MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_021014	AGAAA	2	10	313965	313974	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_021014	GGA	2	6	313993	313998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_021014	AGA	2	6	314012	314017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_021014	ATG	2	6	314018	314023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_021014	A	6	6	314037	314042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_021014	A	7	7	314211	314217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_021014	TCT	2	6	314250	314255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6508	NC_021014	AAAG	2	8	314261	314268	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_021014	A	6	6	314273	314278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_021014	CGAAGA	2	12	314300	314311	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6511	NC_021014	GCA	2	6	314331	314336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6512	NC_021014	GAA	2	6	314396	314401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_021014	GAA	2	6	314484	314489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_021014	CTA	2	6	314626	314631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_021014	ACT	2	6	314673	314678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6516	NC_021014	GTT	2	6	314693	314698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_021014	CTT	2	6	314709	314714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6518	NC_021014	TAT	2	6	314826	314831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_021014	TGA	2	6	314984	314989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_021014	T	6	6	315013	315018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_021014	A	6	6	315046	315051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_021014	TGT	2	6	315104	315109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_021014	CTG	2	6	315137	315142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6524	NC_021014	GTGGA	2	10	315149	315158	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_021014	TGC	2	6	315212	315217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6526	NC_021014	TTC	2	6	315226	315231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6527	NC_021014	AGT	2	6	315245	315250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_021014	AGA	2	6	315275	315280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_021014	TAT	2	6	315321	315326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_021014	TCA	2	6	315356	315361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6531	NC_021014	TAT	2	6	315594	315599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_021014	GAAGT	2	10	315675	315684	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_021014	TGT	2	6	315701	315706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_021014	A	6	6	315756	315761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_021014	AAC	2	6	315821	315826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6536	NC_021014	T	6	6	315922	315927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_021014	TGG	2	6	315956	315961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_021014	GGC	2	6	315963	315968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6539	NC_021014	ATG	3	9	315973	315981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_021014	ATT	2	6	315995	316000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_021014	GTAT	2	8	316031	316038	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_021014	CTT	2	6	316060	316065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6543	NC_021014	AGA	2	6	316172	316177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_021014	TAT	2	6	316193	316198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_021014	ATG	2	6	316216	316221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_021014	GAT	2	6	316268	316273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_021014	AGG	2	6	316355	316360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_021014	AGA	2	6	316388	316393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_021014	A	6	6	316431	316436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_021014	GAA	2	6	316449	316454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_021014	AGA	2	6	316456	316461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_021014	TGA	2	6	316531	316536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_021014	AGG	2	6	316549	316554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_021014	A	6	6	316558	316563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_021014	CAGA	2	8	316589	316596	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6556	NC_021014	GAA	2	6	316601	316606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_021014	AGC	2	6	316619	316624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6558	NC_021014	CTTT	2	8	316669	316676	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6559	NC_021014	ATC	2	6	316727	316732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6561	NC_021014	AGC	2	6	316740	316745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6562	NC_021014	ATG	2	6	316828	316833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_021014	CAGA	2	8	316884	316891	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6564	NC_021014	GGA	2	6	316980	316985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_021014	TCT	2	6	317022	317027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6566	NC_021014	ACCAA	2	10	317109	317118	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6567	NC_021014	TAT	2	6	317120	317125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6571	NC_021014	TTA	2	6	317339	317344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6581	NC_021014	GAA	2	6	317870	317875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_021014	AAT	2	6	317880	317885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6592	NC_021014	AGA	2	6	318071	318076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_021014	GAA	2	6	318078	318083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_021014	GGAA	2	8	318230	318237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_021014	TTGA	2	8	318270	318277	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6596	NC_021014	AAAG	2	8	318369	318376	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6601	NC_021014	ATG	2	6	318595	318600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_021014	TAT	2	6	318606	318611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_021014	CTGG	2	8	318638	318645	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6604	NC_021014	CCA	2	6	318658	318663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6611	NC_021014	GAT	2	6	318854	318859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_021014	GGA	2	6	318860	318865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6615	NC_021014	GCC	2	6	318923	318928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6620	NC_021014	ATC	2	6	319192	319197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6622	NC_021014	TTA	2	6	319290	319295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6623	NC_021014	AT	3	6	319317	319322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6624	NC_021014	ATGG	2	8	319393	319400	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_021014	GAA	2	6	319410	319415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6627	NC_021014	GGA	2	6	319460	319465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_021014	TGT	3	9	319508	319516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_021014	CCG	2	6	319542	319547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6630	NC_021014	GGA	2	6	319559	319564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6631	NC_021014	AGA	2	6	319610	319615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6632	NC_021014	AG	3	6	319619	319624	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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