MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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66002	NC_021014	AC	3	6	3147897	3147902	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66003	NC_021014	A	7	7	3147904	3147910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66004	NC_021014	AT	3	6	3147955	3147960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66005	NC_021014	A	6	6	3148072	3148077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66006	NC_021014	ACC	2	6	3148245	3148250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155206
66007	NC_021014	TTC	2	6	3148314	3148319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155206
66008	NC_021014	TTC	2	6	3148329	3148334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155206
66009	NC_021014	AGCTTC	2	12	3148386	3148397	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479155206
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66011	NC_021014	TCACTG	2	12	3148479	3148490	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479155206
66012	NC_021014	AC	3	6	3148565	3148570	50 %	0 %	0 %	50 %	479155206
66013	NC_021014	TTC	2	6	3148583	3148588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155206
66014	NC_021014	GAA	2	6	3148606	3148611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155206
66015	NC_021014	TCA	2	6	3148626	3148631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155206
66016	NC_021014	CCAT	2	8	3148671	3148678	25 %	25 %	0 %	50 %	479155206
66017	NC_021014	GAT	2	6	3148693	3148698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155206
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66019	NC_021014	GCA	2	6	3148806	3148811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155206
66020	NC_021014	TC	3	6	3148881	3148886	0 %	50 %	0 %	50 %	479155206
66021	NC_021014	CAT	2	6	3148925	3148930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155206
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66054	NC_021014	TGT	2	6	3150455	3150460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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66057	NC_021014	AACAG	2	10	3150545	3150554	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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66091	NC_021014	TTA	2	6	3151831	3151836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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66102	NC_021014	AT	3	6	3152091	3152096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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66120	NC_021014	AG	3	6	3152717	3152722	50 %	0 %	50 %	0 %	479155209
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66122	NC_021014	CA	3	6	3152737	3152742	50 %	0 %	0 %	50 %	479155209
66123	NC_021014	TTC	2	6	3152839	3152844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155209
66124	NC_021014	GAG	2	6	3152871	3152876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479155209
66125	NC_021014	CTT	2	6	3152932	3152937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155209
66126	NC_021014	TCA	2	6	3152975	3152980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155209
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66129	NC_021014	CTT	2	6	3153039	3153044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155209
66130	NC_021014	ATC	2	6	3153050	3153055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155209
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66132	NC_021014	TGC	2	6	3153217	3153222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155209
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66143	NC_021014	T	6	6	3153698	3153703	0 %	100 %	0 %	0 %	479155211
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66153	NC_021014	TTC	2	6	3154173	3154178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155211
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66157	NC_021014	GTT	2	6	3154310	3154315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155211
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66186	NC_021014	TCT	2	6	3155695	3155700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155212
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66191	NC_021014	TCT	2	6	3155863	3155868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155212
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66193	NC_021014	CCGGG	2	10	3155966	3155975	0 %	0 %	60 %	40 %	479155212
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66201	NC_021014	TCC	2	6	3156444	3156449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66202	NC_021014	CAC	2	6	3156479	3156484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155213
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66228	NC_021014	CTG	2	6	3158088	3158093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155213
66229	NC_021014	TG	3	6	3158092	3158097	0 %	50 %	50 %	0 %	479155213
66230	NC_021014	TC	3	6	3158132	3158137	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66231	NC_021014	T	6	6	3158199	3158204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66232	NC_021014	CTGTT	2	10	3158205	3158214	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
66233	NC_021014	TCT	2	6	3158221	3158226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66234	NC_021014	CT	3	6	3158225	3158230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66235	NC_021014	TTTA	2	8	3158238	3158245	25 %	75 %	0 %	0 %	479155214
66236	NC_021014	CTG	2	6	3158353	3158358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155214
66237	NC_021014	CTT	2	6	3158374	3158379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155214
66238	NC_021014	CAT	2	6	3158405	3158410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155214
66239	NC_021014	GGCTC	2	10	3158479	3158488	0 %	20 %	40 %	40 %	479155214
66240	NC_021014	GGA	2	6	3158522	3158527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479155214
66241	NC_021014	TCA	2	6	3158562	3158567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155214
66242	NC_021014	TCC	2	6	3158697	3158702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155214
66243	NC_021014	GAA	2	6	3158724	3158729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155214
66244	NC_021014	TCT	2	6	3158768	3158773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155214
66245	NC_021014	CGG	2	6	3158808	3158813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479155214
66246	NC_021014	TCTCAT	2	12	3158815	3158826	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	479155214
66247	NC_021014	AAGA	2	8	3158830	3158837	75 %	0 %	25 %	0 %	479155214
66248	NC_021014	AGT	2	6	3158870	3158875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155214
66249	NC_021014	CCT	2	6	3158898	3158903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155214
66250	NC_021014	CT	3	6	3158909	3158914	0 %	50 %	0 %	50 %	479155214
66251	NC_021014	GAT	2	6	3158918	3158923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155214
66252	NC_021014	GAT	2	6	3158942	3158947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155214
66253	NC_021014	TCA	2	6	3158949	3158954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155214
66254	NC_021014	GGCA	2	8	3158962	3158969	25 %	0 %	50 %	25 %	479155214
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66260	NC_021014	TTA	2	6	3159391	3159396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66261	NC_021014	A	6	6	3159458	3159463	100 %	0 %	0 %	0 %	479155215
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66264	NC_021014	A	6	6	3159516	3159521	100 %	0 %	0 %	0 %	479155215
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66267	NC_021014	T	6	6	3159559	3159564	0 %	100 %	0 %	0 %	479155215
66268	NC_021014	TGA	2	6	3159583	3159588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66269	NC_021014	TCT	2	6	3159589	3159594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66270	NC_021014	ACC	2	6	3159612	3159617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66271	NC_021014	ACC	2	6	3159654	3159659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66272	NC_021014	CTGCC	2	10	3159742	3159751	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
66273	NC_021014	AAG	2	6	3159758	3159763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66274	NC_021014	TCT	2	6	3159798	3159803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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66276	NC_021014	CTGC	2	8	3159923	3159930	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66277	NC_021014	ATC	2	6	3159939	3159944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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66279	NC_021014	GT	3	6	3160062	3160067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66280	NC_021014	AATAA	2	10	3160149	3160158	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66281	NC_021014	TCC	2	6	3160159	3160164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66282	NC_021014	CTG	2	6	3160269	3160274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66283	NC_021014	TGCC	2	8	3160319	3160326	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66284	NC_021014	T	6	6	3160385	3160390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66285	NC_021014	CAGAT	2	10	3160417	3160426	40 %	20 %	20 %	20 %	479155216
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66301	NC_021014	CACT	2	8	3161302	3161309	25 %	25 %	0 %	50 %	479155216
66302	NC_021014	GCT	2	6	3161342	3161347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155216
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66308	NC_021014	CAA	2	6	3161522	3161527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66309	NC_021014	TC	3	6	3161563	3161568	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66310	NC_021014	TCC	2	6	3161587	3161592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155217
66311	NC_021014	CTG	2	6	3161665	3161670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155217
66312	NC_021014	TCT	3	9	3161684	3161692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155217
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66320	NC_021014	CTG	3	9	3161907	3161915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155217
66321	NC_021014	CTG	2	6	3161919	3161924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155217
66322	NC_021014	CTG	2	6	3161946	3161951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155217
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66343	NC_021014	GAA	2	6	3162805	3162810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155217
66344	NC_021014	CTT	2	6	3162839	3162844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155217
66345	NC_021014	A	7	7	3162863	3162869	100 %	0 %	0 %	0 %	479155217
66346	NC_021014	ACC	2	6	3162894	3162899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155217
66347	NC_021014	ATTC	2	8	3162954	3162961	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66348	NC_021014	CAT	2	6	3163018	3163023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66349	NC_021014	CA	3	6	3163113	3163118	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66350	NC_021014	CAGCG	2	10	3163194	3163203	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
66351	NC_021014	C	6	6	3163214	3163219	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
66352	NC_021014	GTC	2	6	3163246	3163251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66353	NC_021014	CAGCG	2	10	3163252	3163261	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
66354	NC_021014	GAC	2	6	3163264	3163269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66355	NC_021014	CAAC	2	8	3163273	3163280	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66356	NC_021014	N	171	171	3163336	3163506	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66357	NC_021014	CA	3	6	3163538	3163543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66358	NC_021014	A	7	7	3163543	3163549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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66360	NC_021014	CT	3	6	3163577	3163582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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66479	NC_021014	CAA	2	6	3169220	3169225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155220
66480	NC_021014	TCT	2	6	3169238	3169243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155220
66481	NC_021014	GTT	2	6	3169266	3169271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155220
66482	NC_021014	GCC	2	6	3169426	3169431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155220
66483	NC_021014	GA	3	6	3169528	3169533	50 %	0 %	50 %	0 %	479155220
66484	NC_021014	CGG	2	6	3169550	3169555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479155220
66485	NC_021014	TGCC	2	8	3169590	3169597	0 %	25 %	25 %	50 %	479155220
66486	NC_021014	TCA	2	6	3169621	3169626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155220
66487	NC_021014	TTG	2	6	3169660	3169665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155220
66488	NC_021014	CACAG	2	10	3169730	3169739	40 %	0 %	20 %	40 %	479155220
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66490	NC_021014	CAGA	2	8	3169887	3169894	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66491	NC_021014	T	6	6	3169895	3169900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66492	NC_021014	AGG	2	6	3169922	3169927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479155221
66493	NC_021014	GCT	2	6	3169982	3169987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155221
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66498	NC_021014	TTCTG	2	10	3170122	3170131	0 %	60 %	20 %	20 %	479155221
66499	NC_021014	ATA	2	6	3170244	3170249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155221
66500	NC_021014	TTC	2	6	3170274	3170279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155221

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