MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
61001	NC_021014	T	6	6	2909033	2909038	0 %	100 %	0 %	0 %	479155000
61002	NC_021014	ATAAAA	2	12	2909040	2909051	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	479155000
61003	NC_021014	CT	3	6	2909056	2909061	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61004	NC_021014	GCA	2	6	2909107	2909112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61005	NC_021014	CTGG	2	8	2909309	2909316	0 %	25 %	50 %	25 %	479155001
61006	NC_021014	TCA	2	6	2909367	2909372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155001
61007	NC_021014	ATAG	2	8	2909450	2909457	50 %	25 %	25 %	0 %	479155001
61008	NC_021014	AAT	2	6	2909506	2909511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155001
61009	NC_021014	TGA	2	6	2909518	2909523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155001
61010	NC_021014	AATAT	2	10	2909558	2909567	60 %	40 %	0 %	0 %	479155001
61011	NC_021014	CTGA	2	8	2909599	2909606	25 %	25 %	25 %	25 %	479155001
61012	NC_021014	GCA	2	6	2909670	2909675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155001
61013	NC_021014	TC	3	6	2909695	2909700	0 %	50 %	0 %	50 %	479155001
61014	NC_021014	TCT	2	6	2909716	2909721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155001
61015	NC_021014	AAG	2	6	2909786	2909791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155001
61016	NC_021014	AGC	2	6	2909821	2909826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155001
61017	NC_021014	ATTTTC	2	12	2909892	2909903	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479155001
61018	NC_021014	AT	3	6	2909971	2909976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61019	NC_021014	T	6	6	2910269	2910274	0 %	100 %	0 %	0 %	479155003
61020	NC_021014	GCT	2	6	2910296	2910301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155003
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61022	NC_021014	GA	3	6	2910414	2910419	50 %	0 %	50 %	0 %	479155003
61023	NC_021014	AAAG	2	8	2910465	2910472	75 %	0 %	25 %	0 %	479155003
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61027	NC_021014	CAG	2	6	2910781	2910786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155003
61028	NC_021014	AT	4	8	2910789	2910796	50 %	50 %	0 %	0 %	479155003
61029	NC_021014	AAG	2	6	2910863	2910868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155003
61030	NC_021014	ATTTC	2	10	2910973	2910982	20 %	60 %	0 %	20 %	479155003
61031	NC_021014	A	7	7	2911070	2911076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61032	NC_021014	T	6	6	2911084	2911089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61033	NC_021014	TA	3	6	2911124	2911129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61034	NC_021014	GC	3	6	2911136	2911141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61035	NC_021014	AGG	2	6	2911197	2911202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61036	NC_021014	ATC	2	6	2911221	2911226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61037	NC_021014	ATC	2	6	2911282	2911287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61038	NC_021014	CTT	2	6	2911338	2911343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61039	NC_021014	GTT	2	6	2911391	2911396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61040	NC_021014	ATA	2	6	2911408	2911413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61041	NC_021014	AGAAA	2	10	2911529	2911538	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61042	NC_021014	CAGAAA	2	12	2911603	2911614	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61043	NC_021014	GGA	2	6	2911617	2911622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61044	NC_021014	AG	3	6	2911661	2911666	50 %	0 %	50 %	0 %	479155004
61045	NC_021014	AC	3	6	2911755	2911760	50 %	0 %	0 %	50 %	479155004
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61051	NC_021014	TAAT	2	8	2912014	2912021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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61053	NC_021014	CA	3	6	2912119	2912124	50 %	0 %	0 %	50 %	479155005
61054	NC_021014	CTTC	2	8	2912131	2912138	0 %	50 %	0 %	50 %	479155005
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61086	NC_021014	TA	3	6	2913746	2913751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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61089	NC_021014	CT	3	6	2913925	2913930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61090	NC_021014	GTTC	2	8	2913931	2913938	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61091	NC_021014	AG	3	6	2913953	2913958	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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61106	NC_021014	AAG	2	6	2914589	2914594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155007
61107	NC_021014	CGG	2	6	2914650	2914655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479155007
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61110	NC_021014	A	6	6	2914790	2914795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61111	NC_021014	A	6	6	2914800	2914805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61112	NC_021014	TGG	2	6	2914814	2914819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61113	NC_021014	AAT	2	6	2914858	2914863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61114	NC_021014	AT	3	6	2914877	2914882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61115	NC_021014	ATG	2	6	2914899	2914904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61116	NC_021014	GAT	2	6	2914932	2914937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155008
61117	NC_021014	TGA	2	6	2914953	2914958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155008
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61120	NC_021014	GAAAA	2	10	2915062	2915071	80 %	0 %	20 %	0 %	479155008
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61122	NC_021014	TCA	2	6	2915135	2915140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61123	NC_021014	ATG	2	6	2915254	2915259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155009
61124	NC_021014	CAG	2	6	2915274	2915279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155009
61125	NC_021014	ATG	2	6	2915284	2915289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155009
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61128	NC_021014	T	6	6	2915321	2915326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61129	NC_021014	GAT	2	6	2915374	2915379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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61232	NC_021014	T	6	6	2920589	2920594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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61240	NC_021014	TAC	2	6	2921136	2921141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155018
61241	NC_021014	AT	3	6	2921208	2921213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61242	NC_021014	ATT	2	6	2921283	2921288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61243	NC_021014	A	7	7	2921295	2921301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61244	NC_021014	ATT	2	6	2921308	2921313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61245	NC_021014	GAA	2	6	2921423	2921428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155019
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61248	NC_021014	GAAA	2	8	2921595	2921602	75 %	0 %	25 %	0 %	479155020
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61251	NC_021014	TCA	3	9	2921691	2921699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155020
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61285	NC_021014	TGA	2	6	2923560	2923565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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