MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_021014	TGC	2	6	483145	483150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152737
10003	NC_021014	CAG	2	6	483213	483218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152737
10004	NC_021014	GAAC	2	8	483247	483254	50 %	0 %	25 %	25 %	479152737
10005	NC_021014	CTG	2	6	483290	483295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152737
10006	NC_021014	GGA	2	6	483351	483356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152737
10007	NC_021014	GTA	2	6	483375	483380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152737
10008	NC_021014	GATC	2	8	483452	483459	25 %	25 %	25 %	25 %	479152737
10009	NC_021014	CTGG	2	8	483477	483484	0 %	25 %	50 %	25 %	479152737
10010	NC_021014	TGA	2	6	483491	483496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152737
10011	NC_021014	GCA	2	6	483633	483638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152737
10012	NC_021014	TCT	2	6	483647	483652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152737
10013	NC_021014	GCG	3	9	483738	483746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152737
10014	NC_021014	GCT	2	6	483767	483772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152737
10015	NC_021014	TGAA	2	8	483829	483836	50 %	25 %	25 %	0 %	479152737
10016	NC_021014	GAAA	2	8	483840	483847	75 %	0 %	25 %	0 %	479152737
10017	NC_021014	GAG	2	6	483948	483953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_021014	GAA	2	6	483982	483987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152738
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10054	NC_021014	AGA	2	6	485624	485629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_021014	T	7	7	485667	485673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10057	NC_021014	GAT	2	6	485776	485781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10062	NC_021014	GAA	2	6	486404	486409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10067	NC_021014	CAG	2	6	486730	486735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10099	NC_021014	AG	3	6	487876	487881	50 %	0 %	50 %	0 %	479152742
10100	NC_021014	GT	3	6	487947	487952	0 %	50 %	50 %	0 %	479152742
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10115	NC_021014	A	6	6	488649	488654	100 %	0 %	0 %	0 %	479152743
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10125	NC_021014	ATC	2	6	489148	489153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152743
10126	NC_021014	TCA	2	6	489191	489196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152743
10127	NC_021014	GA	3	6	489210	489215	50 %	0 %	50 %	0 %	479152743
10128	NC_021014	AT	3	6	489249	489254	50 %	50 %	0 %	0 %	479152743
10129	NC_021014	GAA	2	6	489398	489403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152743
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10138	NC_021014	AGCA	2	8	489697	489704	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10139	NC_021014	CAA	2	6	489771	489776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152744
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10144	NC_021014	ACA	2	6	490226	490231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152746
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10146	NC_021014	TGC	2	6	490277	490282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152746
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10154	NC_021014	A	6	6	490548	490553	100 %	0 %	0 %	0 %	479152747
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10157	NC_021014	GAA	2	6	490739	490744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10158	NC_021014	GGA	2	6	490748	490753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10159	NC_021014	ATT	2	6	490810	490815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10160	NC_021014	GCA	2	6	490854	490859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10161	NC_021014	AGCTG	2	10	490874	490883	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10162	NC_021014	GA	3	6	490895	490900	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10163	NC_021014	GCG	2	6	490912	490917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10166	NC_021014	GAA	2	6	490935	490940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10167	NC_021014	AT	3	6	490976	490981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10168	NC_021014	TA	3	6	491142	491147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10251	NC_021014	TGT	2	6	495027	495032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152750
10252	NC_021014	TATC	2	8	495096	495103	25 %	50 %	0 %	25 %	479152750
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10261	NC_021014	GAAA	2	8	495621	495628	75 %	0 %	25 %	0 %	479152751
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10281	NC_021014	A	7	7	496363	496369	100 %	0 %	0 %	0 %	479152752
10282	NC_021014	GGT	2	6	496376	496381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152752
10283	NC_021014	TGA	2	6	496406	496411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152752
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10285	NC_021014	TCT	2	6	496466	496471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10370	NC_021014	AG	3	6	499883	499888	50 %	0 %	50 %	0 %	479152755
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10372	NC_021014	AG	3	6	499924	499929	50 %	0 %	50 %	0 %	479152755
10373	NC_021014	GTT	2	6	499963	499968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152755
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10402	NC_021014	TGC	2	6	501357	501362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152755
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10474	NC_021014	GTAT	2	8	505491	505498	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10475	NC_021014	A	6	6	505513	505518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10477	NC_021014	AAAG	2	8	505642	505649	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10494	NC_021014	GAG	3	9	506578	506586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152758
10495	NC_021014	ATG	2	6	506624	506629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152759
10496	NC_021014	GGT	2	6	506650	506655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152759
10497	NC_021014	TGA	2	6	506714	506719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152759
10498	NC_021014	CAT	2	6	506727	506732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152759
10499	NC_021014	ATC	2	6	506737	506742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152759
10500	NC_021014	TGT	2	6	506763	506768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152759

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