MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
70001	NC_021014	CGG	2	6	3340357	3340362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70002	NC_021014	CTC	2	6	3340406	3340411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70003	NC_021014	TCC	2	6	3340413	3340418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70004	NC_021014	AT	3	6	3340437	3340442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70005	NC_021014	CAC	2	6	3340456	3340461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70006	NC_021014	CTC	2	6	3340484	3340489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70007	NC_021014	TCC	2	6	3340506	3340511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70008	NC_021014	AGA	2	6	3340520	3340525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70009	NC_021014	TCC	2	6	3340557	3340562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70010	NC_021014	CTGT	2	8	3340621	3340628	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70011	NC_021014	CGT	2	6	3340676	3340681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70012	NC_021014	CCG	2	6	3340693	3340698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70013	NC_021014	TCT	2	6	3340713	3340718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70014	NC_021014	TTC	2	6	3340724	3340729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70015	NC_021014	CA	4	8	3340805	3340812	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70016	NC_021014	AAG	2	6	3340814	3340819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70017	NC_021014	TTC	2	6	3340830	3340835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70018	NC_021014	TTC	2	6	3340905	3340910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155377
70019	NC_021014	CGATCC	2	12	3340951	3340962	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479155377
70020	NC_021014	TCT	2	6	3340992	3340997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155377
70021	NC_021014	TGT	2	6	3341066	3341071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155377
70022	NC_021014	CT	3	6	3341104	3341109	0 %	50 %	0 %	50 %	479155377
70023	NC_021014	CGC	2	6	3341138	3341143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155377
70024	NC_021014	ACCTC	2	10	3341157	3341166	20 %	20 %	0 %	60 %	479155377
70025	NC_021014	GTCC	2	8	3341252	3341259	0 %	25 %	25 %	50 %	479155377
70026	NC_021014	CTC	2	6	3341399	3341404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155377
70027	NC_021014	TTC	2	6	3341460	3341465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155377
70028	NC_021014	GATA	2	8	3341548	3341555	50 %	25 %	25 %	0 %	479155377
70029	NC_021014	CCA	2	6	3341568	3341573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155377
70030	NC_021014	ATA	2	6	3341588	3341593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155377
70031	NC_021014	CCG	2	6	3341605	3341610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155377
70032	NC_021014	CAC	2	6	3341624	3341629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155377
70033	NC_021014	TCC	2	6	3341718	3341723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70034	NC_021014	T	6	6	3341829	3341834	0 %	100 %	0 %	0 %	479155378
70035	NC_021014	CA	3	6	3341850	3341855	50 %	0 %	0 %	50 %	479155378
70036	NC_021014	ATA	2	6	3341890	3341895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155378
70037	NC_021014	GCC	2	6	3341914	3341919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155378
70038	NC_021014	TTC	2	6	3341978	3341983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155378
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70040	NC_021014	ATA	2	6	3341998	3342003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155378
70041	NC_021014	CTC	2	6	3342073	3342078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155378
70042	NC_021014	GAT	2	6	3342109	3342114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155378
70043	NC_021014	CTG	2	6	3342150	3342155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155378
70044	NC_021014	T	6	6	3342298	3342303	0 %	100 %	0 %	0 %	479155378
70045	NC_021014	CAG	2	6	3342343	3342348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155378
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70049	NC_021014	CTG	2	6	3342579	3342584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155378
70050	NC_021014	GCT	2	6	3342591	3342596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155378
70051	NC_021014	CCT	2	6	3342615	3342620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155378
70052	NC_021014	CAC	2	6	3342628	3342633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155378
70053	NC_021014	CTT	2	6	3342757	3342762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155378
70054	NC_021014	ATT	2	6	3342763	3342768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155378
70055	NC_021014	TTCC	2	8	3342807	3342814	0 %	50 %	0 %	50 %	479155378
70056	NC_021014	TA	3	6	3342825	3342830	50 %	50 %	0 %	0 %	479155378
70057	NC_021014	CCT	2	6	3342891	3342896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155378
70058	NC_021014	GATAA	2	10	3342931	3342940	60 %	20 %	20 %	0 %	479155378
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70060	NC_021014	TA	3	6	3343043	3343048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70061	NC_021014	TGT	2	6	3343053	3343058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70062	NC_021014	ATA	2	6	3343150	3343155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70063	NC_021014	ACT	2	6	3343157	3343162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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70088	NC_021014	CCTT	2	8	3344715	3344722	0 %	50 %	0 %	50 %	479155380
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70102	NC_021014	ATCT	2	8	3345191	3345198	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70103	NC_021014	CTT	2	6	3345214	3345219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70104	NC_021014	CTG	2	6	3345226	3345231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70105	NC_021014	T	6	6	3345255	3345260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70106	NC_021014	A	6	6	3345303	3345308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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70110	NC_021014	TCCA	2	8	3345487	3345494	25 %	25 %	0 %	50 %	479155381
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70118	NC_021014	CT	3	6	3345780	3345785	0 %	50 %	0 %	50 %	479155381
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70241	NC_021014	GACC	2	8	3350304	3350311	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70242	NC_021014	TAT	2	6	3350320	3350325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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70244	NC_021014	T	6	6	3350360	3350365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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70499	NC_021014	CACTGT	2	12	3361502	3361513	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70500	NC_021014	CAC	2	6	3361530	3361535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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