MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 88114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_021012	ATC	2	6	95039	95044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2002	NC_021012	TGT	2	6	95192	95197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2003	NC_021012	TTA	2	6	95206	95211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_021012	TGG	2	6	95242	95247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2005	NC_021012	GAT	2	6	95298	95303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_021012	T	6	6	95359	95364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2007	NC_021012	T	6	6	95386	95391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2008	NC_021012	TG	3	6	95461	95466	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_021012	GAACG	2	10	95484	95493	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2010	NC_021012	A	6	6	95495	95500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2011	NC_021012	ATCAG	2	10	95522	95531	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2012	NC_021012	GAG	2	6	95611	95616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2013	NC_021012	ATC	2	6	95692	95697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2014	NC_021012	CTG	2	6	95710	95715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2015	NC_021012	AGA	2	6	95721	95726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2016	NC_021012	CAG	2	6	95976	95981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2017	NC_021012	TGA	2	6	96008	96013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2018	NC_021012	ATA	2	6	96014	96019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2019	NC_021012	CAG	2	6	96126	96131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2020	NC_021012	TGA	2	6	96132	96137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2021	NC_021012	GGAA	2	8	96180	96187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2022	NC_021012	CGGACT	2	12	96189	96200	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2023	NC_021012	GGT	2	6	96232	96237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2024	NC_021012	CAG	2	6	96296	96301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2025	NC_021012	AGAA	2	8	96302	96309	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2026	NC_021012	A	6	6	96317	96322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2027	NC_021012	GAA	2	6	96325	96330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2028	NC_021012	TTG	2	6	96337	96342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2029	NC_021012	T	6	6	96405	96410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2031	NC_021012	CGGG	2	8	96451	96458	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2032	NC_021012	CTG	2	6	96490	96495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2033	NC_021012	CCA	2	6	96496	96501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2034	NC_021012	TGCC	2	8	96533	96540	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2035	NC_021012	GCG	2	6	96577	96582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2036	NC_021012	AGC	2	6	96638	96643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2037	NC_021012	AAT	2	6	96676	96681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2038	NC_021012	A	6	6	96707	96712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2039	NC_021012	T	6	6	96718	96723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2042	NC_021012	CGGG	2	8	96914	96921	0 %	0 %	75 %	25 %	479146282
2043	NC_021012	TGG	2	6	96967	96972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146282
2044	NC_021012	GAA	2	6	96994	96999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146282
2045	NC_021012	CG	3	6	97057	97062	0 %	0 %	50 %	50 %	479146282
2046	NC_021012	TA	4	8	97170	97177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2049	NC_021012	TAG	2	6	97518	97523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146283
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2051	NC_021012	CAG	2	6	97669	97674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146283
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2053	NC_021012	TG	3	6	97876	97881	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2054	NC_021012	CTT	2	6	97926	97931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2056	NC_021012	TAT	2	6	97950	97955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2057	NC_021012	T	6	6	97964	97969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2059	NC_021012	TACCG	2	10	98246	98255	20 %	20 %	20 %	40 %	479146284
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2065	NC_021012	ATT	2	6	98413	98418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2068	NC_021012	TA	3	6	98499	98504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2134	NC_021012	GCA	2	6	100829	100834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146285
2135	NC_021012	AGC	2	6	100866	100871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146285
2136	NC_021012	CG	3	6	100942	100947	0 %	0 %	50 %	50 %	479146285
2137	NC_021012	TTTC	2	8	100951	100958	0 %	75 %	0 %	25 %	479146285
2138	NC_021012	GGAC	2	8	100971	100978	25 %	0 %	50 %	25 %	479146285
2139	NC_021012	A	7	7	101028	101034	100 %	0 %	0 %	0 %	479146285
2140	NC_021012	A	6	6	101081	101086	100 %	0 %	0 %	0 %	479146285
2141	NC_021012	T	6	6	101126	101131	0 %	100 %	0 %	0 %	479146285
2142	NC_021012	AGA	3	9	101161	101169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146285
2143	NC_021012	ATC	2	6	101234	101239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146285
2144	NC_021012	GCT	2	6	101286	101291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146285
2145	NC_021012	T	7	7	101299	101305	0 %	100 %	0 %	0 %	479146285
2146	NC_021012	A	6	6	101357	101362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2147	NC_021012	GAT	2	6	101409	101414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146286
2148	NC_021012	A	7	7	101434	101440	100 %	0 %	0 %	0 %	479146286
2149	NC_021012	GATGAA	2	12	101532	101543	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479146286
2150	NC_021012	T	6	6	101569	101574	0 %	100 %	0 %	0 %	479146286
2151	NC_021012	TGC	2	6	101608	101613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146286
2152	NC_021012	TGC	2	6	101647	101652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146286
2153	NC_021012	GAT	2	6	101683	101688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146286
2154	NC_021012	TGT	2	6	101732	101737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146286
2155	NC_021012	CTGC	2	8	101769	101776	0 %	25 %	25 %	50 %	479146286
2156	NC_021012	GTCT	2	8	101905	101912	0 %	50 %	25 %	25 %	479146286
2157	NC_021012	AAG	2	6	101928	101933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146286
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2163	NC_021012	A	7	7	102082	102088	100 %	0 %	0 %	0 %	479146287
2164	NC_021012	TG	3	6	102119	102124	0 %	50 %	50 %	0 %	479146287
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2169	NC_021012	A	6	6	102323	102328	100 %	0 %	0 %	0 %	479146287
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2174	NC_021012	AAG	2	6	102491	102496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146287
2175	NC_021012	AGC	2	6	102556	102561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2177	NC_021012	AGC	2	6	102716	102721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2178	NC_021012	TG	3	6	102738	102743	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2179	NC_021012	AT	3	6	102838	102843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2180	NC_021012	TCA	2	6	102912	102917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146288
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2186	NC_021012	ACA	2	6	103333	103338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2187	NC_021012	T	6	6	103442	103447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2188	NC_021012	GA	3	6	103477	103482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2189	NC_021012	ATTT	2	8	103502	103509	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2190	NC_021012	A	6	6	103531	103536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2191	NC_021012	TA	3	6	103541	103546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2192	NC_021012	AG	3	6	103570	103575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2193	NC_021012	TTTGGA	2	12	103615	103626	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	479146289
2194	NC_021012	A	7	7	103644	103650	100 %	0 %	0 %	0 %	479146289
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2232	NC_021012	GGT	2	6	106186	106191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146290
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2234	NC_021012	A	6	6	106279	106284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2235	NC_021012	ATA	2	6	106321	106326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2239	NC_021012	A	6	6	106397	106402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2240	NC_021012	CAGC	2	8	106414	106421	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2241	NC_021012	GGAT	2	8	106470	106477	25 %	25 %	50 %	0 %	479146291
2242	NC_021012	TTC	2	6	106508	106513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146291
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2249	NC_021012	T	7	7	106778	106784	0 %	100 %	0 %	0 %	479146291
2250	NC_021012	TCTT	2	8	106827	106834	0 %	75 %	0 %	25 %	479146291
2251	NC_021012	GTA	2	6	106994	106999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146291
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2253	NC_021012	GAT	2	6	107072	107077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146291
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2258	NC_021012	C	6	6	107467	107472	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2259	NC_021012	ATA	2	6	107533	107538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146292
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2375	NC_021012	CGAT	2	8	112875	112882	25 %	25 %	25 %	25 %	479146297
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2387	NC_021012	GAC	2	6	113702	113707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146298
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2391	NC_021012	CAT	2	6	113989	113994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146298
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