MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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71003	NC_021014	TAA	2	6	3385821	3385826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155422
71004	NC_021014	TCT	2	6	3385828	3385833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155422
71005	NC_021014	CTT	2	6	3385841	3385846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155422
71006	NC_021014	TTTC	2	8	3386004	3386011	0 %	75 %	0 %	25 %	479155422
71007	NC_021014	CCT	2	6	3386052	3386057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71008	NC_021014	TTAT	2	8	3386059	3386066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71009	NC_021014	A	6	6	3386103	3386108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71010	NC_021014	AAAT	2	8	3386130	3386137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71011	NC_021014	TTA	2	6	3386219	3386224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71012	NC_021014	TAT	2	6	3386225	3386230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71013	NC_021014	T	6	6	3386253	3386258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71014	NC_021014	CAA	2	6	3386270	3386275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71015	NC_021014	CTG	2	6	3386340	3386345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155423
71016	NC_021014	CGG	2	6	3386386	3386391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479155423
71017	NC_021014	TC	3	6	3386492	3386497	0 %	50 %	0 %	50 %	479155423
71018	NC_021014	TGG	2	6	3386526	3386531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155423
71019	NC_021014	CTTC	2	8	3386598	3386605	0 %	50 %	0 %	50 %	479155423
71020	NC_021014	T	6	6	3386700	3386705	0 %	100 %	0 %	0 %	479155423
71021	NC_021014	TCC	2	6	3386768	3386773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155423
71022	NC_021014	T	6	6	3386898	3386903	0 %	100 %	0 %	0 %	479155423
71023	NC_021014	AGC	2	6	3386909	3386914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155423
71024	NC_021014	CAT	2	6	3386991	3386996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155423
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71028	NC_021014	TGCC	2	8	3387099	3387106	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71029	NC_021014	T	6	6	3387256	3387261	0 %	100 %	0 %	0 %	479155424
71030	NC_021014	CCA	2	6	3387297	3387302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155424
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71035	NC_021014	CAT	3	9	3387506	3387514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155424
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71037	NC_021014	TC	3	6	3387563	3387568	0 %	50 %	0 %	50 %	479155424
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71040	NC_021014	TGA	2	6	3387688	3387693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155424
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71092	NC_021014	T	7	7	3390501	3390507	0 %	100 %	0 %	0 %	479155428
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71102	NC_021014	CAT	2	6	3391297	3391302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155428
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71111	NC_021014	GCA	2	6	3391863	3391868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155428
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71118	NC_021014	CT	4	8	3392036	3392043	0 %	50 %	0 %	50 %	479155428
71119	NC_021014	AAG	2	6	3392117	3392122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155428
71120	NC_021014	TGC	2	6	3392317	3392322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155428
71121	NC_021014	TCC	2	6	3392403	3392408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155428
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71125	NC_021014	GCT	2	6	3392595	3392600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155428
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71133	NC_021014	ATG	2	6	3392924	3392929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155429
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71197	NC_021014	TA	3	6	3396112	3396117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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71235	NC_021014	A	7	7	3398011	3398017	100 %	0 %	0 %	0 %	479155434
71236	NC_021014	TA	3	6	3398018	3398023	50 %	50 %	0 %	0 %	479155434
71237	NC_021014	CTTT	2	8	3398047	3398054	0 %	75 %	0 %	25 %	479155434
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71239	NC_021014	T	6	6	3398159	3398164	0 %	100 %	0 %	0 %	479155434
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71256	NC_021014	AGG	2	6	3398861	3398866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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71288	NC_021014	N	554	554	3400903	3401456	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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71317	NC_021014	CTG	2	6	3402687	3402692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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71330	NC_021014	A	6	6	3403416	3403421	100 %	0 %	0 %	0 %	479155439
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71341	NC_021014	GAA	2	6	3403799	3403804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155439
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71343	NC_021014	TTA	2	6	3403844	3403849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155439
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71345	NC_021014	ATTC	2	8	3403895	3403902	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71346	NC_021014	ACC	2	6	3403995	3404000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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71350	NC_021014	TAA	2	6	3404048	3404053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155440
71351	NC_021014	GAT	2	6	3404100	3404105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155440
71352	NC_021014	AAAT	2	8	3404137	3404144	75 %	25 %	0 %	0 %	479155440
71353	NC_021014	TAT	2	6	3404169	3404174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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71355	NC_021014	ATT	2	6	3404213	3404218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71356	NC_021014	AAAGG	2	10	3404227	3404236	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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71377	NC_021014	AT	3	6	3405037	3405042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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71384	NC_021014	ATA	2	6	3405250	3405255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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71476	NC_021014	ATC	2	6	3411142	3411147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155447
71477	NC_021014	T	6	6	3411166	3411171	0 %	100 %	0 %	0 %	479155447
71478	NC_021014	GAA	2	6	3411181	3411186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155447
71479	NC_021014	TCTGAT	2	12	3411310	3411321	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71480	NC_021014	T	6	6	3411338	3411343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71481	NC_021014	ATC	2	6	3411358	3411363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71482	NC_021014	AT	3	6	3411383	3411388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71483	NC_021014	TATT	2	8	3411394	3411401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71484	NC_021014	CAGT	2	8	3411438	3411445	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71485	NC_021014	GCA	2	6	3411526	3411531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71486	NC_021014	AGG	2	6	3411537	3411542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71487	NC_021014	T	6	6	3411543	3411548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71488	NC_021014	CT	3	6	3411605	3411610	0 %	50 %	0 %	50 %	479155448
71489	NC_021014	TTA	2	6	3411618	3411623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155448
71490	NC_021014	CA	4	8	3411637	3411644	50 %	0 %	0 %	50 %	479155448
71491	NC_021014	CA	3	6	3411705	3411710	50 %	0 %	0 %	50 %	479155448
71492	NC_021014	TTTATC	2	12	3411742	3411753	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479155448
71493	NC_021014	A	6	6	3411836	3411841	100 %	0 %	0 %	0 %	479155448
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71496	NC_021014	TCT	2	6	3412022	3412027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155448
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71498	NC_021014	A	6	6	3412108	3412113	100 %	0 %	0 %	0 %	479155448
71499	NC_021014	CAA	2	6	3412185	3412190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155448
71500	NC_021014	A	7	7	3412217	3412223	100 %	0 %	0 %	0 %	479155448

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