MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 88114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25501	NC_021012	TGC	2	6	1222141	1222146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25502	NC_021012	ACG	2	6	1222163	1222168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25503	NC_021012	TGT	2	6	1222174	1222179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25504	NC_021012	GAA	2	6	1222206	1222211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25505	NC_021012	TGA	2	6	1222276	1222281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25506	NC_021012	TCG	2	6	1222321	1222326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25507	NC_021012	ATCC	2	8	1222373	1222380	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25508	NC_021012	AGAA	2	8	1222413	1222420	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25509	NC_021012	GCA	2	6	1222451	1222456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25510	NC_021012	ATCC	2	8	1222481	1222488	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25511	NC_021012	GCT	2	6	1222589	1222594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25512	NC_021012	ATT	2	6	1222730	1222735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25513	NC_021012	CAT	2	6	1222754	1222759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25514	NC_021012	GCA	2	6	1222820	1222825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25515	NC_021012	AGA	2	6	1222838	1222843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25516	NC_021012	GA	3	6	1222842	1222847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25517	NC_021012	AGA	2	6	1222882	1222887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25518	NC_021012	GTT	2	6	1222958	1222963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25519	NC_021012	TTGC	2	8	1222994	1223001	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25520	NC_021012	AT	3	6	1223203	1223208	50 %	50 %	0 %	0 %	479147207
25521	NC_021012	A	8	8	1223234	1223241	100 %	0 %	0 %	0 %	479147207
25522	NC_021012	AT	3	6	1223259	1223264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25523	NC_021012	GAAA	2	8	1223289	1223296	75 %	0 %	25 %	0 %	479147208
25524	NC_021012	GGT	2	6	1223297	1223302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479147208
25525	NC_021012	AG	3	6	1223314	1223319	50 %	0 %	50 %	0 %	479147208
25526	NC_021012	TCTT	2	8	1223373	1223380	0 %	75 %	0 %	25 %	479147208
25527	NC_021012	CAGA	2	8	1223394	1223401	50 %	0 %	25 %	25 %	479147208
25528	NC_021012	CAGG	2	8	1223493	1223500	25 %	0 %	50 %	25 %	479147208
25529	NC_021012	AGA	2	6	1223513	1223518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479147208
25530	NC_021012	CA	3	6	1223523	1223528	50 %	0 %	0 %	50 %	479147208
25531	NC_021012	GAA	2	6	1223580	1223585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479147208
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25535	NC_021012	ATAC	2	8	1223774	1223781	50 %	25 %	0 %	25 %	479147208
25536	NC_021012	TTG	2	6	1223785	1223790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479147208
25537	NC_021012	AAG	2	6	1223796	1223801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479147208
25538	NC_021012	GAT	2	6	1223832	1223837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25539	NC_021012	AGG	2	6	1223843	1223848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25540	NC_021012	TCTGAT	2	12	1224022	1224033	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25541	NC_021012	ATA	2	6	1224036	1224041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25542	NC_021012	AGC	2	6	1224125	1224130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25543	NC_021012	GAT	2	6	1224167	1224172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25544	NC_021012	T	6	6	1224216	1224221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25545	NC_021012	AGA	2	6	1224233	1224238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25546	NC_021012	CATA	2	8	1224254	1224261	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25547	NC_021012	GGA	2	6	1224314	1224319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25548	NC_021012	A	6	6	1224411	1224416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25549	NC_021012	CAG	2	6	1224442	1224447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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25551	NC_021012	ATG	2	6	1224650	1224655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25553	NC_021012	T	7	7	1224693	1224699	0 %	100 %	0 %	0 %	479147209
25554	NC_021012	TGAC	2	8	1224720	1224727	25 %	25 %	25 %	25 %	479147209
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25556	NC_021012	GAT	2	6	1224762	1224767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147209
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25559	NC_021012	TTTA	2	8	1224930	1224937	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25560	NC_021012	TTGCT	2	10	1224967	1224976	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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25563	NC_021012	TCG	2	6	1225078	1225083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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25590	NC_021012	TTTG	2	8	1225979	1225986	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25591	NC_021012	TCT	2	6	1226030	1226035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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25593	NC_021012	GTG	2	6	1226089	1226094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25594	NC_021012	T	8	8	1226129	1226136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25595	NC_021012	CAG	2	6	1226177	1226182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25596	NC_021012	TGT	2	6	1226240	1226245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25605	NC_021012	ATGTT	2	10	1226583	1226592	20 %	60 %	20 %	0 %	479147211
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25611	NC_021012	AT	3	6	1226980	1226985	50 %	50 %	0 %	0 %	479147211
25612	NC_021012	ATC	2	6	1227000	1227005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479147211
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25620	NC_021012	AAG	2	6	1228800	1228805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25622	NC_021012	CAAGG	2	10	1228881	1228890	40 %	0 %	40 %	20 %	479147212
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25625	NC_021012	AGA	2	6	1228990	1228995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479147212
25626	NC_021012	T	6	6	1229047	1229052	0 %	100 %	0 %	0 %	479147212
25627	NC_021012	T	6	6	1229106	1229111	0 %	100 %	0 %	0 %	479147212
25628	NC_021012	CA	3	6	1229121	1229126	50 %	0 %	0 %	50 %	479147212
25629	NC_021012	TG	3	6	1229156	1229161	0 %	50 %	50 %	0 %	479147212
25630	NC_021012	AAC	2	6	1229194	1229199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479147212
25631	NC_021012	ATG	2	6	1229251	1229256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147212
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25633	NC_021012	TGC	2	6	1229360	1229365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479147212
25634	NC_021012	GA	3	6	1229402	1229407	50 %	0 %	50 %	0 %	479147212
25635	NC_021012	CATCT	2	10	1229443	1229452	20 %	40 %	0 %	40 %	479147212
25636	NC_021012	CT	3	6	1229468	1229473	0 %	50 %	0 %	50 %	479147212
25637	NC_021012	GTA	2	6	1229579	1229584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147212
25638	NC_021012	ATG	2	6	1229612	1229617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147212
25639	NC_021012	TCC	2	6	1229636	1229641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479147212
25640	NC_021012	GGC	2	6	1229655	1229660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479147212
25641	NC_021012	TCC	2	6	1229681	1229686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479147212
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25644	NC_021012	TTC	2	6	1229788	1229793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479147212
25645	NC_021012	GAAG	2	8	1229828	1229835	50 %	0 %	50 %	0 %	479147212
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25648	NC_021012	AGG	2	6	1229999	1230004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25649	NC_021012	GGTT	2	8	1230006	1230013	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25650	NC_021012	A	6	6	1230020	1230025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25651	NC_021012	GAT	2	6	1230029	1230034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25652	NC_021012	A	6	6	1230122	1230127	100 %	0 %	0 %	0 %	479147213
25653	NC_021012	AGA	2	6	1230132	1230137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479147213
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25657	NC_021012	A	6	6	1230271	1230276	100 %	0 %	0 %	0 %	479147213
25658	NC_021012	GTG	2	6	1230316	1230321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479147213
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25682	NC_021012	AT	3	6	1230884	1230889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25683	NC_021012	TAAA	2	8	1230897	1230904	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25684	NC_021012	AT	3	6	1230916	1230921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25685	NC_021012	AAT	2	6	1230932	1230937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479147214
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25732	NC_021012	ATG	2	6	1233129	1233134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147215
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25735	NC_021012	GAG	2	6	1233338	1233343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479147215
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25738	NC_021012	TGA	2	6	1233601	1233606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147215
25739	NC_021012	TCG	2	6	1233615	1233620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479147215
25740	NC_021012	GAA	2	6	1233635	1233640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479147215
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25742	NC_021012	GCA	2	6	1233761	1233766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147216
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