MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 88114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48002	NC_021012	TAT	2	6	2319422	2319427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479148142
48003	NC_021012	GAA	2	6	2319430	2319435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148142
48004	NC_021012	AAGG	2	8	2319449	2319456	50 %	0 %	50 %	0 %	479148142
48005	NC_021012	AT	3	6	2319502	2319507	50 %	50 %	0 %	0 %	479148142
48006	NC_021012	CAGAT	2	10	2319522	2319531	40 %	20 %	20 %	20 %	479148142
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48008	NC_021012	TGGT	2	8	2319576	2319583	0 %	50 %	50 %	0 %	479148142
48009	NC_021012	TAAAA	2	10	2319702	2319711	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48010	NC_021012	ACC	2	6	2319721	2319726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48011	NC_021012	TCTG	2	8	2319733	2319740	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48012	NC_021012	TGG	2	6	2319775	2319780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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48014	NC_021012	TCTT	2	8	2320020	2320027	0 %	75 %	0 %	25 %	479148143
48015	NC_021012	TA	3	6	2320058	2320063	50 %	50 %	0 %	0 %	479148143
48016	NC_021012	TGG	2	6	2320235	2320240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479148143
48017	NC_021012	TGTA	2	8	2320244	2320251	25 %	50 %	25 %	0 %	479148143
48018	NC_021012	TGC	2	6	2320254	2320259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148143
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48021	NC_021012	CTG	2	6	2320378	2320383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148143
48022	NC_021012	CGG	2	6	2320397	2320402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479148143
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48048	NC_021012	ATA	2	6	2321762	2321767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48049	NC_021012	TGA	2	6	2321975	2321980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148145
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48052	NC_021012	CA	3	6	2322122	2322127	50 %	0 %	0 %	50 %	479148145
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48099	NC_021012	TAT	2	6	2324151	2324156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48103	NC_021012	CA	3	6	2324354	2324359	50 %	0 %	0 %	50 %	479148148
48104	NC_021012	AG	3	6	2324378	2324383	50 %	0 %	50 %	0 %	479148148
48105	NC_021012	TCA	2	6	2324388	2324393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148148
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48112	NC_021012	A	7	7	2324656	2324662	100 %	0 %	0 %	0 %	479148148
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48120	NC_021012	AT	3	6	2324986	2324991	50 %	50 %	0 %	0 %	479148148
48121	NC_021012	CTTT	2	8	2325020	2325027	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48122	NC_021012	A	6	6	2325032	2325037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48123	NC_021012	TAC	2	6	2325046	2325051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48124	NC_021012	GAG	2	6	2325086	2325091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48125	NC_021012	GAA	2	6	2325103	2325108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148149
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48127	NC_021012	GCA	2	6	2325185	2325190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148149
48128	NC_021012	GAT	2	6	2325239	2325244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148149
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48132	NC_021012	TGA	2	6	2325403	2325408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148149
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48149	NC_021012	A	6	6	2326722	2326727	100 %	0 %	0 %	0 %	479148150
48150	NC_021012	ATCA	2	8	2326863	2326870	50 %	25 %	0 %	25 %	479148150
48151	NC_021012	A	6	6	2326879	2326884	100 %	0 %	0 %	0 %	479148150
48152	NC_021012	CAG	2	6	2326899	2326904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148150
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48159	NC_021012	TCG	2	6	2327459	2327464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148151
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48166	NC_021012	AGTG	2	8	2327656	2327663	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48167	NC_021012	ACC	2	6	2327743	2327748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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48172	NC_021012	CAG	3	9	2327916	2327924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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48219	NC_021012	GGA	2	6	2330258	2330263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48220	NC_021012	ATG	3	9	2330364	2330372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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48222	NC_021012	A	7	7	2330431	2330437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48223	NC_021012	TCAT	2	8	2330449	2330456	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48224	NC_021012	A	6	6	2330499	2330504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48225	NC_021012	TA	3	6	2330569	2330574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48226	NC_021012	ACAAA	2	10	2330581	2330590	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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48228	NC_021012	CGG	3	9	2330609	2330617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48229	NC_021012	CAG	2	6	2330619	2330624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48230	NC_021012	AGC	2	6	2330660	2330665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48231	NC_021012	TGA	2	6	2330705	2330710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48232	NC_021012	TATG	2	8	2330723	2330730	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48233	NC_021012	TGC	2	6	2330857	2330862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48234	NC_021012	TCA	2	6	2330910	2330915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48235	NC_021012	A	6	6	2330958	2330963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48236	NC_021012	TTCCG	2	10	2331055	2331064	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
48237	NC_021012	A	6	6	2331105	2331110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48238	NC_021012	A	6	6	2331159	2331164	100 %	0 %	0 %	0 %	479148153
48239	NC_021012	AAAG	2	8	2331213	2331220	75 %	0 %	25 %	0 %	479148153
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48242	NC_021012	GATG	2	8	2331270	2331277	25 %	25 %	50 %	0 %	479148153
48243	NC_021012	ACG	2	6	2331290	2331295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148153
48244	NC_021012	TCG	2	6	2331329	2331334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148153
48245	NC_021012	GTT	2	6	2331346	2331351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479148153
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48247	NC_021012	CAT	2	6	2331397	2331402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148153
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48250	NC_021012	CGAT	2	8	2331725	2331732	25 %	25 %	25 %	25 %	479148153
48251	NC_021012	TGT	2	6	2331837	2331842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479148153
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48254	NC_021012	AAAT	2	8	2331951	2331958	75 %	25 %	0 %	0 %	479148153
48255	NC_021012	CCGT	2	8	2332056	2332063	0 %	25 %	25 %	50 %	479148153
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48260	NC_021012	GCAG	2	8	2332329	2332336	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48261	NC_021012	T	6	6	2332341	2332346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48262	NC_021012	CAC	2	6	2332367	2332372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48263	NC_021012	ACA	2	6	2332382	2332387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48264	NC_021012	A	6	6	2332387	2332392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48265	NC_021012	TA	3	6	2332400	2332405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48266	NC_021012	ATCTG	2	10	2332452	2332461	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48267	NC_021012	GATTA	2	10	2332463	2332472	40 %	40 %	20 %	0 %	479148154
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48270	NC_021012	ATG	2	6	2332568	2332573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148154
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48275	NC_021012	CAA	2	6	2332763	2332768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48302	NC_021012	GAA	2	6	2333944	2333949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148155
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48346	NC_021012	CA	3	6	2335760	2335765	50 %	0 %	0 %	50 %	479148159
48347	NC_021012	AC	3	6	2335785	2335790	50 %	0 %	0 %	50 %	479148159
48348	NC_021012	A	6	6	2335838	2335843	100 %	0 %	0 %	0 %	479148159
48349	NC_021012	TGA	2	6	2335927	2335932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148159
48350	NC_021012	ATC	2	6	2335961	2335966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148159
48351	NC_021012	GCA	2	6	2335999	2336004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148159
48352	NC_021012	ATC	2	6	2336069	2336074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148159
48353	NC_021012	GAA	2	6	2336132	2336137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148159
48354	NC_021012	GGC	2	6	2336200	2336205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479148159
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48356	NC_021012	A	6	6	2336234	2336239	100 %	0 %	0 %	0 %	479148159
48357	NC_021012	ACGAT	2	10	2336256	2336265	40 %	20 %	20 %	20 %	479148159
48358	NC_021012	TAT	2	6	2336314	2336319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479148159
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48362	NC_021012	GACA	2	8	2336645	2336652	50 %	0 %	25 %	25 %	479148159
48363	NC_021012	ATC	2	6	2336672	2336677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148159
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48482	NC_021012	CTG	2	6	2342478	2342483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148165
48483	NC_021012	ACA	2	6	2342484	2342489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479148165
48484	NC_021012	CAG	2	6	2342493	2342498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148165
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