MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 88114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_021012	CAG	2	6	435469	435474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9002	NC_021012	TCA	2	6	435485	435490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9003	NC_021012	TTTCA	2	10	435529	435538	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9004	NC_021012	CAG	2	6	435547	435552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9005	NC_021012	CCT	2	6	435748	435753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9006	NC_021012	TTTTA	2	10	435826	435835	20 %	80 %	0 %	0 %	479146561
9007	NC_021012	CAA	2	6	435864	435869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146561
9008	NC_021012	CAA	2	6	435958	435963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146561
9009	NC_021012	CCT	2	6	435977	435982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479146561
9010	NC_021012	T	6	6	436033	436038	0 %	100 %	0 %	0 %	479146561
9011	NC_021012	ATA	2	6	436082	436087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9012	NC_021012	CTC	2	6	436089	436094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9013	NC_021012	AAG	2	6	436108	436113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9014	NC_021012	T	7	7	436141	436147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9015	NC_021012	GCC	2	6	436338	436343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9016	NC_021012	AGA	2	6	436391	436396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9017	NC_021012	TGC	2	6	436426	436431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9018	NC_021012	GAT	2	6	436491	436496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9019	NC_021012	CTG	2	6	436509	436514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9020	NC_021012	GCG	2	6	436604	436609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9021	NC_021012	GT	3	6	436610	436615	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_021012	GCC	2	6	436657	436662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9023	NC_021012	GGC	2	6	436673	436678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9024	NC_021012	AGG	2	6	436702	436707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9025	NC_021012	CTG	2	6	436709	436714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9026	NC_021012	GGC	2	6	436773	436778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9027	NC_021012	CGAAG	2	10	436938	436947	40 %	0 %	40 %	20 %	479146562
9028	NC_021012	GAA	2	6	436989	436994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146562
9029	NC_021012	CGGG	2	8	437013	437020	0 %	0 %	75 %	25 %	479146562
9030	NC_021012	TAC	2	6	437029	437034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146562
9031	NC_021012	GGT	2	6	437046	437051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146562
9032	NC_021012	GCGG	2	8	437066	437073	0 %	0 %	75 %	25 %	479146562
9033	NC_021012	TGG	2	6	437117	437122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146562
9034	NC_021012	AATC	2	8	437256	437263	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9035	NC_021012	TA	3	6	437289	437294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9036	NC_021012	CATT	2	8	437324	437331	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9037	NC_021012	CGG	2	6	437359	437364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9038	NC_021012	CCG	2	6	437371	437376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9039	NC_021012	GGAAT	2	10	437381	437390	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9040	NC_021012	CGG	2	6	437452	437457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9041	NC_021012	CCA	2	6	437471	437476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9042	NC_021012	CTA	2	6	437567	437572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9043	NC_021012	TTCA	2	8	437577	437584	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9044	NC_021012	GCG	2	6	437715	437720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9045	NC_021012	A	6	6	437782	437787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9046	NC_021012	TGG	2	6	437905	437910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9047	NC_021012	TC	3	6	438032	438037	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9048	NC_021012	AGA	2	6	438064	438069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9049	NC_021012	A	6	6	438135	438140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9050	NC_021012	CAAT	2	8	438151	438158	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9051	NC_021012	ATGA	2	8	438219	438226	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9052	NC_021012	GCG	2	6	438269	438274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9053	NC_021012	CCG	2	6	438291	438296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9054	NC_021012	GCA	2	6	438329	438334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146563
9055	NC_021012	GGAAA	2	10	438336	438345	60 %	0 %	40 %	0 %	479146563
9056	NC_021012	GAAATC	2	12	438379	438390	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479146563
9057	NC_021012	GGAAA	2	10	438403	438412	60 %	0 %	40 %	0 %	479146563
9058	NC_021012	TC	3	6	438426	438431	0 %	50 %	0 %	50 %	479146563
9059	NC_021012	AGC	2	6	438456	438461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146563
9060	NC_021012	CAG	2	6	438481	438486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146563
9061	NC_021012	CAT	2	6	438560	438565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9062	NC_021012	GCT	2	6	438577	438582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9063	NC_021012	CAG	2	6	438602	438607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9064	NC_021012	T	6	6	438617	438622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9065	NC_021012	ATG	2	6	438905	438910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146564
9066	NC_021012	CAG	2	6	438920	438925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146564
9067	NC_021012	TAC	2	6	439058	439063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146564
9068	NC_021012	TGG	2	6	439158	439163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146564
9069	NC_021012	GGA	2	6	439171	439176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146564
9070	NC_021012	GCCCA	2	10	439211	439220	20 %	0 %	20 %	60 %	479146564
9071	NC_021012	GCAG	2	8	439333	439340	25 %	0 %	50 %	25 %	479146564
9072	NC_021012	GCT	2	6	439419	439424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146564
9073	NC_021012	AAG	2	6	439541	439546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146564
9074	NC_021012	TGA	2	6	439548	439553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146564
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9077	NC_021012	TGGC	2	8	439595	439602	0 %	25 %	50 %	25 %	479146564
9078	NC_021012	ATC	2	6	439724	439729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146564
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9083	NC_021012	GGCAAA	2	12	439813	439824	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	479146564
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9088	NC_021012	TGG	2	6	440085	440090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146564
9089	NC_021012	TGA	2	6	440094	440099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146564
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9093	NC_021012	TACC	2	8	440176	440183	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9094	NC_021012	TTA	2	6	440210	440215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9095	NC_021012	ATT	2	6	440242	440247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9096	NC_021012	A	8	8	440307	440314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9097	NC_021012	A	6	6	440331	440336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9098	NC_021012	TAGT	2	8	440369	440376	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9099	NC_021012	TCA	2	6	440401	440406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9100	NC_021012	TTA	2	6	440407	440412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9101	NC_021012	AG	3	6	440451	440456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9102	NC_021012	T	6	6	440539	440544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9103	NC_021012	T	6	6	440576	440581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9104	NC_021012	AG	3	6	440645	440650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9105	NC_021012	A	7	7	440663	440669	100 %	0 %	0 %	0 %	479146565
9106	NC_021012	ATATTA	2	12	440684	440695	50 %	50 %	0 %	0 %	479146565
9107	NC_021012	AAG	2	6	440724	440729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146565
9108	NC_021012	A	6	6	440734	440739	100 %	0 %	0 %	0 %	479146565
9109	NC_021012	TAA	2	6	440740	440745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146565
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9112	NC_021012	AGA	2	6	440839	440844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146565
9113	NC_021012	CGT	2	6	440887	440892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146565
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9120	NC_021012	GAAG	2	8	441193	441200	50 %	0 %	50 %	0 %	479146565
9121	NC_021012	CTTG	2	8	441208	441215	0 %	50 %	25 %	25 %	479146565
9122	NC_021012	GAA	2	6	441230	441235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146565
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9124	NC_021012	CTT	2	6	441254	441259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146565
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9126	NC_021012	GAA	2	6	441286	441291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146565
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9253	NC_021012	GAA	2	6	447792	447797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146569
9254	NC_021012	TGG	2	6	447826	447831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146569
9255	NC_021012	GAT	2	6	447837	447842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146569
9256	NC_021012	GAT	2	6	447852	447857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146569
9257	NC_021012	GAT	2	6	447867	447872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146569
9258	NC_021012	GAT	2	6	447893	447898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146569
9259	NC_021012	CTG	2	6	447993	447998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146569
9260	NC_021012	TGT	2	6	448031	448036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146569
9261	NC_021012	ATG	2	6	448042	448047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146569
9262	NC_021012	GT	3	6	448250	448255	0 %	50 %	50 %	0 %	479146569
9263	NC_021012	GGA	2	6	448259	448264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146569
9264	NC_021012	GGA	2	6	448289	448294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146569
9265	NC_021012	CAGGG	2	10	448305	448314	20 %	0 %	60 %	20 %	479146569
9266	NC_021012	GAA	2	6	448323	448328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146569
9267	NC_021012	CTG	2	6	448407	448412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146569
9268	NC_021012	GCA	2	6	448443	448448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146569
9269	NC_021012	TGG	2	6	448489	448494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146569
9270	NC_021012	TGA	2	6	448556	448561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146569
9271	NC_021012	TGGGA	2	10	448682	448691	20 %	20 %	60 %	0 %	479146569
9272	NC_021012	A	6	6	448691	448696	100 %	0 %	0 %	0 %	479146569
9273	NC_021012	AAG	2	6	448715	448720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146569
9274	NC_021012	GAAA	2	8	448883	448890	75 %	0 %	25 %	0 %	479146569
9275	NC_021012	TA	3	6	448938	448943	50 %	50 %	0 %	0 %	479146569
9276	NC_021012	TTATC	2	10	448965	448974	20 %	60 %	0 %	20 %	479146569
9277	NC_021012	CTGC	2	8	449013	449020	0 %	25 %	25 %	50 %	479146569
9278	NC_021012	GCGG	2	8	449060	449067	0 %	0 %	75 %	25 %	479146569
9279	NC_021012	GAA	2	6	449082	449087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146569
9280	NC_021012	GCAG	2	8	449144	449151	25 %	0 %	50 %	25 %	479146569
9281	NC_021012	A	8	8	449155	449162	100 %	0 %	0 %	0 %	479146569
9282	NC_021012	GCA	2	6	449165	449170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146569
9283	NC_021012	ATG	2	6	449209	449214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146569
9284	NC_021012	A	6	6	449222	449227	100 %	0 %	0 %	0 %	479146569
9285	NC_021012	AGG	3	9	449284	449292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146569
9286	NC_021012	GAG	2	6	449313	449318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146569
9287	NC_021012	AGC	2	6	449356	449361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146569
9288	NC_021012	CAT	2	6	449411	449416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146569
9289	NC_021012	GT	3	6	449440	449445	0 %	50 %	50 %	0 %	479146569
9290	NC_021012	AGC	2	6	449567	449572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146569
9291	NC_021012	ATC	2	6	449754	449759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146569
9292	NC_021012	CTT	2	6	449793	449798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479146569
9293	NC_021012	TGT	2	6	449944	449949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146569
9294	NC_021012	TTCC	2	8	449951	449958	0 %	50 %	0 %	50 %	479146569
9295	NC_021012	AAG	2	6	450039	450044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9296	NC_021012	GCA	2	6	450056	450061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146570
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9299	NC_021012	ATC	2	6	450177	450182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146570
9300	NC_021012	A	7	7	450185	450191	100 %	0 %	0 %	0 %	479146570
9301	NC_021012	GCA	2	6	450219	450224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146570
9302	NC_021012	GA	3	6	450233	450238	50 %	0 %	50 %	0 %	479146570
9303	NC_021012	TGA	2	6	450283	450288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146570
9304	NC_021012	TTG	2	6	450325	450330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479146570
9305	NC_021012	GACCG	2	10	450447	450456	20 %	0 %	40 %	40 %	479146570
9306	NC_021012	GCAGG	2	10	450457	450466	20 %	0 %	60 %	20 %	479146570
9307	NC_021012	TAA	2	6	450626	450631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479146570
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9309	NC_021012	AT	4	8	450692	450699	50 %	50 %	0 %	0 %	479146570
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9312	NC_021012	GTA	2	6	450782	450787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146571
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9314	NC_021012	GGA	2	6	450844	450849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146571
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9317	NC_021012	GCAGAG	2	12	450965	450976	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	479146571
9318	NC_021012	A	6	6	451110	451115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9319	NC_021012	ATG	2	6	451128	451133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146572
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9322	NC_021012	AG	3	6	451242	451247	50 %	0 %	50 %	0 %	479146572
9323	NC_021012	GGA	2	6	451364	451369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146572
9324	NC_021012	ATT	2	6	451408	451413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146572
9325	NC_021012	GAT	2	6	451424	451429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146572
9326	NC_021012	ATTT	2	8	451430	451437	25 %	75 %	0 %	0 %	479146572
9327	NC_021012	ATC	2	6	451649	451654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146572
9328	NC_021012	GCA	2	6	451709	451714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146572
9329	NC_021012	AGGT	2	8	451791	451798	25 %	25 %	50 %	0 %	479146572
9330	NC_021012	TGA	2	6	451831	451836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146572
9331	NC_021012	TGA	2	6	451900	451905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146572
9332	NC_021012	TAC	2	6	451955	451960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146572
9333	NC_021012	GGT	2	6	451975	451980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146572
9334	NC_021012	CAA	2	6	452017	452022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146572
9335	NC_021012	AG	3	6	452160	452165	50 %	0 %	50 %	0 %	479146572
9336	NC_021012	GAA	3	9	452166	452174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146572
9337	NC_021012	GGA	2	6	452179	452184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146572
9338	NC_021012	CGA	2	6	452326	452331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146572
9339	NC_021012	CAA	2	6	452368	452373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146572
9340	NC_021012	TGCG	2	8	452415	452422	0 %	25 %	50 %	25 %	479146572
9341	NC_021012	GCA	2	6	452455	452460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146572
9342	NC_021012	AAG	2	6	452488	452493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146572
9343	NC_021012	AGC	2	6	452570	452575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146573
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9345	NC_021012	AT	3	6	452644	452649	50 %	50 %	0 %	0 %	479146573
9346	NC_021012	GAT	2	6	452781	452786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146573
9347	NC_021012	AT	3	6	452798	452803	50 %	50 %	0 %	0 %	479146573
9348	NC_021012	GAA	2	6	452820	452825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479146573
9349	NC_021012	GGT	2	6	452834	452839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146573
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9351	NC_021012	TAT	2	6	452922	452927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479146573
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9353	NC_021012	GCA	2	6	453129	453134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146573
9354	NC_021012	GAT	2	6	453150	453155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146573
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9356	NC_021012	GAG	2	6	453237	453242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479146573
9357	NC_021012	CGT	2	6	453271	453276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146573
9358	NC_021012	CAGG	2	8	453285	453292	25 %	0 %	50 %	25 %	479146573
9359	NC_021012	TTTTA	2	10	453300	453309	20 %	80 %	0 %	0 %	479146573
9360	NC_021012	AATA	2	8	453321	453328	75 %	25 %	0 %	0 %	479146573
9361	NC_021012	A	6	6	453370	453375	100 %	0 %	0 %	0 %	479146573
9362	NC_021012	TGA	2	6	453392	453397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146573
9363	NC_021012	CAA	2	6	453437	453442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146573
9364	NC_021012	T	7	7	453497	453503	0 %	100 %	0 %	0 %	479146573
9365	NC_021012	TTTG	2	8	453617	453624	0 %	75 %	25 %	0 %	479146574
9366	NC_021012	CAG	2	6	453636	453641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479146574
9367	NC_021012	TGG	2	6	453652	453657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479146574
9368	NC_021012	ATC	2	6	453735	453740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146574
9369	NC_021012	ATTT	2	8	453840	453847	25 %	75 %	0 %	0 %	479146574
9370	NC_021012	AGT	2	6	453884	453889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479146574
9371	NC_021012	GCC	2	6	453895	453900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479146574
9372	NC_021012	ACA	2	6	453928	453933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479146574
9373	NC_021012	CAT	2	6	454013	454018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479146574
9374	NC_021012	CGT	2	6	454046	454051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479146574
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9498	NC_021012	GTCA	2	8	459838	459845	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9499	NC_021012	AAAAG	2	10	459890	459899	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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