MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
61501	NC_021014	A	6	6	2933938	2933943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61502	NC_021014	TTCC	2	8	2933999	2934006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61503	NC_021014	TTC	2	6	2934056	2934061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61504	NC_021014	TGG	2	6	2934083	2934088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61505	NC_021014	ATG	2	6	2934251	2934256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61506	NC_021014	CGG	2	6	2934266	2934271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61507	NC_021014	TCC	2	6	2934298	2934303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61508	NC_021014	AAT	2	6	2934304	2934309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61509	NC_021014	AGC	2	6	2934330	2934335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61510	NC_021014	A	6	6	2934365	2934370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61511	NC_021014	ATC	2	6	2934378	2934383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61512	NC_021014	GACG	2	8	2934390	2934397	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61513	NC_021014	A	6	6	2934431	2934436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61514	NC_021014	GCG	2	6	2934488	2934493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61515	NC_021014	CGG	2	6	2934553	2934558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61516	NC_021014	AGA	2	6	2934562	2934567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61517	NC_021014	A	9	9	2934662	2934670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61518	NC_021014	TATTT	2	10	2934672	2934681	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61519	NC_021014	ATT	2	6	2934749	2934754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61520	NC_021014	ATA	2	6	2934782	2934787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61521	NC_021014	TA	3	6	2934786	2934791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61522	NC_021014	CTATA	2	10	2934833	2934842	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61523	NC_021014	CGG	2	6	2935043	2935048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479155030
61524	NC_021014	TTC	2	6	2935079	2935084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155030
61525	NC_021014	GCA	2	6	2935147	2935152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155030
61526	NC_021014	AGGA	2	8	2935193	2935200	50 %	0 %	50 %	0 %	479155030
61527	NC_021014	GGT	2	6	2935249	2935254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155030
61528	NC_021014	GGAA	2	8	2935329	2935336	50 %	0 %	50 %	0 %	479155030
61529	NC_021014	CTGC	2	8	2935337	2935344	0 %	25 %	25 %	50 %	479155030
61530	NC_021014	TTC	2	6	2935352	2935357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155030
61531	NC_021014	TGC	2	6	2935413	2935418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155030
61532	NC_021014	TGT	2	6	2935431	2935436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155030
61533	NC_021014	CTT	2	6	2935450	2935455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155030
61534	NC_021014	GCA	2	6	2935471	2935476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155030
61535	NC_021014	TCA	2	6	2935598	2935603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155030
61536	NC_021014	GCA	2	6	2935648	2935653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155030
61537	NC_021014	CGG	2	6	2935686	2935691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479155030
61538	NC_021014	AT	3	6	2935722	2935727	50 %	50 %	0 %	0 %	479155030
61539	NC_021014	AG	3	6	2935845	2935850	50 %	0 %	50 %	0 %	479155030
61540	NC_021014	ATC	2	6	2935909	2935914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155030
61541	NC_021014	CTT	2	6	2935942	2935947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155030
61542	NC_021014	ATC	2	6	2935957	2935962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155030
61543	NC_021014	TTC	2	6	2935975	2935980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155030
61544	NC_021014	CAA	2	6	2936025	2936030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155030
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61546	NC_021014	ATC	2	6	2936149	2936154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155030
61547	NC_021014	CAG	2	6	2936224	2936229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155030
61548	NC_021014	GTT	3	9	2936248	2936256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155030
61549	NC_021014	CGG	2	6	2936271	2936276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479155030
61550	NC_021014	TCT	2	6	2936286	2936291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155030
61551	NC_021014	GCA	2	6	2936296	2936301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155030
61552	NC_021014	CAG	2	6	2936315	2936320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155030
61553	NC_021014	GAT	2	6	2936352	2936357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155030
61554	NC_021014	TCC	2	6	2936435	2936440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155030
61555	NC_021014	GGT	2	6	2936509	2936514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155030
61556	NC_021014	TCGT	2	8	2936516	2936523	0 %	50 %	25 %	25 %	479155030
61557	NC_021014	A	6	6	2936555	2936560	100 %	0 %	0 %	0 %	479155030
61558	NC_021014	TTG	2	6	2936624	2936629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155030
61559	NC_021014	TTC	2	6	2936633	2936638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155030
61560	NC_021014	CGG	2	6	2936703	2936708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479155030
61561	NC_021014	TGT	2	6	2936709	2936714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155030
61562	NC_021014	TGA	2	6	2936717	2936722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155030
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61565	NC_021014	TGA	2	6	2936776	2936781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155030
61566	NC_021014	TGATC	2	10	2936821	2936830	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
61567	NC_021014	AAAC	2	8	2936835	2936842	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61568	NC_021014	AGC	2	6	2936871	2936876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61569	NC_021014	TGA	2	6	2936965	2936970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155031
61570	NC_021014	CTG	2	6	2937029	2937034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155031
61571	NC_021014	TAAA	2	8	2937129	2937136	75 %	25 %	0 %	0 %	479155031
61572	NC_021014	GAACGG	2	12	2937158	2937169	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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61574	NC_021014	A	8	8	2937355	2937362	100 %	0 %	0 %	0 %	479155032
61575	NC_021014	TCT	2	6	2937381	2937386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155032
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61578	NC_021014	A	7	7	2937600	2937606	100 %	0 %	0 %	0 %	479155032
61579	NC_021014	GAT	2	6	2937673	2937678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155032
61580	NC_021014	GCT	2	6	2937688	2937693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155032
61581	NC_021014	GGT	2	6	2937700	2937705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155032
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61584	NC_021014	ATT	2	6	2937803	2937808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155032
61585	NC_021014	ATGT	2	8	2937859	2937866	25 %	50 %	25 %	0 %	479155032
61586	NC_021014	CAT	2	6	2937894	2937899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155032
61587	NC_021014	ATC	2	6	2937970	2937975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155032
61588	NC_021014	ATC	2	6	2938078	2938083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155032
61589	NC_021014	TG	3	6	2938087	2938092	0 %	50 %	50 %	0 %	479155032
61590	NC_021014	GAT	2	6	2938132	2938137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155032
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61592	NC_021014	T	6	6	2938238	2938243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61593	NC_021014	AGA	2	6	2938308	2938313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61594	NC_021014	CAGC	2	8	2938513	2938520	25 %	0 %	25 %	50 %	479155033
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61602	NC_021014	CGT	2	6	2938769	2938774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155033
61603	NC_021014	CTG	2	6	2938869	2938874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155033
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61605	NC_021014	CAT	2	6	2938888	2938893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155033
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61608	NC_021014	TCT	2	6	2939085	2939090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155033
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61614	NC_021014	AT	3	6	2939407	2939412	50 %	50 %	0 %	0 %	479155033
61615	NC_021014	AT	3	6	2939416	2939421	50 %	50 %	0 %	0 %	479155033
61616	NC_021014	GAT	2	6	2939458	2939463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61617	NC_021014	TTCC	2	8	2939512	2939519	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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61987	NC_021014	T	6	6	2957826	2957831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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