MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus bromii L2-63 draft genome

Total Repeats: 45010

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021013	AGT	2	6	7	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021013	ACT	2	6	19	24	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021013	T	6	6	33	38	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021013	AATA	2	8	120	127	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021013	A	6	6	159	164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021013	AT	3	6	169	174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021013	ATT	2	6	196	201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021013	T	6	6	212	217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021013	AGG	2	6	321	326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021013	TAAT	2	8	327	334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021013	A	6	6	339	344	100 %	0 %	0 %	0 %	479150084
12	NC_021013	TAA	2	6	367	372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150084
13	NC_021013	TAT	2	6	383	388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150084
14	NC_021013	AAT	2	6	420	425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150084
15	NC_021013	TGA	2	6	533	538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150084
16	NC_021013	AATATC	2	12	566	577	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479150084
17	NC_021013	GAT	2	6	579	584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150084
18	NC_021013	AT	3	6	725	730	50 %	50 %	0 %	0 %	479150084
19	NC_021013	ATG	2	6	760	765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150084
20	NC_021013	A	6	6	835	840	100 %	0 %	0 %	0 %	479150084
21	NC_021013	GAT	2	6	855	860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150084
22	NC_021013	ACA	2	6	996	1001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150084
23	NC_021013	AAAT	2	8	1058	1065	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021013	AAT	2	6	1099	1104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021013	A	6	6	1138	1143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021013	AT	3	6	1148	1153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021013	TA	3	6	1251	1256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021013	TAA	2	6	1270	1275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021013	ATT	2	6	1304	1309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021013	GCG	2	6	1424	1429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150085
31	NC_021013	GAAT	2	8	1432	1439	50 %	25 %	25 %	0 %	479150085
32	NC_021013	AATG	2	8	1445	1452	50 %	25 %	25 %	0 %	479150085
33	NC_021013	GAA	2	6	1571	1576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150085
34	NC_021013	CCTTT	2	10	1641	1650	0 %	60 %	0 %	40 %	479150085
35	NC_021013	TTG	2	6	1752	1757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150085
36	NC_021013	TGT	2	6	1933	1938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150085
37	NC_021013	TGA	2	6	1948	1953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150085
38	NC_021013	TGA	2	6	2128	2133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150085
39	NC_021013	ATTTGA	2	12	2254	2265	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479150085
40	NC_021013	TTG	2	6	2273	2278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150085
41	NC_021013	A	6	6	2345	2350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021013	AAC	2	6	2370	2375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021013	ACA	2	6	2384	2389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150086
44	NC_021013	ATTC	2	8	2403	2410	25 %	50 %	0 %	25 %	479150086
45	NC_021013	CGG	2	6	2454	2459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150086
46	NC_021013	CAGA	2	8	2487	2494	50 %	0 %	25 %	25 %	479150086
47	NC_021013	TTC	2	6	2543	2548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150086
48	NC_021013	CGG	2	6	2634	2639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150086
49	NC_021013	TCA	2	6	2646	2651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150086
50	NC_021013	AGA	3	9	2679	2687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150086
51	NC_021013	AC	3	6	2697	2702	50 %	0 %	0 %	50 %	479150086
52	NC_021013	TTGT	2	8	2704	2711	0 %	75 %	25 %	0 %	479150086
53	NC_021013	TGT	2	6	2913	2918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150086
54	NC_021013	TGA	2	6	2985	2990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150086
55	NC_021013	AATC	2	8	3128	3135	50 %	25 %	0 %	25 %	479150087
56	NC_021013	T	6	6	3187	3192	0 %	100 %	0 %	0 %	479150087
57	NC_021013	GGTG	2	8	3299	3306	0 %	25 %	75 %	0 %	479150087
58	NC_021013	ATA	3	9	3315	3323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150087
59	NC_021013	CAA	2	6	3440	3445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150087
60	NC_021013	AAC	2	6	3601	3606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150087
61	NC_021013	ATT	2	6	3610	3615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150087
62	NC_021013	TTTG	2	8	3769	3776	0 %	75 %	25 %	0 %	479150087
63	NC_021013	CCA	2	6	3812	3817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479150087
64	NC_021013	TAA	2	6	3818	3823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150087
65	NC_021013	AAT	2	6	3831	3836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150087
66	NC_021013	AT	4	8	3873	3880	50 %	50 %	0 %	0 %	479150087
67	NC_021013	AAG	2	6	3909	3914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150087
68	NC_021013	TGA	2	6	3970	3975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150087
69	NC_021013	TTTG	2	8	3981	3988	0 %	75 %	25 %	0 %	479150087
70	NC_021013	A	6	6	4026	4031	100 %	0 %	0 %	0 %	479150087
71	NC_021013	CAT	2	6	4074	4079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150087
72	NC_021013	ATT	2	6	4108	4113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150087
73	NC_021013	T	6	6	4135	4140	0 %	100 %	0 %	0 %	479150087
74	NC_021013	TTG	2	6	4196	4201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150087
75	NC_021013	CAA	2	6	4225	4230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150087
76	NC_021013	A	6	6	4246	4251	100 %	0 %	0 %	0 %	479150087
77	NC_021013	GGTG	2	8	4258	4265	0 %	25 %	75 %	0 %	479150087
78	NC_021013	AAT	2	6	4298	4303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150087
79	NC_021013	AT	3	6	4343	4348	50 %	50 %	0 %	0 %	479150087
80	NC_021013	AT	3	6	4399	4404	50 %	50 %	0 %	0 %	479150087
81	NC_021013	CAT	2	6	4437	4442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150087
82	NC_021013	GTCT	2	8	4516	4523	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_021013	AC	3	6	4538	4543	50 %	0 %	0 %	50 %	479150088
84	NC_021013	TCC	2	6	4591	4596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479150088
85	NC_021013	GGT	2	6	4634	4639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479150088
86	NC_021013	TTC	2	6	4665	4670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150088
87	NC_021013	TCT	2	6	4693	4698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150088
88	NC_021013	GAA	2	6	4709	4714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150088
89	NC_021013	AG	3	6	4721	4726	50 %	0 %	50 %	0 %	479150088
90	NC_021013	CGCTCT	2	12	4748	4759	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	479150088
91	NC_021013	TAA	2	6	4775	4780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150088
92	NC_021013	TGAA	2	8	4895	4902	50 %	25 %	25 %	0 %	479150089
93	NC_021013	A	6	6	4901	4906	100 %	0 %	0 %	0 %	479150089
94	NC_021013	T	6	6	4927	4932	0 %	100 %	0 %	0 %	479150089
95	NC_021013	T	6	6	5008	5013	0 %	100 %	0 %	0 %	479150089
96	NC_021013	TTAT	2	8	5159	5166	25 %	75 %	0 %	0 %	479150089
97	NC_021013	TAA	2	6	5188	5193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150089
98	NC_021013	AGAT	2	8	5239	5246	50 %	25 %	25 %	0 %	479150089
99	NC_021013	ATAC	2	8	5298	5305	50 %	25 %	0 %	25 %	479150089
100	NC_021013	GAA	2	6	5315	5320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150089
101	NC_021013	TCA	2	6	5424	5429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150089
102	NC_021013	ATT	2	6	5438	5443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150089
103	NC_021013	T	6	6	5442	5447	0 %	100 %	0 %	0 %	479150089
104	NC_021013	ATG	2	6	5516	5521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150089
105	NC_021013	AG	3	6	5533	5538	50 %	0 %	50 %	0 %	479150089
106	NC_021013	CAA	2	6	5647	5652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150089
107	NC_021013	CAC	2	6	5687	5692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479150089
108	NC_021013	TGA	2	6	5763	5768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150089
109	NC_021013	AAG	2	6	5821	5826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150089
110	NC_021013	ATG	2	6	5888	5893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150089
111	NC_021013	CTTTT	2	10	5915	5924	0 %	80 %	0 %	20 %	479150089
112	NC_021013	ATC	2	6	5936	5941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150089
113	NC_021013	AATG	2	8	6082	6089	50 %	25 %	25 %	0 %	479150089
114	NC_021013	TAT	2	6	6108	6113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150089
115	NC_021013	ACGGC	2	10	6129	6138	20 %	0 %	40 %	40 %	479150089
116	NC_021013	TTC	2	6	6160	6165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150089
117	NC_021013	CTT	3	9	6183	6191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150089
118	NC_021013	TAG	2	6	6212	6217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150089
119	NC_021013	CCT	2	6	6328	6333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_021013	ACT	2	6	6364	6369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150090
121	NC_021013	TTC	2	6	6411	6416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150090
122	NC_021013	AT	3	6	6441	6446	50 %	50 %	0 %	0 %	479150090
123	NC_021013	T	6	6	6474	6479	0 %	100 %	0 %	0 %	479150090
124	NC_021013	T	7	7	6531	6537	0 %	100 %	0 %	0 %	479150090
125	NC_021013	GTT	2	6	6550	6555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150090
126	NC_021013	TCT	2	6	6566	6571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150090
127	NC_021013	AAT	2	6	6668	6673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150090
128	NC_021013	ATC	2	6	6705	6710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150090
129	NC_021013	ATA	2	6	6789	6794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150090
130	NC_021013	CCA	2	6	6863	6868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479150090
131	NC_021013	CTTG	2	8	6872	6879	0 %	50 %	25 %	25 %	479150090
132	NC_021013	AAT	2	6	6887	6892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150090
133	NC_021013	TGT	2	6	6893	6898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150090
134	NC_021013	GTT	3	9	6928	6936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150090
135	NC_021013	AAG	2	6	6964	6969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150090
136	NC_021013	CATA	2	8	6975	6982	50 %	25 %	0 %	25 %	479150090
137	NC_021013	A	6	6	6987	6992	100 %	0 %	0 %	0 %	479150090
138	NC_021013	TTA	2	6	7015	7020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150090
139	NC_021013	CAA	2	6	7053	7058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150090
140	NC_021013	ATAAA	2	10	7070	7079	80 %	20 %	0 %	0 %	479150090
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274	NC_021013	TCT	2	6	12735	12740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150093
275	NC_021013	CAA	2	6	12825	12830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150093
276	NC_021013	ATA	2	6	12881	12886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150093
277	NC_021013	GTA	2	6	12934	12939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150093
278	NC_021013	ACA	2	6	12986	12991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150093
279	NC_021013	TTC	2	6	13066	13071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150093
280	NC_021013	T	7	7	13084	13090	0 %	100 %	0 %	0 %	479150093
281	NC_021013	TTC	2	6	13174	13179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150093
282	NC_021013	CTT	2	6	13237	13242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150093
283	NC_021013	AAT	2	6	13318	13323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150093
284	NC_021013	TCT	2	6	13434	13439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150093
285	NC_021013	AATGTC	2	12	13486	13497	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479150093
286	NC_021013	TTC	2	6	13507	13512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150093
287	NC_021013	TGAG	2	8	13530	13537	25 %	25 %	50 %	0 %	479150093
288	NC_021013	GTT	2	6	13561	13566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150093
289	NC_021013	CTTT	2	8	13622	13629	0 %	75 %	0 %	25 %	479150093
290	NC_021013	AAT	2	6	13732	13737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150093
291	NC_021013	GAA	2	6	13743	13748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150093
292	NC_021013	ATA	3	9	13847	13855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_021013	AAG	2	6	13864	13869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
294	NC_021013	CA	3	6	13902	13907	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
295	NC_021013	ATTATA	2	12	13921	13932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_021013	AT	3	6	13955	13960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_021013	GGC	2	6	14016	14021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
298	NC_021013	TAA	2	6	14043	14048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_021013	AAAG	2	8	14059	14066	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
300	NC_021013	AAG	2	6	14111	14116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150094
301	NC_021013	ACT	2	6	14167	14172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150094
302	NC_021013	A	6	6	14185	14190	100 %	0 %	0 %	0 %	479150094
303	NC_021013	AG	3	6	14206	14211	50 %	0 %	50 %	0 %	479150094
304	NC_021013	T	6	6	14217	14222	0 %	100 %	0 %	0 %	479150094
305	NC_021013	CGG	2	6	14291	14296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150094
306	NC_021013	CGG	2	6	14332	14337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150094
307	NC_021013	TTGTT	2	10	14341	14350	0 %	80 %	20 %	0 %	479150094
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309	NC_021013	GAT	2	6	14435	14440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150094
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311	NC_021013	AGC	2	6	14475	14480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150094
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313	NC_021013	GCAGG	2	10	14496	14505	20 %	0 %	60 %	20 %	479150094
314	NC_021013	ATTCA	2	10	14507	14516	40 %	40 %	0 %	20 %	479150094
315	NC_021013	TGTT	2	8	14554	14561	0 %	75 %	25 %	0 %	479150094
316	NC_021013	CTTT	2	8	14584	14591	0 %	75 %	0 %	25 %	479150094
317	NC_021013	CGG	2	6	14600	14605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150094
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327	NC_021013	GT	3	6	15232	15237	0 %	50 %	50 %	0 %	479150094
328	NC_021013	AAT	2	6	15261	15266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150094
329	NC_021013	GAGCA	2	10	15291	15300	40 %	0 %	40 %	20 %	479150094
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352	NC_021013	GAT	2	6	16308	16313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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354	NC_021013	AT	3	6	16323	16328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
355	NC_021013	GTTT	2	8	16341	16348	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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380	NC_021013	TTG	3	9	17392	17400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
381	NC_021013	TATG	2	8	17423	17430	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
382	NC_021013	ATGA	2	8	17439	17446	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
383	NC_021013	TGA	2	6	17588	17593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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385	NC_021013	TA	3	6	17645	17650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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408	NC_021013	GAT	3	9	19187	19195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150096
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410	NC_021013	ATA	2	6	19374	19379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_021013	TAA	2	6	20287	20292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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