MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus bromii L2-63 draft genome

Total Repeats: 45010

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021013	GAT	2	6	226690	226695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150259
4502	NC_021013	ATT	2	6	226703	226708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150259
4503	NC_021013	TGCCTG	2	12	226758	226769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150259
4504	NC_021013	AAC	2	6	226799	226804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150259
4505	NC_021013	GAA	2	6	226927	226932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150259
4506	NC_021013	ATG	2	6	226962	226967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150259
4507	NC_021013	CTG	2	6	226984	226989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150260
4508	NC_021013	TCC	2	6	227013	227018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479150260
4509	NC_021013	CTC	2	6	227057	227062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479150260
4510	NC_021013	AT	3	6	227110	227115	50 %	50 %	0 %	0 %	479150260
4511	NC_021013	TTC	2	6	227147	227152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150260
4512	NC_021013	TCG	2	6	227163	227168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150260
4513	NC_021013	AAG	2	6	227234	227239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150260
4514	NC_021013	TTC	2	6	227279	227284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150260
4515	NC_021013	TG	3	6	227299	227304	0 %	50 %	50 %	0 %	479150260
4516	NC_021013	CGG	2	6	227367	227372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150260
4517	NC_021013	TCA	2	6	227400	227405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150260
4518	NC_021013	GCC	2	6	227448	227453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150260
4519	NC_021013	ATT	2	6	227481	227486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150260
4520	NC_021013	A	7	7	227624	227630	100 %	0 %	0 %	0 %	479150260
4521	NC_021013	AC	3	6	227704	227709	50 %	0 %	0 %	50 %	479150260
4522	NC_021013	CCG	3	9	227739	227747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150260
4523	NC_021013	ATC	2	6	227798	227803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150260
4524	NC_021013	TTACC	2	10	227812	227821	20 %	40 %	0 %	40 %	479150260
4525	NC_021013	CCT	2	6	227863	227868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479150261
4526	NC_021013	AAT	2	6	227883	227888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150261
4527	NC_021013	TGG	2	6	227933	227938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479150261
4528	NC_021013	CCGT	2	8	228104	228111	0 %	25 %	25 %	50 %	479150261
4529	NC_021013	GGC	2	6	228115	228120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150261
4530	NC_021013	AC	3	6	228140	228145	50 %	0 %	0 %	50 %	479150261
4531	NC_021013	TTG	2	6	228169	228174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150261
4532	NC_021013	TCC	2	6	228230	228235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4533	NC_021013	T	6	6	228341	228346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_021013	AAAG	2	8	228492	228499	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_021013	GAAAA	2	10	228546	228555	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_021013	GAT	2	6	228569	228574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_021013	CGA	2	6	228638	228643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_021013	GGTG	2	8	228653	228660	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_021013	TCAG	2	8	228777	228784	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4540	NC_021013	AAATAA	2	12	228845	228856	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_021013	GAA	2	6	228873	228878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_021013	GGT	2	6	228911	228916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_021013	CGGA	2	8	228970	228977	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4544	NC_021013	TA	3	6	228986	228991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_021013	GAA	2	6	229038	229043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_021013	CACAGG	2	12	229156	229167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_021013	A	6	6	229280	229285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_021013	A	7	7	229303	229309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_021013	TACTT	2	10	229327	229336	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4550	NC_021013	AGG	2	6	229408	229413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_021013	TATT	2	8	229455	229462	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_021013	TTCT	2	8	229471	229478	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4553	NC_021013	T	6	6	229506	229511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_021013	TTG	3	9	229558	229566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_021013	A	8	8	229582	229589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_021013	TA	3	6	229591	229596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_021013	GTT	2	6	229655	229660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_021013	ATAC	2	8	229669	229676	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4559	NC_021013	GAA	2	6	229964	229969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150262
4560	NC_021013	AGA	2	6	229995	230000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150262
4561	NC_021013	AATA	2	8	230026	230033	75 %	25 %	0 %	0 %	479150262
4562	NC_021013	ATC	2	6	230061	230066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150262
4563	NC_021013	TGTT	2	8	230133	230140	0 %	75 %	25 %	0 %	479150262
4564	NC_021013	ATA	2	6	230184	230189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150262
4565	NC_021013	GAT	2	6	230243	230248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150262
4566	NC_021013	GAA	2	6	230282	230287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150262
4567	NC_021013	GT	3	6	230292	230297	0 %	50 %	50 %	0 %	479150262
4568	NC_021013	TCGT	2	8	230302	230309	0 %	50 %	25 %	25 %	479150262
4569	NC_021013	GAT	2	6	230339	230344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150262
4570	NC_021013	ACCTT	2	10	230400	230409	20 %	40 %	0 %	40 %	479150262
4571	NC_021013	A	6	6	230459	230464	100 %	0 %	0 %	0 %	479150262
4572	NC_021013	CAA	2	6	230470	230475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150262
4573	NC_021013	AAT	2	6	230514	230519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150263
4574	NC_021013	TAT	2	6	230544	230549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150263
4575	NC_021013	GGC	2	6	230550	230555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150263
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4577	NC_021013	TG	3	6	230642	230647	0 %	50 %	50 %	0 %	479150263
4578	NC_021013	GTCA	2	8	230688	230695	25 %	25 %	25 %	25 %	479150263
4579	NC_021013	CAG	2	6	230748	230753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150263
4580	NC_021013	ACT	2	6	230942	230947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150263
4581	NC_021013	CAA	2	6	230951	230956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150263
4582	NC_021013	TTGC	2	8	231019	231026	0 %	50 %	25 %	25 %	479150263
4583	NC_021013	CTT	2	6	231046	231051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150263
4584	NC_021013	GTT	2	6	231221	231226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150263
4585	NC_021013	AAAAG	2	10	231228	231237	80 %	0 %	20 %	0 %	479150263
4586	NC_021013	ATT	2	6	231245	231250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150263
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4588	NC_021013	A	6	6	231459	231464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_021013	GTA	2	6	231487	231492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_021013	ATA	2	6	231495	231500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_021013	GA	3	6	231510	231515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_021013	N	911	911	231552	232462	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_021013	T	7	7	232489	232495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_021013	T	7	7	232506	232512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_021013	ATC	2	6	232541	232546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_021013	ACA	2	6	232632	232637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_021013	GTAT	2	8	232657	232664	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_021013	CA	3	6	232669	232674	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4599	NC_021013	T	6	6	232707	232712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_021013	T	6	6	232718	232723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_021013	AG	3	6	232771	232776	50 %	0 %	50 %	0 %	479150264
4602	NC_021013	CCG	2	6	232806	232811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150264
4603	NC_021013	GACT	2	8	232845	232852	25 %	25 %	25 %	25 %	479150264
4604	NC_021013	TTGA	2	8	232853	232860	25 %	50 %	25 %	0 %	479150264
4605	NC_021013	TCA	2	6	232899	232904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150264
4606	NC_021013	TCA	2	6	232938	232943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150264
4607	NC_021013	TTA	2	6	232948	232953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150264
4608	NC_021013	TCC	2	6	233067	233072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479150264
4609	NC_021013	GAG	2	6	233104	233109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479150264
4610	NC_021013	CAA	2	6	233152	233157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150264
4611	NC_021013	CTG	2	6	233279	233284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150264
4612	NC_021013	TGCGG	2	10	233334	233343	0 %	20 %	60 %	20 %	479150264
4613	NC_021013	AAT	2	6	233344	233349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150264
4614	NC_021013	TGA	2	6	233382	233387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150264
4615	NC_021013	CCGT	2	8	233465	233472	0 %	25 %	25 %	50 %	479150264
4616	NC_021013	CTT	2	6	233571	233576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_021013	CAA	2	6	233585	233590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_021013	A	6	6	233589	233594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_021013	ACA	2	6	233617	233622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_021013	TTTATT	2	12	233645	233656	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_021013	T	6	6	233663	233668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_021013	CTT	2	6	233669	233674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_021013	T	7	7	233703	233709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_021013	AGA	2	6	233732	233737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_021013	TAT	2	6	233819	233824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_021013	GAG	2	6	233856	233861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_021013	AC	3	6	233929	233934	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4629	NC_021013	TTTTAT	2	12	233953	233964	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4755	NC_021013	A	6	6	240249	240254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4756	NC_021013	T	6	6	240289	240294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4757	NC_021013	TCA	2	6	240309	240314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4758	NC_021013	ATA	2	6	240318	240323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4759	NC_021013	ATTA	2	8	240373	240380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4760	NC_021013	A	6	6	240438	240443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4763	NC_021013	GCC	2	6	240512	240517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4764	NC_021013	ATT	2	6	240537	240542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4765	NC_021013	AT	3	6	240587	240592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4766	NC_021013	TAT	2	6	240595	240600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4777	NC_021013	ATTT	2	8	241173	241180	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4797	NC_021013	CTG	2	6	242061	242066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4802	NC_021013	T	7	7	242341	242347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4803	NC_021013	TA	3	6	242393	242398	50 %	50 %	0 %	0 %	479150275
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4875	NC_021013	A	6	6	246295	246300	100 %	0 %	0 %	0 %	479150278
4876	NC_021013	CGA	2	6	246330	246335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150278
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4997	NC_021013	AGA	2	6	251695	251700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4999	NC_021013	CAAAG	2	10	251761	251770	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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