MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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71502	NC_021014	TCT	2	6	3412278	3412283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155448
71503	NC_021014	TTC	2	6	3412320	3412325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155448
71504	NC_021014	ACA	2	6	3412331	3412336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155448
71505	NC_021014	GCA	2	6	3412341	3412346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155448
71506	NC_021014	TGAC	2	8	3412451	3412458	25 %	25 %	25 %	25 %	479155448
71507	NC_021014	ACTT	2	8	3412499	3412506	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71508	NC_021014	AGC	2	6	3412550	3412555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71509	NC_021014	A	7	7	3412558	3412564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71510	NC_021014	TATT	2	8	3412614	3412621	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71511	NC_021014	ACTT	2	8	3412652	3412659	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71512	NC_021014	TAT	2	6	3412728	3412733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71513	NC_021014	TAA	3	9	3412803	3412811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71514	NC_021014	TCA	2	6	3412836	3412841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71515	NC_021014	AAC	2	6	3412864	3412869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71516	NC_021014	ATC	2	6	3412882	3412887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71517	NC_021014	TTC	2	6	3413010	3413015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71518	NC_021014	CTTTT	2	10	3413023	3413032	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
71519	NC_021014	TCC	2	6	3413051	3413056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71520	NC_021014	AAT	2	6	3413070	3413075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71521	NC_021014	GCT	3	9	3413105	3413113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71522	NC_021014	TCA	2	6	3413133	3413138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71523	NC_021014	CCT	2	6	3413190	3413195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71524	NC_021014	CGTC	2	8	3413234	3413241	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71525	NC_021014	TCC	2	6	3413300	3413305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71526	NC_021014	CTA	2	6	3413394	3413399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71527	NC_021014	CTT	2	6	3413440	3413445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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71529	NC_021014	ACA	2	6	3413459	3413464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71530	NC_021014	GCG	2	6	3413504	3413509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71531	NC_021014	GCA	2	6	3413514	3413519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71532	NC_021014	TCC	2	6	3413522	3413527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71533	NC_021014	TTG	2	6	3413534	3413539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71534	NC_021014	GC	3	6	3413718	3413723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71535	NC_021014	CCA	2	6	3413733	3413738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71536	NC_021014	TGG	2	6	3413757	3413762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71537	NC_021014	TCC	2	6	3413794	3413799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71538	NC_021014	AGA	2	6	3413851	3413856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71539	NC_021014	CTC	2	6	3413872	3413877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71540	NC_021014	ACC	2	6	3413911	3413916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71541	NC_021014	CTT	2	6	3413946	3413951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71542	NC_021014	ACA	3	9	3414089	3414097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71543	NC_021014	CT	4	8	3414145	3414152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71544	NC_021014	TC	3	6	3414234	3414239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71545	NC_021014	GAA	2	6	3414345	3414350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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71547	NC_021014	TGT	2	6	3414391	3414396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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71549	NC_021014	GCA	2	6	3414507	3414512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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71551	NC_021014	TC	3	6	3414610	3414615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71552	NC_021014	ATA	2	6	3414655	3414660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71553	NC_021014	CTGC	2	8	3414672	3414679	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71554	NC_021014	TCT	2	6	3414781	3414786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155449
71555	NC_021014	GCT	2	6	3414859	3414864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155449
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71557	NC_021014	GCT	2	6	3414967	3414972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155449
71558	NC_021014	CTT	2	6	3414990	3414995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155449
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71560	NC_021014	CTG	2	6	3415025	3415030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155449
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71564	NC_021014	AT	3	6	3415104	3415109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71565	NC_021014	ATTTTT	2	12	3415111	3415122	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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71567	NC_021014	A	7	7	3415186	3415192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71568	NC_021014	TG	3	6	3415205	3415210	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71569	NC_021014	ATCT	2	8	3415277	3415284	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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71572	NC_021014	GCA	2	6	3415365	3415370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155450
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71587	NC_021014	AT	3	6	3416105	3416110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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71607	NC_021014	GTT	2	6	3416981	3416986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155452
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71617	NC_021014	TCT	2	6	3417699	3417704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155453
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71622	NC_021014	CAT	2	6	3417891	3417896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155453
71623	NC_021014	GTA	2	6	3417898	3417903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155453
71624	NC_021014	TGG	2	6	3417959	3417964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155453
71625	NC_021014	GAT	2	6	3418021	3418026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155453
71626	NC_021014	GAA	2	6	3418195	3418200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155453
71627	NC_021014	GAC	2	6	3418216	3418221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155453
71628	NC_021014	ATC	2	6	3418234	3418239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155453
71629	NC_021014	CTT	2	6	3418245	3418250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155453
71630	NC_021014	ATG	2	6	3418393	3418398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155453
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71633	NC_021014	CAG	2	6	3418531	3418536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155454
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71640	NC_021014	GCT	2	6	3418920	3418925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155454
71641	NC_021014	CTG	2	6	3419000	3419005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155454
71642	NC_021014	TG	3	6	3419004	3419009	0 %	50 %	50 %	0 %	479155454
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71667	NC_021014	CTGC	2	8	3420311	3420318	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71668	NC_021014	CAT	2	6	3420329	3420334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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71691	NC_021014	TTCA	2	8	3421514	3421521	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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71693	NC_021014	ACTT	2	8	3421539	3421546	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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71730	NC_021014	ATA	2	6	3422901	3422906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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71733	NC_021014	T	6	6	3423093	3423098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71734	NC_021014	GCCA	2	8	3423138	3423145	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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71736	NC_021014	TCC	2	6	3423241	3423246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71737	NC_021014	CATT	2	8	3423290	3423297	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71738	NC_021014	AC	3	6	3423333	3423338	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71739	NC_021014	ACA	2	6	3423443	3423448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71740	NC_021014	TA	3	6	3423469	3423474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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