MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021014	TGA	2	6	530889	530894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152789
11002	NC_021014	CGG	2	6	531056	531061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152789
11003	NC_021014	GCT	2	6	531103	531108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152789
11004	NC_021014	GA	3	6	531120	531125	50 %	0 %	50 %	0 %	479152789
11005	NC_021014	CCAGCA	2	12	531151	531162	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	479152789
11006	NC_021014	GGT	2	6	531167	531172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152789
11007	NC_021014	CTG	2	6	531218	531223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152789
11008	NC_021014	CAG	2	6	531295	531300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152789
11009	NC_021014	ATCCTC	2	12	531320	531331	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	479152789
11010	NC_021014	AGA	2	6	531368	531373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152789
11011	NC_021014	CCT	2	6	531391	531396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479152789
11012	NC_021014	GAA	2	6	531412	531417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152789
11013	NC_021014	CAG	2	6	531464	531469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152789
11014	NC_021014	CGCT	2	8	531482	531489	0 %	25 %	25 %	50 %	479152789
11015	NC_021014	TAG	2	6	531493	531498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152789
11016	NC_021014	AT	3	6	531502	531507	50 %	50 %	0 %	0 %	479152789
11017	NC_021014	CTT	2	6	531521	531526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152789
11018	NC_021014	GAA	2	6	531529	531534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152789
11019	NC_021014	TAA	2	6	531580	531585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152789
11020	NC_021014	TC	3	6	531587	531592	0 %	50 %	0 %	50 %	479152789
11021	NC_021014	A	7	7	531598	531604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_021014	CG	3	6	531640	531645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11023	NC_021014	GTATA	2	10	531654	531663	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_021014	A	7	7	531695	531701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_021014	TTA	2	6	531760	531765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_021014	T	6	6	531901	531906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_021014	TAAA	2	8	531918	531925	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_021014	ATC	2	6	531936	531941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11029	NC_021014	T	6	6	531977	531982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_021014	T	6	6	532020	532025	0 %	100 %	0 %	0 %	479152790
11031	NC_021014	ATT	2	6	532040	532045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152790
11032	NC_021014	A	6	6	532075	532080	100 %	0 %	0 %	0 %	479152790
11033	NC_021014	GCA	2	6	532081	532086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152790
11034	NC_021014	CAG	2	6	532141	532146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11035	NC_021014	GAT	2	6	532217	532222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152791
11036	NC_021014	AAC	2	6	532226	532231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152791
11037	NC_021014	GAAA	2	8	532277	532284	75 %	0 %	25 %	0 %	479152791
11038	NC_021014	CTG	2	6	532308	532313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152791
11039	NC_021014	GCA	2	6	532452	532457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152791
11040	NC_021014	GACA	2	8	532526	532533	50 %	0 %	25 %	25 %	479152791
11041	NC_021014	GAAA	2	8	532561	532568	75 %	0 %	25 %	0 %	479152791
11042	NC_021014	AGC	2	6	532616	532621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152791
11043	NC_021014	GCTG	2	8	532808	532815	0 %	25 %	50 %	25 %	479152791
11044	NC_021014	A	6	6	532817	532822	100 %	0 %	0 %	0 %	479152791
11045	NC_021014	CAT	2	6	532848	532853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152791
11046	NC_021014	A	6	6	532869	532874	100 %	0 %	0 %	0 %	479152791
11047	NC_021014	GTCA	2	8	532911	532918	25 %	25 %	25 %	25 %	479152791
11048	NC_021014	TGAA	2	8	532954	532961	50 %	25 %	25 %	0 %	479152791
11049	NC_021014	AC	3	6	533012	533017	50 %	0 %	0 %	50 %	479152791
11050	NC_021014	ATG	2	6	533041	533046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152791
11051	NC_021014	ATT	2	6	533083	533088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152791
11052	NC_021014	A	7	7	533216	533222	100 %	0 %	0 %	0 %	479152791
11053	NC_021014	GCA	2	6	533227	533232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152791
11054	NC_021014	ACA	2	6	533323	533328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152791
11055	NC_021014	TAA	2	6	533337	533342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152791
11056	NC_021014	TA	4	8	533360	533367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_021014	AG	3	6	533386	533391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_021014	GGC	2	6	533432	533437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11059	NC_021014	GAA	2	6	533455	533460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_021014	G	6	6	533474	533479	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_021014	TA	3	6	533543	533548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_021014	A	6	6	533555	533560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_021014	CAA	2	6	533569	533574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11064	NC_021014	ACA	2	6	533708	533713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11065	NC_021014	ACA	2	6	533770	533775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11066	NC_021014	CTG	2	6	533808	533813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11067	NC_021014	CAT	2	6	533848	533853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11068	NC_021014	GAT	2	6	533890	533895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_021014	GTT	2	6	533913	533918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11070	NC_021014	TGA	2	6	533936	533941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_021014	ATG	2	6	533982	533987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_021014	AAT	2	6	534014	534019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_021014	AT	3	6	534018	534023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11074	NC_021014	AAT	2	6	534064	534069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_021014	A	6	6	534263	534268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_021014	GGA	2	6	534329	534334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11077	NC_021014	GCTG	2	8	534371	534378	0 %	25 %	50 %	25 %	479152792
11078	NC_021014	CCG	2	6	534389	534394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479152792
11079	NC_021014	GTA	2	6	534403	534408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152792
11080	NC_021014	GAT	2	6	534427	534432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152792
11081	NC_021014	CGG	2	6	534477	534482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152792
11082	NC_021014	TCCG	2	8	534585	534592	0 %	25 %	25 %	50 %	479152792
11083	NC_021014	GCC	2	6	534643	534648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479152792
11084	NC_021014	CAC	2	6	534825	534830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479152792
11085	NC_021014	GCT	2	6	534835	534840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152792
11086	NC_021014	GGT	2	6	535104	535109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152792
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11089	NC_021014	CTA	2	6	535225	535230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152792
11090	NC_021014	GCT	2	6	535293	535298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152792
11091	NC_021014	TAT	2	6	535380	535385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152792
11092	NC_021014	CAG	2	6	535504	535509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152792
11093	NC_021014	CTA	2	6	535626	535631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152792
11094	NC_021014	TTG	2	6	535651	535656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152792
11095	NC_021014	CAT	2	6	535755	535760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152792
11096	NC_021014	GGC	2	6	535792	535797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152792
11097	NC_021014	GTT	2	6	535804	535809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152792
11098	NC_021014	GCT	2	6	535812	535817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152792
11099	NC_021014	CTG	2	6	535870	535875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152792
11100	NC_021014	A	6	6	536031	536036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_021014	ATT	2	6	536044	536049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152793
11102	NC_021014	TGG	2	6	536058	536063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152793
11103	NC_021014	AGCA	2	8	536104	536111	50 %	0 %	25 %	25 %	479152793
11104	NC_021014	TCA	2	6	536114	536119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152793
11105	NC_021014	AAT	2	6	536131	536136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152793
11106	NC_021014	GCA	2	6	536320	536325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152793
11107	NC_021014	TGT	3	9	536364	536372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152793
11108	NC_021014	ATA	2	6	536396	536401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152793
11109	NC_021014	ATT	2	6	536509	536514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152793
11110	NC_021014	GCG	2	6	536522	536527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152793
11111	NC_021014	AAG	2	6	536581	536586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152793
11112	NC_021014	TTG	2	6	536644	536649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152793
11113	NC_021014	AATA	2	8	536698	536705	75 %	25 %	0 %	0 %	479152793
11114	NC_021014	GCG	2	6	536780	536785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152793
11115	NC_021014	ATG	2	6	536812	536817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152793
11116	NC_021014	TGA	2	6	536859	536864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152793
11117	NC_021014	ATT	2	6	536935	536940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152793
11118	NC_021014	GCG	2	6	536948	536953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152793
11119	NC_021014	AGA	2	6	537147	537152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152793
11120	NC_021014	TGT	2	6	537162	537167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152793
11121	NC_021014	TGT	2	6	537186	537191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152793
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11123	NC_021014	GCA	2	6	537238	537243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152793
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11489	NC_021014	N	1452	1452	554577	556028	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11496	NC_021014	AAG	2	6	556290	556295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152816
11497	NC_021014	CTT	2	6	556299	556304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152816
11498	NC_021014	GAAA	2	8	556645	556652	75 %	0 %	25 %	0 %	479152816
11499	NC_021014	CTT	2	6	556674	556679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152816
11500	NC_021014	ATG	2	6	556698	556703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152816

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