MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 88114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27501	NC_021012	TA	3	6	1320553	1320558	50 %	50 %	0 %	0 %	479147290
27502	NC_021012	ATC	2	6	1320573	1320578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479147290
27503	NC_021012	CAC	2	6	1320587	1320592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479147290
27504	NC_021012	CAG	2	6	1320648	1320653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147290
27505	NC_021012	TCT	2	6	1320669	1320674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479147290
27506	NC_021012	ATT	2	6	1320786	1320791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479147290
27507	NC_021012	CAGACA	2	12	1320882	1320893	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	479147290
27508	NC_021012	CAG	2	6	1320974	1320979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147290
27509	NC_021012	TTTA	2	8	1320996	1321003	25 %	75 %	0 %	0 %	479147290
27510	NC_021012	GTT	2	6	1321050	1321055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479147290
27511	NC_021012	GCGG	2	8	1321077	1321084	0 %	0 %	75 %	25 %	479147290
27512	NC_021012	GAAT	2	8	1321153	1321160	50 %	25 %	25 %	0 %	479147290
27513	NC_021012	GA	4	8	1321166	1321173	50 %	0 %	50 %	0 %	479147290
27514	NC_021012	ACT	2	6	1321198	1321203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479147290
27515	NC_021012	CTT	2	6	1321257	1321262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479147290
27516	NC_021012	TGATC	2	10	1321327	1321336	20 %	40 %	20 %	20 %	479147290
27517	NC_021012	CTT	2	6	1321392	1321397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479147291
27518	NC_021012	AG	3	6	1321435	1321440	50 %	0 %	50 %	0 %	479147291
27519	NC_021012	A	6	6	1321456	1321461	100 %	0 %	0 %	0 %	479147291
27520	NC_021012	GCA	2	6	1321491	1321496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147291
27521	NC_021012	ATT	2	6	1321509	1321514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479147291
27522	NC_021012	TG	3	6	1321612	1321617	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27523	NC_021012	TAT	2	6	1321661	1321666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479147292
27524	NC_021012	CAG	2	6	1321719	1321724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147292
27525	NC_021012	TTC	2	6	1321749	1321754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479147292
27526	NC_021012	TCG	2	6	1321793	1321798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479147292
27527	NC_021012	TGT	2	6	1321857	1321862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479147292
27528	NC_021012	A	6	6	1321870	1321875	100 %	0 %	0 %	0 %	479147292
27529	NC_021012	GA	3	6	1321899	1321904	50 %	0 %	50 %	0 %	479147292
27530	NC_021012	TCT	2	6	1322058	1322063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479147292
27531	NC_021012	T	6	6	1322206	1322211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27532	NC_021012	GGA	2	6	1322229	1322234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27533	NC_021012	AATT	2	8	1322235	1322242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27534	NC_021012	GCA	2	6	1322246	1322251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147293
27535	NC_021012	ATC	2	6	1322309	1322314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479147293
27536	NC_021012	ACATGC	2	12	1322332	1322343	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479147293
27537	NC_021012	TA	3	6	1322436	1322441	50 %	50 %	0 %	0 %	479147293
27538	NC_021012	CAG	2	6	1322445	1322450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147293
27539	NC_021012	GCA	2	6	1322453	1322458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147293
27540	NC_021012	CAT	3	9	1322470	1322478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479147293
27541	NC_021012	A	6	6	1322516	1322521	100 %	0 %	0 %	0 %	479147293
27542	NC_021012	AGGC	2	8	1322541	1322548	25 %	0 %	50 %	25 %	479147293
27543	NC_021012	CGG	2	6	1322761	1322766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479147293
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27546	NC_021012	GCAG	2	8	1322830	1322837	25 %	0 %	50 %	25 %	479147293
27547	NC_021012	GGT	2	6	1322846	1322851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479147293
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27549	NC_021012	ATC	2	6	1323041	1323046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479147293
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27551	NC_021012	GAAA	2	8	1323168	1323175	75 %	0 %	25 %	0 %	479147293
27552	NC_021012	CATC	2	8	1323185	1323192	25 %	25 %	0 %	50 %	479147293
27553	NC_021012	AAC	2	6	1323233	1323238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479147293
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27555	NC_021012	TTG	2	6	1323318	1323323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27556	NC_021012	AGAA	2	8	1323334	1323341	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27557	NC_021012	TCA	2	6	1323342	1323347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27558	NC_021012	ATG	2	6	1323363	1323368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27559	NC_021012	T	7	7	1323373	1323379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27560	NC_021012	GGA	2	6	1323427	1323432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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27562	NC_021012	TGT	2	6	1323493	1323498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27563	NC_021012	T	6	6	1323538	1323543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27564	NC_021012	AG	3	6	1323551	1323556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27565	NC_021012	TGC	2	6	1323565	1323570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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27567	NC_021012	GAAAT	2	10	1323754	1323763	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27568	NC_021012	T	8	8	1323858	1323865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27569	NC_021012	AGG	2	6	1323876	1323881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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27572	NC_021012	TTC	2	6	1323968	1323973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27573	NC_021012	AGG	2	6	1323982	1323987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27574	NC_021012	TCCTC	2	10	1323992	1324001	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
27575	NC_021012	AGG	2	6	1324034	1324039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27576	NC_021012	A	6	6	1324078	1324083	100 %	0 %	0 %	0 %	479147294
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27585	NC_021012	ATG	2	6	1324667	1324672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147294
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27588	NC_021012	ATG	2	6	1325078	1325083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147294
27589	NC_021012	GTT	2	6	1325131	1325136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479147294
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27591	NC_021012	ACTA	2	8	1325296	1325303	50 %	25 %	0 %	25 %	479147294
27592	NC_021012	CCGATC	2	12	1325350	1325361	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479147294
27593	NC_021012	TGA	2	6	1325394	1325399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147294
27594	NC_021012	GAGC	2	8	1325400	1325407	25 %	0 %	50 %	25 %	479147294
27595	NC_021012	AG	3	6	1325430	1325435	50 %	0 %	50 %	0 %	479147294
27596	NC_021012	TGC	2	6	1325469	1325474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479147294
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27599	NC_021012	ATG	2	6	1325597	1325602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147294
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27603	NC_021012	GA	3	6	1325795	1325800	50 %	0 %	50 %	0 %	479147294
27604	NC_021012	GAT	2	6	1325836	1325841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147294
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27606	NC_021012	CGT	2	6	1325944	1325949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479147294
27607	NC_021012	CAT	2	6	1325979	1325984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479147294
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27609	NC_021012	CAG	2	6	1326048	1326053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147294
27610	NC_021012	AATAC	2	10	1326071	1326080	60 %	20 %	0 %	20 %	479147294
27611	NC_021012	ATG	2	6	1326094	1326099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147294
27612	NC_021012	CAG	2	6	1326238	1326243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147294
27613	NC_021012	GAT	2	6	1326355	1326360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147294
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27615	NC_021012	GAA	2	6	1326434	1326439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479147294
27616	NC_021012	A	6	6	1326467	1326472	100 %	0 %	0 %	0 %	479147295
27617	NC_021012	TTA	2	6	1326482	1326487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479147295
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27991	NC_021012	GA	3	6	1344847	1344852	50 %	0 %	50 %	0 %	479147311
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28000	NC_021012	GAA	2	6	1345244	1345249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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