MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 88114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21003	NC_021012	AAT	2	6	1006525	1006530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479147008
21004	NC_021012	ATTT	2	8	1006560	1006567	25 %	75 %	0 %	0 %	479147008
21005	NC_021012	T	6	6	1006581	1006586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21006	NC_021012	GC	3	6	1006615	1006620	0 %	0 %	50 %	50 %	479147009
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21011	NC_021012	GTAGA	2	10	1006786	1006795	40 %	20 %	40 %	0 %	479147009
21012	NC_021012	TCA	2	6	1006831	1006836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479147009
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21016	NC_021012	AGC	2	6	1006961	1006966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147009
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21103	NC_021012	AGCAG	2	10	1010708	1010717	40 %	0 %	40 %	20 %	479147013
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21115	NC_021012	GCA	2	6	1011219	1011224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147014
21116	NC_021012	GCA	2	6	1011231	1011236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147014
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21119	NC_021012	TGG	2	6	1011350	1011355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21120	NC_021012	CA	3	6	1011398	1011403	50 %	0 %	0 %	50 %	479147015
21121	NC_021012	TCG	2	6	1011480	1011485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479147015
21122	NC_021012	CGG	3	9	1011513	1011521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479147015
21123	NC_021012	AGA	2	6	1011583	1011588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479147015
21124	NC_021012	GGT	3	9	1011743	1011751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479147015
21125	NC_021012	GAG	2	6	1011779	1011784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479147015
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21131	NC_021012	TGT	2	6	1012161	1012166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479147016
21132	NC_021012	TCAG	2	8	1012247	1012254	25 %	25 %	25 %	25 %	479147016
21133	NC_021012	TCC	2	6	1012337	1012342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479147016
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21140	NC_021012	TCC	2	6	1012920	1012925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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21143	NC_021012	ATATA	2	10	1013039	1013048	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21144	NC_021012	T	6	6	1013053	1013058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21145	NC_021012	A	6	6	1013139	1013144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21146	NC_021012	CGG	2	6	1013164	1013169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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21150	NC_021012	A	6	6	1013361	1013366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21151	NC_021012	ACA	3	9	1013436	1013444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21152	NC_021012	TGG	2	6	1013466	1013471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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21155	NC_021012	GA	3	6	1013715	1013720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21156	NC_021012	AAC	2	6	1013738	1013743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21157	NC_021012	CGGA	2	8	1013820	1013827	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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21160	NC_021012	AGA	2	6	1014229	1014234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21161	NC_021012	AATA	2	8	1014255	1014262	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21162	NC_021012	A	6	6	1014303	1014308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21163	NC_021012	ATA	3	9	1014332	1014340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21164	NC_021012	TTG	2	6	1014347	1014352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21167	NC_021012	TAA	2	6	1014388	1014393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21168	NC_021012	TA	3	6	1014398	1014403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21169	NC_021012	GAA	2	6	1014423	1014428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479147017
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21195	NC_021012	CA	3	6	1015359	1015364	50 %	0 %	0 %	50 %	479147017
21196	NC_021012	TGG	2	6	1015510	1015515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21197	NC_021012	A	6	6	1015555	1015560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21198	NC_021012	A	6	6	1015562	1015567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21199	NC_021012	A	7	7	1015572	1015578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21200	NC_021012	A	8	8	1015590	1015597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21201	NC_021012	TAA	2	6	1015605	1015610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21202	NC_021012	N	624	624	1015625	1016248	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21204	NC_021012	ATATG	2	10	1016352	1016361	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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21206	NC_021012	A	7	7	1016410	1016416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21207	NC_021012	A	7	7	1016418	1016424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21208	NC_021012	GAT	3	9	1016487	1016495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21209	NC_021012	ATTGT	2	10	1016536	1016545	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21210	NC_021012	GT	3	6	1016544	1016549	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21211	NC_021012	TTATT	2	10	1016621	1016630	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21212	NC_021012	GGC	2	6	1016667	1016672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21213	NC_021012	GC	3	6	1016675	1016680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21214	NC_021012	A	7	7	1016748	1016754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21215	NC_021012	T	6	6	1016758	1016763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21216	NC_021012	GA	3	6	1016764	1016769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21217	NC_021012	GAAA	2	8	1016792	1016799	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21218	NC_021012	GTAA	2	8	1016809	1016816	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21219	NC_021012	T	6	6	1016838	1016843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21220	NC_021012	TGA	2	6	1016864	1016869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21224	NC_021012	A	6	6	1017202	1017207	100 %	0 %	0 %	0 %	479147018
21225	NC_021012	TCA	2	6	1017257	1017262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479147018
21226	NC_021012	TGA	2	6	1017279	1017284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147018
21227	NC_021012	TGG	2	6	1017449	1017454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479147018
21228	NC_021012	GGA	2	6	1017537	1017542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479147018
21229	NC_021012	TCT	2	6	1017571	1017576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479147018
21230	NC_021012	AGAA	2	8	1017654	1017661	75 %	0 %	25 %	0 %	479147018
21231	NC_021012	TGTC	2	8	1017746	1017753	0 %	50 %	25 %	25 %	479147018
21232	NC_021012	GATG	2	8	1017768	1017775	25 %	25 %	50 %	0 %	479147018
21233	NC_021012	GGA	2	6	1017792	1017797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479147018
21234	NC_021012	CAT	2	6	1017807	1017812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479147018
21235	NC_021012	GTC	2	6	1017841	1017846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479147018
21236	NC_021012	GATG	2	8	1017885	1017892	25 %	25 %	50 %	0 %	479147018
21237	NC_021012	TGGAA	2	10	1017956	1017965	40 %	20 %	40 %	0 %	479147018
21238	NC_021012	ATG	2	6	1018016	1018021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147018
21239	NC_021012	CGA	2	6	1018031	1018036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147018
21240	NC_021012	GCA	2	6	1018064	1018069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147018
21241	NC_021012	TTA	2	6	1018077	1018082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479147018
21242	NC_021012	GAC	2	6	1018086	1018091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147018
21243	NC_021012	GAC	2	6	1018104	1018109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147018
21244	NC_021012	GA	4	8	1018206	1018213	50 %	0 %	50 %	0 %	479147018
21245	NC_021012	T	6	6	1018230	1018235	0 %	100 %	0 %	0 %	479147018
21246	NC_021012	GAA	2	6	1018330	1018335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479147018
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21248	NC_021012	CGG	2	6	1018379	1018384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479147018
21249	NC_021012	GA	3	6	1018390	1018395	50 %	0 %	50 %	0 %	479147018
21250	NC_021012	GCT	2	6	1018401	1018406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479147018
21251	NC_021012	GC	3	6	1018413	1018418	0 %	0 %	50 %	50 %	479147018
21252	NC_021012	GAG	2	6	1018432	1018437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479147018
21253	NC_021012	AGC	2	6	1018438	1018443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147018
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21255	NC_021012	CTT	2	6	1018595	1018600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479147018
21256	NC_021012	GGA	2	6	1018722	1018727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479147019
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21263	NC_021012	ACTT	2	8	1019110	1019117	25 %	50 %	0 %	25 %	479147019
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21267	NC_021012	GCA	2	6	1019182	1019187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147019
21268	NC_021012	GGA	2	6	1019223	1019228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479147019
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21280	NC_021012	TGC	2	6	1019633	1019638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479147020
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21289	NC_021012	TTA	2	6	1019924	1019929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479147021
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21291	NC_021012	TTGA	2	8	1019989	1019996	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21292	NC_021012	GA	3	6	1019995	1020000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21293	NC_021012	CT	3	6	1020012	1020017	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21294	NC_021012	ATGC	2	8	1020056	1020063	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21295	NC_021012	GAA	2	6	1020083	1020088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21331	NC_021012	AAG	2	6	1021922	1021927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21332	NC_021012	GT	3	6	1021958	1021963	0 %	50 %	50 %	0 %	479147024
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21342	NC_021012	AG	3	6	1022588	1022593	50 %	0 %	50 %	0 %	479147026
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21346	NC_021012	GAAA	2	8	1022683	1022690	75 %	0 %	25 %	0 %	479147026
21347	NC_021012	GCA	2	6	1022703	1022708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147026
21348	NC_021012	AG	3	6	1022750	1022755	50 %	0 %	50 %	0 %	479147026
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21350	NC_021012	GAA	2	6	1022873	1022878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479147026
21351	NC_021012	A	6	6	1022877	1022882	100 %	0 %	0 %	0 %	479147026
21352	NC_021012	CTG	2	6	1022893	1022898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479147026
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21357	NC_021012	ATG	2	6	1023055	1023060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479147026
21358	NC_021012	GCA	2	6	1023096	1023101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147026
21359	NC_021012	AGC	2	6	1023104	1023109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479147026
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