MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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72502	NC_021014	TTC	2	6	3460697	3460702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155477
72503	NC_021014	ACG	2	6	3460736	3460741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155477
72504	NC_021014	CAC	2	6	3460765	3460770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155477
72505	NC_021014	TGC	2	6	3460828	3460833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155477
72506	NC_021014	TCA	2	6	3460938	3460943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155477
72507	NC_021014	GATA	2	8	3461029	3461036	50 %	25 %	25 %	0 %	479155477
72508	NC_021014	TGA	2	6	3461236	3461241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155477
72509	NC_021014	T	6	6	3461352	3461357	0 %	100 %	0 %	0 %	479155477
72510	NC_021014	CAT	2	6	3461425	3461430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155477
72511	NC_021014	TCT	2	6	3461448	3461453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155477
72512	NC_021014	GCC	2	6	3461501	3461506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72513	NC_021014	GTCCG	2	10	3461550	3461559	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
72514	NC_021014	GAA	2	6	3461793	3461798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155478
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72516	NC_021014	TGA	2	6	3461857	3461862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155478
72517	NC_021014	A	7	7	3461880	3461886	100 %	0 %	0 %	0 %	479155478
72518	NC_021014	CAGA	2	8	3461937	3461944	50 %	0 %	25 %	25 %	479155478
72519	NC_021014	TAA	2	6	3461946	3461951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155478
72520	NC_021014	GAT	2	6	3462047	3462052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155478
72521	NC_021014	AGGA	2	8	3462062	3462069	50 %	0 %	50 %	0 %	479155478
72522	NC_021014	CTT	2	6	3462089	3462094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155478
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72530	NC_021014	ATTT	2	8	3462992	3462999	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72531	NC_021014	TTTCT	2	10	3463006	3463015	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
72532	NC_021014	AAG	2	6	3463033	3463038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72533	NC_021014	GATCAG	2	12	3463042	3463053	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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72536	NC_021014	T	7	7	3463106	3463112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72537	NC_021014	TGT	2	6	3463144	3463149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72538	NC_021014	CGGT	2	8	3463230	3463237	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72539	NC_021014	GGAA	2	8	3463373	3463380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72540	NC_021014	GCC	2	6	3463387	3463392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72541	NC_021014	AT	3	6	3463493	3463498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72542	NC_021014	TAT	2	6	3463503	3463508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72543	NC_021014	GAT	2	6	3463614	3463619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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72545	NC_021014	GAT	2	6	3463663	3463668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72546	NC_021014	GAA	2	6	3463748	3463753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72547	NC_021014	ATC	2	6	3463762	3463767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72548	NC_021014	GC	3	6	3463820	3463825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72549	NC_021014	TCA	2	6	3463830	3463835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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72551	NC_021014	GAT	2	6	3463906	3463911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72552	NC_021014	TCC	2	6	3463928	3463933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72553	NC_021014	TG	3	6	3463955	3463960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72554	NC_021014	TGG	2	6	3464028	3464033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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72557	NC_021014	CATC	2	8	3464133	3464140	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72558	NC_021014	TGGT	2	8	3464192	3464199	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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72563	NC_021014	T	6	6	3464300	3464305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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72592	NC_021014	CATTT	2	10	3465508	3465517	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
72593	NC_021014	TGT	2	6	3465529	3465534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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72601	NC_021014	T	6	6	3465881	3465886	0 %	100 %	0 %	0 %	479155481
72602	NC_021014	AG	3	6	3465905	3465910	50 %	0 %	50 %	0 %	479155481
72603	NC_021014	AAG	3	9	3465915	3465923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155481
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72612	NC_021014	CTC	2	6	3466326	3466331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155481
72613	NC_021014	AT	3	6	3466343	3466348	50 %	50 %	0 %	0 %	479155481
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72623	NC_021014	TCT	2	6	3466887	3466892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155482
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72737	NC_021014	TTTC	2	8	3471321	3471328	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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72980	NC_021014	GATCTT	2	12	3481994	3482005	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479155498
72981	NC_021014	AAC	2	6	3482111	3482116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155498
72982	NC_021014	AGC	3	9	3482216	3482224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155498
72983	NC_021014	CTGA	2	8	3482260	3482267	25 %	25 %	25 %	25 %	479155498
72984	NC_021014	AAATA	2	10	3482371	3482380	80 %	20 %	0 %	0 %	479155498
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72986	NC_021014	TCTG	2	8	3482473	3482480	0 %	50 %	25 %	25 %	479155498
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