MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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60002	NC_021014	TTC	2	6	2862384	2862389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154944
60003	NC_021014	CAG	2	6	2862403	2862408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154944
60004	NC_021014	CAG	2	6	2862426	2862431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154944
60005	NC_021014	GAAG	2	8	2862434	2862441	50 %	0 %	50 %	0 %	479154944
60006	NC_021014	A	7	7	2862449	2862455	100 %	0 %	0 %	0 %	479154944
60007	NC_021014	A	6	6	2862554	2862559	100 %	0 %	0 %	0 %	479154944
60008	NC_021014	AGC	2	6	2862586	2862591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154944
60009	NC_021014	TTC	2	6	2862662	2862667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154944
60010	NC_021014	TAT	2	6	2862705	2862710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479154944
60011	NC_021014	GAG	2	6	2862823	2862828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479154945
60012	NC_021014	TCG	2	6	2862830	2862835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154945
60013	NC_021014	GAT	2	6	2862856	2862861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154945
60014	NC_021014	AAG	2	6	2862886	2862891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154945
60015	NC_021014	GAA	2	6	2862918	2862923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154945
60016	NC_021014	GAT	2	6	2862931	2862936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154945
60017	NC_021014	GAA	3	9	2862939	2862947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154945
60018	NC_021014	A	7	7	2862960	2862966	100 %	0 %	0 %	0 %	479154945
60019	NC_021014	CAG	2	6	2862985	2862990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154945
60020	NC_021014	A	6	6	2863002	2863007	100 %	0 %	0 %	0 %	479154945
60021	NC_021014	CAG	2	6	2863027	2863032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154945
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60023	NC_021014	GATG	2	8	2863060	2863067	25 %	25 %	50 %	0 %	479154945
60024	NC_021014	CAG	2	6	2863090	2863095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154945
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60031	NC_021014	GAA	2	6	2863423	2863428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154945
60032	NC_021014	GCA	2	6	2863440	2863445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154945
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60041	NC_021014	AAAG	2	8	2863835	2863842	75 %	0 %	25 %	0 %	479154945
60042	NC_021014	AGA	2	6	2863862	2863867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154945
60043	NC_021014	GAT	2	6	2863893	2863898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154945
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60049	NC_021014	AAG	2	6	2864135	2864140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60050	NC_021014	GAAA	2	8	2864151	2864158	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60051	NC_021014	A	6	6	2864174	2864179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60052	NC_021014	CAG	2	6	2864207	2864212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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60054	NC_021014	GAT	2	6	2864350	2864355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60055	NC_021014	TTC	2	6	2864357	2864362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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60057	NC_021014	TTC	2	6	2864544	2864549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60058	NC_021014	AAG	2	6	2864742	2864747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60059	NC_021014	ATG	2	6	2864961	2864966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60060	NC_021014	ATG	2	6	2864979	2864984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60061	NC_021014	TCT	2	6	2865013	2865018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60062	NC_021014	GATC	2	8	2865043	2865050	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60063	NC_021014	AAAAG	2	10	2865088	2865097	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60064	NC_021014	GAT	2	6	2865200	2865205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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60067	NC_021014	TAAAG	2	10	2865292	2865301	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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60071	NC_021014	TA	3	6	2865402	2865407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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60087	NC_021014	CAGATG	2	12	2866200	2866211	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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60092	NC_021014	T	6	6	2866356	2866361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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60095	NC_021014	TGGA	2	8	2866484	2866491	25 %	25 %	50 %	0 %	479154948
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60109	NC_021014	AG	3	6	2867183	2867188	50 %	0 %	50 %	0 %	479154948
60110	NC_021014	ATG	3	9	2867319	2867327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154948
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60120	NC_021014	TGG	2	6	2867697	2867702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479154948
60121	NC_021014	AG	3	6	2867708	2867713	50 %	0 %	50 %	0 %	479154948
60122	NC_021014	CA	3	6	2867743	2867748	50 %	0 %	0 %	50 %	479154948
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60184	NC_021014	CCA	2	6	2871272	2871277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60185	NC_021014	TAT	2	6	2871279	2871284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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60188	NC_021014	GAA	2	6	2871382	2871387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154950
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60224	NC_021014	ATA	2	6	2873512	2873517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479154952
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60226	NC_021014	AAAG	2	8	2873553	2873560	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60227	NC_021014	GCA	2	6	2873613	2873618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60228	NC_021014	TGC	2	6	2873632	2873637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60229	NC_021014	CAGG	2	8	2873660	2873667	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60230	NC_021014	CAG	2	6	2873673	2873678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60231	NC_021014	TACAG	2	10	2873683	2873692	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60232	NC_021014	CCAG	2	8	2873704	2873711	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60233	NC_021014	CCAGT	2	10	2873747	2873756	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
60234	NC_021014	GCAG	2	8	2873780	2873787	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60235	NC_021014	GCA	2	6	2873846	2873851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60236	NC_021014	GGA	2	6	2873852	2873857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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60358	NC_021014	ATC	2	6	2879526	2879531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154960
60359	NC_021014	GAA	2	6	2879567	2879572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154960
60360	NC_021014	GAT	2	6	2879667	2879672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154960
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60392	NC_021014	A	7	7	2881552	2881558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60393	NC_021014	T	7	7	2881602	2881608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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60444	NC_021014	TAT	2	6	2883756	2883761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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60477	NC_021014	CTC	2	6	2885283	2885288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479154964
60478	NC_021014	GGT	2	6	2885312	2885317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479154964
60479	NC_021014	GCT	2	6	2885366	2885371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154964
60480	NC_021014	GAT	2	6	2885377	2885382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154964
60481	NC_021014	CAG	2	6	2885475	2885480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154964
60482	NC_021014	GAT	2	6	2885491	2885496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154964
60483	NC_021014	GTT	2	6	2885519	2885524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479154964
60484	NC_021014	GTT	2	6	2885540	2885545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479154964
60485	NC_021014	GGA	2	6	2885564	2885569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479154964
60486	NC_021014	CTT	2	6	2885570	2885575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154964
60487	NC_021014	GGT	2	6	2885627	2885632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479154964
60488	NC_021014	A	6	6	2885647	2885652	100 %	0 %	0 %	0 %	479154964
60489	NC_021014	TCA	2	6	2885667	2885672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154964
60490	NC_021014	AGC	2	6	2885700	2885705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154964
60491	NC_021014	TATC	2	8	2885816	2885823	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60492	NC_021014	GGA	2	6	2885824	2885829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60493	NC_021014	A	6	6	2885851	2885856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60494	NC_021014	TA	3	6	2885869	2885874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60495	NC_021014	A	7	7	2885874	2885880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60496	NC_021014	T	7	7	2885909	2885915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60497	NC_021014	GGC	2	6	2885924	2885929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60498	NC_021014	CAT	2	6	2886020	2886025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154965
60499	NC_021014	ATC	2	6	2886063	2886068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479154965
60500	NC_021014	AGA	2	6	2886098	2886103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479154965

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