MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
63501	NC_021014	AT	3	6	3029545	3029550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63502	NC_021014	GAT	2	6	3029621	3029626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63503	NC_021014	ATT	3	9	3029636	3029644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63504	NC_021014	GAAATT	2	12	3029654	3029665	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63505	NC_021014	ATG	2	6	3029667	3029672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63506	NC_021014	T	7	7	3029706	3029712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63507	NC_021014	AT	3	6	3029720	3029725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63508	NC_021014	AT	3	6	3029768	3029773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63509	NC_021014	AGA	2	6	3029794	3029799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63510	NC_021014	TTG	2	6	3029853	3029858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63511	NC_021014	TAG	2	6	3029878	3029883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63512	NC_021014	GAA	2	6	3029929	3029934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63513	NC_021014	AAC	2	6	3029963	3029968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63514	NC_021014	ATA	2	6	3030024	3030029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63515	NC_021014	TTA	2	6	3030041	3030046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63516	NC_021014	T	7	7	3030066	3030072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63517	NC_021014	ATTT	2	8	3030096	3030103	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63518	NC_021014	ATT	2	6	3030107	3030112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63519	NC_021014	TGA	2	6	3030118	3030123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63520	NC_021014	AGA	2	6	3030178	3030183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63521	NC_021014	A	6	6	3030183	3030188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63522	NC_021014	GAA	2	6	3030206	3030211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63523	NC_021014	AGA	2	6	3030220	3030225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63524	NC_021014	GAAAA	2	10	3030282	3030291	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63525	NC_021014	TAT	2	6	3030323	3030328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63526	NC_021014	A	6	6	3030330	3030335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63527	NC_021014	GCA	2	6	3030386	3030391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63528	NC_021014	AATTT	2	10	3030411	3030420	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63529	NC_021014	AAG	2	6	3030452	3030457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63530	NC_021014	GATT	2	8	3030485	3030492	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63531	NC_021014	AGTC	2	8	3030502	3030509	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63532	NC_021014	AAGG	2	8	3030574	3030581	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63533	NC_021014	GGA	2	6	3030631	3030636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479155112
63534	NC_021014	TAT	2	6	3030698	3030703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155112
63535	NC_021014	AAC	2	6	3030732	3030737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155112
63536	NC_021014	GAT	2	6	3030760	3030765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155112
63537	NC_021014	GAA	2	6	3030792	3030797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155112
63538	NC_021014	TAC	2	6	3030800	3030805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155112
63539	NC_021014	AAG	2	6	3030848	3030853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155112
63540	NC_021014	ATT	2	6	3030862	3030867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155112
63541	NC_021014	AG	3	6	3030922	3030927	50 %	0 %	50 %	0 %	479155112
63542	NC_021014	GATTAT	2	12	3030964	3030975	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479155112
63543	NC_021014	TGAT	2	8	3030980	3030987	25 %	50 %	25 %	0 %	479155112
63544	NC_021014	AAC	2	6	3031194	3031199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155112
63545	NC_021014	GCA	2	6	3031288	3031293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155112
63546	NC_021014	GAGG	2	8	3031356	3031363	25 %	0 %	75 %	0 %	479155112
63547	NC_021014	GAA	2	6	3031436	3031441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155113
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63549	NC_021014	CCAT	2	8	3031507	3031514	25 %	25 %	0 %	50 %	479155113
63550	NC_021014	GCGT	2	8	3031557	3031564	0 %	25 %	50 %	25 %	479155113
63551	NC_021014	CGGG	2	8	3031608	3031615	0 %	0 %	75 %	25 %	479155113
63552	NC_021014	GAC	2	6	3031703	3031708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155113
63553	NC_021014	GAA	2	6	3031748	3031753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155113
63554	NC_021014	CAGG	2	8	3031811	3031818	25 %	0 %	50 %	25 %	479155113
63555	NC_021014	TGA	2	6	3031876	3031881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155113
63556	NC_021014	ATT	2	6	3031882	3031887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155113
63557	NC_021014	AT	3	6	3031927	3031932	50 %	50 %	0 %	0 %	479155113
63558	NC_021014	CGG	2	6	3031998	3032003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479155113
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63560	NC_021014	TGAA	2	8	3032127	3032134	50 %	25 %	25 %	0 %	479155113
63561	NC_021014	TGT	2	6	3032142	3032147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155113
63562	NC_021014	GAA	2	6	3032209	3032214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155113
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63564	NC_021014	A	6	6	3032241	3032246	100 %	0 %	0 %	0 %	479155113
63565	NC_021014	GAA	2	6	3032249	3032254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155113
63566	NC_021014	A	6	6	3032292	3032297	100 %	0 %	0 %	0 %	479155113
63567	NC_021014	TCCCC	2	10	3032377	3032386	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
63568	NC_021014	CAG	2	6	3032409	3032414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63569	NC_021014	TCT	2	6	3032451	3032456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63570	NC_021014	CAG	2	6	3032493	3032498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155114
63571	NC_021014	AACA	2	8	3032501	3032508	75 %	0 %	0 %	25 %	479155114
63572	NC_021014	CAG	2	6	3032520	3032525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155114
63573	NC_021014	GACG	2	8	3032534	3032541	25 %	0 %	50 %	25 %	479155114
63574	NC_021014	TTGA	2	8	3032547	3032554	25 %	50 %	25 %	0 %	479155114
63575	NC_021014	AAAG	2	8	3032555	3032562	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63576	NC_021014	GAA	2	6	3032577	3032582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63577	NC_021014	GT	3	6	3032596	3032601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63578	NC_021014	AG	4	8	3032691	3032698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63579	NC_021014	AT	3	6	3032703	3032708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63580	NC_021014	TGA	2	6	3032717	3032722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63581	NC_021014	ATG	2	6	3032723	3032728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63582	NC_021014	CATT	2	8	3032733	3032740	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63583	NC_021014	TGC	2	6	3032856	3032861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63584	NC_021014	GT	3	6	3032958	3032963	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63585	NC_021014	TGAG	2	8	3032978	3032985	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63586	NC_021014	GGA	2	6	3033109	3033114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63587	NC_021014	A	6	6	3033186	3033191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63588	NC_021014	TTG	2	6	3033239	3033244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63589	NC_021014	GTA	2	6	3033278	3033283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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63591	NC_021014	TGAAGT	2	12	3033327	3033338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63592	NC_021014	GCA	2	6	3033535	3033540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63593	NC_021014	ATT	2	6	3033566	3033571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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63595	NC_021014	A	6	6	3033732	3033737	100 %	0 %	0 %	0 %	479155115
63596	NC_021014	ACTG	2	8	3033757	3033764	25 %	25 %	25 %	25 %	479155115
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63604	NC_021014	CA	3	6	3034324	3034329	50 %	0 %	0 %	50 %	479155115
63605	NC_021014	GA	3	6	3034377	3034382	50 %	0 %	50 %	0 %	479155115
63606	NC_021014	CAA	2	6	3034570	3034575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155115
63607	NC_021014	GTT	2	6	3034604	3034609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155115
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63609	NC_021014	TTG	2	6	3034719	3034724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155115
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63612	NC_021014	GAA	2	6	3034779	3034784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155115
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63614	NC_021014	CTG	2	6	3034875	3034880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155115
63615	NC_021014	ATC	2	6	3034982	3034987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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63619	NC_021014	GA	3	6	3035164	3035169	50 %	0 %	50 %	0 %	479155116
63620	NC_021014	AGA	2	6	3035171	3035176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155116
63621	NC_021014	A	6	6	3035176	3035181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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63998	NC_021014	GAA	2	6	3052192	3052197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63999	NC_021014	GAAAA	2	10	3052235	3052244	80 %	0 %	20 %	0 %	479155128
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