MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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72121	NC_021014	TGT	2	6	3440929	3440934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155468
72122	NC_021014	AT	3	6	3440957	3440962	50 %	50 %	0 %	0 %	479155468
72123	NC_021014	GAA	2	6	3440972	3440977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155468
72124	NC_021014	TCA	2	6	3441006	3441011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155468
72125	NC_021014	TTC	2	6	3441013	3441018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155468
72126	NC_021014	GATT	2	8	3441150	3441157	25 %	50 %	25 %	0 %	479155468
72127	NC_021014	ATCC	2	8	3441227	3441234	25 %	25 %	0 %	50 %	479155468
72128	NC_021014	ACTG	2	8	3441242	3441249	25 %	25 %	25 %	25 %	479155468
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72132	NC_021014	TCA	2	6	3441398	3441403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155468
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72141	NC_021014	CTG	2	6	3441827	3441832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155468
72142	NC_021014	CTG	2	6	3441852	3441857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155468
72143	NC_021014	GCT	2	6	3441926	3441931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155468
72144	NC_021014	TGT	2	6	3441945	3441950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155468
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72146	NC_021014	CTGTC	2	10	3442097	3442106	0 %	40 %	20 %	40 %	479155468
72147	NC_021014	TTCTG	2	10	3442154	3442163	0 %	60 %	20 %	20 %	479155468
72148	NC_021014	ATTT	2	8	3442290	3442297	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72149	NC_021014	A	6	6	3442353	3442358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72150	NC_021014	T	6	6	3442422	3442427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72151	NC_021014	AGA	2	6	3442526	3442531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72152	NC_021014	T	8	8	3442542	3442549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72153	NC_021014	CTG	2	6	3442642	3442647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72154	NC_021014	T	6	6	3442711	3442716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72155	NC_021014	CCA	2	6	3442771	3442776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72156	NC_021014	TCA	2	6	3442780	3442785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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72159	NC_021014	CCTG	2	8	3442960	3442967	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72160	NC_021014	GCC	2	6	3443071	3443076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72161	NC_021014	TTC	2	6	3443103	3443108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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72164	NC_021014	TTC	2	6	3443247	3443252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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72200	NC_021014	TCC	2	6	3444945	3444950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72201	NC_021014	A	6	6	3444965	3444970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72202	NC_021014	T	7	7	3445110	3445116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72203	NC_021014	TTCT	2	8	3445124	3445131	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72204	NC_021014	ACA	2	6	3445240	3445245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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72209	NC_021014	ATA	2	6	3445478	3445483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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72216	NC_021014	T	6	6	3445721	3445726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72217	NC_021014	CA	3	6	3445790	3445795	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72218	NC_021014	GAAA	2	8	3445796	3445803	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72219	NC_021014	ATG	2	6	3445854	3445859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72220	NC_021014	GAC	2	6	3445906	3445911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72221	NC_021014	AAG	2	6	3445955	3445960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72222	NC_021014	AAT	2	6	3445973	3445978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72223	NC_021014	AT	3	6	3445995	3446000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72224	NC_021014	TGGAC	2	10	3446014	3446023	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
72225	NC_021014	CCAGG	2	10	3446060	3446069	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
72226	NC_021014	AGG	2	6	3446074	3446079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72227	NC_021014	GAC	2	6	3446113	3446118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72228	NC_021014	ATG	2	6	3446247	3446252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72229	NC_021014	TA	3	6	3446306	3446311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72230	NC_021014	T	6	6	3446342	3446347	0 %	100 %	0 %	0 %	479155470
72231	NC_021014	A	6	6	3446417	3446422	100 %	0 %	0 %	0 %	479155470
72232	NC_021014	CCA	2	6	3446443	3446448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155470
72233	NC_021014	AGATA	2	10	3446496	3446505	60 %	20 %	20 %	0 %	479155470
72234	NC_021014	GAA	2	6	3446519	3446524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155470
72235	NC_021014	TCC	2	6	3446648	3446653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155470
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72238	NC_021014	A	6	6	3446736	3446741	100 %	0 %	0 %	0 %	479155470
72239	NC_021014	TCT	2	6	3446742	3446747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155470
72240	NC_021014	TAA	2	6	3446813	3446818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155470
72241	NC_021014	CAT	2	6	3446826	3446831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155470
72242	NC_021014	ATC	2	6	3446858	3446863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155470
72243	NC_021014	CTT	2	6	3446884	3446889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155470
72244	NC_021014	GCA	2	6	3446903	3446908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155470
72245	NC_021014	TCC	2	6	3446915	3446920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155470
72246	NC_021014	AGC	2	6	3446957	3446962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155470
72247	NC_021014	CTG	2	6	3447005	3447010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155470
72248	NC_021014	CCG	2	6	3447057	3447062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155470
72249	NC_021014	AAAC	2	8	3447063	3447070	75 %	0 %	0 %	25 %	479155470
72250	NC_021014	GTCT	2	8	3447128	3447135	0 %	50 %	25 %	25 %	479155470
72251	NC_021014	ACT	2	6	3447191	3447196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155470
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72254	NC_021014	AAAG	2	8	3447273	3447280	75 %	0 %	25 %	0 %	479155471
72255	NC_021014	T	6	6	3447305	3447310	0 %	100 %	0 %	0 %	479155471
72256	NC_021014	CCAG	2	8	3447319	3447326	25 %	0 %	25 %	50 %	479155471
72257	NC_021014	CGG	2	6	3447360	3447365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479155471
72258	NC_021014	CAGA	2	8	3447467	3447474	50 %	0 %	25 %	25 %	479155471
72259	NC_021014	CAT	2	6	3447481	3447486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155471
72260	NC_021014	CCT	2	6	3447516	3447521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155471
72261	NC_021014	CTTC	2	8	3447535	3447542	0 %	50 %	0 %	50 %	479155471
72262	NC_021014	TCA	3	9	3447544	3447552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155471
72263	NC_021014	TGC	2	6	3447557	3447562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155471
72264	NC_021014	CA	3	6	3447566	3447571	50 %	0 %	0 %	50 %	479155471
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72269	NC_021014	TCC	2	6	3447900	3447905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155471
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72272	NC_021014	T	6	6	3447988	3447993	0 %	100 %	0 %	0 %	479155471
72273	NC_021014	TTTC	2	8	3448024	3448031	0 %	75 %	0 %	25 %	479155471
72274	NC_021014	CTTG	2	8	3448193	3448200	0 %	50 %	25 %	25 %	479155471
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72295	NC_021014	TGA	2	6	3449134	3449139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72296	NC_021014	CAT	2	6	3449156	3449161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72297	NC_021014	T	7	7	3449161	3449167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72298	NC_021014	AG	3	6	3449175	3449180	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72299	NC_021014	GTAT	2	8	3449204	3449211	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72300	NC_021014	ATT	2	6	3449225	3449230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72301	NC_021014	T	6	6	3449229	3449234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72302	NC_021014	A	6	6	3449258	3449263	100 %	0 %	0 %	0 %	479155472
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72314	NC_021014	CGG	2	6	3450004	3450009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479155472
72315	NC_021014	ACC	2	6	3450020	3450025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155472
72316	NC_021014	TAC	2	6	3450070	3450075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155472
72317	NC_021014	AGT	2	6	3450085	3450090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155472
72318	NC_021014	GAT	2	6	3450182	3450187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155472
72319	NC_021014	CGG	2	6	3450202	3450207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479155472
72320	NC_021014	GAC	2	6	3450239	3450244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155472
72321	NC_021014	TCCC	2	8	3450334	3450341	0 %	25 %	0 %	75 %	479155472
72322	NC_021014	ATG	2	6	3450369	3450374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155472
72323	NC_021014	CTG	2	6	3450467	3450472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155472
72324	NC_021014	ATC	2	6	3450488	3450493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155472
72325	NC_021014	A	6	6	3450535	3450540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72326	NC_021014	CCT	2	6	3450543	3450548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155473
72327	NC_021014	T	7	7	3450582	3450588	0 %	100 %	0 %	0 %	479155473
72328	NC_021014	TC	3	6	3450595	3450600	0 %	50 %	0 %	50 %	479155473
72329	NC_021014	AGC	2	6	3450659	3450664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155474
72330	NC_021014	T	7	7	3450710	3450716	0 %	100 %	0 %	0 %	479155474
72331	NC_021014	ATA	2	6	3450824	3450829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155474
72332	NC_021014	GATCAG	2	12	3450848	3450859	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479155474
72333	NC_021014	CAG	3	9	3450866	3450874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155474
72334	NC_021014	CTG	2	6	3450943	3450948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155474
72335	NC_021014	TTC	2	6	3450975	3450980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155474
72336	NC_021014	CCCA	2	8	3451016	3451023	25 %	0 %	0 %	75 %	479155474
72337	NC_021014	CAG	2	6	3451115	3451120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155474
72338	NC_021014	TGC	2	6	3451128	3451133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155474
72339	NC_021014	CAA	2	6	3451216	3451221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155474
72340	NC_021014	TTC	2	6	3451255	3451260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155474
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72342	NC_021014	CT	3	6	3451366	3451371	0 %	50 %	0 %	50 %	479155474
72343	NC_021014	ATCC	2	8	3451434	3451441	25 %	25 %	0 %	50 %	479155474
72344	NC_021014	TAT	2	6	3451447	3451452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155474
72345	NC_021014	ATC	2	6	3451551	3451556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155474
72346	NC_021014	CAC	2	6	3451685	3451690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155474
72347	NC_021014	CGC	2	6	3451733	3451738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155474
72348	NC_021014	CAG	2	6	3451792	3451797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155474
72349	NC_021014	ATA	2	6	3451820	3451825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155474
72350	NC_021014	CCA	2	6	3451912	3451917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155474
72351	NC_021014	T	6	6	3451927	3451932	0 %	100 %	0 %	0 %	479155474
72352	NC_021014	TGC	2	6	3451988	3451993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72353	NC_021014	CT	3	6	3452017	3452022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72354	NC_021014	T	6	6	3452035	3452040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72355	NC_021014	CCT	2	6	3452057	3452062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155475
72356	NC_021014	AG	3	6	3452074	3452079	50 %	0 %	50 %	0 %	479155475
72357	NC_021014	GGA	2	6	3452132	3452137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479155475
72358	NC_021014	TGGATT	2	12	3452216	3452227	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	479155475
72359	NC_021014	CAT	2	6	3452370	3452375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155475
72360	NC_021014	GAT	2	6	3452412	3452417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155475
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72362	NC_021014	CTG	2	6	3452448	3452453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155475
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72475	NC_021014	T	6	6	3459074	3459079	0 %	100 %	0 %	0 %	479155476
72476	NC_021014	AGA	2	6	3459166	3459171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155476
72477	NC_021014	CTTTT	2	10	3459177	3459186	0 %	80 %	0 %	20 %	479155476
72478	NC_021014	TCC	2	6	3459217	3459222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155476
72479	NC_021014	AAGAA	2	10	3459255	3459264	80 %	0 %	20 %	0 %	479155476
72480	NC_021014	TCT	2	6	3459284	3459289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155476
72481	NC_021014	CTG	2	6	3459332	3459337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155476
72482	NC_021014	CTT	2	6	3459361	3459366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155476
72483	NC_021014	GTA	2	6	3459435	3459440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155476
72484	NC_021014	CAG	2	6	3459471	3459476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155476
72485	NC_021014	A	6	6	3459541	3459546	100 %	0 %	0 %	0 %	479155476
72486	NC_021014	TG	3	6	3459555	3459560	0 %	50 %	50 %	0 %	479155476
72487	NC_021014	TCC	2	6	3459562	3459567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155476
72488	NC_021014	GAA	2	6	3459656	3459661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155476
72489	NC_021014	TAC	2	6	3459720	3459725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155476
72490	NC_021014	GTCAT	2	10	3459751	3459760	20 %	40 %	20 %	20 %	479155476
72491	NC_021014	TCC	2	6	3460003	3460008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155476
72492	NC_021014	AAT	2	6	3460076	3460081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155476
72493	NC_021014	TAA	2	6	3460096	3460101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155476
72494	NC_021014	TCC	2	6	3460128	3460133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72495	NC_021014	AC	3	6	3460208	3460213	50 %	0 %	0 %	50 %	479155477
72496	NC_021014	AT	3	6	3460278	3460283	50 %	50 %	0 %	0 %	479155477
72497	NC_021014	GCCT	2	8	3460334	3460341	0 %	25 %	25 %	50 %	479155477
72498	NC_021014	GATCG	2	10	3460427	3460436	20 %	20 %	40 %	20 %	479155477
72499	NC_021014	ATC	2	6	3460517	3460522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155477
72500	NC_021014	TTCAGG	2	12	3460581	3460592	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479155477

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