MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_021014	GGA	2	6	556748	556753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152816
11502	NC_021014	ATT	2	6	556774	556779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152816
11503	NC_021014	AGA	2	6	556809	556814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152816
11504	NC_021014	ATC	2	6	556911	556916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152817
11505	NC_021014	TG	3	6	556964	556969	0 %	50 %	50 %	0 %	479152817
11506	NC_021014	CCAT	2	8	556972	556979	25 %	25 %	0 %	50 %	479152817
11507	NC_021014	GA	3	6	557022	557027	50 %	0 %	50 %	0 %	479152817
11508	NC_021014	ATC	2	6	557223	557228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152817
11509	NC_021014	GGAA	2	8	557237	557244	50 %	0 %	50 %	0 %	479152817
11510	NC_021014	AG	3	6	557264	557269	50 %	0 %	50 %	0 %	479152817
11511	NC_021014	GGA	2	6	557330	557335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152817
11512	NC_021014	GAA	2	6	557417	557422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152817
11513	NC_021014	TGC	2	6	557513	557518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152817
11514	NC_021014	AAATA	2	10	557580	557589	80 %	20 %	0 %	0 %	479152817
11515	NC_021014	CAT	2	6	557600	557605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152818
11516	NC_021014	A	6	6	557687	557692	100 %	0 %	0 %	0 %	479152818
11517	NC_021014	TTG	2	6	557779	557784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152818
11518	NC_021014	A	6	6	557831	557836	100 %	0 %	0 %	0 %	479152818
11519	NC_021014	CTT	2	6	557889	557894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152818
11520	NC_021014	ACA	2	6	557967	557972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152818
11521	NC_021014	A	6	6	558014	558019	100 %	0 %	0 %	0 %	479152818
11522	NC_021014	AGG	2	6	558055	558060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152818
11523	NC_021014	CTT	2	6	558072	558077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152818
11524	NC_021014	GA	3	6	558082	558087	50 %	0 %	50 %	0 %	479152818
11525	NC_021014	GCC	2	6	558281	558286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479152818
11526	NC_021014	GGC	2	6	558344	558349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152818
11527	NC_021014	GAA	2	6	558416	558421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152818
11528	NC_021014	AGA	2	6	558422	558427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152818
11529	NC_021014	CTT	2	6	558435	558440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152818
11530	NC_021014	A	6	6	558533	558538	100 %	0 %	0 %	0 %	479152818
11531	NC_021014	GA	3	6	558564	558569	50 %	0 %	50 %	0 %	479152818
11532	NC_021014	A	7	7	558608	558614	100 %	0 %	0 %	0 %	479152818
11533	NC_021014	ACC	2	6	558632	558637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479152818
11534	NC_021014	GGA	2	6	558657	558662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_021014	TGT	2	6	558683	558688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_021014	GTGAT	2	10	558751	558760	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_021014	A	6	6	558834	558839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_021014	A	6	6	558875	558880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_021014	GTG	2	6	558906	558911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152819
11540	NC_021014	CAG	2	6	558999	559004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152819
11541	NC_021014	GGC	2	6	559010	559015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152819
11542	NC_021014	TCT	2	6	559072	559077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152819
11543	NC_021014	GCA	3	9	559112	559120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152819
11544	NC_021014	CAG	2	6	559156	559161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152819
11545	NC_021014	TGA	3	9	559197	559205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152819
11546	NC_021014	TAC	2	6	559318	559323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152819
11547	NC_021014	ACC	2	6	559419	559424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479152820
11548	NC_021014	TGG	2	6	559496	559501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152820
11549	NC_021014	GGA	2	6	559565	559570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152820
11550	NC_021014	GCA	2	6	559623	559628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152820
11551	NC_021014	A	6	6	559637	559642	100 %	0 %	0 %	0 %	479152820
11552	NC_021014	GAA	2	6	559706	559711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152820
11553	NC_021014	GGC	2	6	559745	559750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152820
11554	NC_021014	CTT	2	6	559755	559760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152820
11555	NC_021014	GCG	2	6	560053	560058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152820
11556	NC_021014	ATC	2	6	560070	560075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152820
11557	NC_021014	AGG	3	9	560089	560097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152820
11558	NC_021014	A	6	6	560194	560199	100 %	0 %	0 %	0 %	479152820
11559	NC_021014	GGAA	2	8	560210	560217	50 %	0 %	50 %	0 %	479152820
11560	NC_021014	TGA	2	6	560228	560233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152820
11561	NC_021014	GTACC	2	10	560351	560360	20 %	20 %	20 %	40 %	479152820
11562	NC_021014	TCT	2	6	560420	560425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152820
11563	NC_021014	GTT	2	6	560463	560468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152820
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11566	NC_021014	TGA	2	6	560801	560806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152820
11567	NC_021014	AGG	2	6	560881	560886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152820
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11569	NC_021014	ATG	2	6	560899	560904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152820
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11574	NC_021014	ATC	2	6	561135	561140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152820
11575	NC_021014	CTT	2	6	561144	561149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152820
11576	NC_021014	ATG	3	9	561303	561311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152820
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11578	NC_021014	CTT	2	6	561384	561389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11579	NC_021014	AGCGGA	2	12	561402	561413	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11580	NC_021014	GCT	2	6	561434	561439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11581	NC_021014	CTT	2	6	561472	561477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11582	NC_021014	T	6	6	561555	561560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_021014	TCT	2	6	561584	561589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11584	NC_021014	GGAG	2	8	561626	561633	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_021014	TAT	2	6	561642	561647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11586	NC_021014	AGG	2	6	561656	561661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_021014	CCA	2	6	561697	561702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11588	NC_021014	GCG	2	6	561805	561810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11589	NC_021014	GAA	2	6	561851	561856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_021014	GGA	2	6	561908	561913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11591	NC_021014	TG	3	6	561915	561920	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_021014	GGA	2	6	561953	561958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_021014	GAT	2	6	562146	562151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_021014	TCT	2	6	562187	562192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11595	NC_021014	GGAGC	2	10	562203	562212	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11596	NC_021014	AG	3	6	562239	562244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11597	NC_021014	CTT	2	6	562266	562271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11598	NC_021014	GCG	2	6	562276	562281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11599	NC_021014	GAA	2	6	562311	562316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11600	NC_021014	GCG	2	6	562381	562386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11601	NC_021014	TCA	2	6	562400	562405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11602	NC_021014	GGA	2	6	562412	562417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_021014	GGAA	2	8	562421	562428	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_021014	AGC	2	6	562429	562434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11605	NC_021014	ATT	2	6	562558	562563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11606	NC_021014	TAT	2	6	562674	562679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_021014	GAA	2	6	562712	562717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_021014	AAGA	2	8	562731	562738	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_021014	A	6	6	562749	562754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_021014	TCT	2	6	562803	562808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152821
11611	NC_021014	ATC	2	6	562832	562837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152821
11612	NC_021014	CGG	2	6	562908	562913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152821
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11614	NC_021014	TGTC	2	8	562947	562954	0 %	50 %	25 %	25 %	479152821
11615	NC_021014	GCG	2	6	562961	562966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152821
11616	NC_021014	TAT	2	6	562987	562992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152821
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11618	NC_021014	AG	3	6	563164	563169	50 %	0 %	50 %	0 %	479152821
11619	NC_021014	CGG	2	6	563262	563267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152821
11620	NC_021014	GAT	2	6	563371	563376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152821
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11622	NC_021014	TGG	2	6	563417	563422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152821
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11997	NC_021014	GGA	2	6	581470	581475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11998	NC_021014	AGG	2	6	581511	581516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11999	NC_021014	GCA	2	6	581557	581562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12000	NC_021014	AGC	2	6	581587	581592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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