MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 88114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_021012	GAA	2	6	1102606	1102611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23003	NC_021012	T	6	6	1102652	1102657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23004	NC_021012	CA	3	6	1102701	1102706	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23005	NC_021012	CCG	2	6	1102778	1102783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23006	NC_021012	T	6	6	1102865	1102870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23007	NC_021012	GAT	2	6	1102997	1103002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23008	NC_021012	AAG	2	6	1103025	1103030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23009	NC_021012	CAG	2	6	1103040	1103045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23010	NC_021012	AGA	2	6	1103046	1103051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23011	NC_021012	TAT	2	6	1103141	1103146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23012	NC_021012	GA	3	6	1103154	1103159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23013	NC_021012	CTGTGA	2	12	1103194	1103205	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23014	NC_021012	AAC	2	6	1103225	1103230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23015	NC_021012	TGT	2	6	1103323	1103328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23016	NC_021012	TTGATA	2	12	1103352	1103363	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23017	NC_021012	GAT	2	6	1103429	1103434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23018	NC_021012	CCG	2	6	1103530	1103535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23019	NC_021012	ATC	2	6	1103537	1103542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23020	NC_021012	CGC	2	6	1103543	1103548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23021	NC_021012	GAA	2	6	1103562	1103567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23022	NC_021012	GCT	2	6	1103603	1103608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23023	NC_021012	A	6	6	1103654	1103659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23024	NC_021012	TAT	2	6	1103676	1103681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23025	NC_021012	GAA	3	9	1103687	1103695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23026	NC_021012	CGAT	2	8	1103709	1103716	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23027	NC_021012	GAA	2	6	1103849	1103854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23028	NC_021012	TGA	2	6	1103953	1103958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23029	NC_021012	CAG	2	6	1104140	1104145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23030	NC_021012	ATC	2	6	1104158	1104163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23031	NC_021012	GAT	2	6	1104238	1104243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23032	NC_021012	ATG	2	6	1104251	1104256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23033	NC_021012	GCA	2	6	1104290	1104295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23034	NC_021012	GCAG	2	8	1104379	1104386	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23035	NC_021012	GGA	2	6	1104448	1104453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23036	NC_021012	TGA	2	6	1104519	1104524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23037	NC_021012	TGG	2	6	1104628	1104633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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23039	NC_021012	ATC	2	6	1104674	1104679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23040	NC_021012	GCA	2	6	1104695	1104700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23041	NC_021012	AGAA	2	8	1104762	1104769	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23042	NC_021012	GCAG	2	8	1104835	1104842	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23043	NC_021012	AGC	2	6	1104886	1104891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23044	NC_021012	CTT	2	6	1105044	1105049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23045	NC_021012	GCA	2	6	1105091	1105096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23059	NC_021012	AAC	2	6	1106073	1106078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479147098
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23098	NC_021012	AATA	2	8	1107619	1107626	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23099	NC_021012	GGAG	2	8	1107662	1107669	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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23102	NC_021012	A	6	6	1107823	1107828	100 %	0 %	0 %	0 %	479147100
23103	NC_021012	AGC	2	6	1107834	1107839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147100
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23105	NC_021012	TAA	2	6	1107859	1107864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479147100
23106	NC_021012	TG	3	6	1107893	1107898	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23107	NC_021012	T	8	8	1107905	1107912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23108	NC_021012	TGAG	2	8	1107916	1107923	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23109	NC_021012	AT	3	6	1107936	1107941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23110	NC_021012	ATA	2	6	1107951	1107956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23120	NC_021012	A	6	6	1108661	1108666	100 %	0 %	0 %	0 %	479147101
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23122	NC_021012	ATT	2	6	1108686	1108691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23123	NC_021012	A	6	6	1108705	1108710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23124	NC_021012	T	6	6	1108769	1108774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23125	NC_021012	TAA	2	6	1108778	1108783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479147102
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23141	NC_021012	GGA	2	6	1109552	1109557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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23223	NC_021012	T	6	6	1113755	1113760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23232	NC_021012	TCA	2	6	1114081	1114086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479147106
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23234	NC_021012	TCA	2	6	1114219	1114224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479147106
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23241	NC_021012	T	8	8	1114392	1114399	0 %	100 %	0 %	0 %	479147106
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23358	NC_021012	AGA	2	6	1119231	1119236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479147111
23359	NC_021012	CGG	2	6	1119279	1119284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479147111
23360	NC_021012	AG	3	6	1119327	1119332	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23361	NC_021012	GCA	2	6	1119442	1119447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147112
23362	NC_021012	GCT	2	6	1119449	1119454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479147112
23363	NC_021012	TATC	2	8	1119494	1119501	25 %	50 %	0 %	25 %	479147112
23364	NC_021012	AGGA	2	8	1119530	1119537	50 %	0 %	50 %	0 %	479147112
23365	NC_021012	GAG	2	6	1119544	1119549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479147112
23366	NC_021012	TCAG	2	8	1119563	1119570	25 %	25 %	25 %	25 %	479147112
23367	NC_021012	TTG	2	6	1119686	1119691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479147112
23368	NC_021012	A	6	6	1119724	1119729	100 %	0 %	0 %	0 %	479147112
23369	NC_021012	ATG	2	6	1119818	1119823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147112
23370	NC_021012	AGGC	2	8	1119848	1119855	25 %	0 %	50 %	25 %	479147112
23371	NC_021012	GTT	2	6	1119904	1119909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479147112
23372	NC_021012	GCT	2	6	1119910	1119915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479147112
23373	NC_021012	GTT	2	6	1119961	1119966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479147112
23374	NC_021012	TGA	2	6	1120124	1120129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147112
23375	NC_021012	CGG	3	9	1120188	1120196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479147112
23376	NC_021012	TGC	2	6	1120212	1120217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479147112
23377	NC_021012	CCG	2	6	1120260	1120265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479147112
23378	NC_021012	GGA	2	6	1120293	1120298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479147112
23379	NC_021012	CAT	2	6	1120303	1120308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479147112
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23382	NC_021012	ATC	2	6	1120570	1120575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479147112
23383	NC_021012	GAA	2	6	1120582	1120587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479147112
23384	NC_021012	GGT	2	6	1120621	1120626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479147112
23385	NC_021012	AATA	2	8	1120711	1120718	75 %	25 %	0 %	0 %	479147112
23386	NC_021012	CTG	2	6	1120758	1120763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23387	NC_021012	T	6	6	1120774	1120779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23388	NC_021012	T	7	7	1120789	1120795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23389	NC_021012	T	7	7	1120850	1120856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23390	NC_021012	ATG	2	6	1120889	1120894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23391	NC_021012	TGA	2	6	1120920	1120925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23392	NC_021012	GGA	2	6	1120948	1120953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479147113
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23394	NC_021012	GAAA	2	8	1120972	1120979	75 %	0 %	25 %	0 %	479147113
23395	NC_021012	AAG	2	6	1121013	1121018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479147113
23396	NC_021012	ACAG	2	8	1121041	1121048	50 %	0 %	25 %	25 %	479147113
23397	NC_021012	CAG	2	6	1121072	1121077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147113
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23399	NC_021012	A	6	6	1121111	1121116	100 %	0 %	0 %	0 %	479147113
23400	NC_021012	GAC	2	6	1121134	1121139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147113
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23433	NC_021012	CAAA	2	8	1123047	1123054	75 %	0 %	0 %	25 %	479147113
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23440	NC_021012	ATG	2	6	1123358	1123363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147113
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23442	NC_021012	A	7	7	1123520	1123526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23443	NC_021012	CAAT	2	8	1123563	1123570	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23444	NC_021012	AAATG	2	10	1123579	1123588	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23445	NC_021012	T	6	6	1123613	1123618	0 %	100 %	0 %	0 %	479147114
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23452	NC_021012	CTGAC	2	10	1123805	1123814	20 %	20 %	20 %	40 %	479147114
23453	NC_021012	GA	3	6	1123961	1123966	50 %	0 %	50 %	0 %	479147114
23454	NC_021012	CAGC	2	8	1124090	1124097	25 %	0 %	25 %	50 %	479147114
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23456	NC_021012	AC	3	6	1124199	1124204	50 %	0 %	0 %	50 %	479147114
23457	NC_021012	TAC	2	6	1124219	1124224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479147114
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23460	NC_021012	GAT	2	6	1124369	1124374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147114
23461	NC_021012	AAT	2	6	1124412	1124417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479147114
23462	NC_021012	CTC	2	6	1124467	1124472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479147115
23463	NC_021012	GA	3	6	1124498	1124503	50 %	0 %	50 %	0 %	479147115
23464	NC_021012	CGGA	2	8	1124589	1124596	25 %	0 %	50 %	25 %	479147115
23465	NC_021012	TC	3	6	1124630	1124635	0 %	50 %	0 %	50 %	479147115
23466	NC_021012	AT	3	6	1124672	1124677	50 %	50 %	0 %	0 %	479147115
23467	NC_021012	TTTC	2	8	1124718	1124725	0 %	75 %	0 %	25 %	479147115
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23469	NC_021012	GAT	2	6	1124836	1124841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147115
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23471	NC_021012	CAT	2	6	1125118	1125123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479147115
23472	NC_021012	GCT	2	6	1125182	1125187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479147116
23473	NC_021012	TCC	2	6	1125259	1125264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479147116
23474	NC_021012	TAA	2	6	1125266	1125271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479147116
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