MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 88114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021012	TCAG	2	8	24066	24073	25 %	25 %	25 %	25 %	479146222
502	NC_021012	GCT	2	6	24090	24095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146222
503	NC_021012	A	6	6	24112	24117	100 %	0 %	0 %	0 %	479146222
504	NC_021012	GCA	2	6	24176	24181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146222
505	NC_021012	A	6	6	24278	24283	100 %	0 %	0 %	0 %	479146222
506	NC_021012	CTG	2	6	24413	24418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146223
507	NC_021012	AG	3	6	24469	24474	50 %	0 %	50 %	0 %	479146223
508	NC_021012	CAG	3	9	24505	24513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146223
509	NC_021012	CTT	2	6	24574	24579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146223
510	NC_021012	TTTG	2	8	24584	24591	0 %	75 %	25 %	0 %	479146223
511	NC_021012	CTT	2	6	24592	24597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146223
512	NC_021012	GGAA	2	8	24699	24706	50 %	0 %	50 %	0 %	479146223
513	NC_021012	GAA	2	6	24764	24769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146223
514	NC_021012	T	7	7	24829	24835	0 %	100 %	0 %	0 %	479146223
515	NC_021012	AAG	2	6	24851	24856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146223
516	NC_021012	TCA	2	6	24936	24941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146223
517	NC_021012	CCG	2	6	24942	24947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146223
518	NC_021012	GTT	2	6	25148	25153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146223
519	NC_021012	TCA	2	6	25243	25248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146223
520	NC_021012	GGAT	2	8	25271	25278	25 %	25 %	50 %	0 %	479146223
521	NC_021012	CCG	3	9	25296	25304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146223
522	NC_021012	TGCC	2	8	25324	25331	0 %	25 %	25 %	50 %	479146223
523	NC_021012	GTT	2	6	25427	25432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146223
524	NC_021012	TCC	2	6	25520	25525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_021012	AAAAT	2	10	25528	25537	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_021012	A	6	6	25544	25549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_021012	A	6	6	25574	25579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_021012	ACC	2	6	25588	25593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_021012	ACA	2	6	25638	25643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_021012	CTA	2	6	25680	25685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_021012	CTT	2	6	25797	25802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_021012	TGT	2	6	25814	25819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_021012	T	7	7	25875	25881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_021012	A	6	6	25973	25978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_021012	A	6	6	25995	26000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_021012	AGA	2	6	26039	26044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_021012	AAC	2	6	26045	26050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_021012	CGG	2	6	26073	26078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_021012	A	6	6	26093	26098	100 %	0 %	0 %	0 %	479146225
540	NC_021012	GAA	2	6	26099	26104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146225
541	NC_021012	ATC	2	6	26117	26122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146225
542	NC_021012	ATG	2	6	26135	26140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146225
543	NC_021012	TCA	2	6	26277	26282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146225
544	NC_021012	TGA	2	6	26298	26303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146225
545	NC_021012	AGA	2	6	26310	26315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146225
546	NC_021012	GTG	2	6	26318	26323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146225
547	NC_021012	GGA	2	6	26344	26349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146225
548	NC_021012	ATT	2	6	26370	26375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146225
549	NC_021012	AG	3	6	26488	26493	50 %	0 %	50 %	0 %	479146225
550	NC_021012	AAG	2	6	26648	26653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146226
551	NC_021012	AG	3	6	26681	26686	50 %	0 %	50 %	0 %	479146226
552	NC_021012	A	6	6	26701	26706	100 %	0 %	0 %	0 %	479146226
553	NC_021012	GGC	2	6	26724	26729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146226
554	NC_021012	ACG	2	6	26746	26751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146226
555	NC_021012	AGC	2	6	26782	26787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146226
556	NC_021012	GAC	2	6	26811	26816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146226
557	NC_021012	A	6	6	26825	26830	100 %	0 %	0 %	0 %	479146226
558	NC_021012	A	6	6	26852	26857	100 %	0 %	0 %	0 %	479146226
559	NC_021012	TTATC	2	10	26887	26896	20 %	60 %	0 %	20 %	479146226
560	NC_021012	GAA	2	6	26920	26925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146226
561	NC_021012	TGA	2	6	26997	27002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146226
562	NC_021012	A	6	6	27077	27082	100 %	0 %	0 %	0 %	479146226
563	NC_021012	TGA	2	6	27099	27104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146226
564	NC_021012	GAT	2	6	27120	27125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146226
565	NC_021012	ATGT	2	8	27163	27170	25 %	50 %	25 %	0 %	479146226
566	NC_021012	ATG	2	6	27176	27181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146226
567	NC_021012	AGG	2	6	27191	27196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146226
568	NC_021012	ATT	2	6	27217	27222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146226
569	NC_021012	GGA	2	6	27234	27239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146226
570	NC_021012	GAC	2	6	27330	27335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146226
571	NC_021012	GGA	2	6	27345	27350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146226
572	NC_021012	GAT	2	6	27454	27459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146226
573	NC_021012	CTT	2	6	27523	27528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146226
574	NC_021012	AGC	2	6	27589	27594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146226
575	NC_021012	GAA	2	6	27700	27705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146226
576	NC_021012	GCG	2	6	27725	27730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146226
577	NC_021012	CAG	3	9	27777	27785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146226
578	NC_021012	CGG	2	6	27825	27830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146226
579	NC_021012	AG	3	6	27831	27836	50 %	0 %	50 %	0 %	479146226
580	NC_021012	ATT	2	6	27845	27850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146226
581	NC_021012	GCA	2	6	27854	27859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146226
582	NC_021012	TGT	2	6	27897	27902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146226
583	NC_021012	GCA	2	6	27950	27955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146226
584	NC_021012	TGG	2	6	27992	27997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146226
585	NC_021012	ATA	2	6	28116	28121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_021012	AAT	2	6	28125	28130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_021012	CAGC	2	8	28158	28165	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
588	NC_021012	TAA	2	6	28192	28197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_021012	GTA	2	6	28234	28239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146227
590	NC_021012	TGG	2	6	28337	28342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146227
591	NC_021012	TCG	2	6	28406	28411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146227
592	NC_021012	CGGAGC	2	12	28413	28424	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	479146227
593	NC_021012	GGA	2	6	28431	28436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146227
594	NC_021012	AT	3	6	28461	28466	50 %	50 %	0 %	0 %	479146227
595	NC_021012	TGA	2	6	28467	28472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146227
596	NC_021012	ATT	2	6	28496	28501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146227
597	NC_021012	AG	3	6	28503	28508	50 %	0 %	50 %	0 %	479146227
598	NC_021012	GGTGT	2	10	28543	28552	0 %	40 %	60 %	0 %	479146227
599	NC_021012	CGGA	2	8	28632	28639	25 %	0 %	50 %	25 %	479146227
600	NC_021012	GAG	2	6	28651	28656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146227
601	NC_021012	A	7	7	28670	28676	100 %	0 %	0 %	0 %	479146227
602	NC_021012	TTA	2	6	28689	28694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146227
603	NC_021012	CAA	2	6	28812	28817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146227
604	NC_021012	GAT	2	6	28905	28910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146227
605	NC_021012	GAA	2	6	28951	28956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146227
606	NC_021012	TGA	2	6	28992	28997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146227
607	NC_021012	ATG	2	6	29059	29064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146228
608	NC_021012	TGA	2	6	29105	29110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146228
609	NC_021012	GA	3	6	29109	29114	50 %	0 %	50 %	0 %	479146228
610	NC_021012	GGA	2	6	29117	29122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146228
611	NC_021012	A	6	6	29134	29139	100 %	0 %	0 %	0 %	479146228
612	NC_021012	T	6	6	29165	29170	0 %	100 %	0 %	0 %	479146229
613	NC_021012	GAG	2	6	29218	29223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146229
614	NC_021012	GCA	2	6	29319	29324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146229
615	NC_021012	AGG	2	6	29330	29335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146229
616	NC_021012	CAGG	2	8	29449	29456	25 %	0 %	50 %	25 %	479146229
617	NC_021012	ACG	3	9	29485	29493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146229
618	NC_021012	GAG	2	6	29536	29541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146229
619	NC_021012	GTT	2	6	29545	29550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146229
620	NC_021012	T	6	6	29594	29599	0 %	100 %	0 %	0 %	479146229
621	NC_021012	GCA	2	6	29610	29615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146229
622	NC_021012	GAAA	2	8	29619	29626	75 %	0 %	25 %	0 %	479146229
623	NC_021012	A	6	6	29624	29629	100 %	0 %	0 %	0 %	479146229
624	NC_021012	TAA	2	6	29766	29771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146229
625	NC_021012	GGAAT	2	10	29788	29797	40 %	20 %	40 %	0 %	479146229
626	NC_021012	GCA	2	6	29941	29946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146229
627	NC_021012	GAT	2	6	29985	29990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_021012	GAA	2	6	30005	30010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_021012	ACA	2	6	30031	30036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_021012	TGATT	2	10	30040	30049	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
631	NC_021012	GT	3	6	30058	30063	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
632	NC_021012	TGA	2	6	30074	30079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_021012	T	6	6	30104	30109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_021012	A	6	6	30148	30153	100 %	0 %	0 %	0 %	479146230
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637	NC_021012	TGC	2	6	30325	30330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146230
638	NC_021012	GCTG	2	8	30335	30342	0 %	25 %	50 %	25 %	479146230
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650	NC_021012	GAA	2	6	30826	30831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146232
651	NC_021012	ATT	2	6	30832	30837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146232
652	NC_021012	GAA	3	9	30842	30850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146232
653	NC_021012	GAG	2	6	30895	30900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146232
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662	NC_021012	TG	3	6	31214	31219	0 %	50 %	50 %	0 %	479146232
663	NC_021012	TTTC	2	8	31231	31238	0 %	75 %	0 %	25 %	479146232
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761	NC_021012	CGG	2	6	36253	36258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479146236
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781	NC_021012	T	6	6	37008	37013	0 %	100 %	0 %	0 %	479146237
782	NC_021012	T	6	6	37063	37068	0 %	100 %	0 %	0 %	479146237
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795	NC_021012	T	7	7	37891	37897	0 %	100 %	0 %	0 %	479146238
796	NC_021012	AT	3	6	37915	37920	50 %	50 %	0 %	0 %	479146238
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