MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus bromii L2-63 draft genome

Total Repeats: 45010

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021013	A	6	6	200418	200423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_021013	A	6	6	200442	200447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_021013	GTTTTT	2	12	200459	200470	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_021013	ATG	2	6	200504	200509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_021013	T	6	6	200665	200670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_021013	TGTT	2	8	200724	200731	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_021013	GCG	2	6	200761	200766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_021013	TGT	2	6	200775	200780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_021013	TGT	2	6	200810	200815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_021013	CTT	2	6	200930	200935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_021013	CAA	2	6	200936	200941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_021013	ATC	2	6	200961	200966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_021013	TG	3	6	200973	200978	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_021013	GTC	2	6	201009	201014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_021013	GTT	2	6	201024	201029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_021013	A	6	6	201103	201108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_021013	AC	3	6	201166	201171	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4018	NC_021013	TCG	2	6	201193	201198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_021013	ATT	2	6	201244	201249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_021013	TG	3	6	201262	201267	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_021013	CTG	2	6	201307	201312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_021013	CCTGTA	2	12	201389	201400	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_021013	TTC	2	6	201421	201426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_021013	GT	3	6	201666	201671	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_021013	ATG	2	6	201747	201752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_021013	GA	3	6	201813	201818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_021013	CCG	2	6	201824	201829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4028	NC_021013	CCG	2	6	201839	201844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4029	NC_021013	GAT	2	6	201856	201861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_021013	TGA	2	6	201923	201928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_021013	TGT	2	6	202027	202032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_021013	GTT	3	9	202070	202078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_021013	CT	3	6	202120	202125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4034	NC_021013	GTA	2	6	202270	202275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_021013	TGT	2	6	202317	202322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_021013	GTA	2	6	202336	202341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_021013	TTC	2	6	202429	202434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_021013	TCA	2	6	202484	202489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_021013	GT	3	6	202513	202518	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_021013	CCT	2	6	202659	202664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4041	NC_021013	AAT	2	6	202668	202673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_021013	ATT	2	6	202720	202725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_021013	ATTT	2	8	202793	202800	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_021013	TTTA	2	8	202821	202828	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_021013	TGT	2	6	202882	202887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_021013	A	7	7	202948	202954	100 %	0 %	0 %	0 %	479150243
4047	NC_021013	ATT	2	6	202968	202973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150243
4048	NC_021013	TCA	2	6	203023	203028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150243
4049	NC_021013	TGT	2	6	203088	203093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150243
4050	NC_021013	AGA	2	6	203100	203105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150243
4051	NC_021013	ACA	2	6	203165	203170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150243
4052	NC_021013	AGAC	2	8	203171	203178	50 %	0 %	25 %	25 %	479150243
4053	NC_021013	ACT	2	6	203185	203190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150243
4054	NC_021013	GGC	2	6	203247	203252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150243
4055	NC_021013	CGG	2	6	203307	203312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150243
4056	NC_021013	CCGT	2	8	203361	203368	0 %	25 %	25 %	50 %	479150243
4057	NC_021013	TTG	2	6	203414	203419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150243
4058	NC_021013	AGA	2	6	203444	203449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150243
4059	NC_021013	AAG	2	6	203503	203508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150243
4060	NC_021013	TTC	3	9	203535	203543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150243
4061	NC_021013	CAG	2	6	203581	203586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150243
4062	NC_021013	GAC	2	6	203776	203781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150243
4063	NC_021013	AAC	2	6	203820	203825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150243
4064	NC_021013	TTC	2	6	203889	203894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150244
4065	NC_021013	GCG	2	6	203916	203921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150244
4066	NC_021013	TATTCT	2	12	203938	203949	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479150244
4067	NC_021013	CTT	2	6	203981	203986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150244
4068	NC_021013	CAT	2	6	204031	204036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150244
4069	NC_021013	AT	3	6	204066	204071	50 %	50 %	0 %	0 %	479150244
4070	NC_021013	CAG	2	6	204118	204123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150244
4071	NC_021013	GGCA	2	8	204188	204195	25 %	0 %	50 %	25 %	479150244
4072	NC_021013	CTT	2	6	204215	204220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150244
4073	NC_021013	CGG	2	6	204260	204265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150244
4074	NC_021013	GCG	2	6	204285	204290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150244
4075	NC_021013	TTC	2	6	204313	204318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150244
4076	NC_021013	ATC	2	6	204324	204329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150244
4077	NC_021013	GT	3	6	204331	204336	0 %	50 %	50 %	0 %	479150244
4078	NC_021013	CTA	2	6	204368	204373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150244
4079	NC_021013	GT	3	6	204412	204417	0 %	50 %	50 %	0 %	479150244
4080	NC_021013	TTC	2	6	204427	204432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150244
4081	NC_021013	GTT	2	6	204462	204467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150244
4082	NC_021013	ACGG	2	8	204549	204556	25 %	0 %	50 %	25 %	479150244
4083	NC_021013	TGT	2	6	204638	204643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150244
4084	NC_021013	TCA	2	6	204664	204669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150244
4085	NC_021013	A	6	6	204729	204734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_021013	CAA	2	6	204774	204779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_021013	AAAG	2	8	204812	204819	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_021013	GCG	2	6	204856	204861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_021013	GCG	2	6	204871	204876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_021013	ACA	2	6	204953	204958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_021013	ATCT	2	8	205054	205061	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4092	NC_021013	CAA	2	6	205083	205088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_021013	TAA	2	6	205100	205105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_021013	CTT	2	6	205201	205206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_021013	GAG	2	6	205261	205266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_021013	ATT	2	6	205345	205350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_021013	TTAT	2	8	205427	205434	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_021013	ATGT	2	8	205501	205508	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_021013	CTT	2	6	205561	205566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_021013	CAAT	2	8	205580	205587	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4101	NC_021013	TTG	2	6	205601	205606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_021013	ACA	2	6	205622	205627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_021013	ATT	2	6	205648	205653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_021013	TAC	2	6	205692	205697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150245
4105	NC_021013	GAA	2	6	205736	205741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150245
4106	NC_021013	TTG	2	6	205822	205827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150245
4107	NC_021013	TCC	2	6	205897	205902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479150245
4108	NC_021013	AC	3	6	205983	205988	50 %	0 %	0 %	50 %	479150245
4109	NC_021013	AAGA	2	8	206001	206008	75 %	0 %	25 %	0 %	479150245
4110	NC_021013	TTG	2	6	206020	206025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150245
4111	NC_021013	CGC	2	6	206042	206047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150245
4112	NC_021013	AGAC	2	8	206066	206073	50 %	0 %	25 %	25 %	479150245
4113	NC_021013	CAA	2	6	206109	206114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150245
4114	NC_021013	GAG	2	6	206211	206216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479150245
4115	NC_021013	ATA	2	6	206263	206268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150245
4116	NC_021013	GCA	2	6	206270	206275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150245
4117	NC_021013	GAA	2	6	206379	206384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150245
4118	NC_021013	GA	3	6	206410	206415	50 %	0 %	50 %	0 %	479150246
4119	NC_021013	TTG	2	6	206472	206477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150246
4120	NC_021013	GAT	2	6	206503	206508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150246
4121	NC_021013	ATCC	2	8	206575	206582	25 %	25 %	0 %	50 %	479150246
4122	NC_021013	CTT	3	9	206600	206608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150246
4123	NC_021013	GA	3	6	206675	206680	50 %	0 %	50 %	0 %	479150246
4124	NC_021013	GAT	2	6	206858	206863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150246
4125	NC_021013	TCAT	2	8	206910	206917	25 %	50 %	0 %	25 %	479150246
4126	NC_021013	AT	3	6	207055	207060	50 %	50 %	0 %	0 %	479150246
4127	NC_021013	TTA	2	6	207107	207112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_021013	A	7	7	207129	207135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_021013	TTTAA	2	10	207163	207172	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_021013	TTG	2	6	207210	207215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_021013	TTG	2	6	207243	207248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150247
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4158	NC_021013	A	6	6	208897	208902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4230	NC_021013	ATT	2	6	212124	212129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4231	NC_021013	ATG	2	6	212193	212198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4232	NC_021013	ACA	2	6	212226	212231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4234	NC_021013	TGC	2	6	212252	212257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4241	NC_021013	GTATA	2	10	212566	212575	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4242	NC_021013	ATTT	2	8	212585	212592	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4243	NC_021013	AGG	2	6	212599	212604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4244	NC_021013	A	6	6	212636	212641	100 %	0 %	0 %	0 %	479150249
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4254	NC_021013	ATC	2	6	213221	213226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150249
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4258	NC_021013	A	7	7	213402	213408	100 %	0 %	0 %	0 %	479150250
4259	NC_021013	ATG	2	6	213495	213500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150250
4260	NC_021013	GTTG	2	8	213529	213536	0 %	50 %	50 %	0 %	479150250
4261	NC_021013	CGT	2	6	213559	213564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150250
4262	NC_021013	TCT	2	6	213704	213709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150250
4263	NC_021013	CAA	2	6	213751	213756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150250
4264	NC_021013	GTA	2	6	213780	213785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150250
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4287	NC_021013	ATA	2	6	214966	214971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4320	NC_021013	TTC	3	9	216875	216883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4323	NC_021013	GAA	2	6	217022	217027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4329	NC_021013	T	7	7	217335	217341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4330	NC_021013	TGAACT	2	12	217354	217365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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4332	NC_021013	TTGT	2	8	217398	217405	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4333	NC_021013	TGAA	2	8	217417	217424	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4334	NC_021013	AAT	2	6	217472	217477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4335	NC_021013	CCGAA	2	10	217600	217609	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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4337	NC_021013	GAA	2	6	217688	217693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4339	NC_021013	ACA	2	6	217770	217775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4350	NC_021013	CAA	3	9	218093	218101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4351	NC_021013	TAA	2	6	218107	218112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4352	NC_021013	AAAT	2	8	218127	218134	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4353	NC_021013	T	6	6	218149	218154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4354	NC_021013	ATA	2	6	218239	218244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4370	NC_021013	T	6	6	219352	219357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4373	NC_021013	A	6	6	219453	219458	100 %	0 %	0 %	0 %	479150254
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4376	NC_021013	GGTA	2	8	219646	219653	25 %	25 %	50 %	0 %	479150254
4377	NC_021013	CTT	2	6	219662	219667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150254
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4380	NC_021013	CCG	2	6	219808	219813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4381	NC_021013	ACA	2	6	219910	219915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150255
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4384	NC_021013	AAC	2	6	220326	220331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150255
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4386	NC_021013	GAA	2	6	220353	220358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150255
4387	NC_021013	A	6	6	220432	220437	100 %	0 %	0 %	0 %	479150255
4388	NC_021013	TCA	2	6	220438	220443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150255
4389	NC_021013	TGAT	2	8	220468	220475	25 %	50 %	25 %	0 %	479150255
4390	NC_021013	GGA	2	6	220571	220576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479150255
4391	NC_021013	A	6	6	220578	220583	100 %	0 %	0 %	0 %	479150255
4392	NC_021013	AT	3	6	220594	220599	50 %	50 %	0 %	0 %	479150256
4393	NC_021013	A	6	6	220609	220614	100 %	0 %	0 %	0 %	479150256
4394	NC_021013	CATTA	2	10	220619	220628	40 %	40 %	0 %	20 %	479150256
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4404	NC_021013	TA	3	6	220955	220960	50 %	50 %	0 %	0 %	479150256
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4429	NC_021013	CA	3	6	222461	222466	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4432	NC_021013	AAT	2	6	222744	222749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4433	NC_021013	TA	3	6	222754	222759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4434	NC_021013	A	6	6	222759	222764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4435	NC_021013	A	6	6	222770	222775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4455	NC_021013	TTATG	2	10	223784	223793	20 %	60 %	20 %	0 %	479150257
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4463	NC_021013	A	6	6	224157	224162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4489	NC_021013	CAG	2	6	225893	225898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150259
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4491	NC_021013	AAAAC	2	10	226031	226040	80 %	0 %	0 %	20 %	479150259
4492	NC_021013	ACCGA	2	10	226064	226073	40 %	0 %	20 %	40 %	479150259
4493	NC_021013	T	6	6	226178	226183	0 %	100 %	0 %	0 %	479150259
4494	NC_021013	AAT	2	6	226234	226239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150259
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4498	NC_021013	CAA	2	6	226418	226423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150259
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4500	NC_021013	GAA	2	6	226549	226554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150259

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