MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
65001	NC_021014	CAT	2	6	3100915	3100920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155168
65002	NC_021014	TG	3	6	3100940	3100945	0 %	50 %	50 %	0 %	479155168
65003	NC_021014	A	6	6	3100948	3100953	100 %	0 %	0 %	0 %	479155168
65004	NC_021014	AT	3	6	3100968	3100973	50 %	50 %	0 %	0 %	479155168
65005	NC_021014	AGC	2	6	3101065	3101070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155168
65006	NC_021014	TCT	2	6	3101115	3101120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155168
65007	NC_021014	AAGT	2	8	3101143	3101150	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65008	NC_021014	TTC	2	6	3101232	3101237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65009	NC_021014	GAT	2	6	3101245	3101250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65010	NC_021014	ATA	2	6	3101251	3101256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65011	NC_021014	TTAT	2	8	3101292	3101299	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65012	NC_021014	ATT	2	6	3101416	3101421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155169
65013	NC_021014	GAA	2	6	3101432	3101437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155169
65014	NC_021014	AGC	2	6	3101446	3101451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155169
65015	NC_021014	GTT	2	6	3101472	3101477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155169
65016	NC_021014	TGGT	2	8	3101530	3101537	0 %	50 %	50 %	0 %	479155169
65017	NC_021014	AGA	2	6	3101705	3101710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155169
65018	NC_021014	AGA	2	6	3101737	3101742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155169
65019	NC_021014	GAA	2	6	3101776	3101781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155169
65020	NC_021014	CTG	2	6	3101822	3101827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155169
65021	NC_021014	AGA	2	6	3101847	3101852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155170
65022	NC_021014	CTT	2	6	3101936	3101941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155170
65023	NC_021014	GAA	2	6	3101948	3101953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155170
65024	NC_021014	CT	3	6	3101975	3101980	0 %	50 %	0 %	50 %	479155170
65025	NC_021014	GGA	2	6	3101981	3101986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479155170
65026	NC_021014	GTG	2	6	3102152	3102157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155170
65027	NC_021014	GAG	2	6	3102180	3102185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479155170
65028	NC_021014	GAGAA	2	10	3102328	3102337	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
65029	NC_021014	A	6	6	3102411	3102416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65030	NC_021014	GACGA	2	10	3102423	3102432	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
65031	NC_021014	AG	4	8	3102452	3102459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65032	NC_021014	TCCGG	2	10	3102522	3102531	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
65033	NC_021014	ATC	2	6	3102542	3102547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65034	NC_021014	GCA	2	6	3102582	3102587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65035	NC_021014	AGCA	2	8	3102589	3102596	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65036	NC_021014	GAAT	2	8	3102611	3102618	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65037	NC_021014	T	6	6	3102657	3102662	0 %	100 %	0 %	0 %	479155171
65038	NC_021014	ACA	2	6	3102734	3102739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65039	NC_021014	CATTA	2	10	3102745	3102754	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65040	NC_021014	A	6	6	3102766	3102771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65041	NC_021014	TGC	2	6	3102834	3102839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65042	NC_021014	CCAT	2	8	3103021	3103028	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65043	NC_021014	CTA	2	6	3103041	3103046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65044	NC_021014	ATC	2	6	3103111	3103116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65045	NC_021014	A	6	6	3103117	3103122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65046	NC_021014	GGAG	2	8	3103224	3103231	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
65047	NC_021014	TGA	2	6	3103289	3103294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65048	NC_021014	CTT	2	6	3103321	3103326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65049	NC_021014	TCT	2	6	3103327	3103332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65050	NC_021014	GAA	2	6	3103438	3103443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65051	NC_021014	GAG	2	6	3103582	3103587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65052	NC_021014	CTC	2	6	3103616	3103621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65053	NC_021014	TGA	2	6	3103695	3103700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65054	NC_021014	AGCAG	2	10	3103767	3103776	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
65055	NC_021014	GA	3	6	3103844	3103849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65056	NC_021014	ATC	2	6	3103997	3104002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65057	NC_021014	ACAA	2	8	3104020	3104027	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65058	NC_021014	GAG	2	6	3104092	3104097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65059	NC_021014	CATTC	2	10	3104103	3104112	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
65060	NC_021014	GCT	2	6	3104131	3104136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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65062	NC_021014	CTT	2	6	3104218	3104223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65063	NC_021014	CAT	2	6	3104280	3104285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65064	NC_021014	GA	3	6	3104311	3104316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65065	NC_021014	GA	3	6	3104442	3104447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65066	NC_021014	GCT	2	6	3104459	3104464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65067	NC_021014	GGAC	2	8	3104469	3104476	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65068	NC_021014	GA	3	6	3104518	3104523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65069	NC_021014	GAA	2	6	3104557	3104562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65070	NC_021014	AAG	2	6	3104580	3104585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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65072	NC_021014	AAG	2	6	3104642	3104647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65073	NC_021014	GAAGA	2	10	3104686	3104695	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
65074	NC_021014	AAACA	2	10	3104699	3104708	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
65075	NC_021014	GAT	2	6	3104709	3104714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65076	NC_021014	ATAA	2	8	3104721	3104728	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65077	NC_021014	GCC	2	6	3104752	3104757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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65089	NC_021014	CCG	2	6	3105290	3105295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155172
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65091	NC_021014	CCT	2	6	3105704	3105709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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65093	NC_021014	ATA	2	6	3105742	3105747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65094	NC_021014	A	6	6	3105747	3105752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65095	NC_021014	CAA	2	6	3105780	3105785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65096	NC_021014	A	6	6	3105834	3105839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65097	NC_021014	CAGA	2	8	3105856	3105863	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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65101	NC_021014	GGA	2	6	3105980	3105985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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65103	NC_021014	TG	3	6	3106102	3106107	0 %	50 %	50 %	0 %	479155173
65104	NC_021014	CCTG	2	8	3106136	3106143	0 %	25 %	25 %	50 %	479155173
65105	NC_021014	GGC	2	6	3106195	3106200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479155173
65106	NC_021014	T	7	7	3106206	3106212	0 %	100 %	0 %	0 %	479155173
65107	NC_021014	CGT	2	6	3106217	3106222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155173
65108	NC_021014	A	6	6	3106237	3106242	100 %	0 %	0 %	0 %	479155173
65109	NC_021014	GGC	2	6	3106243	3106248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479155173
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65111	NC_021014	TG	3	6	3106396	3106401	0 %	50 %	50 %	0 %	479155173
65112	NC_021014	AGA	2	6	3106423	3106428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155173
65113	NC_021014	GCA	2	6	3106467	3106472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155173
65114	NC_021014	ATC	2	6	3106536	3106541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155173
65115	NC_021014	A	6	6	3106584	3106589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65116	NC_021014	A	6	6	3106682	3106687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65117	NC_021014	CTG	3	9	3106691	3106699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65118	NC_021014	TGA	2	6	3106711	3106716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65119	NC_021014	GGT	2	6	3106741	3106746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65120	NC_021014	TTATG	2	10	3106850	3106859	20 %	60 %	20 %	0 %	479155174
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65122	NC_021014	T	6	6	3106930	3106935	0 %	100 %	0 %	0 %	479155174
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65124	NC_021014	TGG	2	6	3107062	3107067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155174
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65483	NC_021014	AAAC	2	8	3122362	3122369	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65484	NC_021014	A	7	7	3122383	3122389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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65486	NC_021014	C	6	6	3122456	3122461	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
65487	NC_021014	TA	3	6	3122469	3122474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65488	NC_021014	AAG	2	6	3122493	3122498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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65490	NC_021014	T	6	6	3122537	3122542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65491	NC_021014	AT	4	8	3122580	3122587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65492	NC_021014	A	6	6	3122601	3122606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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