12065	NC_021014	TGCT	2	8	584548	584555	0 %	50 %	25 %	25 %	479152837
12066	NC_021014	TG	3	6	584565	584570	0 %	50 %	50 %	0 %	479152837
12067	NC_021014	GTA	2	6	584615	584620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12068	NC_021014	GGT	2	6	584654	584659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152838
12069	NC_021014	ATC	2	6	584660	584665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152838
12070	NC_021014	GGAAGC	2	12	584669	584680	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	479152838
12071	NC_021014	GTG	2	6	584777	584782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152838
12072	NC_021014	TGC	2	6	584786	584791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152838
12073	NC_021014	CAGAT	2	10	584799	584808	40 %	20 %	20 %	20 %	479152838
12074	NC_021014	TG	3	6	584816	584821	0 %	50 %	50 %	0 %	479152838
12075	NC_021014	AT	4	8	584880	584887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12076	NC_021014	TG	3	6	584926	584931	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12077	NC_021014	TGTA	2	8	584935	584942	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12078	NC_021014	AATA	2	8	584944	584951	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12079	NC_021014	A	7	7	584973	584979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12080	NC_021014	TAT	2	6	585025	585030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12081	NC_021014	TGG	2	6	585052	585057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12082	NC_021014	AGG	2	6	585084	585089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12083	NC_021014	A	7	7	585103	585109	100 %	0 %	0 %	0 %	479152839
12084	NC_021014	AAC	2	6	585145	585150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152839
12085	NC_021014	GCA	2	6	585176	585181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152839
12086	NC_021014	CAG	2	6	585231	585236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152839
12087	NC_021014	TGT	2	6	585262	585267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152839
12088	NC_021014	ATG	2	6	585287	585292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152839
12089	NC_021014	T	6	6	585311	585316	0 %	100 %	0 %	0 %	479152839
12090	NC_021014	GA	3	6	585330	585335	50 %	0 %	50 %	0 %	479152839
12091	NC_021014	ATG	3	9	585375	585383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152839
12092	NC_021014	GAT	2	6	585449	585454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152839
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12094	NC_021014	TGA	2	6	585553	585558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152839
12095	NC_021014	ATC	2	6	585583	585588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152839
12096	NC_021014	CAA	2	6	585679	585684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152839
12097	NC_021014	TAT	2	6	585737	585742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152839
12098	NC_021014	TGA	2	6	585769	585774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152839
12099	NC_021014	GAT	2	6	585875	585880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152839
12100	NC_021014	ATGA	2	8	585953	585960	50 %	25 %	25 %	0 %	479152839
12101	NC_021014	CTTTC	2	10	586041	586050	0 %	60 %	0 %	40 %	479152839
12102	NC_021014	CTA	2	6	586099	586104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152839
12103	NC_021014	TGTA	2	8	586236	586243	25 %	50 %	25 %	0 %	479152839
12104	NC_021014	TCT	2	6	586279	586284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152839
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12106	NC_021014	TATC	2	8	586546	586553	25 %	50 %	0 %	25 %	479152839
12107	NC_021014	GTAA	2	8	586583	586590	50 %	25 %	25 %	0 %	479152839
12108	NC_021014	TGA	2	6	586606	586611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152839
12109	NC_021014	TATT	2	8	586627	586634	25 %	75 %	0 %	0 %	479152839
12110	NC_021014	ATT	2	6	586638	586643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152839
12111	NC_021014	AAAT	2	8	586664	586671	75 %	25 %	0 %	0 %	479152839
12112	NC_021014	AGG	2	6	586756	586761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12113	NC_021014	GAA	2	6	586770	586775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12114	NC_021014	AGC	2	6	586848	586853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12115	NC_021014	TCCTG	2	10	586863	586872	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12116	NC_021014	GAA	2	6	586897	586902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12117	NC_021014	GA	3	6	586917	586922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12118	NC_021014	TGA	2	6	587006	587011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12119	NC_021014	ACCG	2	8	587015	587022	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12120	NC_021014	TGC	2	6	587081	587086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12121	NC_021014	ATCT	2	8	587218	587225	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12122	NC_021014	AAG	2	6	587367	587372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12123	NC_021014	TCC	2	6	587392	587397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12124	NC_021014	TTATG	2	10	587400	587409	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12125	NC_021014	T	6	6	587546	587551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12126	NC_021014	GTG	2	6	587645	587650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152840
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12154	NC_021014	T	6	6	588686	588691	0 %	100 %	0 %	0 %	479152842
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12197	NC_021014	ATC	2	6	590706	590711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12210	NC_021014	TGCGG	2	10	591474	591483	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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12218	NC_021014	ACAG	2	8	591774	591781	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12219	NC_021014	AG	3	6	591780	591785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12220	NC_021014	ATC	2	6	591923	591928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152845
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12234	NC_021014	GCA	2	6	592330	592335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152846
12235	NC_021014	A	6	6	592342	592347	100 %	0 %	0 %	0 %	479152846
12236	NC_021014	CAG	2	6	592356	592361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152846
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12242	NC_021014	GGAG	2	8	592600	592607	25 %	0 %	75 %	0 %	479152846
12243	NC_021014	AGG	2	6	592631	592636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152846
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12491	NC_021014	AG	3	6	605435	605440	50 %	0 %	50 %	0 %	479152859
12492	NC_021014	AGT	2	6	605475	605480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152859
12493	NC_021014	TCC	2	6	605561	605566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479152859
12494	NC_021014	AG	3	6	605601	605606	50 %	0 %	50 %	0 %	479152859
12495	NC_021014	AGA	2	6	605636	605641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152859
12496	NC_021014	T	6	6	605651	605656	0 %	100 %	0 %	0 %	479152859
12497	NC_021014	GTC	2	6	605688	605693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152859
12498	NC_021014	AGA	2	6	605729	605734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152859
12499	NC_021014	ACC	2	6	605788	605793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479152859
12500	NC_021014	GGAAG	2	10	605820	605829	40 %	0 %	60 %	0 %	479152859

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