MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 88114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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47002	NC_021012	GCAG	2	8	2272208	2272215	25 %	0 %	50 %	25 %	479148098
47003	NC_021012	A	6	6	2272240	2272245	100 %	0 %	0 %	0 %	479148098
47004	NC_021012	AAAT	2	8	2272248	2272255	75 %	25 %	0 %	0 %	479148098
47005	NC_021012	TCA	2	6	2272295	2272300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47006	NC_021012	AGG	2	6	2272331	2272336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47007	NC_021012	ATT	2	6	2272337	2272342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47008	NC_021012	AAAT	2	8	2272351	2272358	75 %	25 %	0 %	0 %	479148099
47009	NC_021012	ACA	2	6	2272368	2272373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479148099
47010	NC_021012	GACC	2	8	2272440	2272447	25 %	0 %	25 %	50 %	479148099
47011	NC_021012	CAT	2	6	2272486	2272491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148099
47012	NC_021012	GGA	2	6	2272492	2272497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479148099
47013	NC_021012	ATG	2	6	2272530	2272535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148099
47014	NC_021012	AG	3	6	2272622	2272627	50 %	0 %	50 %	0 %	479148099
47015	NC_021012	CTTT	2	8	2272668	2272675	0 %	75 %	0 %	25 %	479148099
47016	NC_021012	AAG	2	6	2272685	2272690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148099
47017	NC_021012	TGT	2	6	2272711	2272716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479148099
47018	NC_021012	TGC	2	6	2272764	2272769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148099
47019	NC_021012	ATT	2	6	2272833	2272838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479148099
47020	NC_021012	TTC	2	6	2272846	2272851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479148099
47021	NC_021012	CGA	2	6	2272885	2272890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148099
47022	NC_021012	AAAAAT	2	12	2272913	2272924	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	479148099
47023	NC_021012	GCG	2	6	2273070	2273075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479148099
47024	NC_021012	AG	3	6	2273122	2273127	50 %	0 %	50 %	0 %	479148099
47025	NC_021012	CTG	2	6	2273231	2273236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148099
47026	NC_021012	TCTG	2	8	2273274	2273281	0 %	50 %	25 %	25 %	479148099
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47034	NC_021012	AAAG	2	8	2273653	2273660	75 %	0 %	25 %	0 %	479148099
47035	NC_021012	GA	4	8	2273760	2273767	50 %	0 %	50 %	0 %	479148099
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47038	NC_021012	CA	5	10	2273971	2273980	50 %	0 %	0 %	50 %	479148100
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47042	NC_021012	A	6	6	2274074	2274079	100 %	0 %	0 %	0 %	479148100
47043	NC_021012	TGG	2	6	2274163	2274168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479148100
47044	NC_021012	GA	3	6	2274216	2274221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47045	NC_021012	TTCCG	2	10	2274276	2274285	0 %	40 %	20 %	40 %	479148101
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47049	NC_021012	A	7	7	2274423	2274429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47050	NC_021012	TGC	2	6	2274450	2274455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47051	NC_021012	GGA	2	6	2274477	2274482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47052	NC_021012	GCC	2	6	2274513	2274518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47053	NC_021012	ATTC	2	8	2274525	2274532	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47054	NC_021012	ATA	2	6	2274536	2274541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47055	NC_021012	ATC	2	6	2274568	2274573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47056	NC_021012	ATT	2	6	2274607	2274612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47057	NC_021012	CGC	2	6	2274619	2274624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47058	NC_021012	CGGT	2	8	2274626	2274633	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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47061	NC_021012	CAA	2	6	2274710	2274715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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47090	NC_021012	CAG	2	6	2275890	2275895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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47108	NC_021012	ACTGC	2	10	2276685	2276694	20 %	20 %	20 %	40 %	479148103
47109	NC_021012	AAGA	2	8	2276703	2276710	75 %	0 %	25 %	0 %	479148103
47110	NC_021012	CGG	2	6	2276760	2276765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479148103
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47122	NC_021012	GA	4	8	2277297	2277304	50 %	0 %	50 %	0 %	479148103
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47240	NC_021012	T	6	6	2282710	2282715	0 %	100 %	0 %	0 %	479148107
47241	NC_021012	TCA	2	6	2282717	2282722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148107
47242	NC_021012	AAT	2	6	2282731	2282736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479148107
47243	NC_021012	TGGCA	2	10	2282752	2282761	20 %	20 %	40 %	20 %	479148107
47244	NC_021012	CAGA	2	8	2282787	2282794	50 %	0 %	25 %	25 %	479148107
47245	NC_021012	GA	3	6	2282945	2282950	50 %	0 %	50 %	0 %	479148107
47246	NC_021012	CGGCAA	2	12	2282954	2282965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148107
47247	NC_021012	TGC	2	6	2282996	2283001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148107
47248	NC_021012	GGA	2	6	2283018	2283023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479148107
47249	NC_021012	A	6	6	2283045	2283050	100 %	0 %	0 %	0 %	479148107
47250	NC_021012	GAA	2	6	2283079	2283084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148107
47251	NC_021012	A	7	7	2283088	2283094	100 %	0 %	0 %	0 %	479148107
47252	NC_021012	ATT	2	6	2283132	2283137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479148107
47253	NC_021012	T	6	6	2283136	2283141	0 %	100 %	0 %	0 %	479148107
47254	NC_021012	ACG	2	6	2283166	2283171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148107
47255	NC_021012	ATT	2	6	2283255	2283260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479148107
47256	NC_021012	GAA	2	6	2283271	2283276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148107
47257	NC_021012	ATG	2	6	2283296	2283301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148107
47258	NC_021012	CGCAA	2	10	2283324	2283333	40 %	0 %	20 %	40 %	479148107
47259	NC_021012	TGA	2	6	2283344	2283349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148107
47260	NC_021012	GTCA	2	8	2283358	2283365	25 %	25 %	25 %	25 %	479148107
47261	NC_021012	GGC	2	6	2283391	2283396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479148107
47262	NC_021012	ATG	2	6	2283442	2283447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148107
47263	NC_021012	AG	3	6	2283510	2283515	50 %	0 %	50 %	0 %	479148107
47264	NC_021012	AAAT	2	8	2283537	2283544	75 %	25 %	0 %	0 %	479148107
47265	NC_021012	ATG	2	6	2283565	2283570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148107
47266	NC_021012	TGAT	2	8	2283581	2283588	25 %	50 %	25 %	0 %	479148107
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47269	NC_021012	AGG	2	6	2283719	2283724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479148107
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47271	NC_021012	GGCA	2	8	2283852	2283859	25 %	0 %	50 %	25 %	479148107
47272	NC_021012	CA	3	6	2283858	2283863	50 %	0 %	0 %	50 %	479148107
47273	NC_021012	GAA	2	6	2283886	2283891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479148107
47274	NC_021012	TGC	2	6	2283927	2283932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148107
47275	NC_021012	A	6	6	2284018	2284023	100 %	0 %	0 %	0 %	479148107
47276	NC_021012	GAC	2	6	2284028	2284033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148107
47277	NC_021012	GAT	2	6	2284051	2284056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148107
47278	NC_021012	TGG	2	6	2284184	2284189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479148107
47279	NC_021012	GGA	2	6	2284290	2284295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47280	NC_021012	CAT	2	6	2284385	2284390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148108
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47282	NC_021012	CAT	2	6	2284427	2284432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148108
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47286	NC_021012	GGA	2	6	2284507	2284512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479148108
47287	NC_021012	CT	3	6	2284535	2284540	0 %	50 %	0 %	50 %	479148108
47288	NC_021012	TGA	2	6	2284573	2284578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148108
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47290	NC_021012	AT	3	6	2284805	2284810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47291	NC_021012	AAGA	2	8	2284811	2284818	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47292	NC_021012	TGCG	2	8	2284856	2284863	0 %	25 %	50 %	25 %	479148109
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47294	NC_021012	CTG	2	6	2284904	2284909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148109
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47307	NC_021012	GGA	2	6	2285310	2285315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479148109
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47322	NC_021012	CGG	2	6	2286018	2286023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479148109
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47333	NC_021012	GGC	2	6	2286958	2286963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479148110
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47343	NC_021012	AAAG	2	8	2287641	2287648	75 %	0 %	25 %	0 %	479148110
47344	NC_021012	ATG	2	6	2287748	2287753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148110
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47346	NC_021012	GCG	2	6	2287909	2287914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479148110
47347	NC_021012	GCA	2	6	2287981	2287986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479148110
47348	NC_021012	TCT	2	6	2287989	2287994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479148110
47349	NC_021012	GAT	2	6	2288052	2288057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148110
47350	NC_021012	TCT	2	6	2288073	2288078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479148110
47351	NC_021012	TATG	2	8	2288134	2288141	25 %	50 %	25 %	0 %	479148110
47352	NC_021012	ATC	2	6	2288210	2288215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479148110
47353	NC_021012	GAAA	2	8	2288438	2288445	75 %	0 %	25 %	0 %	479148110
47354	NC_021012	CGG	3	9	2288465	2288473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479148110
47355	NC_021012	CGGA	2	8	2288561	2288568	25 %	0 %	50 %	25 %	479148110
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47357	NC_021012	ATT	2	6	2288750	2288755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479148110
47358	NC_021012	TGA	2	6	2288874	2288879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479148110
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47475	NC_021012	A	6	6	2293941	2293946	100 %	0 %	0 %	0 %	479148115
47476	NC_021012	CAA	2	6	2294042	2294047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479148115
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47478	NC_021012	TGC	2	6	2294138	2294143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479148115
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