MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8502	NC_021014	TCT	2	6	408246	408251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152664
8503	NC_021014	AAT	2	6	408309	408314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8504	NC_021014	CCG	2	6	408321	408326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8505	NC_021014	CGG	2	6	408356	408361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8506	NC_021014	T	6	6	408364	408369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8507	NC_021014	T	7	7	408470	408476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8508	NC_021014	TCTG	2	8	408559	408566	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8509	NC_021014	A	6	6	408699	408704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8510	NC_021014	GCA	2	6	408719	408724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8511	NC_021014	AT	3	6	408797	408802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8512	NC_021014	ACC	2	6	408917	408922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8513	NC_021014	GCG	2	6	409056	409061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8514	NC_021014	A	6	6	409139	409144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8515	NC_021014	T	6	6	409172	409177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8516	NC_021014	AGA	2	6	409243	409248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8517	NC_021014	GAT	2	6	409277	409282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8518	NC_021014	GAA	2	6	409368	409373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8519	NC_021014	CAG	2	6	409515	409520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8520	NC_021014	CGT	2	6	409521	409526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8521	NC_021014	TTG	2	6	409536	409541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8522	NC_021014	TG	3	6	409561	409566	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_021014	TAT	2	6	409587	409592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8524	NC_021014	TCT	3	9	409598	409606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8525	NC_021014	ATG	2	6	409609	409614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8526	NC_021014	CAG	2	6	409679	409684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8527	NC_021014	AGAA	2	8	409708	409715	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8528	NC_021014	GAG	2	6	409764	409769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8529	NC_021014	AGA	2	6	409783	409788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152665
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8533	NC_021014	CTG	2	6	409858	409863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152665
8534	NC_021014	GAT	2	6	409878	409883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152665
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8538	NC_021014	TGA	2	6	410019	410024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152665
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8540	NC_021014	GAG	2	6	410056	410061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152665
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8542	NC_021014	CAGA	2	8	410128	410135	50 %	0 %	25 %	25 %	479152665
8543	NC_021014	GAA	2	6	410152	410157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152665
8544	NC_021014	CAA	2	6	410240	410245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152665
8545	NC_021014	ACTG	2	8	410256	410263	25 %	25 %	25 %	25 %	479152665
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8551	NC_021014	A	7	7	410587	410593	100 %	0 %	0 %	0 %	479152665
8552	NC_021014	TACT	2	8	410694	410701	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8553	NC_021014	ATT	2	6	410703	410708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8554	NC_021014	ACA	2	6	410713	410718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8555	NC_021014	GGA	2	6	410719	410724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8564	NC_021014	AGA	2	6	411304	411309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152666
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8566	NC_021014	CAGA	2	8	411387	411394	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8567	NC_021014	GGAG	2	8	411413	411420	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8568	NC_021014	TTATC	2	10	411441	411450	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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8570	NC_021014	CGG	2	6	411615	411620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8571	NC_021014	CTAT	2	8	411646	411653	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8572	NC_021014	TGC	2	6	411662	411667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8574	NC_021014	TGC	2	6	411675	411680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8575	NC_021014	TGG	2	6	411713	411718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8577	NC_021014	GTTT	2	8	411785	411792	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8578	NC_021014	ATG	2	6	411793	411798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8581	NC_021014	GCTG	2	8	411848	411855	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8582	NC_021014	ATCT	2	8	411856	411863	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8583	NC_021014	GCG	2	6	411910	411915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8584	NC_021014	GGGA	2	8	411969	411976	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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8586	NC_021014	TGG	2	6	412082	412087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8587	NC_021014	TGA	2	6	412112	412117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8588	NC_021014	GAT	2	6	412140	412145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8589	NC_021014	GGA	2	6	412147	412152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8590	NC_021014	CTGC	2	8	412225	412232	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8591	NC_021014	T	7	7	412317	412323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8592	NC_021014	TGC	2	6	412346	412351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8593	NC_021014	TA	3	6	412361	412366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8594	NC_021014	TATT	2	8	412374	412381	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8595	NC_021014	CGT	2	6	412477	412482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8599	NC_021014	GAA	2	6	412741	412746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152667
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8601	NC_021014	AGG	2	6	412838	412843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152667
8602	NC_021014	A	6	6	412861	412866	100 %	0 %	0 %	0 %	479152668
8603	NC_021014	GCA	2	6	412869	412874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152668
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8606	NC_021014	GATG	2	8	413026	413033	25 %	25 %	50 %	0 %	479152668
8607	NC_021014	T	6	6	413071	413076	0 %	100 %	0 %	0 %	479152668
8608	NC_021014	AT	3	6	413095	413100	50 %	50 %	0 %	0 %	479152668
8609	NC_021014	CAG	2	6	413162	413167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152668
8610	NC_021014	ATG	2	6	413183	413188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152668
8611	NC_021014	TGGA	2	8	413202	413209	25 %	25 %	50 %	0 %	479152668
8612	NC_021014	GAA	2	6	413242	413247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152668
8613	NC_021014	TGA	2	6	413299	413304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152668
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8615	NC_021014	GGA	2	6	413456	413461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152668
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8617	NC_021014	GT	3	6	413515	413520	0 %	50 %	50 %	0 %	479152668
8618	NC_021014	AGAA	2	8	413535	413542	75 %	0 %	25 %	0 %	479152668
8619	NC_021014	GAA	3	9	413540	413548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152668
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8621	NC_021014	TTA	2	6	413601	413606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152668
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8623	NC_021014	AG	3	6	413624	413629	50 %	0 %	50 %	0 %	479152668
8624	NC_021014	A	6	6	413650	413655	100 %	0 %	0 %	0 %	479152668
8625	NC_021014	GAA	2	6	413690	413695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152668
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8627	NC_021014	T	6	6	413961	413966	0 %	100 %	0 %	0 %	479152669
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