MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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69002	NC_021014	ATTT	2	8	3291072	3291079	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69003	NC_021014	T	6	6	3291092	3291097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69004	NC_021014	AGCAT	2	10	3291227	3291236	40 %	20 %	20 %	20 %	479155336
69005	NC_021014	CA	3	6	3291267	3291272	50 %	0 %	0 %	50 %	479155336
69006	NC_021014	AGA	2	6	3291322	3291327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155336
69007	NC_021014	CTT	2	6	3291341	3291346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155336
69008	NC_021014	TCT	2	6	3291350	3291355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155336
69009	NC_021014	T	6	6	3291443	3291448	0 %	100 %	0 %	0 %	479155336
69010	NC_021014	TGG	2	6	3291495	3291500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155336
69011	NC_021014	CTT	2	6	3291623	3291628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155336
69012	NC_021014	TC	3	6	3291646	3291651	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69013	NC_021014	GCC	2	6	3291713	3291718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155337
69014	NC_021014	CTC	2	6	3291730	3291735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155337
69015	NC_021014	TC	4	8	3291738	3291745	0 %	50 %	0 %	50 %	479155337
69016	NC_021014	TTC	2	6	3291822	3291827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155337
69017	NC_021014	GAA	2	6	3291861	3291866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155337
69018	NC_021014	GAT	2	6	3291898	3291903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155337
69019	NC_021014	CTT	2	6	3291946	3291951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155337
69020	NC_021014	GCT	2	6	3291960	3291965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155337
69021	NC_021014	A	7	7	3292006	3292012	100 %	0 %	0 %	0 %	479155337
69022	NC_021014	TCC	2	6	3292028	3292033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155337
69023	NC_021014	TAC	2	6	3292081	3292086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155337
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69025	NC_021014	CAT	2	6	3292174	3292179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155337
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69028	NC_021014	CAT	3	9	3292323	3292331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155337
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69030	NC_021014	TTTA	2	8	3292348	3292355	25 %	75 %	0 %	0 %	479155337
69031	NC_021014	CGGA	2	8	3292398	3292405	25 %	0 %	50 %	25 %	479155337
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69036	NC_021014	T	6	6	3292603	3292608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69037	NC_021014	TGA	3	9	3292614	3292622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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69040	NC_021014	GAAAA	2	10	3292737	3292746	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69041	NC_021014	A	6	6	3292743	3292748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69042	NC_021014	CAT	2	6	3292783	3292788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69043	NC_021014	TTCC	2	8	3292811	3292818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69044	NC_021014	TGT	2	6	3292837	3292842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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69048	NC_021014	CT	3	6	3293174	3293179	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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69053	NC_021014	GTA	2	6	3293573	3293578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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69055	NC_021014	TCA	2	6	3293691	3293696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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69103	NC_021014	T	6	6	3296223	3296228	0 %	100 %	0 %	0 %	479155340
69104	NC_021014	CTGA	2	8	3296277	3296284	25 %	25 %	25 %	25 %	479155340
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69116	NC_021014	T	6	6	3296673	3296678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69117	NC_021014	TAT	2	6	3296686	3296691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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69121	NC_021014	T	6	6	3297013	3297018	0 %	100 %	0 %	0 %	479155341
69122	NC_021014	TCC	2	6	3297059	3297064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69123	NC_021014	TC	3	6	3297131	3297136	0 %	50 %	0 %	50 %	479155342
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69150	NC_021014	T	6	6	3298460	3298465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69151	NC_021014	ATTT	2	8	3298517	3298524	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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69153	NC_021014	TTTTA	2	10	3298559	3298568	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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69159	NC_021014	GCA	2	6	3298805	3298810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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69232	NC_021014	TCA	2	6	3302615	3302620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155344
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69236	NC_021014	T	6	6	3302696	3302701	0 %	100 %	0 %	0 %	479155344
69237	NC_021014	GCT	2	6	3302727	3302732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155344
69238	NC_021014	AAG	2	6	3302746	3302751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155344
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69478	NC_021014	TCGC	2	8	3315246	3315253	0 %	25 %	25 %	50 %	479155356
69479	NC_021014	CAC	2	6	3315268	3315273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155356
69480	NC_021014	ATC	2	6	3315463	3315468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155356
69481	NC_021014	TCA	2	6	3315471	3315476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155356
69482	NC_021014	TCTG	2	8	3315498	3315505	0 %	50 %	25 %	25 %	479155356
69483	NC_021014	TCG	2	6	3315572	3315577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155356
69484	NC_021014	AGCTTC	2	12	3315581	3315592	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479155356
69485	NC_021014	CTG	2	6	3315724	3315729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155356
69486	NC_021014	T	6	6	3315735	3315740	0 %	100 %	0 %	0 %	479155356
69487	NC_021014	ATGG	2	8	3315803	3315810	25 %	25 %	50 %	0 %	479155356
69488	NC_021014	AGGA	2	8	3315821	3315828	50 %	0 %	50 %	0 %	479155356
69489	NC_021014	CTGG	2	8	3315850	3315857	0 %	25 %	50 %	25 %	479155356
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69491	NC_021014	CTG	2	6	3315881	3315886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155356
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69493	NC_021014	T	6	6	3315993	3315998	0 %	100 %	0 %	0 %	479155356
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69497	NC_021014	CT	3	6	3316338	3316343	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69498	NC_021014	GC	3	6	3316346	3316351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69499	NC_021014	TTAA	2	8	3316401	3316408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69500	NC_021014	A	6	6	3316460	3316465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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