MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 88114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_021012	T	6	6	553915	553920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_021012	GCA	2	6	553921	553926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11503	NC_021012	CA	3	6	553972	553977	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11504	NC_021012	GAT	2	6	554108	554113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_021012	GAG	2	6	554138	554143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_021012	GGC	2	6	554186	554191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11507	NC_021012	TCA	2	6	554194	554199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11508	NC_021012	AAG	2	6	554234	554239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_021012	AATGG	2	10	554351	554360	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_021012	CGG	2	6	554382	554387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11511	NC_021012	CCG	2	6	554426	554431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11512	NC_021012	TTC	2	6	554479	554484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11513	NC_021012	A	6	6	554534	554539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_021012	GAT	2	6	554659	554664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_021012	GAT	2	6	554708	554713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146660
11516	NC_021012	ACA	2	6	554721	554726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146660
11517	NC_021012	AGC	2	6	554764	554769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146660
11518	NC_021012	GAAG	2	8	554825	554832	50 %	0 %	50 %	0 %	479146660
11519	NC_021012	CGC	2	6	554867	554872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146660
11520	NC_021012	A	6	6	554900	554905	100 %	0 %	0 %	0 %	479146660
11521	NC_021012	A	6	6	554943	554948	100 %	0 %	0 %	0 %	479146660
11522	NC_021012	GAA	2	6	554949	554954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146660
11523	NC_021012	GGT	2	6	554966	554971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146660
11524	NC_021012	GAT	2	6	554991	554996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146660
11525	NC_021012	CAG	3	9	555064	555072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146660
11526	NC_021012	TGA	2	6	555095	555100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146660
11527	NC_021012	A	6	6	555104	555109	100 %	0 %	0 %	0 %	479146660
11528	NC_021012	TGGA	2	8	555160	555167	25 %	25 %	50 %	0 %	479146660
11529	NC_021012	CTT	2	6	555175	555180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146660
11530	NC_021012	ATG	2	6	555238	555243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146660
11531	NC_021012	GAA	2	6	555363	555368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146660
11532	NC_021012	ATC	2	6	555588	555593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146660
11533	NC_021012	AGA	2	6	555635	555640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146660
11534	NC_021012	CGC	2	6	555698	555703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146660
11535	NC_021012	CAA	2	6	555728	555733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146660
11536	NC_021012	GAA	2	6	555768	555773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146660
11537	NC_021012	CAG	2	6	555789	555794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146660
11538	NC_021012	AGC	2	6	555961	555966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146661
11539	NC_021012	CAG	2	6	556100	556105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146661
11540	NC_021012	GGA	2	6	556141	556146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146661
11541	NC_021012	GTG	2	6	556193	556198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146661
11542	NC_021012	GCAT	2	8	556250	556257	25 %	25 %	25 %	25 %	479146661
11543	NC_021012	GATGGA	2	12	556259	556270	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	479146661
11544	NC_021012	GT	3	6	556281	556286	0 %	50 %	50 %	0 %	479146661
11545	NC_021012	GAT	2	6	556307	556312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146661
11546	NC_021012	ATT	2	6	556314	556319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146661
11547	NC_021012	ATTTT	2	10	556330	556339	20 %	80 %	0 %	0 %	479146661
11548	NC_021012	CTG	2	6	556402	556407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146661
11549	NC_021012	GC	4	8	556430	556437	0 %	0 %	50 %	50 %	479146661
11550	NC_021012	GCT	2	6	556444	556449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146661
11551	NC_021012	ATT	2	6	556459	556464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146661
11552	NC_021012	TGCA	2	8	556532	556539	25 %	25 %	25 %	25 %	479146661
11553	NC_021012	AGT	2	6	556597	556602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146661
11554	NC_021012	AGA	2	6	556711	556716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146661
11555	NC_021012	AGA	2	6	556787	556792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146661
11556	NC_021012	A	7	7	556821	556827	100 %	0 %	0 %	0 %	479146661
11557	NC_021012	A	6	6	556929	556934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_021012	A	7	7	556945	556951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_021012	CAG	2	6	556967	556972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11560	NC_021012	T	6	6	557014	557019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_021012	TGA	2	6	557035	557040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_021012	GAAG	2	8	557162	557169	50 %	0 %	50 %	0 %	479146662
11563	NC_021012	CCA	2	6	557197	557202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479146662
11564	NC_021012	TGA	2	6	557228	557233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146662
11565	NC_021012	TTC	2	6	557262	557267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146662
11566	NC_021012	T	6	6	557277	557282	0 %	100 %	0 %	0 %	479146662
11567	NC_021012	GA	3	6	557290	557295	50 %	0 %	50 %	0 %	479146662
11568	NC_021012	GGA	2	6	557325	557330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146662
11569	NC_021012	AAC	2	6	557364	557369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146662
11570	NC_021012	CGTC	2	8	557410	557417	0 %	25 %	25 %	50 %	479146662
11571	NC_021012	ATAC	2	8	557458	557465	50 %	25 %	0 %	25 %	479146662
11572	NC_021012	TAATA	2	10	557483	557492	60 %	40 %	0 %	0 %	479146662
11573	NC_021012	GT	3	6	557507	557512	0 %	50 %	50 %	0 %	479146662
11574	NC_021012	TTC	2	6	557526	557531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146662
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11577	NC_021012	TCT	2	6	557575	557580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146662
11578	NC_021012	AT	3	6	557602	557607	50 %	50 %	0 %	0 %	479146662
11579	NC_021012	GCAG	2	8	557621	557628	25 %	0 %	50 %	25 %	479146662
11580	NC_021012	GAT	2	6	557685	557690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146662
11581	NC_021012	T	6	6	557690	557695	0 %	100 %	0 %	0 %	479146662
11582	NC_021012	GA	3	6	557832	557837	50 %	0 %	50 %	0 %	479146662
11583	NC_021012	CAA	2	6	557936	557941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146662
11584	NC_021012	A	6	6	557995	558000	100 %	0 %	0 %	0 %	479146662
11585	NC_021012	CT	3	6	558095	558100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11586	NC_021012	AT	3	6	558146	558151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_021012	TAT	2	6	558180	558185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_021012	CAG	2	6	558190	558195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11589	NC_021012	ACG	2	6	558293	558298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11590	NC_021012	TGT	2	6	558315	558320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11591	NC_021012	A	6	6	558332	558337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_021012	A	6	6	558354	558359	100 %	0 %	0 %	0 %	479146663
11593	NC_021012	A	6	6	558361	558366	100 %	0 %	0 %	0 %	479146663
11594	NC_021012	TTG	2	6	558433	558438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146663
11595	NC_021012	GCT	2	6	558441	558446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146663
11596	NC_021012	A	6	6	558471	558476	100 %	0 %	0 %	0 %	479146663
11597	NC_021012	TGAA	2	8	558538	558545	50 %	25 %	25 %	0 %	479146663
11598	NC_021012	TGA	2	6	558599	558604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146663
11599	NC_021012	TTA	2	6	558629	558634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146663
11600	NC_021012	CAA	2	6	558709	558714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146663
11601	NC_021012	A	6	6	558713	558718	100 %	0 %	0 %	0 %	479146663
11602	NC_021012	AACA	2	8	558731	558738	75 %	0 %	0 %	25 %	479146663
11603	NC_021012	AAG	2	6	558751	558756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146663
11604	NC_021012	CAG	2	6	558871	558876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146663
11605	NC_021012	ATGA	2	8	558924	558931	50 %	25 %	25 %	0 %	479146663
11606	NC_021012	ATTGC	2	10	559221	559230	20 %	40 %	20 %	20 %	479146663
11607	NC_021012	TGT	2	6	559259	559264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146663
11608	NC_021012	ATG	2	6	559348	559353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146663
11609	NC_021012	GAT	2	6	559406	559411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146663
11610	NC_021012	GAA	2	6	559442	559447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146663
11611	NC_021012	TCTGTA	2	12	559548	559559	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479146663
11612	NC_021012	GCA	2	6	559599	559604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146663
11613	NC_021012	TAA	2	6	559748	559753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146663
11614	NC_021012	ATC	2	6	559785	559790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146663
11615	NC_021012	GACGA	2	10	559812	559821	40 %	0 %	40 %	20 %	479146663
11616	NC_021012	GTT	2	6	559887	559892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146663
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11619	NC_021012	CAGG	2	8	559995	560002	25 %	0 %	50 %	25 %	479146663
11620	NC_021012	ATCA	2	8	560124	560131	50 %	25 %	0 %	25 %	479146663
11621	NC_021012	GGC	2	6	560177	560182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146663
11622	NC_021012	CAG	2	6	560223	560228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146663
11623	NC_021012	AG	3	6	560332	560337	50 %	0 %	50 %	0 %	479146663
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11997	NC_021012	ATT	2	6	578579	578584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146677
11998	NC_021012	AGC	2	6	578699	578704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146678
11999	NC_021012	AAAG	2	8	578756	578763	75 %	0 %	25 %	0 %	479146678
12000	NC_021012	GCA	2	6	578772	578777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146678

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