MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
67501	NC_021014	CGA	2	6	3217925	3217930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155275
67502	NC_021014	A	6	6	3217992	3217997	100 %	0 %	0 %	0 %	479155275
67503	NC_021014	TG	3	6	3218013	3218018	0 %	50 %	50 %	0 %	479155275
67504	NC_021014	CTG	2	6	3218077	3218082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155275
67505	NC_021014	TC	3	6	3218097	3218102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67506	NC_021014	CGC	2	6	3218103	3218108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67507	NC_021014	TCATT	2	10	3218133	3218142	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67508	NC_021014	TCAGA	2	10	3218144	3218153	40 %	20 %	20 %	20 %	479155276
67509	NC_021014	AATA	2	8	3218181	3218188	75 %	25 %	0 %	0 %	479155276
67510	NC_021014	TCC	2	6	3218240	3218245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155276
67511	NC_021014	TTC	2	6	3218278	3218283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155276
67512	NC_021014	CCA	2	6	3218313	3218318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155276
67513	NC_021014	TTC	2	6	3218326	3218331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155276
67514	NC_021014	CACTGC	2	12	3218384	3218395	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479155276
67515	NC_021014	GCT	2	6	3218433	3218438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155276
67516	NC_021014	TCTCT	2	10	3218452	3218461	0 %	60 %	0 %	40 %	479155276
67517	NC_021014	GCT	2	6	3218465	3218470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155276
67518	NC_021014	TTTC	2	8	3218540	3218547	0 %	75 %	0 %	25 %	479155276
67519	NC_021014	TC	3	6	3218570	3218575	0 %	50 %	0 %	50 %	479155276
67520	NC_021014	TCT	2	6	3218607	3218612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155276
67521	NC_021014	GAT	2	6	3218637	3218642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155276
67522	NC_021014	TCT	2	6	3218682	3218687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155276
67523	NC_021014	TCT	2	6	3218720	3218725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155276
67524	NC_021014	TTC	2	6	3218746	3218751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155276
67525	NC_021014	TCC	2	6	3218864	3218869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155276
67526	NC_021014	CTT	2	6	3218920	3218925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155276
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67529	NC_021014	CTC	2	6	3219268	3219273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155276
67530	NC_021014	CTGC	2	8	3219310	3219317	0 %	25 %	25 %	50 %	479155276
67531	NC_021014	GAT	2	6	3219331	3219336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155276
67532	NC_021014	GGAT	2	8	3219380	3219387	25 %	25 %	50 %	0 %	479155276
67533	NC_021014	CTG	2	6	3219435	3219440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155276
67534	NC_021014	CTG	2	6	3219547	3219552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155276
67535	NC_021014	AT	3	6	3219563	3219568	50 %	50 %	0 %	0 %	479155276
67536	NC_021014	TCT	2	6	3219600	3219605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155276
67537	NC_021014	GCC	2	6	3219740	3219745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155276
67538	NC_021014	TC	3	6	3219789	3219794	0 %	50 %	0 %	50 %	479155276
67539	NC_021014	T	7	7	3219801	3219807	0 %	100 %	0 %	0 %	479155276
67540	NC_021014	TCC	2	6	3219839	3219844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155276
67541	NC_021014	CA	4	8	3219854	3219861	50 %	0 %	0 %	50 %	479155276
67542	NC_021014	TTCC	2	8	3219873	3219880	0 %	50 %	0 %	50 %	479155276
67543	NC_021014	CAGC	2	8	3219900	3219907	25 %	0 %	25 %	50 %	479155276
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67546	NC_021014	TA	3	6	3220047	3220052	50 %	50 %	0 %	0 %	479155276
67547	NC_021014	CAGCC	2	10	3220092	3220101	20 %	0 %	20 %	60 %	479155276
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67550	NC_021014	CTT	2	6	3220251	3220256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155276
67551	NC_021014	TCC	2	6	3220259	3220264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155276
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67554	NC_021014	AAG	2	6	3220341	3220346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155276
67555	NC_021014	GCC	2	6	3220364	3220369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155276
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67558	NC_021014	CAG	2	6	3220669	3220674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155276
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67561	NC_021014	GCC	2	6	3220706	3220711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155276
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67563	NC_021014	T	7	7	3220793	3220799	0 %	100 %	0 %	0 %	479155276
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67569	NC_021014	T	7	7	3221004	3221010	0 %	100 %	0 %	0 %	479155276
67570	NC_021014	TCA	2	6	3221056	3221061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155277
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67588	NC_021014	T	6	6	3222005	3222010	0 %	100 %	0 %	0 %	479155278
67589	NC_021014	TCCA	2	8	3222040	3222047	25 %	25 %	0 %	50 %	479155278
67590	NC_021014	AGA	2	6	3222124	3222129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155278
67591	NC_021014	ATC	2	6	3222208	3222213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155278
67592	NC_021014	TTCATT	2	12	3222230	3222241	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479155278
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67597	NC_021014	TCCA	2	8	3222382	3222389	25 %	25 %	0 %	50 %	479155278
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67601	NC_021014	ACCTC	2	10	3222540	3222549	20 %	20 %	0 %	60 %	479155278
67602	NC_021014	CCGG	2	8	3222558	3222565	0 %	0 %	50 %	50 %	479155278
67603	NC_021014	CGC	2	6	3222608	3222613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155278
67604	NC_021014	AT	3	6	3222638	3222643	50 %	50 %	0 %	0 %	479155278
67605	NC_021014	TCC	2	6	3222731	3222736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155278
67606	NC_021014	CAGTC	2	10	3222749	3222758	20 %	20 %	20 %	40 %	479155278
67607	NC_021014	CCG	2	6	3222774	3222779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155278
67608	NC_021014	T	6	6	3223010	3223015	0 %	100 %	0 %	0 %	479155278
67609	NC_021014	AAT	2	6	3223113	3223118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155278
67610	NC_021014	GACA	2	8	3223268	3223275	50 %	0 %	25 %	25 %	479155278
67611	NC_021014	CTTGG	2	10	3223286	3223295	0 %	40 %	40 %	20 %	479155278
67612	NC_021014	CAGATA	2	12	3223303	3223314	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479155278
67613	NC_021014	TCA	2	6	3223329	3223334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155278
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67615	NC_021014	TCC	2	6	3223405	3223410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155278
67616	NC_021014	TTC	2	6	3223421	3223426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155278
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67738	NC_021014	ATC	2	6	3229182	3229187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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67740	NC_021014	GAC	2	6	3229224	3229229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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67742	NC_021014	TCA	2	6	3229388	3229393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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67745	NC_021014	GAGAA	2	10	3229807	3229816	60 %	0 %	40 %	0 %	479155283
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67981	NC_021014	GCT	2	6	3241416	3241421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155292
67982	NC_021014	TTC	2	6	3241459	3241464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155292
67983	NC_021014	GCC	2	6	3241483	3241488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155292
67984	NC_021014	GTT	3	9	3241601	3241609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155292
67985	NC_021014	TCC	2	6	3241625	3241630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67986	NC_021014	TGT	2	6	3241637	3241642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67987	NC_021014	T	6	6	3241642	3241647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67988	NC_021014	TTA	2	6	3241666	3241671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67989	NC_021014	A	7	7	3241709	3241715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67990	NC_021014	TTA	2	6	3241760	3241765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67991	NC_021014	TTAT	2	8	3241770	3241777	25 %	75 %	0 %	0 %	479155293
67992	NC_021014	CTT	2	6	3241803	3241808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155293
67993	NC_021014	CGCC	2	8	3241832	3241839	0 %	0 %	25 %	75 %	479155293
67994	NC_021014	ATC	2	6	3241861	3241866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155293
67995	NC_021014	TGT	2	6	3241879	3241884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155293
67996	NC_021014	CCTCAT	2	12	3241920	3241931	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	479155293
67997	NC_021014	CTC	2	6	3241981	3241986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155293
67998	NC_021014	AGGA	2	8	3242023	3242030	50 %	0 %	50 %	0 %	479155293
67999	NC_021014	CCT	2	6	3242033	3242038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155293
68000	NC_021014	GCC	2	6	3242092	3242097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155293

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