MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 74336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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59002	NC_021014	TGGAA	2	10	2818329	2818338	40 %	20 %	40 %	0 %	479154897
59003	NC_021014	ATCA	2	8	2818457	2818464	50 %	25 %	0 %	25 %	479154897
59004	NC_021014	CTT	2	6	2818468	2818473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154897
59005	NC_021014	TTG	3	9	2818544	2818552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479154897
59006	NC_021014	TAT	2	6	2818557	2818562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479154897
59007	NC_021014	GTATG	2	10	2818563	2818572	20 %	40 %	40 %	0 %	479154897
59008	NC_021014	GTGC	2	8	2818574	2818581	0 %	25 %	50 %	25 %	479154897
59009	NC_021014	TGG	2	6	2818583	2818588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479154897
59010	NC_021014	TAC	2	6	2818653	2818658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59011	NC_021014	AAAT	3	12	2818663	2818674	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59012	NC_021014	AGG	2	6	2818682	2818687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59013	NC_021014	CTG	2	6	2818740	2818745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154898
59014	NC_021014	ATT	2	6	2818860	2818865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59015	NC_021014	ATA	2	6	2818907	2818912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59016	NC_021014	AGA	2	6	2818944	2818949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59017	NC_021014	GTT	2	6	2818955	2818960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59018	NC_021014	ATGAA	2	10	2819024	2819033	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59019	NC_021014	ATT	2	6	2819072	2819077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59020	NC_021014	GGT	2	6	2819082	2819087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59021	NC_021014	GAT	2	6	2819100	2819105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154899
59022	NC_021014	AAATA	2	10	2819135	2819144	80 %	20 %	0 %	0 %	479154899
59023	NC_021014	TGT	2	6	2819205	2819210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479154899
59024	NC_021014	GA	3	6	2819231	2819236	50 %	0 %	50 %	0 %	479154899
59025	NC_021014	AT	3	6	2819237	2819242	50 %	50 %	0 %	0 %	479154899
59026	NC_021014	ATT	2	6	2819342	2819347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479154899
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59030	NC_021014	AT	3	6	2819572	2819577	50 %	50 %	0 %	0 %	479154899
59031	NC_021014	GACAA	2	10	2819634	2819643	60 %	0 %	20 %	20 %	479154899
59032	NC_021014	TTA	2	6	2819708	2819713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479154899
59033	NC_021014	GAT	2	6	2819727	2819732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154899
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59038	NC_021014	AG	3	6	2819818	2819823	50 %	0 %	50 %	0 %	479154899
59039	NC_021014	AAAT	2	8	2819987	2819994	75 %	25 %	0 %	0 %	479154899
59040	NC_021014	ATG	2	6	2820013	2820018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154899
59041	NC_021014	T	6	6	2820051	2820056	0 %	100 %	0 %	0 %	479154899
59042	NC_021014	TGG	2	6	2820068	2820073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479154899
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59044	NC_021014	TTC	2	6	2820101	2820106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154899
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59048	NC_021014	T	6	6	2820237	2820242	0 %	100 %	0 %	0 %	479154900
59049	NC_021014	TAT	2	6	2820249	2820254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479154900
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59053	NC_021014	TTA	2	6	2820355	2820360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479154900
59054	NC_021014	TA	3	6	2820412	2820417	50 %	50 %	0 %	0 %	479154900
59055	NC_021014	GCA	2	6	2820433	2820438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154900
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59058	NC_021014	ATG	2	6	2820544	2820549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59059	NC_021014	T	6	6	2820556	2820561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59060	NC_021014	T	6	6	2820594	2820599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59061	NC_021014	TTAT	2	8	2820614	2820621	25 %	75 %	0 %	0 %	479154901
59062	NC_021014	TTA	2	6	2820665	2820670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479154901
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59079	NC_021014	AACAG	2	10	2821398	2821407	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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59084	NC_021014	ATT	2	6	2821591	2821596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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59088	NC_021014	GATC	2	8	2821686	2821693	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59089	NC_021014	ATT	3	9	2821714	2821722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59090	NC_021014	TGA	2	6	2821755	2821760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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59092	NC_021014	TAT	2	6	2821824	2821829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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59100	NC_021014	TGAA	2	8	2822111	2822118	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59101	NC_021014	TA	3	6	2822131	2822136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59102	NC_021014	A	6	6	2822147	2822152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59103	NC_021014	ATT	2	6	2822158	2822163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59104	NC_021014	A	6	6	2822165	2822170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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59106	NC_021014	ATTTAT	2	12	2822181	2822192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59107	NC_021014	AG	3	6	2822212	2822217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59108	NC_021014	CTT	2	6	2822259	2822264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59109	NC_021014	AT	3	6	2822275	2822280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59110	NC_021014	ATTA	2	8	2822362	2822369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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59112	NC_021014	ATTTG	2	10	2822512	2822521	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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59116	NC_021014	TGAAAG	2	12	2822723	2822734	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59117	NC_021014	T	6	6	2822744	2822749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59118	NC_021014	TCT	2	6	2822756	2822761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59119	NC_021014	ATT	3	9	2822774	2822782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59120	NC_021014	ATA	2	6	2822886	2822891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59121	NC_021014	AGA	2	6	2822937	2822942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59122	NC_021014	TTC	2	6	2822953	2822958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154903
59123	NC_021014	TTC	2	6	2823018	2823023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154903
59124	NC_021014	ATA	2	6	2823060	2823065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479154903
59125	NC_021014	TTCT	2	8	2823111	2823118	0 %	75 %	0 %	25 %	479154903
59126	NC_021014	AAT	2	6	2823135	2823140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479154903
59127	NC_021014	GCA	2	6	2823224	2823229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479154903
59128	NC_021014	GTC	2	6	2823291	2823296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154903
59129	NC_021014	TTA	2	6	2823364	2823369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479154903
59130	NC_021014	TCCT	2	8	2823394	2823401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59131	NC_021014	GCT	2	6	2823543	2823548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59132	NC_021014	TGGA	2	8	2823559	2823566	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59133	NC_021014	T	7	7	2823613	2823619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59134	NC_021014	T	6	6	2823662	2823667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59135	NC_021014	TG	3	6	2823688	2823693	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59136	NC_021014	T	6	6	2823697	2823702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59137	NC_021014	AGAT	2	8	2823713	2823720	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59138	NC_021014	AGC	3	9	2823839	2823847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59139	NC_021014	GCT	2	6	2823954	2823959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154904
59140	NC_021014	AGAA	2	8	2823964	2823971	75 %	0 %	25 %	0 %	479154904
59141	NC_021014	TTC	3	9	2823972	2823980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479154904
59142	NC_021014	TA	3	6	2824113	2824118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59143	NC_021014	CTG	2	6	2824129	2824134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59144	NC_021014	GCTTT	2	10	2824148	2824157	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
59145	NC_021014	TTGG	2	8	2824207	2824214	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59146	NC_021014	TGC	2	6	2824226	2824231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59147	NC_021014	T	6	6	2824344	2824349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59148	NC_021014	GGC	2	6	2824507	2824512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59149	NC_021014	TGC	2	6	2824550	2824555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59150	NC_021014	T	6	6	2824591	2824596	0 %	100 %	0 %	0 %	479154905
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59153	NC_021014	GAT	2	6	2824659	2824664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154905
59154	NC_021014	CATA	2	8	2824665	2824672	50 %	25 %	0 %	25 %	479154905
59155	NC_021014	C	6	6	2824674	2824679	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
59156	NC_021014	CA	3	6	2824750	2824755	50 %	0 %	0 %	50 %	479154906
59157	NC_021014	TG	3	6	2824777	2824782	0 %	50 %	50 %	0 %	479154906
59158	NC_021014	CAGA	2	8	2824796	2824803	50 %	0 %	25 %	25 %	479154906
59159	NC_021014	T	6	6	2824891	2824896	0 %	100 %	0 %	0 %	479154906
59160	NC_021014	TTTG	2	8	2824907	2824914	0 %	75 %	25 %	0 %	479154906
59161	NC_021014	CA	3	6	2824986	2824991	50 %	0 %	0 %	50 %	479154906
59162	NC_021014	TGC	2	6	2825053	2825058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479154906
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59169	NC_021014	CTT	2	6	2825610	2825615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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59173	NC_021014	TCA	2	6	2825904	2825909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59174	NC_021014	GCAG	2	8	2825918	2825925	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59175	NC_021014	TAA	2	6	2825929	2825934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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59182	NC_021014	A	6	6	2826192	2826197	100 %	0 %	0 %	0 %	479154908
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59231	NC_021014	TGTT	2	8	2828555	2828562	0 %	75 %	25 %	0 %	479154908
59232	NC_021014	TGGTAA	2	12	2828568	2828579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479154908
59233	NC_021014	CTTGTG	2	12	2828607	2828618	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	479154908
59234	NC_021014	CGC	2	6	2828655	2828660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479154908
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59240	NC_021014	GA	3	6	2829001	2829006	50 %	0 %	50 %	0 %	479154908
59241	NC_021014	TG	3	6	2829032	2829037	0 %	50 %	50 %	0 %	479154908
59242	NC_021014	ATT	2	6	2829073	2829078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479154908
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