MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus bromii L2-63 draft genome

Total Repeats: 45010

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_021013	ATA	2	6	2175035	2175040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43502	NC_021013	CGGG	2	8	2175041	2175048	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43503	NC_021013	AGG	2	6	2175119	2175124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43504	NC_021013	GTACCC	2	12	2175141	2175152	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
43505	NC_021013	GCG	2	6	2175219	2175224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43506	NC_021013	TTTC	2	8	2175248	2175255	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43507	NC_021013	TGC	2	6	2175310	2175315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43508	NC_021013	GTG	3	9	2175363	2175371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43509	NC_021013	CAT	2	6	2175377	2175382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43510	NC_021013	GACA	2	8	2175422	2175429	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43511	NC_021013	AGG	2	6	2175469	2175474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43512	NC_021013	GAA	2	6	2175500	2175505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43513	NC_021013	GCG	2	6	2175511	2175516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43514	NC_021013	CCCGC	2	10	2175534	2175543	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
43515	NC_021013	ATC	2	6	2175580	2175585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43516	NC_021013	GCA	2	6	2175621	2175626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43517	NC_021013	GAC	2	6	2175736	2175741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43518	NC_021013	ACT	2	6	2175779	2175784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43519	NC_021013	CT	3	6	2175808	2175813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43520	NC_021013	TCA	2	6	2175815	2175820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43521	NC_021013	GCG	2	6	2175836	2175841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43522	NC_021013	AGG	2	6	2175872	2175877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43523	NC_021013	CAA	2	6	2175939	2175944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43524	NC_021013	AT	3	6	2175963	2175968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43525	NC_021013	GCG	2	6	2176000	2176005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43526	NC_021013	CAA	2	6	2176041	2176046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43527	NC_021013	GCCC	2	8	2176069	2176076	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43528	NC_021013	TGC	2	6	2176103	2176108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43529	NC_021013	GGGC	2	8	2176128	2176135	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43530	NC_021013	TATCT	2	10	2176299	2176308	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
43531	NC_021013	GAA	2	6	2176426	2176431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43532	NC_021013	A	6	6	2176435	2176440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43533	NC_021013	AGCGA	2	10	2176498	2176507	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
43534	NC_021013	CGG	3	9	2176616	2176624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43535	NC_021013	AGA	2	6	2176634	2176639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43536	NC_021013	AAC	2	6	2176831	2176836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43537	NC_021013	AGC	2	6	2176856	2176861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43538	NC_021013	GCC	2	6	2176915	2176920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43539	NC_021013	CGA	3	9	2176953	2176961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43540	NC_021013	GAC	2	6	2177110	2177115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43541	NC_021013	GGC	2	6	2177170	2177175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43542	NC_021013	AGG	2	6	2177177	2177182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43543	NC_021013	AGC	2	6	2177306	2177311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43544	NC_021013	GCG	2	6	2177323	2177328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43545	NC_021013	CGG	2	6	2177336	2177341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43546	NC_021013	AGC	2	6	2177432	2177437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43547	NC_021013	AGC	2	6	2177444	2177449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43548	NC_021013	A	6	6	2177452	2177457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43549	NC_021013	TCT	2	6	2177553	2177558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43550	NC_021013	CCG	2	6	2177576	2177581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43551	NC_021013	GGC	2	6	2177620	2177625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43552	NC_021013	TGCT	2	8	2177660	2177667	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43553	NC_021013	GGC	2	6	2177724	2177729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43554	NC_021013	AGC	2	6	2177753	2177758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43555	NC_021013	GCA	2	6	2177772	2177777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43556	NC_021013	TCT	2	6	2177819	2177824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43557	NC_021013	GTG	2	6	2177833	2177838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43558	NC_021013	GAC	2	6	2177889	2177894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43559	NC_021013	GGA	2	6	2177901	2177906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43560	NC_021013	ATC	2	6	2177943	2177948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479151833
43561	NC_021013	GCCC	2	8	2178013	2178020	0 %	0 %	25 %	75 %	479151833
43562	NC_021013	GGA	2	6	2178065	2178070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479151833
43563	NC_021013	GAA	2	6	2178209	2178214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151833
43564	NC_021013	CAG	2	6	2178234	2178239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151833
43565	NC_021013	AAC	2	6	2178249	2178254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479151833
43566	NC_021013	CAAA	2	8	2178269	2178276	75 %	0 %	0 %	25 %	479151833
43567	NC_021013	GGT	2	6	2178328	2178333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479151833
43568	NC_021013	AGAA	2	8	2178358	2178365	75 %	0 %	25 %	0 %	479151833
43569	NC_021013	GCT	2	6	2178403	2178408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479151833
43570	NC_021013	AAG	2	6	2178438	2178443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151833
43571	NC_021013	GCC	2	6	2178459	2178464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479151833
43572	NC_021013	AGCCG	2	10	2178467	2178476	20 %	0 %	40 %	40 %	479151833
43573	NC_021013	CGG	2	6	2178490	2178495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151833
43574	NC_021013	CTA	2	6	2178593	2178598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479151833
43575	NC_021013	CGA	2	6	2178599	2178604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151833
43576	NC_021013	GGGC	2	8	2178668	2178675	0 %	0 %	75 %	25 %	479151833
43577	NC_021013	CGC	2	6	2178680	2178685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479151833
43578	NC_021013	GGC	2	6	2178735	2178740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151833
43579	NC_021013	ACG	2	6	2178771	2178776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151833
43580	NC_021013	AGC	2	6	2178790	2178795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151833
43581	NC_021013	TA	3	6	2178807	2178812	50 %	50 %	0 %	0 %	479151833
43582	NC_021013	GACA	2	8	2178866	2178873	50 %	0 %	25 %	25 %	479151833
43583	NC_021013	CGC	2	6	2178943	2178948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479151834
43584	NC_021013	GCAGC	2	10	2179031	2179040	20 %	0 %	40 %	40 %	479151834
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43588	NC_021013	GGC	2	6	2179189	2179194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151834
43589	NC_021013	CGA	2	6	2179252	2179257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151834
43590	NC_021013	AGC	2	6	2179306	2179311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151834
43591	NC_021013	GGC	2	6	2179333	2179338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151834
43592	NC_021013	AAAGA	2	10	2179346	2179355	80 %	0 %	20 %	0 %	479151834
43593	NC_021013	TGA	2	6	2179378	2179383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151834
43594	NC_021013	CCCGC	2	10	2179470	2179479	0 %	0 %	20 %	80 %	479151834
43595	NC_021013	CAA	2	6	2179504	2179509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479151834
43596	NC_021013	GAA	2	6	2179562	2179567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151834
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43601	NC_021013	AGC	2	6	2179761	2179766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151834
43602	NC_021013	GGC	2	6	2179802	2179807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151834
43603	NC_021013	GGC	2	6	2179846	2179851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151834
43604	NC_021013	A	6	6	2179852	2179857	100 %	0 %	0 %	0 %	479151834
43605	NC_021013	CCG	2	6	2179860	2179865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479151834
43606	NC_021013	A	6	6	2179873	2179878	100 %	0 %	0 %	0 %	479151834
43607	NC_021013	GGC	2	6	2179896	2179901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151834
43608	NC_021013	CGG	2	6	2179905	2179910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151834
43609	NC_021013	GTAT	2	8	2179913	2179920	25 %	50 %	25 %	0 %	479151834
43610	NC_021013	TCA	2	6	2179944	2179949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479151834
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43612	NC_021013	TGA	2	6	2179995	2180000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151834
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43617	NC_021013	AGA	2	6	2180278	2180283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151834
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43619	NC_021013	GGA	2	6	2180413	2180418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479151834
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43852	NC_021013	TCCTT	2	10	2191724	2191733	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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43980	NC_021013	ATG	2	6	2197235	2197240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151851
43981	NC_021013	A	7	7	2197244	2197250	100 %	0 %	0 %	0 %	479151851
43982	NC_021013	GGA	2	6	2197262	2197267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479151851
43983	NC_021013	AGCGC	2	10	2197304	2197313	20 %	0 %	40 %	40 %	479151851
43984	NC_021013	GAA	2	6	2197360	2197365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151851
43985	NC_021013	CAGA	2	8	2197515	2197522	50 %	0 %	25 %	25 %	479151851
43986	NC_021013	ACAT	2	8	2197554	2197561	50 %	25 %	0 %	25 %	479151851
43987	NC_021013	A	6	6	2197590	2197595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43988	NC_021013	CAA	2	6	2197614	2197619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479151852
43989	NC_021013	ATA	2	6	2197648	2197653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479151852
43990	NC_021013	AGC	2	6	2197694	2197699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151852
43991	NC_021013	TCA	2	6	2197742	2197747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479151852
43992	NC_021013	GTTTTT	2	12	2197786	2197797	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	479151852
43993	NC_021013	TCC	2	6	2197811	2197816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479151853
43994	NC_021013	T	6	6	2197903	2197908	0 %	100 %	0 %	0 %	479151853
43995	NC_021013	T	6	6	2197942	2197947	0 %	100 %	0 %	0 %	479151853
43996	NC_021013	AT	3	6	2197979	2197984	50 %	50 %	0 %	0 %	479151853
43997	NC_021013	AT	3	6	2198000	2198005	50 %	50 %	0 %	0 %	479151853
43998	NC_021013	ATC	2	6	2198047	2198052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479151854
43999	NC_021013	TC	3	6	2198051	2198056	0 %	50 %	0 %	50 %	479151854
44000	NC_021013	TTC	2	6	2198204	2198209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479151854

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