MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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68002	NC_021014	TC	3	6	3242166	3242171	0 %	50 %	0 %	50 %	479155293
68003	NC_021014	CTT	2	6	3242271	3242276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155293
68004	NC_021014	TCC	2	6	3242279	3242284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155293
68005	NC_021014	AATA	2	8	3242349	3242356	75 %	25 %	0 %	0 %	479155293
68006	NC_021014	GAT	2	6	3242367	3242372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155293
68007	NC_021014	CAT	2	6	3242400	3242405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155293
68008	NC_021014	GGAA	2	8	3242477	3242484	50 %	0 %	50 %	0 %	479155293
68009	NC_021014	AAAG	2	8	3242629	3242636	75 %	0 %	25 %	0 %	479155293
68010	NC_021014	TCT	2	6	3242807	3242812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155293
68011	NC_021014	TGCA	2	8	3242845	3242852	25 %	25 %	25 %	25 %	479155293
68012	NC_021014	CAG	2	6	3242874	3242879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155293
68013	NC_021014	CCG	2	6	3242903	3242908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155293
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68015	NC_021014	TGC	2	6	3242941	3242946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155293
68016	NC_021014	CAC	2	6	3242987	3242992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155293
68017	NC_021014	TCCT	2	8	3243019	3243026	0 %	50 %	0 %	50 %	479155293
68018	NC_021014	TC	4	8	3243045	3243052	0 %	50 %	0 %	50 %	479155293
68019	NC_021014	CTT	2	6	3243054	3243059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155293
68020	NC_021014	CAT	2	6	3243069	3243074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155293
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68022	NC_021014	A	6	6	3243109	3243114	100 %	0 %	0 %	0 %	479155293
68023	NC_021014	GCC	2	6	3243130	3243135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155293
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68028	NC_021014	GCA	2	6	3243393	3243398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155293
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68031	NC_021014	GATCT	2	10	3243475	3243484	20 %	40 %	20 %	20 %	479155293
68032	NC_021014	ATC	2	6	3243517	3243522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155293
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68043	NC_021014	T	6	6	3244000	3244005	0 %	100 %	0 %	0 %	479155293
68044	NC_021014	GAT	2	6	3244063	3244068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155293
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68048	NC_021014	TCT	2	6	3244323	3244328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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68051	NC_021014	ATT	2	6	3244390	3244395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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68055	NC_021014	GAA	2	6	3244553	3244558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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68104	NC_021014	TC	3	6	3246524	3246529	0 %	50 %	0 %	50 %	479155295
68105	NC_021014	TA	3	6	3246543	3246548	50 %	50 %	0 %	0 %	479155295
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68108	NC_021014	TC	3	6	3246670	3246675	0 %	50 %	0 %	50 %	479155295
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68118	NC_021014	GTA	2	6	3247001	3247006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68119	NC_021014	GTAT	2	8	3247019	3247026	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68120	NC_021014	ATC	3	9	3247109	3247117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68121	NC_021014	TGG	2	6	3247233	3247238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68122	NC_021014	GTCT	2	8	3247253	3247260	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68123	NC_021014	ATG	2	6	3247374	3247379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68124	NC_021014	TGT	2	6	3247424	3247429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68125	NC_021014	CAT	2	6	3247478	3247483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68126	NC_021014	ATA	2	6	3247499	3247504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68127	NC_021014	AT	3	6	3247608	3247613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68128	NC_021014	CAC	2	6	3247640	3247645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68129	NC_021014	CTG	2	6	3247720	3247725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68130	NC_021014	CATA	3	12	3247805	3247816	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68131	NC_021014	TGC	2	6	3247844	3247849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68132	NC_021014	TCA	2	6	3247950	3247955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68133	NC_021014	ACA	2	6	3247992	3247997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68134	NC_021014	TCA	2	6	3248043	3248048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68135	NC_021014	TCA	2	6	3248088	3248093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68136	NC_021014	GCT	2	6	3248094	3248099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68137	NC_021014	TCCC	2	8	3248150	3248157	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
68138	NC_021014	ATGTGT	2	12	3248162	3248173	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68139	NC_021014	CCAA	2	8	3248181	3248188	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68140	NC_021014	TAC	2	6	3248195	3248200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68141	NC_021014	ATA	2	6	3248229	3248234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68142	NC_021014	CT	3	6	3248242	3248247	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68143	NC_021014	CA	3	6	3248287	3248292	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68144	NC_021014	AT	3	6	3248297	3248302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68145	NC_021014	TAT	2	6	3248305	3248310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68146	NC_021014	TTC	2	6	3248339	3248344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155296
68147	NC_021014	TAT	3	9	3248394	3248402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155296
68148	NC_021014	CAT	2	6	3248406	3248411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155296
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68151	NC_021014	A	7	7	3248465	3248471	100 %	0 %	0 %	0 %	479155296
68152	NC_021014	ACTG	2	8	3248646	3248653	25 %	25 %	25 %	25 %	479155297
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68191	NC_021014	CTGT	2	8	3250666	3250673	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68192	NC_021014	TCA	2	6	3250699	3250704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68193	NC_021014	TCC	2	6	3250782	3250787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68194	NC_021014	CTG	2	6	3250853	3250858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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68196	NC_021014	CAT	2	6	3251030	3251035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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68199	NC_021014	TCC	2	6	3251224	3251229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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68217	NC_021014	CA	3	6	3251967	3251972	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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68220	NC_021014	TG	3	6	3252106	3252111	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68221	NC_021014	ATG	2	6	3252112	3252117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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68228	NC_021014	CAT	2	6	3252398	3252403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68229	NC_021014	TCT	2	6	3252449	3252454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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68231	NC_021014	GAA	2	6	3252545	3252550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68232	NC_021014	AAG	2	6	3252552	3252557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68233	NC_021014	ATG	2	6	3252562	3252567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68234	NC_021014	TCA	2	6	3252602	3252607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68235	NC_021014	TTCC	2	8	3252625	3252632	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68236	NC_021014	TCC	2	6	3252671	3252676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68237	NC_021014	CAT	2	6	3252757	3252762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68238	NC_021014	TTTCC	2	10	3252807	3252816	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
68239	NC_021014	AAAG	2	8	3252873	3252880	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68240	NC_021014	GGC	2	6	3252920	3252925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68241	NC_021014	GCT	2	6	3253087	3253092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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68470	NC_021014	TCT	2	6	3264600	3264605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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68487	NC_021014	ATAG	2	8	3265464	3265471	50 %	25 %	25 %	0 %	479155308
68488	NC_021014	ATC	2	6	3265473	3265478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155308
68489	NC_021014	TTG	2	6	3265527	3265532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155308
68490	NC_021014	CTTT	2	8	3265557	3265564	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68491	NC_021014	A	7	7	3265572	3265578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68492	NC_021014	AC	3	6	3265621	3265626	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68493	NC_021014	CAAA	2	8	3265739	3265746	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
68494	NC_021014	CAAC	2	8	3265765	3265772	50 %	0 %	0 %	50 %	479155309
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68499	NC_021014	ACCG	2	8	3265985	3265992	25 %	0 %	25 %	50 %	479155309
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