MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
64001	NC_021014	T	6	6	3052371	3052376	0 %	100 %	0 %	0 %	479155128
64002	NC_021014	AAT	2	6	3052418	3052423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155128
64003	NC_021014	AAT	2	6	3052430	3052435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155128
64004	NC_021014	TGG	2	6	3052480	3052485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64005	NC_021014	AGG	2	6	3052591	3052596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64006	NC_021014	TGAAA	2	10	3052602	3052611	60 %	20 %	20 %	0 %	479155129
64007	NC_021014	TAA	2	6	3052614	3052619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155129
64008	NC_021014	TTA	2	6	3052620	3052625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155129
64009	NC_021014	ACTG	2	8	3052633	3052640	25 %	25 %	25 %	25 %	479155129
64010	NC_021014	AGGT	2	8	3052643	3052650	25 %	25 %	50 %	0 %	479155129
64011	NC_021014	ATG	2	6	3052730	3052735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155129
64012	NC_021014	GCA	2	6	3052916	3052921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155129
64013	NC_021014	TGC	2	6	3052968	3052973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155129
64014	NC_021014	TGG	2	6	3052979	3052984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155129
64015	NC_021014	TAT	2	6	3053154	3053159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155129
64016	NC_021014	GGA	2	6	3053335	3053340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479155129
64017	NC_021014	ATC	2	6	3053409	3053414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155129
64018	NC_021014	AG	3	6	3053473	3053478	50 %	0 %	50 %	0 %	479155129
64019	NC_021014	GCC	2	6	3053523	3053528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155129
64020	NC_021014	GAT	2	6	3053557	3053562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155129
64021	NC_021014	AGC	2	6	3053587	3053592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155129
64022	NC_021014	CAA	3	9	3053723	3053731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155129
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64024	NC_021014	GAA	2	6	3053845	3053850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155129
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64026	NC_021014	AT	3	6	3053915	3053920	50 %	50 %	0 %	0 %	479155129
64027	NC_021014	TAAA	2	8	3053937	3053944	75 %	25 %	0 %	0 %	479155129
64028	NC_021014	ACTT	2	8	3053952	3053959	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64029	NC_021014	ATT	2	6	3054034	3054039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64030	NC_021014	AAC	2	6	3054095	3054100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64031	NC_021014	C	7	7	3054129	3054135	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
64032	NC_021014	CCA	2	6	3054150	3054155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64033	NC_021014	CGC	2	6	3054204	3054209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64034	NC_021014	CTA	2	6	3054255	3054260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64035	NC_021014	AT	3	6	3054276	3054281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64036	NC_021014	TAC	2	6	3054434	3054439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64037	NC_021014	CTG	2	6	3054450	3054455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64038	NC_021014	CAG	2	6	3054457	3054462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64039	NC_021014	AAATC	2	10	3054465	3054474	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
64040	NC_021014	CCTT	2	8	3054483	3054490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64041	NC_021014	GATCT	2	10	3054686	3054695	20 %	40 %	20 %	20 %	479155130
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64043	NC_021014	GAA	2	6	3054749	3054754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155130
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64048	NC_021014	GTCCAG	2	12	3055060	3055071	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479155130
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64052	NC_021014	TCA	2	6	3055246	3055251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64053	NC_021014	AG	3	6	3055275	3055280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64054	NC_021014	ATC	2	6	3055291	3055296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64055	NC_021014	T	6	6	3055357	3055362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64056	NC_021014	T	6	6	3055382	3055387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64057	NC_021014	AGA	2	6	3055406	3055411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64058	NC_021014	GGA	2	6	3055423	3055428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64059	NC_021014	ATTT	2	8	3055446	3055453	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64060	NC_021014	AG	3	6	3055500	3055505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64061	NC_021014	GTAT	2	8	3055518	3055525	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64062	NC_021014	AAC	2	6	3055598	3055603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64063	NC_021014	TG	3	6	3055618	3055623	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64064	NC_021014	AAT	2	6	3055654	3055659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64065	NC_021014	TAT	2	6	3055667	3055672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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64067	NC_021014	TG	3	6	3055741	3055746	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64068	NC_021014	CAT	2	6	3055830	3055835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155131
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64073	NC_021014	TA	3	6	3056165	3056170	50 %	50 %	0 %	0 %	479155131
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64075	NC_021014	T	6	6	3056262	3056267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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64108	NC_021014	T	6	6	3057915	3057920	0 %	100 %	0 %	0 %	479155134
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64112	NC_021014	TCC	2	6	3058165	3058170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64113	NC_021014	TGA	2	6	3058180	3058185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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64115	NC_021014	AAT	2	6	3058202	3058207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64116	NC_021014	GAAT	2	8	3058256	3058263	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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64118	NC_021014	TCAT	2	8	3059085	3059092	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64119	NC_021014	GGA	2	6	3059093	3059098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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64121	NC_021014	AAG	2	6	3059258	3059263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64122	NC_021014	ACAG	2	8	3059415	3059422	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64123	NC_021014	CT	3	6	3059438	3059443	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64124	NC_021014	GA	3	6	3059561	3059566	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64125	NC_021014	TGGC	2	8	3059576	3059583	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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64222	NC_021014	A	6	6	3064343	3064348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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64224	NC_021014	TGTT	2	8	3064522	3064529	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64225	NC_021014	GCTG	2	8	3064546	3064553	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64226	NC_021014	GAA	2	6	3064600	3064605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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64228	NC_021014	CGAT	2	8	3064749	3064756	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64229	NC_021014	ATC	2	6	3064767	3064772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64230	NC_021014	TG	3	6	3064878	3064883	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64231	NC_021014	GCCC	2	8	3064982	3064989	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
64232	NC_021014	CTT	2	6	3065045	3065050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64233	NC_021014	GGA	2	6	3065122	3065127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64234	NC_021014	GCT	2	6	3065132	3065137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64235	NC_021014	TGA	2	6	3065187	3065192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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64237	NC_021014	GTT	2	6	3065257	3065262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64238	NC_021014	ACA	2	6	3065319	3065324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64239	NC_021014	ATC	2	6	3065366	3065371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64240	NC_021014	CTT	2	6	3065372	3065377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64241	NC_021014	ATGG	2	8	3065417	3065424	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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64243	NC_021014	AG	3	6	3065476	3065481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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64366	NC_021014	TGGT	2	8	3070727	3070734	0 %	50 %	50 %	0 %	479155140
64367	NC_021014	TTC	2	6	3070737	3070742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155140
64368	NC_021014	CAAG	2	8	3070793	3070800	50 %	0 %	25 %	25 %	479155140
64369	NC_021014	GT	3	6	3070818	3070823	0 %	50 %	50 %	0 %	479155140
64370	NC_021014	GGT	2	6	3070846	3070851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155140
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64373	NC_021014	GGT	2	6	3070930	3070935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155140
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64381	NC_021014	CGT	2	6	3071113	3071118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155140
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64384	NC_021014	TCCGAT	2	12	3071239	3071250	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479155140
64385	NC_021014	AGC	2	6	3071271	3071276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155140
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64388	NC_021014	GAT	2	6	3071514	3071519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155140
64389	NC_021014	GAT	2	6	3071656	3071661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155140
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64393	NC_021014	A	6	6	3071778	3071783	100 %	0 %	0 %	0 %	479155141
64394	NC_021014	AGA	2	6	3071901	3071906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64395	NC_021014	GCA	2	6	3071928	3071933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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64399	NC_021014	CGG	3	9	3072035	3072043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479155142
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64402	NC_021014	TGGTA	2	10	3072275	3072284	20 %	40 %	40 %	0 %	479155142
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64434	NC_021014	TGGT	2	8	3073646	3073653	0 %	50 %	50 %	0 %	479155144
64435	NC_021014	AGG	2	6	3073697	3073702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479155144
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64447	NC_021014	TCA	2	6	3074035	3074040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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64450	NC_021014	GAG	2	6	3074122	3074127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64451	NC_021014	TG	3	6	3074160	3074165	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64452	NC_021014	ATC	2	6	3074289	3074294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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64454	NC_021014	A	7	7	3074380	3074386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64455	NC_021014	GCA	2	6	3074398	3074403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64456	NC_021014	TGA	2	6	3074463	3074468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155145
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64469	NC_021014	ATC	2	6	3075120	3075125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155146
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64471	NC_021014	AGA	2	6	3075229	3075234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155146
64472	NC_021014	A	6	6	3075255	3075260	100 %	0 %	0 %	0 %	479155146
64473	NC_021014	GTATC	2	10	3075307	3075316	20 %	40 %	20 %	20 %	479155146
64474	NC_021014	GATC	2	8	3075334	3075341	25 %	25 %	25 %	25 %	479155146
64475	NC_021014	TTCT	2	8	3075342	3075349	0 %	75 %	0 %	25 %	479155146
64476	NC_021014	CAG	2	6	3075443	3075448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155146
64477	NC_021014	TA	3	6	3075516	3075521	50 %	50 %	0 %	0 %	479155146
64478	NC_021014	A	7	7	3075533	3075539	100 %	0 %	0 %	0 %	479155146
64479	NC_021014	CAT	2	6	3075640	3075645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155146
64480	NC_021014	CGAAG	2	10	3075668	3075677	40 %	0 %	40 %	20 %	479155146
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